EPH receptor A4 - EPH receptor A4

EPHA4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LW8, 2WO1, 2WO2, 2WO3, 3CKH, 3GXU, 4BK4, 4BK5, 4BKA, 4BKF, 4M4P, 4M4R, 4W4Z, 4W50, 5JR2
Identifikátory
Aliasy	EPHA4, Epha4, 2900005C20Rik, AI385584, Cek8, Hek8, Sek, Sek1, Tyro1, rb, EPH receptor A4, HEK8, SEK, TYRO1, EK8
Externí ID	OMIM: 602188 MGI: 98277 HomoloGene: 20933 Genové karty: EPHA4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	221,574,202 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	77,515,088 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita proteinkinázy; • vazba nukleotidů; • Aktivita receptoru efrinu spojeného s GPI; • vazba na efrinový receptor; • Vazba domény DH; • aktivita transmembránového efrinu; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • Vazba na doménu PH; • aktivita protein tyrosinkinázy; • ATP vazba; • aktivita receptoru efrinu; • vazba amyloid-beta; • vazba protein tyrosinkinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • axonový konec; • integrální součást membrány; • buněčné tělo; • perikaryon; • postsynaptická membrána; • Golgiho aparát; • endozom; • buněčná projekce; • časná endosomová membrána; • membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • filopodium; • neuromuskulární spojení; • buněčná membrána; • dendritická páteř; • axonální růstový kužel; • integrální součást plazmatické membrány; • synapse; • povrch buňky; • mitochondriální vnější membrána; • buněčné spojení; • axon; • dendrit; • časný endosom; • endoplazmatické retikulum; • neuronová projekce; • dendritická hřídel; • receptorový komplex; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • glutamátergická synapse; • integrální součást postsynaptické membrány; • integrální součást presynaptické membrány;
Biologický proces	• negativní regulace regenerace axonů; • fascikulace axonu motorického neuronu; • fosforylace; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • pozitivní regulace aktivity JUN kinázy; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • vývoj nervového systému; • regulace axonogeneze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • fosforylace bílkovin; • regulace diferenciace astrocytů; • buněčná adheze; • pozitivní regulace morfogeneze dendritů; • morfogeneze nefrického kanálu; • autofosforylace; • morfogeneze kortikospinálního traktu; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • fascikulace axonu senzorických neuronů; • vedení motorických neuronů axonem; • pozitivní regulace aktivity výměnného faktoru Rho guanyl-nukleotid; • regulace morfogeneze dendritické páteře; • migrace gliových buněk; • chování dospělých při chůzi; • axonové vedení; • signální dráha receptoru efrinu; • negativní regulace vývoje projekce neuronů; • stabilizace bílkovin; • pozitivní regulace aktivity protein tyrosin kinázy; • vedení projekce neuronů; • demontáž synapse; • fasciculace neuronové projekce; • negativní regulace dlouhodobé synaptické potenciace; • pozitivní regulace tvorby amyloidu-beta; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy aspartátového typu podílející se na katabolickém procesu proteinu prekurzoru amyloidu; • negativní regulace proteolýzy účastnící se katabolického procesu buněčných proteinů; • buněčná odpověď na amyloid-beta; • regulace modifikace synaptické struktury;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2043
	13838
	ENSG00000116106
	ENSMUSG00000026235
	P54764
	Q03137
	NM_001304536; NM_001304537; NM_004438; NM_001363748
	NM_007936
	NP_001291465; NP_001291466; NP_004429; NP_001350677
	NP_031962
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

EPH receptor A4 (receptor ephrinu typu A 4) je protein že u lidí je kódován EPHA4 gen.^[5]^[6]

Tento gen patří do ephrin podrodina receptoru protein-tyrosinkináza rodina. EPH a receptory související s EPH se podílejí na zprostředkování vývojových událostí, zejména v nervový systém. Receptory v podrodině EPH mají obvykle jediný kináza doména a extracelulární oblast obsahující doménu bohatou na Cys a 2 fibronektin opakování typu III. Efrinové receptory jsou rozděleny do 2 skupin na základě podobnosti sekvencí jejich extracelulárních domén a jejich afinit k vazbě na ephrin-A a ephrin-B ligandy.^[6]

