KCNIP1 - KCNIP1

KCNIP1

Protein KCNIP1 PDB 1s1e.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1S1E, 2I2R, 2NZ0

Identifikátory

KCNIP1, KCHIP1, VABP, draslík napěťově řízený kanál interagující protein 1

Externí ID

OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 Genové karty: KCNIP1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 5 (lidský)^[1]

Kapela	5q35.1	Start	170,353,487 bp^[1]
Kapela	5q35.1	Konec	170,736,632 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 11 (myš)^[2]

Kapela	11 \| 11 A4	Start	33,629,339 bp^[2]
Kapela	11 \| 11 A4	Konec	33,993,152 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku • aktivita regulátoru draslíkového kanálu • aktivita draslíkového kanálu • GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba kovových iontů • napěťově řízená aktivita iontového kanálu
Buněčná složka	• cytoplazma • vnější složka cytoplazmatické strany plazmatické membrány • komplex draslíkových kanálů s napětím • buněčná membrána • buněčná projekce • dendrit • membrána
Biologický proces	• transport iontů draslíku • regulace iontového transmembránového transportu • iontový transport • regulace transmembránového transportu iontů draslíku • transmembránový transport draselných iontů • srdeční vedení
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


30820


70357


ENSG00000182132


ENSMUSG00000053519


Q9NZI2


Q9JJ57

RefSeq (mRNA)


NM_001034837 NM_001034838 NM_001278339 NM_001278340 NM_014592


NM_001190885 NM_001190886 NM_001290690 NM_027398 NM_001363115

RefSeq (protein)


NP_001030009 NP_001030010 NP_001265268 NP_001265269 NP_055407


NP_001177814 NP_001177815 NP_001277619 NP_081674 NP_001350044

Místo (UCSC)

Chr 5: 170,35 - 170,74 Mb

Chr 11: 33,63 - 33,99 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

K._proti protein interagující s kanálem 1 také známý jako KChIP1 je protein že u lidí je kódován KCNIP1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny draslíku řízeného napětím (K._proti ) proteiny interagující s kanály (KCNIP, také často nazývané „KChIP“), které patří do zotavit se pobočka EF ruka nadčeleď.^[7] Členy rodiny KCNIP jsou malé proteiny vázající vápník. Všechny mají doménu podobnou EF a liší se od sebe v N-konec. Jsou nedílnou součástí podjednotky nativního K._proti4 kanálové komplexy. Mohou regulovat proudy typu A, a tím i neuronální excitabilitu, v reakci na změny intracelulárního vápníku. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[6]

Viz také

Napěťově řízený draslíkový kanál

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182132 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000053519 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ WF, Bowlby MR, Betty M, Cao J, Ling HP, Mendoza G, Hinson JW, Mattsson KI, Strassle BW, Trimmer JS, Rhodes KJ (únor 2000). "Modulace draslíkových kanálů typu A rodinou senzorů vápníku". Příroda. 403 (6769): 553–556. Bibcode:2000Natur.403..553A. doi:10.1038/35000592. PMID 10676964. S2CID 4419472.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KCNIP1 Kv kanál interagující s proteinem 1“.
^ Burgoyne RD (2007). „Neuronální vápníkové senzorové proteiny: generování diverzity v neuronální Ca2 + signalizaci“. Nat. Rev. Neurosci. 8 (3): 182–193. doi:10.1038 / nrn2093. PMC 1887812. PMID 17311005.

