FGR (gen) - FGR (gene)

FGR
Identifikátory
Aliasy	FGR, SRC2, c-fgr, c-src2, p55-Fgr, p55c-fgr, p58-Fgr, p58c-fgr, FGR protoonkogen, tyrosinkináza rodiny Src
Externí ID	OMIM: 164940 MGI: 95527 HomoloGene: 3842 Genové karty: FGR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	27,635,185 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	133,001,910 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • vazba na imunoglobulinový receptor; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba komplexu Fc-gama receptor I; • ATP vazba; • vazba protein kinázy; • aktivita protein tyrosinkinázy; • aktivita membránové proteinové tyrosinkinázy; • vazba zbytku fosfotyrosinu; • vazba na receptory;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná projekce; • membrána; • vnější složka cytoplazmatické strany plazmatické membrány; • mitochondriální mezimembránový prostor; • volánová membrána; • mitochondrie; • aktinový cytoskelet; • mitochondriální vnitřní membrána; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • agresivní; • lumen sekreční granule;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • regulace vrozené imunitní odpovědi; • Signální dráha receptoru Fc-gama zapojená do fagocytózy; • fosforylace; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • proces imunitního systému; • pozitivní regulace buněčné migrace; • pozitivní regulace sekrece cytokinů; • reakce na virus; • pozitivní regulace degranulace žírných buněk; • signální dráha buněčného povrchu regulující imunitní odpověď; • pozitivní regulace aktivity 3-kinázy fosfatidylinositolu; • fosforylace bílkovin; • regulace buněčné proliferace; • regulace tvaru buňky; • autofosforylace peptidyl-tyrosin; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • autofosforylace; • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • regulace aktivity proteinkinázy; • regulace fagocytózy; • obranná odpověď na grampozitivní bakterii; • migrace buněk; • vrozený imunitní systém; • degranulace neutrofilů; • mineralizace kostí; • morfogeneze kosterního systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2268
	14191
	ENSG00000000938
	ENSMUSG00000028874
	P09769
	P14234
	NM_001042729; NM_001042747; NM_005248
	NM_010208
	NP_001036194; NP_001036212; NP_005239
	NP_034338
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Onkologický homolog Gardner-Rasheed pro kočičí sarkom virový (v-fgr), také známý jako FGR, je protein který je u lidí kódován FGR gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je členem rodiny proteinů Src tyrosinkinázy (PTK). Kódovaný protein obsahuje N-terminál weby pro myristoylace a palmitoylace, doména PTK a SH2 a SH3 domény, které se podílejí na zprostředkování interakcí protein-protein s motivy obsahujícími fosfotyrosin a motivy bohatými na prolin. Protein se lokalizuje na volánech plazmatické membrány a funguje jako negativní regulátor buňky migrace a přilnavost spuštěna beta-2 integrin signální transdukční dráha. Infekce Virus Epstein-Barr vede k nadměrné expresi tohoto genu. Bylo identifikováno několik alternativně sestřižených variant kódujících stejný protein.^[6]

Objev

Kočičí verzi tohoto genu objevili Suraiya Rasheed, Murray Gardner a spolupracovníci.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že FGR (gen) komunikovat s Protein Wiskott-Aldrichova syndromu.^[8]^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000000938 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028874 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tronick SR, Popescu NC, Cheah MS, Swan DC, Amsbaugh SC, Lengel CR, DiPaolo JA, Robbins KC (říjen 1985). „of the Sciences of the United States of America“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82 (19): 6595–9. doi:10.1073 / pnas.82.19.6595. PMC 391256. PMID 2995972.
^ ^A ^b "Entrez Gene: FGR Gardner-Rasheed kočičí sarkom virový (v-fgr) onkogenní homolog".
^ Rasheed S, Barbacid M, Aaronson S, Gardner MB (únor 1982). "Původ a biologické vlastnosti nového viru kočičího sarkomu". Virologie. 117 (1): 238–44. doi:10.1016/0042-6822(82)90522-0. PMID 6175084.
^ Banin S, Truong O, Katz DR, Waterfield MD, Brickell PM, Dna I (srpen 1996). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu (WASp) je vazebným partnerem pro protein-tyrosinkinázy rodiny c-Src.“ Aktuální biologie. 6 (8): 981–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00642-5. PMID 8805332.
^ Finan PM, Soames CJ, Wilson L, Nelson DL, Stewart DM, Truong O, Hsuan JJ, Kellie S (říjen 1996). "Identifikace oblastí proteinu Wiskott-Aldrichova syndromu odpovědného za asociaci s vybranými doménami 3 homologie Src" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 271 (42): 26291–5. doi:10.1074 / jbc.271.42.26291. PMID 8824280.
^ Rivero-Lezcano OM, Marcilla A, Sameshima JH, Robbins KC (říjen 1995). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu se fyzicky asociuje s Nck prostřednictvím 3 domén Src homologie“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (10): 5725–31. doi:10.1128 / MCB.15.10.5725. PMC 230823. PMID 7565724.

