CLIC4 - CLIC4

CLIC4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2AHE, 2D2Z, 3OQS
Identifikátory
Aliasy	CLIC4, CLIC4L, H1, MTCLIC, huH1, p64H1, chloridový intracelulární kanál 4
Externí ID	OMIM: 606536 MGI: 1352754 HomoloGene: 8490 Genové karty: CLIC4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	24,844,321 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	135,272,814 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita glutathiontransferázy; • aktivita chloridového kanálu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • cytosol; • centrosome; • membrána; • mezibuněčné spojení; • jaderná matice; • mikrotubulární cytoskelet; • buněčná membrána; • apikální část buňky; • intracelulární; • komplex chloridových kanálů; • organizační centrum mikrotubulů; • mikrovilli; • povrch buňky; • buněčné spojení; • střední část těla; • mitochondrie; • aktinový cytoskelet; • perinukleární oblast cytoplazmy; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro;
Biologický proces	• buněčná odpověď na iont vápníku; • diferenciace buněk; • růst mnohobuněčných organismů; • regulace iontového transmembránového transportu; • morfogeneze endotelových buněk; • iontový transport; • diferenciace keratinocytů; • vakuolární okyselování; • negativní regulace buněčné migrace; • oplodnění; • vytvoření nebo zachování polarity apikálních / bazálních buněk; • transport chloridů; • rozvětvená morfogeneze epiteliální trubice; • morfogeneze vaskulatury sítnice v oku kamerového typu; • regulace organizace cytoskeletu; • angiogeneze; • glutathionový metabolický proces; • chloridový transmembránový transport; • doprava; • iontový transmembránový transport;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25932
	29876
	ENSG00000169504
	ENSMUSG00000037242
	Q9Y696
	Q9QYB1
	NM_013943
	NM_013885
	NP_039234
	NP_038913
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chloridový intracelulární kanál 4, také známý jako CLIC4, je eukaryot gen.^[5]

Chloridové kanály jsou různorodá skupina proteinů, které regulují základní buněčné procesy včetně stabilizace potenciálu buněčné membrány, transepiteliálního transportu, údržby intracelulární pH a regulace objemu buněk. Chloridový intracelulární kanál 4 (CLIC4) protein, kódovaný genem CLIC4, je členem rodiny p64; gen je exprimován v mnoha tkáních a vykazuje intracelulární vezikulární vzor v PANC-1 buňky (buňky rakoviny pankreatu).^[5]

Závazní partneři

CLIC4 se váže na dynamin Já, α-tubulin, β-aktin, kreatinkináza a dvě izoformy 14-3-3.^[6]

Viz také

Chloridový kanál

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169504 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037242 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CLIC4 chlorid intracelulární kanál 4".
^ Suginta W, Karoulias N, Aitken A, Ashley RH (říjen 2001). „Chloridový protein intracelulárního kanálu CLIC4 (p64H1) se váže přímo na mozkový dynamin I v komplexu obsahujícím aktin, tubulin a izoformy 14-3-3“. Biochem. J. 359 (Pt1): 55–64. doi:10.1042/0264-6021:3590055. PMC 1222121. PMID 11563969.