Další čtení

Bähring R, Dannenberg J, Peters HC a kol. (2001). "Zachovaná Kv4 N-terminální doména kritická pro účinky proteinu 2.2 ovlivňujícího Kv kanál na expresi kanálu a hradlování". J. Biol. Chem. 276 (26): 23888–23894. doi:10,1074 / jbc.M101320200. PMID 11287421.
Nakamura TY, Nandi S, Pountney DJ a kol. (2001). "Různé účinky proteinu vázajícího Ca (2 +), KChIP1, na dva členy podrodiny Kv4, Kv4.1 a Kv4.2". FEBS Lett. 499 (3): 205–209. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02560-1. PMID 11423117. S2CID 23908034.
Kutsenko AS, Gizatullin RZ, Al-Amin AN a kol. (2002). „NotI lemující sekvence: nástroj pro objev genů a ověření lidského genomu“. Nucleic Acids Res. 30 (14): 3163–3170. doi:10.1093 / nar / gkf428. PMC 135748. PMID 12136098.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Shibata R, Misonou H, Campomanes CR a kol. (2003). „Zásadní role KChIP při určování molekulárních vlastností a přenosu draslíkových kanálů Kv4.2“. J. Biol. Chem. 278 (38): 36445–36454. doi:10,1074 / jbc.M306142200. PMID 12829703.
Van Hoorick D, Raes A, Keysers W a kol. (2004). "Diferenciální modulace kinetiky Kv4 variantami sestřihu KCHIP1". Mol. Buňka. Neurosci. 24 (2): 357–366. doi:10.1016 / S1044-7431 (03) 00174-X. PMID 14572458. S2CID 40647616.
Scannevin RH, Wang K, Jow F a kol. (2004). "Dvě N-koncové domény Kv4 K (+) kanálů regulují vazbu na a modulaci pomocí KChIP1". Neuron. 41 (4): 587–598. doi:10.1016 / S0896-6273 (04) 00049-2. PMID 14980207. S2CID 17380435.
Lin YL, Lin SR, Wu TT, Chang LS (2004). "Důkazy ukazující intermolekulární interakci mezi proteiny KChIP a kardiotoxiny z kobry z Tchaj-wanu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 319 (3): 720–724. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.05.064. PMID 15184042.
Lin YL, Chen CY, Cheng CP, Chang LS (2004). "Interakce proteinů a proteinů KChIP proteinů a Kv4.2". Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (3): 606–610. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.006. PMID 15358149.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Pruunsild P, Timmusk T (2005). "Struktura, alternativní sestřih a exprese lidské a myší genové rodiny KCNIP". Genomika. 86 (5): 581–593. doi:10.1016 / j.ygeno.2005.07.001. PMID 16112838.
Pioletti M, Findeisen F, Hura GL, Minor DL (2007). „Trojrozměrná struktura komplexu KChIP1-Kv4.3 T1 odhaluje oktamer ve tvaru kříže“. Nat. Struct. Mol. Biol. 13 (11): 987–995. doi:10.1038 / nsmb1164. PMC 3018330. PMID 17057713.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
Hasdemir B, Fitzgerald DJ, Prior IA, Tepikin AV, Burgoyne RD (2005). „Provoz kanálů Kv4 K + zprostředkovaných KChIP1 probíhá prostřednictvím nové vezikulární dráhy po ER“. J. Cell Biol. 171 (3): 459–469. doi:10.1083 / jcb.200506005. PMC 2171252. PMID 16260497.
Venn N, Haynes LP, Burgoyne RD (2008). „Specifické účinky KChIP3 / kalsenilin / DREAM, ale nikoli KChIPs1, 2 a 4 na signalizaci vápníku a regulovanou sekreci v buňkách PC12“. Biochem. J. 413 (1): 71–80. doi:10.1042 / BJ20080441. PMC 2474559. PMID 18393943.

externí odkazy

KCNIP1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Galerie PDB
1s1e: Krystalová struktura proteinu interagujícího s Kv kanálem 1 (KChIP-1) 1s6c: Krystalová struktura komplexu mezi KChIP1 a Kv4.2 N1-30 2i2r: Krystalová struktura komplexu KChIP1 / Kv4.3 T1 2nz0: Krystalová struktura draslíkového kanálu Kv4.3 v komplexu s jeho regulační podjednotkou KChIP1 (CASP Target)

Membránový transportní protein: iontové kanály (TC 1A )

Ca.²⁺: Vápníkový kanál

Ligandové brány	Inositol trisfosfátový receptor 1 2 3 Ryanodinový receptor 1 2 3
Napěťově řízené	Typ L. /Ca._protiα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-typ /Ca._protiα2.2 Typ P. /Ca._protiα 2.1 Q-typ /Ca._protiα2.1 Typ R. /Ca._protiα2.3 T-typ /Ca._protiα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-podjednotky 1 2 β-podjednotky β1 β2 β3 β4 y-podjednotky γ1 γ2 y3 y4 Kationtové kanály spermií 1 2 3 4 Kanál se dvěma póry 1 2

Na⁺: Sodný kanál

Konstitutivně aktivní	Epitelový sodíkový kanál α β y δ
Proton - bránou	Kanál kationů citlivý na amilorid 1 2 3 4
Napěťově řízené	Na_protiα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_protiβ 1 2 3 4

K.⁺: Draselný kanál

Aktivováno vápníkem	BK kanál α1 β1 β2 β3 β4 SK kanál SK1 SK2 SK3 IK kanál IK1 K._Ca. 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1
Vnitřní usměrňovač	K._ATP K._ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 DÍVKA /K._ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K._ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1
Doména tandemových pórů	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18
Napěťově řízené	K._protiα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K._protiα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11,1 / hERG 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K._protiβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK / ISK podobné minK / ISK MiRP 1 2 3 Třepačka (gen)

Smíšený

Cl⁻: Chloridový kanál	Chloridové kanály aktivované vápníkem Anoctamin ANO1 Bestrophin 1 2 Chloridový kanál příslušenství 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B
H⁺: Protonový kanál	HVCN1
M⁺: Kanál kationů CNG	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4
M⁺: Kanál kationů TRP	TRPA (1 ) TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6
H₂Ó (+ rozpuštěné látky ): Porin	Aquaporin 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Aniontový kanál závislý na napětí 1 2 3 Obecná rodina bakteriálních porinů
Cytoplazma: Spojení mezer	Connexin A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Innexin

Vratovým mechanismem

Třída iontového kanálu	Ligandové brány Světlo bránou Napěťově řízené Stretch aktivován

viz také poruchy

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.