Cav2.1 - Cav2.1

CACNA1A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3BXK
Identifikátory
Aliasy	CACNA1A, APCA, BI, CACNL1A4, CAV2.1, EA2, FHM, HPCA, MHP, MHP1, SCA6, Cav2.1, podjednotka kanálu s vápníkovým napětím alfa1 A, EIEE42
Externí ID	OMIM: 601011 MGI: 109482 HomoloGene: 56383 Genové karty: CACNA1A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	13,633,025 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	84,640,246 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita iontového kanálu; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • syntaxinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • napěťově řízená aktivita vápníkového kanálu; • aktivita vápníkového kanálu; • aktivita vápníkového kanálu s vysokým napětím; • vazba amyloid-beta;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex vápníkového kanálu s napětím; • buněčná projekce; • buněčné jádro; • membrána; • integrální součást membrány; • buněčná membrána; • tělo neuronových buněk;
Biologický proces	• transport iontů vápníku; • buněčná smrt; • transmembránová doprava; • membránová depolarizace během akčního potenciálu; • regulace iontového transmembránového transportu; • iontový transport; • doprava; • regulace sekrece inzulínu; • transmembránový transport vápenatých iontů; • pozitivní regulace koncentrace cytosolických iontů vápníku; • membránová depolarizace; • chemický synaptický přenos; • modulace chemického synaptického přenosu; • dovoz iontů vápníku; • reakce na amyloid-beta; • buněčná odpověď na amyloid-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	773
	12286
	ENSG00000141837
	ENSMUSG00000034656
	O00555
	P97445
	NM_023035; NM_000068; NM_001127221; NM_001127222; NM_001174080
	NM_001252059; NM_001252060; NM_001252061; NM_007578
	NP_000059; NP_001120693; NP_001120694; NP_001167551; NP_075461
	NP_001238988; NP_001238989; NP_001238990; NP_031604
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The Ca._proti2.1 P /Q napěťově závislý vápníkový kanál je kódován CACNA1A gen.

Funkce

Napěťově závislé vápníkové kanály zprostředkovávají vstup vápenatých iontů do excitabilních buněk a jsou také zapojeny do různých procesů závislých na vápníku, včetně kontrakce svalů, uvolňování hormonů nebo neurotransmiterů a genové exprese. Vápníkové kanály jsou multisubunitové komplexy složené z podjednotek alfa-1, beta, alfa-2 / delta a gama. Aktivita kanálu je směrována podjednotkou alfa-1 tvořící póry, zatímco ostatní fungují jako pomocné podjednotky regulující tuto aktivitu. Charakteristické vlastnosti typů vápníkových kanálů souvisí primárně s expresí různých izoforem alfa-1, alfa-1A, B, C, D, E a S. Tento gen kóduje podjednotku alfa-1A, která je převážně vyjádřeno v neuronální tkáni.

Klinický význam

Mutace v tomto genu jsou spojeny s mnoha neurologickými poruchami, z nichž mnohé jsou epizodické, jako např familiární hemiplegická migréna, poruchy hybnosti jako např epizodická ataxie, a epilepsie s několika typy záchvatů.^[5]

Tento gen také vykazuje polymorfní variaci v důsledku (CAG) n-opakování. Bylo popsáno několik variant transkriptu, nicméně není známa úplná povaha všech. V jedné sadě variant transkriptu se n-repetice (CAG) vyskytují v 3 'UTR a nejsou spojeny s žádným onemocněním. V jiné sadě variant však inzerce rozšiřuje oblast kódování tak, aby zahrnovala (CAG) n-opakování, která kódují polyglutaminový trakt. Expanze (CAG) n-opakování z normálních 4–16 na 21–28 v kódující oblasti je spojena se spinocerebelární ataxií 6.^[6]

Interakce

Cav2.1 bylo prokázáno komunikovat s CACNB4.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141837 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034656 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Papandreou A, Danti FR, Spaull R, Leuzzi V, Mctague A, Kurian MA (únor 2020). "Rozšiřující se spektrum pohybových poruch u genetických epilepsií". Vývojová medicína a dětská neurologie. 62 (2): 178–191. doi:10.1111 / dmcn.14407. PMID 31784983. S2CID 208498567.
^ „Entrez Gene: CACNA1A vápenatý kanál, závislý na napětí, typ P / Q, podjednotka alfa 1A“.
^ Walker D, Bichet D, Campbell KP, De Waard M (leden 1998). „Místo interakce specifické pro izoformu beta 4 v karboxylové koncové oblasti napěťově závislé podjednotky kanálu alfa 2A alfa 1A“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2361–7. doi:10.1074 / jbc.273.4.2361. PMID 9442082.
^ Walker D, Bichet D, Geib S, Mori E, Cornet V, Snutch TP a kol. (Duben 1999). „Nová interakce specifická pro podtyp beta v podjednotce alfa1A řídí aktivaci kanálu Ca2 + typu P / Q“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12383–90. doi:10.1074 / jbc.274.18.12383. PMID 10212211.