Další čtení

Patel M, Faulkner L, Katz DR, Brickell PM (1991). „C-fgr proto-onkogen: exprese v B-lymfocytech infikovaných virem Epstein-Barr a v buňkách myelomonocytických a granulocytárních linií“. Patobiologie. 59 (4): 289–92. doi:10.1159/000163665. PMID 1652975.
Resh MD (únor 1994). „Myristylace a palmitylace členů rodiny Src: tuky hmoty“. Buňka. 76 (3): 411–3. doi:10.1016 / 0092-8674 (94) 90104-X. PMID 8313462.
Lowell CA, Berton G (březen 1999). "Integrinová signální transdukce v myeloidních leukocytech". Journal of Leukocyte Biology. 65 (3): 313–20. doi:10,1002 / jlb.65.3.313. PMID 10080533.
Snapper SB, Rosen FS (1999). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu (WASP): role v signalizaci a cytoskeletální organizaci“. Výroční přehled imunologie. 17 (1): 905–29. doi:10.1146 / annurev.immunol.17.1.905. PMID 10358777.
Tatosyan AG, Mizenina OA (leden 2000). "Kinázy rodiny Src: struktura a funkce". Biochemie. Biokhimiia. 65 (1): 49–58. PMID 10702640.
Patel MS, Mankoo BS, Brickell PM (duben 1992). „Polymorfní mikrosatelitní repetice se nachází v blízkosti promotorové oblasti proto-onkogenu c-fgr (FGR) na chromozomu 1p36.2-p36.1.“ Lidská molekulární genetika. 1 (1): 65. doi:10,1093 / hmg / 1,1,65-a. PMID 1339476.
Link DC, Gutkind SJ, Robbins KC, Ley TJ (květen 1992). „Charakterizace 5 'nepřekládané oblasti lidského genu c-fgr a identifikace hlavního myelomonocytového promotoru c-fgr“. Onkogen. 7 (5): 877–84. PMID 1373875.
Patel M, Leevers SJ, Brickell PM (únor 1990). "Struktura kompletního lidského c-fgr protoonkogenu a identifikace více počátečních transkripčních míst". Onkogen. 5 (2): 201–6. PMID 1690869.
Biondi A, Paganin C, Rossi V, Benvestito S, Perlmutter RM, Mantovani A, Allavena P (březen 1991). „Exprese genů proteinové tyrosinkinázy s omezením na linii v lidských přirozených zabijáckých buňkách“. European Journal of Immunology. 21 (3): 843–6. doi:10.1002 / eji.1830210348. PMID 1826268.
Gutkind JS, Link DC, Katamine S, Lacal P, Miki T, Ley TJ, Robbins KC (březen 1991). „Nový exon c-fgr používaný v B lymfocytech infikovaných virem Epstein-Barr, ale ne v normálních monocytech“. Molekulární a buněčná biologie. 11 (3): 1500–7. doi:10.1128 / MCB.11.3.1500. PMC 369433. PMID 1847500.
Patel M, Leevers SJ, Brickell PM (únor 1990). „Regulace exprese proto-onkogenu c-fgr v B-buněčných liniích infikovaných virem Epstein-Barr“. International Journal of Cancer. 45 (2): 342–6. doi:10.1002 / ijc.2910450222. PMID 2154410.
Parker RC, Mardon G, Lebo RV, Varmus HE, Bishop JM (duben 1985). „Izolace duplikovaných lidských genů c-src lokalizovaných na chromozomech 1 a 20“. Molekulární a buněčná biologie. 5 (4): 831–8. doi:10.1128 / MCB.5.4.831. PMC 366788. PMID 2581127.
Brickell PM, Patel M (prosinec 1988). "Struktura a exprese m-RNA protoonkogenu c-fgr v buněčných liniích konvertovaných virem Epstein-Barr". British Journal of Cancer. 58 (6): 704–9. doi:10.1038 / bjc.1988.294. PMC 2246855. PMID 2852026.
Tronick SR, Popescu NC, Cheah MS, Swan DC, Amsbaugh SC, Lengel CR, DiPaolo JA, Robbins KC (říjen 1985). "Izolace a chromozomální lokalizace lidského fgr protoonkogenu, odlišného člena rodiny genů tyrosinkinázy". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 82 (19): 6595–9. doi:10.1073 / pnas.82.19.6595. PMC 391256. PMID 2995972.
Cheah MS, Ley TJ, Tronick SR, Robbins KC (1986). "fgr protoonkogenní mRNA indukovaná v B lymfocytech infekcí virem Epstein-Barr". Příroda. 319 (6050): 238–40. doi:10.1038 / 319238a0. PMID 3003578.
Nishizawa M, Semba K, Yoshida MC, Yamamoto T, Sasaki M, Toyoshima K (únor 1986). "Struktura, exprese a chromozomální umístění lidského genu c-fgr". Molekulární a buněčná biologie. 6 (2): 511–7. doi:10.1128 / MCB.6.2.511. PMC 367540. PMID 3023853.
Katamine S, Notario V, Rao CD, Miki T, Cheah MS, Tronick SR, Robbins KC (leden 1988). "Primární struktura lidského fgr protoonkogenního produktu p55c-fgr". Molekulární a buněčná biologie. 8 (1): 259–66. doi:10.1128 / MCB.8.1.259. PMC 363113. PMID 3275868.
Inoue K, Ikawa S, Semba K, Sukegawa J, Yamamoto T, Toyoshima K (1988). „Izolace a sekvenování klonů cDNA homologních s v-fgr onkogenem z buněčné linie lidských B lymfocytů, IM-9“. Onkogen. 1 (3): 301–4. PMID 3330776.
Nishizawa M, Semba K, Yamamoto T, Toyoshima K (březen 1985). "Lidský gen c-f gr neobsahuje kódující sekvenci pro protein podobný aktinu". Japonský žurnál výzkumu rakoviny. 76 (3): 155–9. PMID 3922831.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000000938 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028874 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2995972-5] Tronick SR, Popescu NC, Cheah MS, Swan DC, Amsbaugh SC, Lengel CR, DiPaolo JA, Robbins KC (říjen 1985). „of the Sciences of the United States of America“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82 (19): 6595–9. doi:10.1073 / pnas.82.19.6595. PMC 391256. PMID 2995972.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: FGR Gardner-Rasheed kočičí sarkom virový (v-fgr) onkogenní homolog".

