PDGFA - PDGFA

PDGFA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3 MJK
Identifikátory
Aliasy	PDGFA, PDGF-A, PDGF1, podjednotka A růstového faktoru odvozeného z destiček
Externí ID	OMIM: 173430 MGI: 97527 HomoloGene: 32055 Genové karty: PDGFA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	520,296 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	138,997,370 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kolagenu; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba růstového faktoru odvozeného z krevních destiček; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita růstového faktoru; • Aktivita faktoru výměny ras guanyl-nukleotidů; • aktivita fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát 3-kinázy; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• lumen endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • extracelulární oblast; • mikrovilli; • povrch buňky; • lumen destiček alfa granule; • extracelulární; • Golgiho lumen;
Biologický proces	• vývoj vlasového folikulu; • embryonální vývoj plic; • pozitivní regulace migrace metanefrických mezenchymálních buněk signální cestou receptoru beta beta růstového faktoru; • negativní chemotaxe; • regulace organizace aktinového cytoskeletu; • pozitivní regulace aktivity MAP kinázy; • regulace větvení účastnících se morfogeneze slinných žláz epiteliálně-mezenchymální signalizací; • pozitivní regulace buněčné migrace; • pozitivní regulace proliferace fibroblastů; • signalizace buňka-buňka; • degranulace krevních destiček; • organizace extracelulární matice; • regulace procesu biosyntézy DNA; • aktivace buněk; • Kaskáda MAPK; • negativní regulace aktivace krevních destiček; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace proliferace mezenchymálních buněk; • reakce na zranění; • sestava projekce buněk; • negativní regulace procesu biosyntézy fosfatidylinositolu; • angiogeneze; • pozitivní regulace autofosforylace bílkovin; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • regulace migrace buněk hladkého svalstva; • morfogeneze zvířecích orgánů; • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • signální dráha receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček; • vývoj plicních alveol; • pozitivní regulace buněčného dělení; • organizace aktinového cytoskeletu; • pozitivní regulace kaskády MAPK; • vývoj kůže; • regulace proliferace glomerulárních mezangiálních buněk; • regulace fosforylace peptidyl-tyrosinu; • hojení ran; • fosforylace fosfatidylinositolu; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • regulace aktivity receptoru; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5154
	18590
	ENSG00000197461
	ENSMUSG00000025856
	P04085
	P20033
	NM_002607; NM_033023
	NM_008808; NM_001363271
	NP_002598; NP_148983
	NP_032834; NP_001350200
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka růstového faktoru odvozená z krevních destiček A je protein že u lidí je kódován PDGFA gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem růstový faktor odvozený z krevních destiček rodina. Čtyři členové této rodiny jsou mitogenní faktory pro buňky mezenchymální původu a vyznačují se a motiv osmi cysteinů. Tento genový produkt může existovat buď jako homodimer nebo jako heterodimer s polypeptidem růstového faktoru beta odvozeným z krevních destiček, kde jsou dimery spojeny disulfidové vazby. Studie využívají knockout myši ukázaly buněčné vady v oligodendrocyty, alveolární buňky hladkého svalstva a Leydigovy buňky v varle; knockout myši umírají buď jako embrya nebo krátce po narození. Pro tento gen byly identifikovány dvě varianty sestřihu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197461 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025856 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Stenman G, Rorsman F, Huebner K, Betsholtz C (září 1992). „Gen alfa řetězce růstového faktoru odvozeného z krevních destiček (PDGFA) se mapuje na chromozom 7p22“. Cytogenet Cell Genet. 60 (3–4): 206–7. doi:10.1159/000133337. PMID 1505216.
^ Matsui T, Heidaran M, Miki T, Popescu N, La Rochelle W, Kraus M, Pierce J, Aaronson S (březen 1989). „Izolace nové receptorové cDNA potvrzuje existenci dvou genů receptoru PDGF“. Věda. 243 (4892): 800–4. doi:10.1126 / science.2536956. PMID 2536956.
^ "Entrez Gene: PDGFA destičkový růstový faktor alfa polypeptid".