Další čtení

Terwindt G, Kors E, Haan J, Vermeulen F, Van den Maagdenberg A, Frants R, Ferrari M (červen 2002). „Mutační analýza genu podjednotky vápníkového kanálu CACNA1A u 27 pacientů se sporadickou hemiplegickou migrénou“. Archivy neurologie. 59 (6): 1016–8. doi:10.1001 / archneur.59.6.1016. PMID 12056940.
Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (prosinec 2005). „International Union of Pharmacology. XLVIII. Nomenklatura a strukturně-funkční vztahy napěťově řízených vápníkových kanálů“. Farmakologické recenze. 57 (4): 411–25. doi:10.1124 / pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.
Perez-Reyes E, Castellano A, Kim HS, Bertrand P, Baggstrom E, Lacerda AE a kol. (Leden 1992). "Klonování a exprese srdeční / mozkové beta podjednotky vápníkového kanálu typu L". The Journal of Biological Chemistry. 267 (3): 1792–7. PMID 1370480.
Barry EL, Viglione MP, Kim YI, Froehner SC (leden 1995). "Exprese a inhibice protilátek vápníkových kanálů typu P v buňkách lidského malobuněčného karcinomu plic". The Journal of Neuroscience. 15 (1 Pt 1): 274–83. doi:10.1523 / JNEUROSCI.15-01-00274.1995. PMC 6578292. PMID 7823133.
Joutel A, Bousser MG, Biousse V, Labauge P, Chabriat H, Nibbio A a kol. (Září 1993). "Gen pro familiární hemiplegickou migrénu se mapuje na chromozom 19". Genetika přírody. 5 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng0993-40. PMID 8220421. S2CID 6493091.
Margolis RL, Breschel TS, Li SH, Kidwai AS, Antonarakis SE, McInnis MG, Ross CA (červenec 1995). "Charakterizace cDNA klonů obsahujících CCA trinukleotidové repetice odvozené z lidského mozku". Somatická buněčná a molekulární genetika. 21 (4): 279–84. doi:10.1007 / BF02255782. PMID 8525433. S2CID 22174220.
Rettig J, Sheng ZH, Kim DK, Hodson CD, Snutch TP, Catterall WA (červenec 1996). "Isoformově specifická interakce podjednotek alfa1A mozkových Ca2 + kanálů s presynaptickými proteiny syntaxinem a SNAP-25". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (14): 7363–8. doi:10.1073 / pnas.93.14.7363. PMC 38990. PMID 8692999.
Diriong S, Lory P, Williams ME, Ellis SB, Harpold MM, Taviaux S (prosinec 1995). "Chromozomální lokalizace lidských genů pro alfa 1A, alfa 1B a alfa 1E napěťově závislé podjednotky kanálu Ca2 +". Genomika. 30 (3): 605–9. doi:10.1006 / geno.1995.1284. PMID 8825650.
Ophoff RA, Terwindt GM, Vergouwe MN, van Eijk R, Oefner PJ, Hoffman SM a kol. (Listopad 1996). „Familiární hemiplegická migréna a epizodická ataxie typu 2 jsou způsobeny mutacemi v genu Ca2 + kanálu CACNL1A4“. Buňka. 87 (3): 543–52. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81373-2. hdl:1765/57576. PMID 8898206. S2CID 16840573.
Zhuchenko O, Bailey J, Bonnen P, Ashizawa T, Stockton DW, Amos C a kol. (Leden 1997). „Autosomálně dominantní cerebelární ataxie (SCA6) spojená s malými expanzemi polyglutaminu v kanálu vápníku závislého na alfa 1A napětí“. Genetika přírody. 15 (1): 62–9. doi:10.1038 / ng0197-62. PMID 8988170. S2CID 9116828.
De Waard M, Liu H, Walker D, Scott VE, Gurnett CA, Campbell KP (leden 1997). "Přímá vazba komplexu G-protein betagamma na napěťově závislé vápníkové kanály". Příroda. 385 (6615): 446–50. doi:10.1038 / 385446a0. PMID 9009193. S2CID 4287544.
Qin N, Platano D, Olcese R, Stefani E, Birnbaumer L (srpen 1997). „Přímá interakce gbetagammy s C-koncovou doménou vázající gbetagammu podjednotky alfa1 kanálu Ca2 + je zodpovědná za inhibici kanálu receptory spojenými s G proteinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (16): 8866–71. doi:10.1073 / pnas.94.16.8866. PMC 23172. PMID 9238069.
Riess O, Schöls L, Bottger H, Nolte D, Vieira-Saecker AM, Schimming C a kol. (Srpen 1997). „SCA6 je způsoben mírnou expanzí CAG v genu vápníkového kanálu závislého na alfa1A napětí“. Lidská molekulární genetika. 6 (8): 1289–93. doi:10,1093 / hmg / 6.8.1289. PMID 9259275.
Jodice C, Mantuano E, Veneziano L, Trettel F, Sabbadini G, Calandriello L a kol. (Říjen 1997). „Epizodická ataxie typu 2 (EA2) a spinocerebelární ataxie typu 6 (SCA6) v důsledku expanze CAG opakování v genu CACNA1A na chromozomu 19p“. Lidská molekulární genetika. 6 (11): 1973–8. doi:10,1093 / hmg / 6.11.1973. PMID 9302278.
Charvin N, L'evêque C, Walker D, Berton F, Raymond C, Kataoka M a kol. (Srpen 1997). „Přímá interakce synaptotagminu proteinu senzoru vápníku s cytoplazmatickou doménou podjednotky alfa1A vápníkového kanálu typu P / Q“. Časopis EMBO. 16 (15): 4591–6. doi:10.1093 / emboj / 16.15.4591. PMC 1170085. PMID 9303303.
Ishikawa K, Tanaka H, Saito M, Ohkoshi N, Fujita T, Yoshizawa K a kol. (Srpen 1997). „Japonské rodiny s autosomálně dominantní čistou cerebelární ataxií mapují chromozom 19p13.1-p13.2 a jsou silně spojeny s mírnými expanzemi CAG v genu pro spinocerebelární ataxii typu 6 v chromozomu 19p13.1“. American Journal of Human Genetics. 61 (2): 336–46. doi:10.1086/514867. PMC 1715894. PMID 9311738.
Walker D, Bichet D, Campbell KP, De Waard M (leden 1998). „Místo interakce specifické pro izoformu beta 4 v karboxylové koncové oblasti napěťově závislé podjednotky kanálu alfa 2A alfa 1A“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2361–7. doi:10.1074 / jbc.273.4.2361. PMID 9442082.
Yue Q, Jen JC, Thwe MM, Nelson SF, Baloh RW (květen 1998). „De novo mutace v CACNA1A způsobila epizazickou ataxii reagující na acetazolamid“. American Journal of Medical Genetics. 77 (4): 298–301. doi:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19980526) 77: 4 <298 :: AID-AJMG9> 3.0.CO; 2-J. PMID 9600739.
Hans M, Urrutia A, Deal C, Brust PF, Stauderman K, Ellis SB a kol. (Březen 1999). „Strukturní prvky v doméně IV, které ovlivňují biofyzikální a farmakologické vlastnosti lidských vysokonapěťových vápníkových kanálů obsahujících alfa1A“. Biofyzikální deník. 76 (3): 1384–400. doi:10.1016 / S0006-3495 (99) 77300-5. PMC 1300117. PMID 10049321.
Walker D, Bichet D, Geib S, Mori E, Cornet V, Snutch TP a kol. (Duben 1999). „Nová interakce specifická pro podtyp beta v podjednotce alfa1A řídí aktivaci kanálu Ca2 + typu P / Q“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12383–90. doi:10.1074 / jbc.274.18.12383. PMID 10212211.

