VCAM-1 - VCAM-1

VCAM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1IJ9, 1 VCA, 1VSC
Identifikátory
Aliasy	VCAM1, CD106, INCAM-100, molekula adheze vaskulárních buněk 1
Externí ID	OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 Genové karty: VCAM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	100,739,045 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	116,129,688 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• primární aktivita aminoxidázy; • integrinová vazba; • vazba molekul buněčné adheze;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • komplex alfa9-beta1 integrin-vaskulární buněčná adhezní molekula-1; • membrána; • filopodium; • buněčná membrána; • apikální část buňky; • mikrovilli; • povrch buňky; • časný endosom; • endoplazmatické retikulum; • podosomy; • sarcolemma; • extracelulární exosom; • vnější strana plazmatické membrány; • extracelulární; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• adheze leukocytů buňka-buňka; • reakce na ionizující záření; • heterofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • reakce na hypoxii; • reakce na živiny; • interferon-gama zprostředkovaná signální dráha; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • reakce na nikotin; • stárnutí; • reakce na iont zinku; • organizace extracelulární matice; • aminový metabolický proces; • reakce na lipopolysacharid; • buněčná adheze; • akutní zánětlivá odpověď; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • dokování membrány na membránu; • regulace imunitní odpovědi; • uvázání nebo válcování leukocytů; • buněčná chemotaxe; • Diferenciace B buněk; • buněčná odpověď na stimul vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • buněčná matice adheze; • GO: virový proces 0022415; • reakce na ethanol; • vápníkem zprostředkovaná signalizace pomocí intracelulárního zdroje vápníku; • Chronický zánět; • oxidačně-redukční proces; • buněčná adheze; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • heterotypická adheze mezi buňkami; • inervace; • diferenciace srdečních neuronů; • buněčná adheze v reakci na extracelulární stimul; • buněčná odpověď na amyloid-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7412
	22329
	ENSG00000162692
	ENSMUSG00000027962
	P19320
	P29533
	NM_080682; NM_001078; NM_001199834
	NM_011693
	NP_001069; NP_001186763; NP_542413
	NP_035823
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vaskulární buněčný adhezní protein 1 také známý jako molekula adheze vaskulárních buněk 1 (VCAM-1) nebo shluk diferenciace 106 (CD106) je protein že u lidí je kódován VCAM1 gen.^[5] VCAM-1 funguje jako a molekula buněčné adheze.

Struktura

Gen VCAM-1 obsahuje šest nebo sedm imunoglobulin domén, a je vyjádřen na malých i velkých cévy až po endoteliální buňky jsou stimulovány cytokiny. to je alternativně sestříhané do dvou známých RNA přepisy které kódují různé izoformy u lidí.^[6] Produktem genu je povrch buňky sialoglykoprotein, membránový protein typu I, který je členem Ig nadčeleď.

Funkce

Protein VCAM-1 zprostředkovává adhezi lymfocyty, monocyty, eosinofily, a bazofily na cévní endotel. Funguje také v endoteliální buňce leukocytů signální transdukce, a může hrát roli při vývoji ateroskleróza a revmatoidní artritida.

Upregulace VCAM-1 v endoteliálních buňkách cytokiny nastává v důsledku zvýšené genová transkripce (např. v reakci na Faktor nekrózy nádorů-alfa (TNF-a) a Interleukin-1 (IL-1)) a prostřednictvím stabilizace Messenger RNA (mRNA) (např. Interleukin-4 (IL-4)). Oblast promotoru genu VCAM-1 obsahuje funkční tandem NF-kB (jaderný faktor-kappa B). Trvalá exprese VCAM-1 trvá déle než 24 hodin.

Protein VCAM-1 je primárně endotel ligand pro VLA-4 (Velmi pozdní antigen-4 nebo integrin α4β1) z podrodiny β1 integriny. Exprese VCAM-1 byla také pozorována u jiných buněčných typů (např. buňky hladkého svalstva ). Bylo také prokázáno, že komunikovat s EZR^[7] a Moesin.^[7]

CD106 také existuje na povrchu některých subpopulací mezenchymální kmenové buňky (MSC).^[8]

