KCNJ4 - KCNJ4

KCNJ4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3GJ9
Identifikátory
Aliasy	KCNJ4, HIR, HIRK2, HRK1, IRK-3, IRK3, Kir2.3, draselná napěťově řízená podskupina kanálu J, člen 4, draselná dovnitř usměrňující kanálová podrodina J, člen 4
Externí ID	OMIM: 600504 MGI: 104743 HomoloGene: 3653 Genové karty: KCNJ4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	38,455,199 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	79,505,241 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • Vazba domény PDZ; • aktivita draslíkového kanálu usměrňovače; • Aktivita vnitřního usměrňovače draslíkového kanálu aktivovaná G-proteinem;
Buněčná složka	• synapse; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • komplex draslíkových kanálů s napětím; • buněčné spojení; • integrální součást membrány; • membrána; • cytoplazmatický váček; • bazolaterální plazmatická membrána; • postsynaptická membrána; • buněčná membrána;
Biologický proces	• regulace iontového transmembránového transportu; • iontový transport; • transport iontů draslíku; • import iontů draslíku přes plazmatickou membránu; • srdeční vedení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3761
	16520
	ENSG00000168135
	ENSMUSG00000044216
	P48050
	P52189
	NM_152868; NM_004981
	NM_008427
	NP_004972; NP_690607
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kanál dovnitř usměrňující kanál, podčeleď J, člen 4, také známý jako KCNJ4 nebo K._ir2.3, je člověk gen.^[5]

Funkce

Je známo, že několik různých draslíkových kanálů je zapojeno do elektrické signalizace v nervovém systému. Jedna třída je aktivována depolarizací, zatímco druhá třída není. Posledně jmenované se označují jako dovnitř usměrňující kanály K + a mají větší tendenci umožňovat tok draslíku do buňky, nikoli z ní. Tato asymetrie vodivosti iontů draslíku hraje klíčovou roli v excitabilitě svalových buněk a neuronů. Protein kódovaný tímto genem je integrální membránový protein a člen rodiny draslíkových kanálů směřujících dovnitř. Kódovaný protein má ve srovnání s ostatními členy této proteinové rodiny malou jednotkovou vodivost. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že KCNJ4 komunikovat s:

SUD,^[6]^[7]
DLG1^[6]^[7]^[8]
DLG4,^[7]^[9]^[10]
LIN7B,^[11] a
LIN7C.^[6]^[7]

Viz také

Kanadový iontový kanál dovnitř usměrňovače

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168135 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000044216 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: KCNJ4 draslík dovnitř usměrňující kanál, podčeleď J, člen 4".
^ ^A ^b ^C Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (květen 2004). "Komplexy transportu a ukotvení proteinů odhalené proteomickou analýzou proteinů asociovaných s vnitřním usměrňovačem draslíkového kanálu (Kir2.x)". J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. doi:10,1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.
^ ^A ^b ^C ^d Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (duben 2004). „Komplex obchodování s více proteiny složený z SAP97, CASK, Veli a Mint1 je spojen s draslíkovými kanály Kir2 směrem dovnitř“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. doi:10,1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
^ Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (březen 2001). "Inward rectifier draslíkový kanál Kir2.2 je spojen s proteinem SAP97 spojeným se synapse". J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987–98. PMID 11181181.
^ Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (leden 2000). „Neuronální dovnitř usměrňující K (+) kanály se odlišně spojují s PDZ proteiny rodiny PSD-95 / SAP90“. J. Neurosci. 20 (1): 156–62. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.
^ Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (červen 2002). „Kanál vnitřního usměrňovače K + kanál Kir2.3 je lokalizován na postsynaptické membráně excitačních synapsí“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (6): C1396–403. doi:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
^ Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (leden 2002). „Basolaterální membránová exprese kanálu Kir 2.3 je koordinována interakcí PDZ s komplexem Lin-7 / CASK“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (1): C183–95. doi:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.

Další čtení

Kubo Y, Adelman JP, Clapham DE, Jan LY, Karschin A, Kurachi Y, Lazdunski M, Nichols CG, Seino S, Vandenberg CA (2006). "International Union of Pharmacology. LIV. Nomenklatura and molekulárních vztahů dovnitř směřujících draslíkových kanálů". Pharmacol. Rev. 57 (4): 509–26. doi:10.1124 / pr.57.4.11. PMID 16382105.
Budarf ML, Périer F, Barnoski BL, Bell CJ, Vandenberg CA (1995). "Přiřazení genu lidského hipokampálního vnitřního usměrňovacího draslíkového kanálu (HIR) k 22q13.1". Genomika. 26 (3): 625–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80189-S. PMID 7607694.
Périer F, Radeke CM, Vandenberg CA (1994). „Primární struktura a charakterizace dovnitř usměrňujícího draslíkového kanálu s malou vodivostí z lidského hipokampu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (13): 6240–4. doi:10.1073 / pnas.91.13.6240. PMC 44174. PMID 8016146.
Tang W, Yang XC (1994). "Klonování nového lidského mozku dovnitř usměrňovacího draslíkového kanálu a jeho funkční exprese v oocytech Xenopus". FEBS Lett. 348 (3): 239–43. doi:10.1016/0014-5793(94)00612-1. PMID 8034048.
Makhina EN, Kelly AJ, Lopatin AN, Mercer RW, Nichols CG (1994). "Klonování a exprese nového lidského mozku dovnitř usměrňovacího draslíkového kanálu". J. Biol. Chem. 269 (32): 20468–74. PMID 8051145.
Cohen NA, Brenman JE, Snyder SH, Bredt DS (1996). „Vazba dovnitř usměrňovacího kanálu K + kanálu Kir 2.3 na PSD-95 je regulována fosforylací proteinkinázy A“. Neuron. 17 (4): 759–67. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80207-X. PMID 8893032.
Cohen NA, Sha Q, Makhina EN, Lopatin AN, Linder ME, Snyder SH, Nichols CG (1997). „Inhibice draslíkového kanálu dovnitř usměrňovače (Kir2.3) podjednotkami betagammy G-proteinu“. J. Biol. Chem. 271 (50): 32301–5. doi:10.1074 / jbc.271.50.32301. PMID 8943291.
Zhu G, Qu Z, Cui N, Jiang C (1999). "Potlačení aktivity Kir2.3 fosforylací proteinu kinázy C kanálového proteinu na threoninu 53". J. Biol. Chem. 274 (17): 11643–6. doi:10.1074 / jbc.274.17.11643. PMID 10206975.
Kurschner C, Yuzaki M (1999). „Neuronální interleukin-16 (NIL-16): protein s dvojí funkcí PDZ domény“. J. Neurosci. 19 (18): 7770–80. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-18-07770.1999. PMC 6782450. PMID 10479680.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (2000). „Neuronální dovnitř usměrňující K (+) kanály se odlišně spojují s PDZ proteiny rodiny PSD-95 / SAP90“. J. Neurosci. 20 (1): 156–62. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.
Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (2001). "Inward rectifier draslíkový kanál Kir2.2 je spojen s proteinem SAP97 spojeným se synapse". J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987–98. PMID 11181181.
Liu Y, Liu D, Heath L, Meyers DM, Krafte DS, Wagoner PK, Silvia CP, Yu W, Curran ME (2001). "Přímá aktivace dovnitř usměrňujícího draslíkového kanálu kyselinou arachidonovou". Mol. Pharmacol. 59 (5): 1061–8. doi:10,1124 / mol. 59,5.1061. PMID 11306688.
Perillan PR, Chen M, Potts EA, Simard JM (2002). „Transformující růstový faktor-beta 1 reguluje kanály K + dovnitř usměrňovače Kir2.3 prostřednictvím fosfolipázy C a proteinkinázy C-delta v reaktivních astrocytech z mozku dospělých krys“. J. Biol. Chem. 277 (3): 1974–80. doi:10,1074 / jbc.M107984200. PMID 11713246.
Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (2002). „Basolaterální membránová exprese kanálu Kir 2.3 je koordinována interakcí PDZ s komplexem Lin-7 / CASK“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (1): C183–95. doi:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.
Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (2002). „Kanál vnitřního usměrňovače K + kanál Kir2.3 je lokalizován na postsynaptické membráně excitačních synapsí“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (6): C1396–403. doi:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
Preisig-Müller R, Schlichthörl G, Goerge T, Heinen S, Brüggemann A, Rajan S, Derst C, Veh RW, Daut J (2002). „Heteromerizace draselných kanálů Kir2.x přispívá k fenotypu Andersenova syndromu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (11): 7774–9. doi:10.1073 / pnas.102609499. PMC 124349. PMID 12032359.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003 ). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). „Komplex obchodování s více proteiny složený z SAP97, CASK, Veli a Mint1 je spojen s draslíkovými kanály Kir2 směrem dovnitř“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. doi:10,1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). "Komplexy transportu a ukotvení proteinů odhalené proteomickou analýzou proteinů asociovaných s vnitřním usměrňovačem draslíkového kanálu (Kir2.x)". J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. doi:10,1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.

externí odkazy

KCNJ4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168135 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000044216 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: KCNJ4 draslík dovnitř usměrňující kanál, podčeleď J, člen 4".

[pmid15024025-6] A ^b ^C Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (květen 2004). "Komplexy transportu a ukotvení proteinů odhalené proteomickou analýzou proteinů asociovaných s vnitřním usměrňovačem draslíkového kanálu (Kir2.x)". J. Biol. Chem. 279 (21): 22331–46. doi:10,1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.

[pmid14960569-7] A ^b ^C ^d Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (duben 2004). „Komplex obchodování s více proteiny složený z SAP97, CASK, Veli a Mint1 je spojen s draslíkovými kanály Kir2 směrem dovnitř“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19051–63. doi:10,1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.

[pmid11181181-8] Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (březen 2001). "Inward rectifier draslíkový kanál Kir2.2 je spojen s proteinem SAP97 spojeným se synapse". J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987–98. PMID 11181181.

[pmid10627592-9] Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (leden 2000). „Neuronální dovnitř usměrňující K (+) kanály se odlišně spojují s PDZ proteiny rodiny PSD-95 / SAP90“. J. Neurosci. 20 (1): 156–62. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.

[pmid11997254-10] Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (červen 2002). „Kanál vnitřního usměrňovače K + kanál Kir2.3 je lokalizován na postsynaptické membráně excitačních synapsí“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (6): C1396–403. doi:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.

[pmid11742811-11] Olsen O, Liu H, Wade JB, Merot J, Welling PA (leden 2002). „Basolaterální membránová exprese kanálu Kir 2.3 je koordinována interakcí PDZ s komplexem Lin-7 / CASK“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 282 (1): C183–95. doi:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]