Další čtení

Jen JC (květen 2015). „Familiární hemiplegická migréna“. V publikaci Pagon RA, Bird TD, Dolan CR a kol. (eds.). GeneReviews [Internet]. Seattle WA: University of Washington, Seattle. NBK1388. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Spacey S (prosinec 2011). Epizodická ataxie typu 2. NBK1501. v GeneReviews
Gomez CM (červenec 2013). Spinocerebelární ataxie typu 6. NBK1140. v GeneReviews

CACNA1A + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000141837 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034656 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Papandreou A, Danti FR, Spaull R, Leuzzi V, Mctague A, Kurian MA (únor 2020). "Rozšiřující se spektrum pohybových poruch u genetických epilepsií". Vývojová medicína a dětská neurologie. 62 (2): 178–191. doi:10.1111 / dmcn.14407. PMID 31784983. S2CID 208498567.

[6] „Entrez Gene: CACNA1A vápenatý kanál, závislý na napětí, typ P / Q, podjednotka alfa 1A“.

[pmid9442082-7] Walker D, Bichet D, Campbell KP, De Waard M (leden 1998). „Místo interakce specifické pro izoformu beta 4 v karboxylové koncové oblasti napěťově závislé podjednotky kanálu alfa 2A alfa 1A“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2361–7. doi:10.1074 / jbc.273.4.2361. PMID 9442082.

[pmid10212211-8] Walker D, Bichet D, Geib S, Mori E, Cornet V, Snutch TP a kol. (Duben 1999). „Nová interakce specifická pro podtyp beta v podjednotce alfa1A řídí aktivaci kanálu Ca2 + typu P / Q“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12383–90. doi:10.1074 / jbc.274.18.12383. PMID 10212211.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]