Farmakologie

Určitý melanom buňky mohou používat VCAM-1 k adhezi na endotel,^[9], VCAM-1 se může účastnit náboru monocytů do aterosklerotických míst a v zaníceném mozku je vysoce nadměrně exprimován.^[10] Ve výsledku je VCAM-1 potenciál lék cílová.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162692 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027962 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cybulsky M, Fries JW, Williams AJ, Sultan P, Eddy RL, Byers MG, Show TB, Gimbrone MA Jr, Collins T (1991). „Lidský gen VCAM1 je přiřazen chromozomu 1p31-p32.“ Cytogenet. Cell Genet. 58 (3–4): 1850–1867. doi:10.1159/000133735.
^ "Entrez Gene: VCAM1 vaskulární buněčná adhezní molekula 1".
^ ^A ^b Barreiro O, Yanez-Mo M, Serrador JM, Montoya MC, Vicente-Manzanares M, Tejedor R, Furthmayr H, Sanchez-Madrid F (červen 2002). „Dynamická interakce VCAM-1 a ICAM-1 s moesinem a ezrinem v nové endoteliální dokovací struktuře pro adherentní leukocyty“. J. Cell Biol. 157 (7): 1233–45. doi:10.1083 / jcb.200112126. PMC 2173557. PMID 12082081.
^ ZX Yang; et al. (2013). „CD106 identifikuje subpopulaci mezenchymálních kmenových buněk s jedinečnými imunomodulačními vlastnostmi“. PLOS One. 8 (3): e59354. Bibcode:2013PLoSO ... 859354Y. doi:10.1371 / journal.pone.0059354. PMC 3595282. PMID 23555021.
^ Eibl RH, Benoit M (2004). "Molekulární rozlišení sil adheze buněk". Sborník IEE - nanobiotechnologie. 151 (3): 128–32. doi:10.1049 / ip-nbt: 20040707. PMID 16475855.
^ Marcos-Contreras, Oscar A (2020). „Selektivní cílení nanomedicíny na zanícenou mozkovou vaskulaturu za účelem zvýšení hematoencefalické bariéry“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 117 (7): 3405–3414. doi:10.1073 / pnas.1912012117. PMC 7035611. PMID 32005712.

Další čtení

Yonekawa K, Harlan JM (2005). "Cílení na integriny leukocytů u lidských nemocí". J. Leukoc. Biol. 77 (2): 129–40. doi:10.1189 / jlb.0804460. PMID 15548573.
Wu TC (2007). „Úloha molekuly adheze vaskulárních buněk-1 při imunitní evasii nádoru“. Cancer Res. 67 (13): 6003–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1543. PMC 3179385. PMID 17616653.

externí odkazy

VCAM-1 v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P19320 (Vaskulární buněčný adhezní protein 1) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162692 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027962 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[Cybulsky_1991-5] Cybulsky M, Fries JW, Williams AJ, Sultan P, Eddy RL, Byers MG, Show TB, Gimbrone MA Jr, Collins T (1991). „Lidský gen VCAM1 je přiřazen chromozomu 1p31-p32.“ Cytogenet. Cell Genet. 58 (3–4): 1850–1867. doi:10.1159/000133735.

[6] "Entrez Gene: VCAM1 vaskulární buněčná adhezní molekula 1".

[pmid12082081-7] A ^b Barreiro O, Yanez-Mo M, Serrador JM, Montoya MC, Vicente-Manzanares M, Tejedor R, Furthmayr H, Sanchez-Madrid F (červen 2002). „Dynamická interakce VCAM-1 a ICAM-1 s moesinem a ezrinem v nové endoteliální dokovací struktuře pro adherentní leukocyty“. J. Cell Biol. 157 (7): 1233–45. doi:10.1083 / jcb.200112126. PMC 2173557. PMID 12082081.

[8] ZX Yang; et al. (2013). „CD106 identifikuje subpopulaci mezenchymálních kmenových buněk s jedinečnými imunomodulačními vlastnostmi“. PLOS One. 8 (3): e59354. Bibcode:2013PLoSO ... 859354Y. doi:10.1371 / journal.pone.0059354. PMC 3595282. PMID 23555021.

[9] Eibl RH, Benoit M (2004). "Molekulární rozlišení sil adheze buněk". Sborník IEE - nanobiotechnologie. 151 (3): 128–32. doi:10.1049 / ip-nbt: 20040707. PMID 16475855.

[10] Marcos-Contreras, Oscar A (2020). „Selektivní cílení nanomedicíny na zanícenou mozkovou vaskulaturu za účelem zvýšení hematoencefalické bariéry“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 117 (7): 3405–3414. doi:10.1073 / pnas.1912012117. PMC 7035611. PMID 32005712.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350