Inhibiční faktor leukémie - Leukemia inhibitory factor

LIF
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 EMR, 1PVH, 2Q7N
Identifikátory
Aliasy	LIF„CDF, DIA, HILDA, MLPLI, faktor inhibující leukémii, cytokiny z rodiny interleukinů 6, cytokiny z rodiny interleukinů 6
Externí ID	OMIM: 159540 MGI: 96787 HomoloGene: 1734 Genové karty: LIF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	30,246,759 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	4,272,514 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptory; • aktivita růstového faktoru; • aktivita cytokinů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba receptoru na inhibiční faktor leukémie;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace buněčné proliferace; • diferenciace kmenových buněk; • pozitivní regulace peptidyl-serinové fosforylace proteinu STAT; • pozitivní regulace kaskády MAPK; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • diferenciace spongiotrofoblastů; • vývoj plic; • pozitivní regulace acetylace histonu H3-K27; • vývoj mnohobuněčných organismů; • morfogeneze plicního laloku; • morfogeneze svalových orgánů; • mateřský proces spojený s těhotenstvím žen; • negativní regulace sekrece hormonů; • signální dráha inhibičního faktoru leukémie; • regulace diferenciace epiteliálních buněk metanefrického nefronového tubulu; • regulace diferenciace buněk; • pozitivní regulace genové exprese; • udržování populace kmenových buněk; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-tyrosinu; • regulace vazby DNA specifické pro sekvenci regulační oblasti RNA polymerázy II; • pozitivní regulace diferenciace astrocytů; • negativní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • vývoj neuronů; • decidualizace; • pozitivní regulace mezenchymálního přechodu k epitelu podílející se na morfogenezi metanephros; • vývoj plicních alveol; • pozitivní regulace diferenciace makrofágů; • remodelace krevních cév; • diferenciace obřích buněk trofoblastu; • vývoj vaskulatury plic; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do jádra; • implantace embrya; • negativní regulace meiotického jaderného dělení; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace fosforylace tyrosinu STAT proteinu; • tyrosinová fosforylace STAT proteinu; • regulace aktivity receptoru; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3976
	16878
	ENSG00000128342
	ENSMUSG00000034394
	P15018
	P09056
	NM_001257135; NM_002309
	NM_001039537; NM_008501
	NP_001244064; NP_002300
	NP_001034626; NP_032527
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibiční faktor leukémienebo LIF, je interleukin 6 třída cytokin který ovlivňuje buňka růst inhibicí diferenciace. Když hladiny LIF klesnou, buňky se diferencují.

Funkce

LIF odvozuje svůj název od schopnosti indukovat terminál diferenciace z myeloidní leukemie buňky, čímž zabrání jejich dalšímu růstu. Mezi další vlastnosti připisované cytokinu patří: podpora růstu a diferenciace buněk různých typů cílových buněk, vliv na kost metabolismus, kachexie, neurální vývoj, embryogeneze a zánět. p53 Ukázalo se, že regulovaný LIF usnadňuje implantace u myšího modelu a případně u lidí.^[5] Bylo navrženo, že rekombinantní lidský LIF může pomoci zlepšit rychlost implantace u žen s nevysvětlitelnou neplodností.^[6]

Vazba / aktivace

LIF se váže na konkrétní LIF receptor (LIFR -α), která tvoří a heterodimer se specifickou podjednotkou společnou pro všechny členy této rodiny receptorů, GP130 signální podjednotka. To vede k aktivaci JAK /STAT (Janus kinase /převodník signálu a aktivátor transkripce ) a MAPK (mitogen aktivován protein kináza ) kaskády.^{[Citace je zapotřebí ]}

Výraz

Život se normálně vyjadřuje v trophectoderm vyvíjejícího se embrya s jeho receptorem LIFR exprimovaným v celém vnitřní buněčná hmota. Protože embryonální kmenové buňky jsou odvozeny z vnitřní buněčné hmoty ve stadiu blastocysty, jejich odstranění z vnitřní buněčné hmoty také odstraňuje jejich zdroj LIF. Rekombinantní LIF byl produkován v rostlinách společností InVitria.

Použití v kultuře kmenových buněk

LIF se často přidává do kultivačního média kmenových buněk jako alternativa k výživné buněčné kultuře, kvůli omezení, které doplňkové buňky představují pouze produkcí LIF na povrchu jejich buněk. Podávací buňky postrádající LIF gen nepodporují účinně kmenové buňky.^[7] LIF podporuje sebeobnovu náborem převodníku signálu a aktivátoru transkripce 3 (Stat3 ). Stat3 je získán na aktivovaný LIF receptor a fosforylován pomocí Janus kináza. Je třeba poznamenat, že LIF a Stat3 nejsou dostatečné k inhibici diferenciace kmenových buněk, protože buňky se budou odlišovat po odstranění séra. Během fáze reverzibility diferenciace od naivní pluripotence je možné vrátit buňky zpět na naivní pluripotenci přidáním LIF.^[8]Odstranění LIF tlačí kmenové buňky směrem diferenciace však genetická manipulace s embryonálními kmenovými buňkami umožňuje růst nezávislý na LIF, zejména nadměrnou expresi genu Nanog.

LIF se obvykle přidává do kultivačního média kmenových buněk, aby se snížila spontánní diferenciace.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128342 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034394 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hu W, Feng Z, Teresky AK, Levine AJ (listopad 2007). "p53 reguluje reprodukci matek prostřednictvím LIF". Příroda. 450 (7170): 721–4. Bibcode:2007 Natur.450..721H. doi:10.1038 / nature05993. PMID 18046411.
^ Aghajanova L (prosinec 2004). "Inhibiční faktor leukémie a implantace lidských embryí". Annals of the New York Academy of Sciences. 1034 (1): 176–83. Bibcode:2004NYASA1034..176A. doi:10.1196 / annals.1335.020. PMID 15731310.
^ Stewart CL, Kaspar P, Brunet LJ, Bhatt H, Gadi I, Köntgen F, Abbondanzo SJ (září 1992). „Implantace blastocyst závisí na expresi inhibičního faktoru leukémie matkou“. Příroda. 359 (6390): 76–9. Bibcode:1992 Natur.359 ... 76S. doi:10.1038 / 359076a0. PMID 1522892.
^ Martello G, Smith A (2014). "Povaha embryonálních kmenových buněk". Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 30: 647–75. doi:10.1146 / annurev-cellbio-100913-013116. PMID 25288119.
^ Kawahara Y, Manabe T, Matsumoto M, Kajiume T, Matsumoto M, Yuge L (červenec 2009). Zwaka T (ed.). „Kultura embryonálních kmenových buněk bez LIF v simulované mikrogravitaci“. PLOS ONE. 4 (7): e6343. Bibcode:2009PLoSO ... 4,6343K. doi:10,1371 / journal.pone.0006343. PMC 2710515. PMID 19626124.
^ „CGS: PTO shledává očekávání patentu na kmenové buňky, zjevné ve světle„ významných pokynů'". Archivovány od originál dne 04.10.2011.

Další čtení

Patterson PH (srpen 1994). „Leukemický inhibiční faktor, cytokin na rozhraní mezi neurobiologií a imunologií“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (17): 7833–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.7833P. doi:10.1073 / pnas.91.17.7833. PMC 44497. PMID 8058719.
Aghajanova L (prosinec 2004). "Inhibiční faktor leukémie a implantace lidských embryí". Annals of the New York Academy of Sciences. 1034: 176–83. Bibcode:2004NYASA1034..176A. doi:10.1196 / annals.1335.020. PMID 15731310.
Králícková M, Síma P, Rokyta Z (2005). „Úloha mutací genu pro faktor inhibující leukémii u neplodných žen: vzájemná komunikace embryo-endometriálního cytokinu během implantace - křehká homeostatická rovnováha.“ Folia Microbiologica. 50 (3): 179–86. doi:10.1007 / BF02931563. PMID 16295654.
Stahl J, Gearing DP, Willson TA, Brown MA, King JA, Gough NM (květen 1990). "Strukturální organizace genů pro myší a lidský leukemický inhibiční faktor. Evoluční ochrana kódujících a nekódujících oblastí". The Journal of Biological Chemistry. 265 (15): 8833–41. PMID 1692837.
Bazan JF (srpen 1991). "Neuropoetické cytokiny v hemopoetickém záhybu". Neuron. 7 (2): 197–208. doi:10.1016/0896-6273(91)90258-2. PMID 1714745.
Lowe DG, Nunes W, Bombara M, McCabe S, Ranges GE, Henzel W, Tomida M, Yamamoto-Yamaguchi Y, Hozumi M, Goeddel DV (červen 1989). "Genomické klonování a heterologní exprese lidského faktoru stimulujícího diferenciaci". DNA. 8 (5): 351–9. doi:10.1089 / dna.1.1989.8.351. PMID 2475312.
Sutherland GR, Baker E, Hyland VJ, Callen DF, Stahl J, Gough NM (leden 1989). "Gen pro lidský leukemický inhibiční faktor (LIF) se mapuje na 22q12". Leukémie. 3 (1): 9–13. PMID 2491897.
Mori M, Yamaguchi K, Abe K (květen 1989). „Čištění proteinu inhibujícího lipoprotein lipázu produkovaného melanomovou buněčnou linií spojenou s rakovinovou kachexií“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 160 (3): 1085–92. doi:10.1016 / S0006-291X (89) 80114-7. PMID 2730639.
Gough NM, Gearing DP, King JA, Willson TA, Hilton DJ, Nicola NA, Metcalf D (duben 1988). "Molekulární klonování a exprese lidského homologu myšího genu kódujícího faktor inhibující myeloidní leukémii". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 85 (8): 2623–7. Bibcode:1988PNAS ... 85.2623G. doi:10.1073 / pnas.85.8.2623. PMC 280050. PMID 3128791.
Williams RL, Hilton DJ, Pease S, Willson TA, Stewart CL, Gearing DP, Wagner EF, Metcalf D, Nicola NA, Gough NM (prosinec 1988). „Inhibiční faktor pro myeloidní leukémii udržuje vývojový potenciál embryonálních kmenových buněk“. Příroda. 336 (6200): 684–7. Bibcode:1988Natur.336..684W. doi:10.1038 / 336684a0. PMID 3143916.
Moreau JF, Donaldson DD, Bennett F, Witek-Giannotti J, Clark SC, Wong GG (prosinec 1988). „Inhibiční faktor leukémie je identický s lidským interleukinem myeloidního růstového faktoru pro buňky DA“. Příroda. 336 (6200): 690–2. Bibcode:1988Natur.336..690M. doi:10.1038 / 336690a0. PMID 3143918.
Yamaguchi M, Miki N, Ono M, Ohtsuka C, Demura H, Kurachi H, Inoue M, Endo H, Taga T, Kishimoto T (březen 1995). "Inhibice produkce faktoru uvolňujícího růstový hormon v myší placentě cytokiny s použitím gp130 jako signálního převodníku". Endokrinologie. 136 (3): 1072–8. doi:10.1210 / en.136.3.1072. PMID 7867561.
Schmelzer CH, Harris RJ, Butler D, Yedinak CM, Wagner KL, Burton LE (květen 1993). "Glykosylační vzorec a disulfidové přiřazení rekombinantního lidského faktoru stimulujícího diferenciaci". Archivy biochemie a biofyziky. 302 (2): 484–9. doi:10.1006 / abbi.1993.1243. PMID 8489250.
Aikawa J, Ikeda-Naiki S, Ohgane J, Min KS, Imamura T, Sasai K, Shiota K, Ogawa T (září 1997). „Molekulární klonování genu alfa-řetězce receptoru pro inhibiční faktor leukemie a jeho exprese během těhotenství“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1353 (3): 266–76. doi:10.1016 / s0167-4781 (97) 00079-1. PMID 9349722.
Hinds MG, Maurer T, Zhang JG, Nicola NA, Norton RS (květen 1998). "Struktura řešení inhibičního faktoru leukémie". The Journal of Biological Chemistry. 273 (22): 13738–45. doi:10.1074 / jbc.273.22.13738. PMID 9593715.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (listopad 1998). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Výzkum genomu. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Tanaka M, Hara T, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Miyajima A (únor 1999). "Rekonstituce funkčního myšího onkostatinového M (OSM) receptoru: molekulární klonování myší podjednotky OSM receptoru beta". Krev. 93 (3): 804–15. doi:10.1182 / krev.V93.3.804. PMID 9920829.
Nakashima K, Yanagisawa M, Arakawa H, Kimura N, Hisatsune T, Kawabata M, Miyazono K, Taga T (duben 1999). "Synergická signalizace v mozku plodu komplexem STAT3-Smad1 přemostěna p300". Věda. 284 (5413): 479–82. Bibcode:1999Sci ... 284..479N. doi:10.1126 / science.284.5413.479. PMID 10205054.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999 Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