Další čtení

Berryman M, Bretscher A (2000). „Identifikace nového člena rodiny chloridových intracelulárních genů (CLIC5), která souvisí s aktinovým cytoskeletem placentárních mikroklků“. Mol. Biol. Buňka. 11 (5): 1509–21. doi:10,1091 / mbc. 11.5.1509. PMC 14863. PMID 10793131.
Berryman MA, Goldenring JR (2004). „CLIC4 je obohacen na spojích buňka-buňka a kolokalizuje s AKAP350 v centrosomu a midbody kultivovaných savčích buněk“. Cell Motil. Cytoskelet. 56 (3): 159–72. doi:10,1002 / cm. 10141. PMID 14569596.
Bohman S, Matsumoto T, Suh K a kol. (2006). „Proteomická analýza diferenciace endoteliálních buněk indukovaná vaskulárním endoteliálním růstovým faktorem odhaluje roli chloridového intracelulárního kanálu 4 (CLIC4) v tubulární morfogenezi“. J. Biol. Chem. 280 (51): 42397–404. doi:10,1074 / jbc.M506724200. PMID 16239224.
Chuang JZ, Milner TA, Zhu M, Sung CH (1999). „Nitrobuněčný chloridový kanál p64H1 s 29 kDa je spojen s velkými vezikuly s hustým jádrem v hipokampálních neuronech potkanů“. J. Neurosci. 19 (8): 2919–28. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-08-02919.1999. PMID 10191309.
Duncan RR, Westwood PK, Boyd A, Ashley RH (1997). „Mozek potkana p64H1, exprese nového člena rodiny proteinů chloridového kanálu p64 v endoplazmatickém retikulu“. J. Biol. Chem. 272 (38): 23880–6. doi:10.1074 / jbc.272.38.23880. PMID 9295337.
Edwards JC (1999). „Nová Cl. Související s p64⁻ kanál: subcelulární distribuce a specifická exprese nefronového segmentu ". Dopoledne. J. Physiol. 276 (3 Pt 2): F398–408. doi:10.1152 / ajprenal.1999.276.3.F398. PMID 10070163.
Qian Z, Okuhara D, Abe MK, Rosner MR (1999). "Molekulární klonování a charakterizace mitogenem aktivovaného proteinkinázy asociovaného intracelulárního chloridového kanálu". J. Biol. Chem. 274 (3): 1621–7. doi:10.1074 / jbc.274.3.1621. PMID 9880541.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Rønnov-Jessen L, Villadsen R, Edwards JC, Petersen OW (2002). „Diferenciální exprese genu chloridu v nitrobuněčném kanálu, CLIC4, při přeměně fibroblastů na myofibroblasty zprostředkovanou růstovým faktorem β1“. Dopoledne. J. Pathol. 161 (2): 471–80. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 64203-4. PMC 1850723. PMID 12163372.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Shiio Y, Suh KS, Lee H a kol. (2006). „Kvantitativní proteomická analýza mycem indukované apoptózy: přímá role pro Myc indukci mitochondriálního chloridového iontového kanálu, mtCLIC / CLIC4“. J. Biol. Chem. 281 (5): 2750–6. doi:10,1074 / jbc.M509349200. PMID 16316993.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Singh H, Ashley RH (2007). „CLIC4 (p64H1) a jeho domnělá transmembránová doména tvoří špatně selektivní, redoxem regulované iontové kanály“. Mol. Membr. Biol. 24 (1): 41–52. doi:10.1080/09687860600927907. PMID 17453412.
Singh H, Cousin MA, Ashley RH (2007). „Funkční rekonstituce savčích„ chloridových intracelulárních kanálů “CLIC1, CLIC4 a CLIC5 odhaluje rozdílnou regulaci cytoskeletálním aktinem“. FEBS J. 274 (24): 6306–6316. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.06145.x. PMID 18028448.
Singh H (2010). „Dvě desetiletí s nitrobuněčnými kanály dimorfního chloridu (CLIC)“. FEBS Dopisy. 584 (10): 2112–21. doi:10.1016 / j.febslet.2010.03.013. PMID 20226783.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Suginta W, Karoulias N, Aitken A, Ashley RH (2003). „Chloridový protein intracelulárního kanálu CLIC4 (p64H1) se váže přímo na mozkový dynamin I v komplexu obsahujícím aktin, tubulin a izoformy 14-3-3“. Biochem. J. 359 (Pt 1): 55–64. doi:10.1042/0264-6021:3590055. PMC 1222121. PMID 11563969.
Valenzuela SM, Martin DK, Por SB a kol. (1997). "Molekulární klonování a exprese chloridového iontového kanálu buněčných jader". J. Biol. Chem. 272 (19): 12575–82. doi:10.1074 / jbc.272.19.12575. PMID 9139710.
Wick M, Bürger C, Brüsselbach S, et al. (1994). "Identifikace sérem indukovatelných genů: různé vzorce regulace genů během progrese G0 -> S a G1 -> S". J. Cell Sci. 107 (1): 227–39. PMID 8175911.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

externí odkazy

CLIC4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CLIC4 umístění genomu a CLIC4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169504 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037242 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: CLIC4 chlorid intracelulární kanál 4".

[pmid11563969-6] Suginta W, Karoulias N, Aitken A, Ashley RH (říjen 2001). „Chloridový protein intracelulárního kanálu CLIC4 (p64H1) se váže přímo na mozkový dynamin I v komplexu obsahujícím aktin, tubulin a izoformy 14-3-3“. Biochem. J. 359 (Pt1): 55–64. doi:10.1042/0264-6021:3590055. PMC 1222121. PMID 11563969.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]