V roce 2012 byla vydána publikace v Přírodní medicína odhalila souvislost mezi EPHA4 a neurodegenerativním onemocněním Amyotrofní laterální skleróza (ALS), kde defektní gen umožňuje pacientům s ALS žít podstatně déle než pacienti s intaktním genem. To otevírá vývoj léčby této v současnosti neléčitelné nemoci.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116106 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026235 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ephnomenclature Committee (září 1997). "Jednotná nomenklatura pro receptory rodiny Eph a jejich ligandy, efriny. Výbor pro nomenklaturu Eph". Buňka. 90 (3): 403–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID 9267020. S2CID 26773768.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EPHA4 EPH receptor A4“.

Další čtení

Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). "Efriny a receptory Eph v nervovém vývoji". Annu. Rev. Neurosci. 21: 309–45. doi:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499.
Zhou R (1998). "Eph receptory a ligandy rodiny". Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. doi:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID 9576626.
Holder N, Klein R (1999). "Eph receptory a efriny: efektory morfogeneze". Rozvoj. 126 (10): 2033–44. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). „Eph receptory a efriny: regulátory vedení a montáže; Kapitola: Eph receptory a efriny: regulátory vedení a montáže“. Int. Reverend Cytol. International Review of Cytology. 196: 177–244. doi:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN 978-0-12-364600-2. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (2001). "Role Eph receptorů a efrinů v segmentovém vzorování". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 355 (1399): 993–1002. doi:10.1098 / rstb.2000.0635. PMC 1692797. PMID 11128993.
Wilkinson DG (2001). "Více rolí EPH receptorů a efrinů v nervovém vývoji". Nat. Rev. Neurosci. 2 (3): 155–64. doi:10.1038/35058515. PMID 11256076. S2CID 205014301.
Fox GM, Holst PL, Chute HT a kol. (1995). "cDNA klonování a tkáňová distribuce pěti lidských EPH podobných receptorových proteinových tyrosin kináz". Onkogen. 10 (5): 897–905. PMID 7898931.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Ellis C, Kasmi F, Ganju P a kol. (1996). „Juxtamembránové autofosforylační místo v receptorové tyrosinkináze rodiny Eph, Sek, zprostředkovává vysoce afinitní interakci s p59fyn“. Onkogen. 12 (8): 1727–36. PMID 8622893.
Gale NW, Holland SJ, Valenzuela DM a kol. (1996). „Eph receptory a ligandy obsahují dvě hlavní podtřídy specificity a jsou během embryogeneze recipročně rozčleněny“. Neuron. 17 (1): 9–19. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80276-7. PMID 8755474. S2CID 1075856.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Aasheim HC, Terstappen LW, Logtenberg T (1997). „Regulovaná exprese receptoru tyrosinkinázy Hekll souvisejícího s Eph v časné lidské B lymfopoéze“. Krev. 90 (9): 3613–22. doi:10,1182 / krev. V90.9.3613. PMID 9345045.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Bergemann AD, Zhang L, Chiang MK a kol. (1998). „Ephrin-B3, ligand pro receptor EphB3, exprimovaný ve středové čáře vyvíjející se neurální trubice“. Onkogen. 16 (4): 471–80. doi:10.1038 / sj.onc.1201557. PMID 9484836.
Janis LS, Cassidy RM, Kromer LF (1999). „Vazba Ephrin-A a exprese EphA receptoru vymezují matriční kompartment striata“. J. Neurosci. 19 (12): 4962–71. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-12-04962.1999. PMC 6782661. PMID 10366629.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116106 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026235 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9267020-5] Ephnomenclature Committee (září 1997). "Jednotná nomenklatura pro receptory rodiny Eph a jejich ligandy, efriny. Výbor pro nomenklaturu Eph". Buňka. 90 (3): 403–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID 9267020. S2CID 26773768.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: EPHA4 EPH receptor A4“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )