Růstový faktor odvozený od hepatomu - Hepatoma-derived growth factor

HDGF
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1RI0, 2NLU
Identifikátory
Aliasy	HDGF, HMG1L2, růstový faktor odvozený od hepatomu, růstový faktor vázající se na heparin
Externí ID	OMIM: 600339 MGI: 1194494 HomoloGene: 3306 Genové karty: HDGF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	156,766,925 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	87,916,132 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba DNA; • transkripční vazba na jádrový kompresor; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • aktivita růstového faktoru; • vazba na heparin; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • transkripční represorový komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • extracelulární; • extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• Rozvinutá proteinová reakce zprostředkovaná IRE1; • buněčná proliferace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • signální transdukce; • buněčný proces; • regulace aktivity receptoru; • buněčná odpověď na interleukin-7;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3068
	15191
	ENSG00000143321
	ENSMUSG00000004897
	P51858
	P51859
NM_001126050; NM_001126051; NM_004494; NM_001319186; NM_001319187;
	NM_001319188
	NM_008231; NM_001331051; NM_001331052
NP_001119522; NP_001119523; NP_001306115; NP_001306116; NP_001306117;
	NP_004485
	NP_001317980; NP_001317981; NP_032257
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Růstový faktor odvozený od hepatomu (HDGF) také známý jako protein skupiny 1 s vysokou mobilitou 2 (HMG-1L2) je a protein že u lidí je kódován HDGF gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143321 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004897 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wanschura S, Schoenmakers EF, Huysmans C, Bartnitzke S, Van de Ven WJ, Bullerdiek J (květen 1997). „Mapování genu kódujícího růstový faktor odvozený od lidského hepatomu (HDGF) s homologií s proteinem skupiny s vysokou mobilitou (HMG) -1 na Xq25“. Genomika. 32 (2): 298–300. doi:10.1006 / geno.1996.0122. PMID 8833162.
^ „Entrez Gene: HDGF hepatoma-odvozený růstový faktor (protein skupiny s vysokou mobilitou 1)“.

Další čtení

Everett AD, Bushweller J (2003). „Růstový faktor odvozený z hepatatomu je mitogen cílený na jadernou energii“. Aktuální drogové cíle. 4 (5): 367–71. doi:10.2174/1389450033490975. PMID 12816346.
Nakamura H, Izumoto Y, Kambe H a kol. (1994). "Molekulární klonování komplementární DNA pro nový růstový faktor odvozený od lidského hepatomu. Jeho homologie s proteinem skupiny 1 s vysokou mobilitou". J. Biol. Chem. 269 (40): 25143–9. PMID 7929202.
Kishima Y, Yamamoto H, Izumoto Y a kol. (2002). „Růstový faktor odvozený od hepatomu stimuluje buněčný růst po translokaci do jádra pomocí signálů nukleární lokalizace“. J. Biol. Chem. 277 (12): 10315–22. doi:10,1074 / jbc.M111122200. PMID 11751870.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mori M, Morishita H, Nakamura H a kol. (2004). „Růstový faktor odvozený od hepatomu se podílí na remodelaci plic stimulací růstu epitelu“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 30 (4): 459–69. doi:10.1165 / rcmb.2003-0013OC. PMID 12972397.
Yoshida K, Nakamura H, Okuda Y a kol. (2004). "Exprese růstového faktoru odvozeného od hepatomu v hepatokarcinogenezi". J. Gastroenterol. Hepatol. 18 (11): 1293–301. doi:10.1046 / j.1440-1746.2003.03191.x. PMID 14535987.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Shu H, Chen S, Bi Q a kol. (2004). „Identifikace fosfoproteinů a jejich fosforylačních míst v buněčné linii lymfomu WEHI-231 B“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (3): 279–86. doi:10,1074 / mcp. D300003-MCP200. PMID 14729942.
Everett AD, Narron JV, Stoops T a kol. (2004). „Růstový faktor odvozený od hepatomu je angiogenní faktor plicních endoteliálních buněk exprimovaný“. Dopoledne. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 286 (6): L1194–201. doi:10.1152 / ajplung.00427.2003. PMID 14751852.
Sue SC, Chen JY, Huang TH (2004). „Sekvenčně specifické přiřazení rezonance 1H, 13C a 15N hath-domény růstového faktoru odvozeného od lidského hepatomu“. J. Biomol. NMR. 29 (1): 95–6. doi:10.1023 / B: JNMR.0000019467.57276.05. PMID 15017145.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Shen XY, Zacal N, Singh G, Rainbow AJ (2005). "Změny v mitochondriální a apoptóza regulující genové expresi ve fotodynamické terapii rezistentních variantách buněk HT29 karcinomu tlustého střeva". Photochem. Fotobiol. 81 (2): 306–13. doi:10.1562 / 2004-07-22-RA-242. PMID 15560738.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153.
Iwasaki T, Nakagawa K, Nakamura H a kol. (2005). „Růstový faktor odvozený od hepatomu jako prognostický marker u zcela resekovaného nemalobuněčného karcinomu plic“. Oncol. Rep. 13 (6): 1075–80. doi:10.3892 / nebo 13.6.1075. PMID 15870924.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Beranova-Giorgianni S, Zhao Y, Desiderio DM, Giorgianni F (2006). "Fosfoproteomická analýza lidské hypofýzy". Hypofýza. 9 (2): 109–20. doi:10.1007 / s11102-006-8916-x. PMID 16807684.
Clermont F, Gonzalez NS, Communi D, Franken S, Dumont JE, Robaye B (2008). „HDGF je defosforylován během raných fází apoptózy endoteliálních buněk způsobem závislým na kaspázách“. J Cell Biochem. 104 (4): 1161–1171. doi:10.1002 / jcb.21788. PMID 18465786.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro růstový faktor odvozený z lidského hepatomu

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143321 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004897 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8833162-5] Wanschura S, Schoenmakers EF, Huysmans C, Bartnitzke S, Van de Ven WJ, Bullerdiek J (květen 1997). „Mapování genu kódujícího růstový faktor odvozený od lidského hepatomu (HDGF) s homologií s proteinem skupiny s vysokou mobilitou (HMG) -1 na Xq25“. Genomika. 32 (2): 298–300. doi:10.1006 / geno.1996.0122. PMID 8833162.

[entrez-6] „Entrez Gene: HDGF hepatoma-odvozený růstový faktor (protein skupiny s vysokou mobilitou 1)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]