KCNAB2 - KCNAB2

KCNAB2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ZSX
Identifikátory
Aliasy	KCNAB2, AKR6A5, HKvbeta2, HKvbeta2.1, HKvbeta2.2, KCNA2B, KV-BETA-2, podrodina kanálu s draslíkovým napětím A regulační beta podjednotka 2
Externí ID	OMIM: 601142 MGI: 109239 HomoloGene: 56492 Genové karty: KCNAB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	6,101,193 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	152,477,910 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita aldo-keto reduktázy (NADP); • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • aktivita regulátoru draslíkového kanálu; • napěťově řízená aktivita draslíkového kanálu; • aktivita oxidoreduktázy;
Buněčná složka	• axonový konec; • cytoplazma; • integrální součást membrány; • cytosol; • buněčná projekce; • membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • vnější složka cytoplazmatické strany plazmatické membrány; • komplex draslíkových kanálů s napětím; • buněčná membrána; • synapse; • axon; • buněčné spojení; • pinceau vlákno; • neuronová projekce; • mikrotubuly; • cytoskelet; • juxtaparanode oblast axonu; • specifická granulovaná membrána; • membrána terciární granule;
Biologický proces	• Oxidace NADPH; • regulace lokalizace proteinu na buněčný povrch; • regulace iontového transmembránového transportu; • iontový transport; • transport iontů draslíku; • neuromuskulární proces; • diferenciace hematopoetických progenitorových buněk; • transmembránový transport draselných iontů; • oxidačně-redukční proces; • regulace transmembránového transportu iontů draslíku; • degranulace neutrofilů; • iontový transmembránový transport;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8514
	16498
	ENSG00000069424
	ENSMUSG00000028931
	Q13303
	P62482
NM_001199860; NM_001199861; NM_001199862; NM_001199863; NM_003636;
	NM_172130
NM_001252654; NM_001252655; NM_001252656; NM_010598; NM_001355172;
	NM_001355173
NP_001186789; NP_001186790; NP_001186791; NP_001186792; NP_003627;
	NP_742128; NP_001186789.1; NP_001186790.1; NP_003627.1
NP_001239583; NP_001239584; NP_001239585; NP_034728; NP_001342101;
	NP_001342102
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Napěťově řízená podjednotka draslíkového kanálu beta-2 je protein že u lidí je kódován KCNAB2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Napěťově řízené draselné (Kv) kanály představují nejsložitější třídu napěťově řízených iontových kanálů z funkčního i strukturálního hlediska. Mezi jejich různé funkce patří regulace uvolňování neurotransmiterů, srdeční frekvence, sekrece inzulínu, neuronální excitabilita, transport elektrolytu epitelu, kontrakce hladkého svalstva a objem buněk. V Drosophile byly identifikovány čtyři geny draslíkových kanálů související se sekvencí - třepačka, shaw, shab a shal - a u každého bylo prokázáno, že má lidský homolog (y). Tento gen kóduje člena podrodiny draslíkového kanálu, napěťově řízenou a třepačku. Tento člen je jednou z beta podjednotek, což jsou pomocné proteiny asociované s funkčními podjednotkami Kv-alfa. Tento člen mění funkční vlastnosti produktu genu KCNA4. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím odlišné izoformy.^[6]

V melanocytických buňkách může být exprese genu KCNAB2 regulována pomocí MITF.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že KCNAB2 komunikovat s KCNA2.^[8]^[9]

Viz také

Napěťově řízený draslíkový kanál

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000069424 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028931 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schultz D, Litt M, Smith L, Thayer M, McCormack K (březen 1997). "Lokalizace dvou genů beta podjednotky draslíkového kanálu, KCNA1B a KCNA2B". Genomika. 31 (3): 389–91. doi:10.1006 / geno.1996.0065. PMID 8838324.
^ ^A ^b „Entrez Gene: KCNAB2 draslíkový napěťově řízený kanál, podrodina související s třepačkou, beta člen 2“.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971.
^ Coleman SK, Newcombe J, Pryke J, Dolly JO (srpen 1999). "Podjednotkové složení kanálů Kv1 v lidském CNS". J. Neurochem. 73 (2): 849–58. doi:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084.
^ Nakahira K, Shi G, Rhodes KJ, Trimmer JS (březen 1996). „Selektivní interakce napěťově řízených beta-podjednotek kanálu K + s alfa-podjednotkami“. J. Biol. Chem. 271 (12): 7084–9. doi:10.1074 / jbc.271.12.7084. PMID 8636142.

Další čtení

McCormack K, McCormack T, Tanouye M, Rudy B, Stühmer W (1995). "Alternativní sestřih lidského Shaker K + kanálu genu beta 1 a funkční exprese produktu genu beta 2". FEBS Lett. 370 (1–2): 32–6. doi:10.1016/0014-5793(95)00785-8. PMID 7649300.
McCormack T, McCormack K (1995). „Shaker K + podjednotky kanálu beta patří do nadrodiny oxidoreduktázy závislé na NAD (P) H“. Buňka. 79 (7): 1133–5. doi:10.1016/0092-8674(94)90004-3. PMID 8001150.
Nakahira K, Shi G, Rhodes KJ, Trimmer JS (1996). „Selektivní interakce napěťově řízených beta-podjednotek kanálu K + s alfa-podjednotkami“. J. Biol. Chem. 271 (12): 7084–9. doi:10.1074 / jbc.271.12.7084. PMID 8636142.
Kääb S, Dixon J, Duc J, Ashen D, Näbauer M, Beuckelmann DJ, Steinbeck G, McKinnon D, Tomaselli GF (1998). „Molekulární podstata přechodné downregulace proudu draslíku směrem ven u lidského srdečního selhání: pokles Kv4,3 mRNA koreluje se snížením hustoty proudu“. Oběh. 98 (14): 1383–93. doi:10.1161 / 01.cir.98.14.1383. PMID 9760292.
Coleman SK, Newcombe J, Pryke J, Dolly JO (1999). "Podjednotkové složení kanálů Kv1 v lidském CNS". J. Neurochem. 73 (2): 849–58. doi:10.1046 / j.1471-4159.1999.0730849.x. PMID 10428084.
Poliak S, Gollan L, Martinez R, Custer A, Einheber S, Salzer JL, Trimmer JS, Shrager P, Peles E (2000). „Caspr2, nový člen nadrodiny neurexinů, je lokalizován na juxtaparanodech myelinovaných axonů a sdružuje se s kanály K +“. Neuron. 24 (4): 1037–47. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 81049-1. PMID 10624965.
Croci C, Brändstatter JH, Enz R (2003). „ZIP3, nová sestřihová varianta rodiny proteinů interagujících s PKC-zeta, se váže na receptory GABAC, PKC-zeta a Kv beta 2“. J. Biol. Chem. 278 (8): 6128–35. doi:10,1074 / jbc.M205162200. PMID 12431995.
Gu C, Jan YN, Jan LY (2003). "Konzervovaná doména v axonálním cílení Kv1 (Shaker) napěťově řízených draslíkových kanálů". Věda. 301 (5633): 646–9. doi:10.1126 / science.1086998. PMID 12893943.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.