Průvodce farmakologií - Guide to Pharmacology

Průvodce IUPHAR / BPS FARMAKOLOGIE
Průvodce logem PHARMACOLOGY long.jpg
Obsah
PopisOnline portál s otevřeným přístupem k farmakologickým informacím o všech lidských cílech léků na předpis
Typy dat
zajat		Cílová nomenklatura, farmakologické údaje, struktury ligandů
OrganismyČlověk, myš, krysa
Kontakt
Výzkumné centrumUniversity of Edinburgh, UK
Primární citacePrůvodce IUPHAR / BPS k FARMAKOLOGII v roce 2020: rozšíření obsahu imunofarmakologie a zavedení Průvodce IUPHAR / MMV k FARMAKOLOGII MALARIE [1]
Přístup
webová stránkawww.guidetofarmakologie.org
webová služba URLwww.guidetofarmakologie.org/webové služby.jsp
Sparql koncový bodrdf.guidetofarmakologie.org/ sparql
Smíšený
Správa verzíObsah aktualizovaný přibližně čtvrtletně (tj. 2020.2 označuje [rok]. [Číslo vydání])
Kurátorská politikaManuální, interní

The Průvodce IUPHAR / BPS FARMAKOLOGIE je otevřený přístup funguje jako portál s informacemi o biologických cílech licencovaných léků a dalších malých molekul. Příručka k FARMAKOLOGII (se standardní zkratkou GtoPdb) je vyvinut jako společný podnik mezi Mezinárodní unie základní a klinické farmakologie (IUPHAR) a Britská farmakologická společnost (BPS). Toto nahrazuje a rozšiřuje původní databázi IUPHAR z roku 2009 (standardní zkratka IUPHAR-DB). Příručka k FARMAKOLOGII si klade za cíl poskytnout stručný přehled všech farmakologických cílů přístupných všem členům vědecké a klinické komunity a zainteresované veřejnosti s odkazy na podrobnosti o vybraném souboru cílů. Mezi uváděné informace patří farmakologické údaje, cílová a genová nomenklatura a také chemické informace o ligandech. Zahrnuty jsou přehledy a komentáře ke každé cílové rodině s odkazy na klíčové reference.

Pozadí a vývoj

Příručka k FARMAKOLOGII byla původně zpřístupněna online v prosinci 2011 a další materiál byl vydán v červenci 2012. Příručku k FARMAKOLOGII, kterou udržuje tým kurátorů z University of Edinburgh, je vytvořena mezinárodní sítí přispěvatelů, včetně redaktorů the Stručný průvodce farmakologií. Stejně jako u původního IUPHAR-DB působí jako vědecká poradní a redakční rada pro databázi Výbor pro klasifikaci receptorů a klasifikaci léčiv (IUPHAR) Mezinárodní unie pro základní a klinickou farmakologii. Jeho síť více než 500 odborných poradců (organizovaných do ~ 90 podvýborů) přispívá odbornými znalostmi a údaji. Současným držitelem PI a Grantu projektu GtoPdb je Prof. Jamie A. Davies. Vývoj a vydání první verze GtoPdb v roce 2012 byly popsány v úvodníku publikovaném v British Journal of Pharmacology s názvem „Průvodce po farmakologii.org - aktualizace“.[2] IUPHAR-DB se již nevyvíjí a všechny informace obsažené na tomto webu jsou nyní k dispozici v Průvodci FARMAKOLOGIÍ (odkazy IUPHAR-DB by nyní měly být přesměrovány).

Obsah a funkce

Cílové skupiny, které jsou v současné době zahrnuty v příručce k farmakologii, jsou:

Informace o každé cílové skupině jsou dále rozděleny do rodin na základě klasifikace se samostatnou datovou stránkou pro každou rodinu. Na každé stránce jsou cíle uspořádány do seznamů tabulek, přičemž každá tabulka obsahuje proteinovou a genovou nomenklaturu pro cíl s odkazy na databáze genové nomenklatury a seznam vybraných ligandů s aktivitou na cíli, včetně agonistů, antagonistů, inhibitorů a radioligandů. Jsou uvedeny farmakologické údaje a odkazy a každý ligand je hypertextově propojen se stránkou ligandu se zobrazením nomenklatury a chemické struktury nebo peptidové sekvence spolu se synonymy a příslušnými databázovými odkazy. Průvodce po farmakologii také obsahuje seznam všech molekul ligandu zahrnutých na webu, dále rozdělených do kategorií včetně malých organických molekul (včetně savčích metabolity, hormony a neurotransmitery ), syntetické organické molekuly, přírodní produkty, peptidy, anorganické molekuly a protilátky. Úplný seznam všech schválených léků obsažených na webových stránkách je také k dispozici prostřednictvím seznamu ligandů. Příručka k FARMAKOLOGII se kromě vzdělávacích zdrojů rozšiřuje o klinické informace o cílech a ligandech. Mezi funkce vyhledávání na webu patří rychlé a pokročilé možnosti vyhledávání a vyhledávání receptorů a ligandů, včetně podpory struktur ligandů využívajících chemické struktury. Mezi další funkce patří novinky „Hot topic“ a nedávný seznam párování receptor-ligand.

