CLCA2 - CLCA2 - Wikipedia

CLCA2
Identifikátory
Aliasy	CLCA2, CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, příslušenství pro chloridový kanál 2
Externí ID	OMIM: 604003 MGI: 2139758 HomoloGene: 4765 Genové karty: CLCA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	86,456,553 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	145,099,443 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • aktivita peptidázy; • aktivita iontového kanálu řízená ligandem; • aktivita hydrolázy; • aktivita metalopeptidázy; • aktivita chloridového kanálu; • aktivita metaloendopeptidázy; • intracelulární aktivita vápníkem aktivovaného chloridového kanálu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární oblast; • buněčné spojení; • bazální plazmatická membrána; • buněčné jádro; • cytosol; • buněčná membrána; • ne membrána;
Biologický proces	• chloridový transmembránový transport; • iontový transport; • proteolýza; • buněčná adheze; • transport chloridů; • iontový transmembránový transport;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9635
	229933
	ENSG00000137975
	ENSMUSG00000036960
	Q9UQC9
	Q8BG22
	NM_006536
	NM_178697
	NP_006527
	NP_848812
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Příslušenství pro chloridový kanál 2 je protein že u lidí je kódován CLCA2 gen.^[5]

Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny proteinů vodivosti chloridů citlivých na vápník. K dnešnímu dni všichni členové této genové rodiny mapují na stejné místo na chromozomu 1p31-p22 a sdílejí vysoké stupně homologie ve velikosti, sekvenci a předpokládané struktuře, ale významně se liší v distribuci tkání. Protože je tento protein exprimován převážně v průdušnici a plicích, předpokládá se, že hraje roli v komplexní patogenezi cystické fibrózy. Může také sloužit jako adhezní molekula pro plicní metastatické rakovinné buňky, zprostředkující vaskulární zástavu a kolonizaci a dále se předpokládá, že působí jako tumor supresorový gen pro rakovinu prsu.^[5] Metody predikce proteinové struktury naznačují, že N-terminální oblastí proteinu CLCA2 je zinek metaloproteáza.^[6]

Viz také

Chloridový kanál

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137975 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036960 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CLCA2 chloridový kanál, aktivovaný vápník, člen rodiny 2“.
^ Pawłowski K, Lepistö M, Meinander N a kol. (2006). „Nová konzervovaná doména hydrolázy v rodině CLCA údajných chloridových kanálů aktivovaných vápníkem“. Proteiny. 63 (3): 424–39. doi:10,1002 / prot.20887. PMID 16470849.