[pmid6175084-7] Rasheed S, Barbacid M, Aaronson S, Gardner MB (únor 1982). "Původ a biologické vlastnosti nového viru kočičího sarkomu". Virologie. 117 (1): 238–44. doi:10.1016/0042-6822(82)90522-0. PMID 6175084.

[pmid8805332-8] Banin S, Truong O, Katz DR, Waterfield MD, Brickell PM, Dna I (srpen 1996). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu (WASp) je vazebným partnerem pro protein-tyrosinkinázy rodiny c-Src.“ Aktuální biologie. 6 (8): 981–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00642-5. PMID 8805332.

[pmid8824280-9] Finan PM, Soames CJ, Wilson L, Nelson DL, Stewart DM, Truong O, Hsuan JJ, Kellie S (říjen 1996). "Identifikace oblastí proteinu Wiskott-Aldrichova syndromu odpovědného za asociaci s vybranými doménami 3 homologie Src" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 271 (42): 26291–5. doi:10.1074 / jbc.271.42.26291. PMID 8824280.

[pmid7565724-10] Rivero-Lezcano OM, Marcilla A, Sameshima JH, Robbins KC (říjen 1995). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu se fyzicky asociuje s Nck prostřednictvím 3 domén Src homologie“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (10): 5725–31. doi:10.1128 / MCB.15.10.5725. PMC 230823. PMID 7565724.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )