Receptor růstového faktoru fibroblastů 4 - Fibroblast growth factor receptor 4

FGFR4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4QQ5, 4QQC, 4QQJ, 4QQT, 4QRC, 4R6V, 4TYE, 4TYG, 4TYI, 4TYJ, 4UXQ, 4XCU
Identifikátory
Aliasy	FGFR4CD334, JTK2, TKF, receptor fibroblastového růstového faktoru 4
Externí ID	OMIM: 134935 MGI: 95525 HomoloGene: 20461 Genové karty: FGFR4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	177,098,144 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	55,168,759 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • vazba na heparin; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • aktivita protein tyrosinkinázy; • vazba fibroblastového růstového faktoru; • aktivita receptoru aktivovaného růstovým faktorem fibroblastů; • ATP vazba; • Aktivita faktoru výměny ras guanyl-nukleotidů; • aktivita fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát 3-kinázy; • Aktivita 1-fosfatidylinositol-3-kinázy; • receptor tyrosinkinázy; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • endozom; • Golgiho aparát; • membrána; • mezibuněčné spojení; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • transportní váček; • extracelulární oblast; • endoplazmatické retikulum; • cytoplazma; • receptorový komplex;
Biologický proces	• homeostáza glukózy; • fosforylace; • homeostáza fosfátových iontů; • reakce na žlučovou kyselinu; • regulace demontáže extracelulární matrice; • Kaskáda MAPK; • regulace procesu biosyntézy žlučových kyselin; • signální dráha receptoru pro fibroblastový růstový faktor; • regulace metabolismu lipidů; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace genové exprese; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace procesu biosyntézy DNA; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • pozitivní regulace proteolýzy; • autofosforylace; • peptidyl-tyrosinová fosforylace; • migrace buněk; • fosforylace fosfatidylinositolu; • GO: 0048554 pozitivní regulace katalytické aktivity; • biosyntetický proces fosfatidylinositol-3-fosfátu; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • homeostáza cholesterolu; • angiogeneze; • negativní regulace přenosu signálu; • diferenciace buněk; • negativní regulace apoptotického procesu; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální cesta; • vývoj nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2264
	14186
	ENSG00000160867
	ENSMUSG00000005320
	P22455
	Q03142
	NM_001291980; NM_002011; NM_022963; NM_213647; NM_001354984
	NM_008011
	NP_001278909; NP_002002; NP_075252; NP_998812; NP_001341913
	NP_032037
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptor růstového faktoru fibroblastů 4 je protein že u lidí je kódován FGFR4 gen. FGFR4 byl také označen jako CD334 (shluk diferenciace 334).

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny receptorů fibroblastových růstových faktorů, kde aminokyselina sekvence je mezi členy a v průběhu evoluce vysoce konzervativní. Členové rodiny FGFR se navzájem liší ligand afinity a distribuce tkání. Reprezentativní protein plné délky by sestával z extracelulární oblasti složené ze tří imunoglobulin -jako domény, jediná hydrofobní membránový segment a a cytoplazmatický tyrosinkináza doména. Extracelulární část proteinu interaguje s růstovými faktory fibroblastů a uvádí do pohybu kaskádu následných signálů, což v konečném důsledku ovlivňuje mitogenezi a diferenciaci. Genomická organizace tohoto genu, ve srovnání s členy 1-3, zahrnuje 18 exony spíše než 19 nebo 20. Ačkoli alternativní sestřih bylo pozorováno, neexistují žádné důkazy o tom, že C-terminál polovina IgIII doména tohoto proteinu se pohybuje mezi třemi alternativními formami, jak je uvedeno u členů 1-3. Tento konkrétní člen rodiny přednostně váže kyselý růstový faktor fibroblastů, a přestože jeho specifická funkce není známa, je nadměrně exprimován ve vzorcích gynekologických nádorů, což naznačuje roli v tumorigenezi prsu a vaječníků.^[5] Ve studii metaanalýzy bylo pozorováno, že funkční polymorfismus Gly388Arg (rs351855) FGFR4 je významně spojen s postižením uzlin a celkovým přežitím u pacientů s různými typy rakoviny. ^[6]