externí odkazy

Leukémie + inhibiční + faktor v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Zdroj inhibičního faktoru rekombinantní leukémie (http://www.invitria.com/cell-culture-products-services/leukemia-inhibitory-factor-culture-media.html )
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P15018 (Leukemický inhibiční faktor) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128342 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034394 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Hu W, Feng Z, Teresky AK, Levine AJ (listopad 2007). "p53 reguluje reprodukci matek prostřednictvím LIF". Příroda. 450 (7170): 721–4. Bibcode:2007 Natur.450..721H. doi:10.1038 / nature05993. PMID 18046411.

[6] Aghajanova L (prosinec 2004). "Inhibiční faktor leukémie a implantace lidských embryí". Annals of the New York Academy of Sciences. 1034 (1): 176–83. Bibcode:2004NYASA1034..176A. doi:10.1196 / annals.1335.020. PMID 15731310.

[7] Stewart CL, Kaspar P, Brunet LJ, Bhatt H, Gadi I, Köntgen F, Abbondanzo SJ (září 1992). „Implantace blastocyst závisí na expresi inhibičního faktoru leukémie matkou“. Příroda. 359 (6390): 76–9. Bibcode:1992 Natur.359 ... 76S. doi:10.1038 / 359076a0. PMID 1522892.

[8] Martello G, Smith A (2014). "Povaha embryonálních kmenových buněk". Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 30: 647–75. doi:10.1146 / annurev-cellbio-100913-013116. PMID 25288119.

[9] Kawahara Y, Manabe T, Matsumoto M, Kajiume T, Matsumoto M, Yuge L (červenec 2009). Zwaka T (ed.). „Kultura embryonálních kmenových buněk bez LIF v simulované mikrogravitaci“. PLOS ONE. 4 (7): e6343. Bibcode:2009PLoSO ... 4,6343K. doi:10,1371 / journal.pone.0006343. PMC 2710515. PMID 19626124.

[10] „CGS: PTO shledává očekávání patentu na kmenové buňky, zjevné ve světle„ významných pokynů'". Archivovány od originál dne 04.10.2011.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]