Průvodce IUPHAR IMMUNOPHARMACOLOGY

V období od listopadu 2015 do října 2018 Wellcome Trust podpořila projekt rozvoje Průvodce IUPHAR IMMUNOPHARMACOLOGY (GtoImmuPdb), založený na schématu GtoPdb. GtoImmuPdb je zdroj s otevřeným přístupem, který přináší imunologickou perspektivu k vysoce kvalitním, odborně upraveným farmakologickým datům obsaženým ve stávající příručce IUPHAR / BPS Guide to PHARMACOLOGY. Proteinové cíle a ligandy relevantní pro imunofarmakologii byly označeny a kurátorovány na GtoImmuPdb. Ty byly také spojeny s novými typy imunologických dat, jako jsou imunologické procesy, typy buněk a nemoci. GtoImmuPdb poskytuje znalostní databázi, která spojuje imunologii s farmakologií, přináší přidanou hodnotu a podporuje výzkum a vývoj léků zaměřených na modulaci imunitních, zánětlivých nebo infekčních složek onemocnění.[3]

Stručný průvodce farmakologií

Příručka k FARMAKOLOGII obsahuje online verzi databáze s otevřeným přístupem Stručný průvodce farmakologií, dříve „Průvodce receptory a kanály“[4] k dispozici v HTML, PDF a tištěných formátech. Tištěné shrnutí online databáze je zveřejněno jako Stručný průvodce farmakologií 2017/2018 [5] jako série příspěvků jako dvouletý dodatek k British Journal of Pharmacology.

Odkazy na databáze

Příručka k FARMAKOLOGII obsahuje odkazy na další relevantní zdroje prostřednictvím cílových a ligandových stránek na stručných i podrobných stránkách. Mnoho z těchto zdrojů udržuje vzájemné vazby s příslušnými stránkami Průvodce po FARMAKOLOGII.

Budoucí pokyny

Po financování z Wellcome Trust V letech 2012 až 2015 byl Průvodce po farmakologii rozšířen o biologické cíle všech léků na předpis a další pravděpodobné cíle budoucích léků s malou molekulou. Na stránkách souhrnného zobrazení jsou k dispozici přehledy klíčových funkcí široké škály cílů, přičemž stránky s podrobným zobrazením poskytují podrobnější informace o vlastnostech vybrané podskupiny cílů. Od ledna 2018 Léky na malárii podporuje nové rozšíření pro vývoj Průvodce farmakologií malárie. Jádro GtoPdb nadále podporuje Britská farmakologická společnost.

Viz také

Reference

  1. ^ Armstrong, JF; Faccenda, E; Harding, SD; Pawson, AJ; Southan, C; Sharman, JL; Campo, B; Cavanagh, DR; Alexander, SPH; Davenport, AP; Spedding, M; Davies, JA (8. ledna 2020). „Průvodce IUPHAR / BPS k FARMAKOLOGII v roce 2020: rozšíření obsahu imunofarmakologie a zavedení Průvodce IUPHAR / MMV k MALARIA PHARMACOLOGY“. Výzkum nukleových kyselin. 48 (D1): D1006 – D1021. doi:10.1093 / nar / gkz951. PMC  7145572. PMID  31691834.
  2. ^ Alexander, S. P .; Benson, H. E.; Davenport, A .; Mathie, A .; McGrath, I. J .; Pawson, A. J .; Peters, J. A .; Sharman, J.L .; Spedding, M .; Harmar, A. J. (2012). „GuideToPharmacology.org - aktualizace“. British Journal of Pharmacology. 167 (4): 697–698. doi:10.1111 / j.1476-5381.2012.02141.x. PMC  3575771. PMID  23003568.
  3. ^ Harding, SD; Faccenda, E; Southan, C; Maffia, P; Davies, JA (prosinec 2018). "Nový průvodce imunofarmakologií". Recenze přírody. Imunologie. 18 (12): 729. doi:10.1038 / s41577-018-0079-2. PMID  30327546.
  4. ^ Alexander, SP; Mathie, A; Peters, JA (listopad 2011). „Průvodce receptory a kanály (GRAC), 5. vydání“. British Journal of Pharmacology. 164 Suppl 1: S1–324. doi:10.1111 / j.1476-5381.2011.01649_1.x. PMC  3315626. PMID  22040146.
  5. ^ Alexander, SP; Kelly, E; Marrion, NV; Peters, JA; Faccenda, E; Harding, SD; Pawson, AJ; Sharman, JL; Southan, C; Buneman, OP; Cidlowski, JA; Christopoulos, A; Davenport, AP; Fabbro, D; Spedding, M; Striessnig, J; Davies, JA; CGTP, spolupracovníci. (Prosinec 2017). „SPRÁVCE KONCISE K FARMAKOLOGII 2017/18: Přehled“. British Journal of Pharmacology. 174 Suppl 1: S1 – S16. doi:10.1111 / bph.13882. PMC  5650665. PMID  29055037.

externí odkazy