Interakce

Ukázalo se, že receptor 4 fibroblastového růstového faktoru komunikovat s FGF1.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160867 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005320 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: FGFR4 fibroblast growth factor receptor 4“.
^ Frullanti, E (2011). „Meta a souhrnné analýzy polymorfismu FGFR4 Gly388Arg jako prognostického faktoru rakoviny“. Eur J Cancer Prev. 20 (4): 340–347. doi:10.1097 / CEJ.0b013e3283457274. PMID 21412156. S2CID 29668012.
^ Loo, B B; Darwish K K; Vainikka SS; Saarikettu J J; Vihko P P; Hermonen J J; Goldman A A; Alitalo K K; Jalkanen M M (květen 2000). "Produkce a charakterizace extracelulární domény rekombinantního receptoru lidského fibroblastového růstového faktoru 4". Int. J. Biochem. Cell Biol. ANGLIE. 32 (5): 489–97. doi:10.1016 / S1357-2725 (99) 00145-4. ISSN 1357-2725. PMID 10736564.
^ Kan, M; Wu X; Wang F; McKeehan W L (květen 1999). „Specifičnost pro růstové faktory fibroblastů stanovená heparansulfátem v binárním komplexu s receptorovou kinázou“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (22): 15947–52. doi:10.1074 / jbc.274.22.15947. ISSN 0021-9258. PMID 10336501.

Další čtení

Doherty P, Smith P, Walsh FS (1997). "Domény homologie sdílené buněčné adhezní molekuly (CAM) ukazují na CAM signalizující prostřednictvím FGF receptorů". Pohledy na vývojovou neurobiologii. 4 (2–3): 157–68. PMID 9168198.
Warrington JA, Bailey SK, Armstrong E a kol. (1992). „Radiační hybridní mapa genů 18 růstového faktoru, receptoru růstového faktoru, hormonálního receptoru nebo neurotransmiteru v distální oblasti dlouhého ramene chromozomu 5“. Genomika. 13 (3): 803–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90156-M. PMID 1322355.
Armstrong E, Partanen J, Cannizzaro L a kol. (1992). "Lokalizace genu receptoru 4 pro růstový faktor fibroblastů do oblasti chromozomu 5q33-qter". Geny Chromozomy Rakovina. 4 (1): 94–8. doi:10,1002 / gcc.2870040116. PMID 1377018. S2CID 6377972.
Vainikka S, Partanen J, Bellosta P a kol. (1992). „Fibroblastový růstový faktor receptor-4 vykazuje nové rysy v genomové struktuře, vazbě ligandu a signální transdukci“. EMBO J.. 11 (12): 4273–80. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05526.x. PMC 557000. PMID 1385111.
Partanen J, Mäkelä TP, Eerola E a kol. (1991). „FGFR-4, nový receptor kyselého fibroblastového růstového faktoru se zřetelným vzorem exprese“. EMBO J.. 10 (6): 1347–54. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07654.x. PMC 452793. PMID 1709094.
Holtrich U, Bräuninger A, Strebhardt K, Rübsamen-Waigmann H (1992). „Dvě další protein-tyrosin kinázy exprimované v lidských plicích: čtvrtý člen rodiny receptorů fibroblastových růstových faktorů a intracelulární protein-tyrosin kináza“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (23): 10411–5. Bibcode:1991PNAS ... 8810411H. doi:10.1073 / pnas.88.23.10411. PMC 52938. PMID 1720539.
Partanen J, Mäkelä TP, Alitalo R a kol. (1991). „Předpokládané tyrosinkinázy exprimované v buňkách lidské leukémie K-562“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 8913–7. Bibcode:1990PNAS ... 87.8913P. doi:10.1073 / pnas.87.22.8913. PMC 55070. PMID 2247464.
Vainikka S, Joukov V, Wennström S a kol. (1994). "Transdukce signálu receptorem 4 fibroblastového růstového faktoru (FGFR-4). Srovnání s FGFR-1". J. Biol. Chem. 269 (28): 18320–6. PMID 7518429.
Wen Z, Zhong Z, Darnell JE (1995). "Maximální aktivace transkripce Stat1 a Stat3 vyžaduje fosforylaci tyrosinu i serinu". Buňka. 82 (2): 241–50. doi:10.1016/0092-8674(95)90311-9. PMID 7543024. S2CID 6717533.
Quelle FW, Thierfelder W, Witthuhn BA a kol. (1995). „Fosforylace a aktivace vazebné aktivity DNA čištěného Stat1 pomocí proteinových tyrosin kináz Janus a receptoru epidermálního růstového faktoru“. J. Biol. Chem. 270 (35): 20775–80. doi:10.1074 / jbc.270.35.20775. PMID 7657660.
Ron D, Reich R, Chedid M a kol. (1993). „Fibroblastový růstový faktor receptor 4 je vysoce afinitní receptor pro kyselý i bazický fibroblastový růstový faktor, nikoli však pro růstový faktor keratinocytů.“ J. Biol. Chem. 268 (8): 5388–94. PMID 7680645.
Shuai K, Stark GR, Kerr IM, Darnell JE (1993). "Jediný fosfotyrosinový zbytek Stat91 požadovaný pro aktivaci genu interferonem-gama". Věda. 261 (5129): 1744–6. Bibcode:1993Sci ... 261.1744S. doi:10.1126 / science.7690989. PMID 7690989.
Jaakkola S, Salmikangas P, Nylund S a kol. (1993). "Amplifikace genu fgfr4 v lidských prsou a gynekologických rakovinách". Int. J. Cancer. 54 (3): 378–82. doi:10.1002 / ijc.2910540305. PMID 8099571. S2CID 19513080.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Reich-Slotky R, Shaoul E, Berman B a kol. (1996). „Chimérické molekuly mezi růstovým faktorem keratinocytů a základním růstovým faktorem fibroblastů definují domény, které propůjčují vazebné specificity pro receptory“. J. Biol. Chem. 270 (50): 29813–8. doi:10.1074 / jbc.270.50.29813. PMID 8530375.
Vainikka S, Joukov V, Klint P, Alitalo K (1996). "Sdružení 85-kDa serinkinázy s aktivovaným receptorem fibroblastového růstového faktoru-4". J. Biol. Chem. 271 (3): 1270–3. doi:10.1074 / jbc.271.3.1270. PMID 8576110.
Kaptein A, Paillard V, Saunders M (1996). „Dominantní negativní mutant stat3 inhibuje přenos signálu Jak-STAT indukovaný interleukinem 6“. J. Biol. Chem. 271 (11): 5961–4. doi:10.1074 / jbc.271.11.5961. PMID 8626374.
Ornitz DM, Xu J, Colvin JS, et al. (1996). "Specifičnost receptoru rodiny fibroblastových růstových faktorů". J. Biol. Chem. 271 (25): 15292–7. doi:10.1074 / jbc.271.25.15292. PMID 8663044.
Agnès F, Toux MM, André C, Galibert F (1997). „Genomická organizace extracelulární kódující oblasti lidských genů FGFR4 a FLT4: vývoj genů kódujících receptorové tyrosinkinázy s doménami podobnými imunoglobulinu“. J. Mol. Evol. 45 (1): 43–9. Bibcode:1997JMolE..45 ... 43A. doi:10.1007 / PL00006199. PMID 9211733. S2CID 34208733.