Další čtení

Pauli BU, Abdel-Ghany M, Cheng HC a kol. (2001). "Molekulární charakteristiky a funkční rozmanitost členů rodiny CLCA". Clin. Exp. Pharmacol. Physiol. 27 (11): 901–5. doi:10.1046 / j.1440-1681.2000.03358.x. PMID 11071307.
Gruber AD, Schreur KD, Ji HL a kol. (1999). "Molekulární klonování a transmembránová struktura hCLCA2 z lidských plic, průdušnice a mléčné žlázy". Dopoledne. J. Physiol. 276 (6 Pt 1): C1261–70. PMID 10362588.
Agnel M, Vermat T, Culouscou JM (1999). "Identifikace tří nových členů rodiny vápník-závislých chloridových kanálů (CaCC) převážně exprimovaných v zažívacím traktu a průdušnici". FEBS Lett. 455 (3): 295–301. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00891-1. PMID 10437792.
Gruber AD, Pauli BU (1999). „Tumorigenicita lidského karcinomu prsu je spojena se ztrátou Ca²⁺-aktivovaný chloridový kanál CLCA2 ". Cancer Res. 59 (21): 5488–91. PMID 10554024.
Gruber AD, Pauli BU (1999). "Shlukování rodiny lidských genů CLCA na krátkém rameni chromozomu 1 (1p22-31)". Genom. 42 (5): 1030–2. doi:10.1139 / gen-42-5-1030. PMID 10584316.
Liu QH, Williams DA, McManus C a kol. (2000). „HIV-1 gp120 a chemokiny aktivují iontové kanály v primárních makrofázích prostřednictvím stimulace CCR5 a CXCR4“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (9): 4832–7. doi:10.1073 / pnas.090521697. PMC 18318. PMID 10758170.
Koegel H, Alzheimer C (2001). „Vyjádření a biologický význam Ca²⁺-aktivované iontové kanály v lidských keratinocytech ". FASEB J.. 15 (1): 145–154. doi:10.1096 / fj.00-0055com. PMID 11149902.
Itoh R, Kawamoto S, Miyamoto Y a kol. (2001). "Izolace a charakterizace Ca²⁺-aktivovaný chloridový kanál z lidského epitelu rohovky ". Curr. Eye Res. 21 (6): 918–25. doi:10,1076 / ceyr. 21.6.918.6983. PMID 11262615.
Abdel-Ghany M, Cheng HC, Elble RC, Pauli BU (2001). „Karcinom prsu beta 4 integrin a endoteliální lidský CLCA2 zprostředkovávají plicní metastázy“. J. Biol. Chem. 276 (27): 25438–46. doi:10,1074 / jbc.M100478200. PMID 11320086.
Abdel-Ghany M, Cheng HC, Elble RC, Pauli BU (2002). „Fokální adhezní kináza aktivovaná ligací beta (4) integrinu na mCLCA1 zprostředkovává časný metastatický růst“. J. Biol. Chem. 277 (37): 34391–400. doi:10,1074 / jbc.M205307200. PMID 12110680.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mall M, Gonska T, Thomas J a kol. (2003). "Modulace Ca²⁺-aktivovaná Cl⁻ sekrece bazolaterální K.⁺ kanály v epitelu dýchacích cest u lidí s normální a cystickou fibrózou ". Pediatr. Res. 53 (4): 608–18. doi:10.1203 / 01.PDR.0000057204.51420.DC. PMID 12612194.
Abdel-Ghany M, Cheng HC, Elble RC a kol. (2004). „Interagující vazebné domény beta (4) integrinu a vápníkem aktivovaných chloridových kanálů (CLCA) v metastázách“. J. Biol. Chem. 278 (49): 49406–16. doi:10,1074 / jbc.M309086200. PMID 14512419.
Connon CJ, Kawasaki S, Yamasaki K a kol. (2005). "Kvantifikace hCLCA2 a kolokalizace s integrinem beta4 ve stratifikovaných lidských epitelích". Acta Histochem. 106 (6): 421–5. doi:10.1016 / j.acthis.2004.08.003. PMID 15707651.
Connon CJ, Kawasaki S, Liles M a kol. (2006). "Genová exprese a imunolokalizace vápníkem aktivovaného chloridového kanálu během stratifikace kultivovaného a vyvíjejícího se epitelu rohovky". Cell Tissue Res. 323 (1): 177–82. doi:10.1007 / s00441-005-0059-2. PMID 16158324.
Elble RC, Walia V, Cheng HC a kol. (2006). „Předpokládaný chloridový kanál hCLCA2 má jediný C-koncový transmembránový segment“. J. Biol. Chem. 281 (40): 29448–54. doi:10,1074 / jbc.M605919200. PMID 16873362.

externí odkazy

CLCN1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CLCA2 umístění genomu a CLCA2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137975 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036960 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: CLCA2 chloridový kanál, aktivovaný vápník, člen rodiny 2“.

[pmid16470849-6] Pawłowski K, Lepistö M, Meinander N a kol. (2006). „Nová konzervovaná doména hydrolázy v rodině CLCA údajných chloridových kanálů aktivovaných vápníkem“. Proteiny. 63 (3): 424–39. doi:10,1002 / prot.20887. PMID 16470849.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]