Další čtení

Nath K, Gogi R, Khan AA, Hameed S (1978). "Cévní hamartom a vaskulární nádory oběžné dráhy". Indian Journal of Ophthalmology. 25 (1): 18–23. PMID 612586.
Ishibashi T, Bottaro DP, Chan A a kol. (1993). "Expresní klonování lidské dvojí specificity fosfatázy". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (24): 12170–4. doi:10.1073 / pnas.89.24.12170. PMC 50720. PMID 1281549.
Raines EW, Lane TF, Iruela-Arispe ML a kol. (1992). „Extracelulární glykoprotein SPARC interaguje s růstovým faktorem odvozeným z krevních destiček (PDGF) -AB a -BB a inhibuje vazbu PDGF na jeho receptory.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (4): 1281–5. doi:10.1073 / pnas.89.4.1281. PMC 48433. PMID 1311092.
Andersson M, Ostman A, Bäckström G a kol. (1992). „Přiřazení meziřetězcových disulfidových vazeb v růstovém faktoru odvozeném z krevních destiček (PDGF) a důkaz agonistické aktivity monomerního PDGF“. J. Biol. Chem. 267 (16): 11260–6. PMID 1317862.
Rorsman F, Leveen P, Betsholtz C (1993). „Destičkový růstový faktor (PDGF) A-řetězec mRNA heterogenita generovaná použitím alternativních promotorů a alternativních polyadenylačních míst“. Faktory růstu. 7 (3): 241–51. doi:10.3109/08977199209046928. PMID 1360804.
Wang Z, Lin XH, Qiu QQ, Deuel TF (1992). „Modulace transkripce genu A-řetězce růstového faktoru odvozeného z krevních destiček promotorovou oblastí citlivou na nukleázu S1“. J. Biol. Chem. 267 (24): 17022–31. PMID 1512241.
Bonthron D, Collins T, Grzeschik KH a kol. (1992). „Řetězec růstového faktoru A odvozený z krevních destiček: potvrzení lokalizace PDGFA na chromozom 7p22 a popis neobvyklého minisatelitu“. Genomika. 13 (2): 257–63. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90240-S. PMID 1612586.
Takimoto Y, Wang ZY, Kobler K, Deuel TF (1991). „Promotorová oblast genu A-řetězce růstového faktoru odvozeného z lidských destiček“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (5): 1686–90. doi:10.1073 / pnas.88.5.1686. PMC 51089. PMID 1848007.
Fabisiak JP, Evans JN, Absher M a kol. (1991). "Exprese mRNA růstového faktoru A-řetězce (PDGF-A) odvozeného z krevních destiček v plicní tkáni a buňkách. Složitá regulace během remodelace". Hruď. 99 (3 doplňky): 52S – 54S. doi:10,1378 / hrudník. 99,3_ doplněk. 52S. PMID 1997274.
Mendoza AE, Young R, Orkin SH, Collins T (1990). „Zvýšená exprese A-řetězce růstového faktoru odvozeného z krevních destiček v buňkách hladkého svalstva lidské dělohy během fyziologické hypertrofie těhotenství“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (6): 2177–81. doi:10.1073 / pnas.87.6.2177. PMC 53649. PMID 2315311.
Claesson-Welsh L, Eriksson A, Westermark B, Heldin CH (1989). „Klonování cDNA a exprese receptoru lidského růstového faktoru typu A (PDGF) stanoví strukturální podobnost s receptorem PDGF typu B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (13): 4917–21. doi:10.1073 / pnas.86.13.4917. PMC 297526. PMID 2544881.
Rorsman F, Bywater M, Knott TJ a kol. (1988). „Strukturální charakterizace cDNA a genu A-řetězce růstového faktoru odvozeného z lidských destiček: alternativní použití exonu předpovídá dva různé prekurzorové proteiny“. Mol. Buňka. Biol. 8 (2): 571–7. doi:10.1128 / MCB.8.2.571. PMC 363182. PMID 2832727.
Beckmann MP, Betsholtz C, Heldin CH a kol. (1988). „Srovnání biologických vlastností a transformačního potenciálu lidských řetězců PDGF-A a PDGF-B“. Věda. 241 (4871): 1346–9. doi:10.1126 / science.2842868. PMID 2842868.
Bonthron DT, Morton CC, Orkin SH, Collins T (1988). „Řetězec růstového faktoru A odvozený z krevních destiček: struktura genu, umístění chromozomů a základ pro alternativní sestřih mRNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85 (5): 1492–6. doi:10.1073 / pnas.85.5.1492. PMC 279797. PMID 3422746.
Tong BD, Auer DE, Jaye M a kol. (1987). „Klony cDNA odhalují rozdíly mezi řetězci A růstového faktoru z lidských gliových a endoteliálních buněk z růstových faktorů“. Příroda. 328 (6131): 619–21. doi:10.1038 / 328619a0. PMID 3614363. S2CID 4362771.
Collins T, Bonthron DT, Orkin SH (1987). „Alternativní sestřih RNA ovlivňuje funkci kódovaného řetězce růstového faktoru A odvozeného z destiček“. Příroda. 328 (6131): 621–4. doi:10.1038 / 328621a0. PMID 3614364. S2CID 4268696.
Hoppe J, Schumacher L, Eichner W, Weich HA (1987). "Dlouhé 3'-nepřekládané oblasti PDGF-A a -B mRNA jsou jen vzdáleně příbuzné". FEBS Lett. 223 (2): 243–6. doi:10.1016/0014-5793(87)80297-1. PMID 3666150. S2CID 46032767.
Betsholtz C, Johnsson A, Heldin CH a kol. (1986). „sekvence cDNA a chromozomální lokalizace řetězce A růstového faktoru odvozeného z krevních destiček a jeho exprese v liniích nádorových buněk“. Příroda. 320 (6064): 695–9. doi:10.1038 / 320695a0. PMID 3754619. S2CID 4281536.
Takimoto Y, Li WY, Wang ZY a kol. (1993). „Nukleotidová sekvence v 5 'oblasti genu A-řetězce lidského růstového faktoru odvozeného z krevních destiček“. Hirošima J. Med. Sci. 42 (1): 47–52. PMID 8486521.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197461 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025856 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1505216-5] Stenman G, Rorsman F, Huebner K, Betsholtz C (září 1992). „Gen alfa řetězce růstového faktoru odvozeného z krevních destiček (PDGFA) se mapuje na chromozom 7p22“. Cytogenet Cell Genet. 60 (3–4): 206–7. doi:10.1159/000133337. PMID 1505216.

[pmid2536956-6] Matsui T, Heidaran M, Miki T, Popescu N, La Rochelle W, Kraus M, Pierce J, Aaronson S (březen 1989). „Izolace nové receptorové cDNA potvrzuje existenci dvou genů receptoru PDGF“. Věda. 243 (4892): 800–4. doi:10.1126 / science.2536956. PMID 2536956.

[entrez-7] "Entrez Gene: PDGFA destičkový růstový faktor alfa polypeptid".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]