externí odkazy

FGFR4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160867 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005320 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: FGFR4 fibroblast growth factor receptor 4“.

[6] Frullanti, E (2011). „Meta a souhrnné analýzy polymorfismu FGFR4 Gly388Arg jako prognostického faktoru rakoviny“. Eur J Cancer Prev. 20 (4): 340–347. doi:10.1097 / CEJ.0b013e3283457274. PMID 21412156. S2CID 29668012.

[pmid10736564-7] Loo, B B; Darwish K K; Vainikka SS; Saarikettu J J; Vihko P P; Hermonen J J; Goldman A A; Alitalo K K; Jalkanen M M (květen 2000). "Produkce a charakterizace extracelulární domény rekombinantního receptoru lidského fibroblastového růstového faktoru 4". Int. J. Biochem. Cell Biol. ANGLIE. 32 (5): 489–97. doi:10.1016 / S1357-2725 (99) 00145-4. ISSN 1357-2725. PMID 10736564.

[pmid10336501-8] Kan, M; Wu X; Wang F; McKeehan W L (květen 1999). „Specifičnost pro růstové faktory fibroblastů stanovená heparansulfátem v binárním komplexu s receptorovou kinázou“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 274 (22): 15947–52. doi:10.1074 / jbc.274.22.15947. ISSN 0021-9258. PMID 10336501.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )