EPH receptor A3 - EPH receptor A3

EPHA3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 GSF, 2QO7, 2QO9, 2QOB, 2QOC, 2QOD, 2QOF, 2QOI, 2QOK, 2QOL, 2QON, 2QOO, 2QOQ, 3DZQ, 3FXX, 3FY2, 4G2F, 4GK2, 4GK3, 4GK4, 4L0P, 4P4C, 4P5Q, 4P5Z, 4 TWW, 4TWO
Identifikátory
Aliasy	EPHA3, Epha3, AW492086, Cek4, ETK1, End3, Hek, Hek4, Mek4, Tyro4, EK4, ETK, EPH receptor A3, HEK, HEK4, TYRO4
Externí ID	OMIM: 179611 MGI: 99612 HomoloGene: 21083 Genové karty: EPHA3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	89,482,134 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	63,864,175 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • Aktivita receptoru efrinu spojeného s GPI; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • aktivita protein tyrosinkinázy; • ATP vazba; • aktivita receptoru efrinu; • receptor tyrosinkinázy; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • aktivita transmembránového efrinu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární oblast; • časný endosom; • cytoplazma; • neuronová projekce; • receptorový komplex;
Biologický proces	• buněčná odpověď na kyselinu retinovou; • regulace organizace aktinového cytoskeletu; • fascikulace axonu motorického neuronu; • fosforylace; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • regulace přechodu mezi epitelem a mezenchymem; • regulace organizace mikrotubulárního cytoskeletu; • fosforylace bílkovin; • buněčná adheze; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • regulace sestavy ohniskové adheze; • fascikulace axonu senzorických neuronů; • migrace buněk; • signální dráha receptoru efrinu; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • negativní regulace endocytózy; • pozitivní regulace lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • negativní regulace přenosu signálu; • diferenciace buněk; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • axonové vedení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2042
	13837
	ENSG00000044524
	ENSMUSG00000052504
	P29320
	P29319; Q8BRB1
	NM_005233; NM_182644
	NM_010140; NM_001362452
	NP_005224; NP_872585
	NP_034270; NP_001349381
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

EPH receptor A3 (receptor ephrinu typu A 3) je protein že u lidí je kódován EPHA3 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen patří do podrodiny efrinových receptorů rodiny protein-tyrosinkináz. EPH a receptory související s EPH se podílejí na zprostředkování vývojových událostí, zejména v nervovém systému. Receptory v podrodině EPH mají obvykle jednu kinázovou doménu a extracelulární oblast obsahující doménu bohatou na Cys a 2 opakování fibronektinu typu III. Efrinové receptory jsou rozděleny do 2 skupin na základě podobnosti jejich sekvencí extracelulárních domén a jejich afinit pro vazbu ligandů ephrin-A a ephrin-B. Tento gen kóduje protein, který váže ligandy ephrin-A. Pro tento gen byly popsány dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že receptor EPH A3 komunikovat s EFNB2^[8]^[9] a EFNA5.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000044524 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000052504 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Boyd AW, Ward LD, Wicks IP, Simpson RJ, Salvaris E, Wilks A, Welch K, Loudovaris M, Rockman S, Busmanis I (březen 1992). „Izolace a charakterizace nové proteinové tyrosinkinázy receptorového typu (hek) z lidské buněčné linie pre-B“. J Biol Chem. 267 (5): 3262–7. PMID 1737782.
^ Wicks IP, Wilkinson D, Salvaris E, Boyd AW (duben 1992). "Molekulární klonování HEK, genu kódujícího receptorovou tyrosinkinázu exprimovanou lidskými lymfoidními buněčnými liniemi". Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (5): 1611–5. doi:10.1073 / pnas.89.5.1611. PMC 48502. PMID 1311845.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EPHA3 EPH receptor A3“.
^ Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (listopad 1995). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Mol. Immunol. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.
^ ^A ^b Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (červen 1997). „Ligand pro EPH-příbuznou kinázu (LERK) 7 je upřednostňovaný vysoce afinitní ligand pro HEK receptor“. J. Biol. Chem. 272 (26): 16521–30. doi:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID 9195962.
^ Kozlosky CJ, VandenBos T, Park L, Cerretti DP, Carpenter MK (srpen 1997). „LERK-7: ligand kináz souvisejících s Eph je vývojově regulován v mozku“. Cytokin. 9 (8): 540–9. doi:10.1006 / cyto.1997.0199. PMID 9245480.

Další čtení

Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). "Efriny a receptory Eph v nervovém vývoji". Annu. Rev. Neurosci. 21: 309–45. doi:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499.
Zhou R (1998). "Eph receptory a ligandy rodiny". Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. doi:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID 9576626.
Ernst AF, Jurney WM, McLoon SC (1999). "Mechanismy podílející se na vývoji retinotektálních spojení: role Eph receptorových tyrosin kináz, NMDA receptorů a oxidu dusnatého". Prog. Brain Res. 118: 115–31. doi:10.1016 / S0079-6123 (08) 63204-5. PMID 9932438.
Holder N, Klein R (1999). "Eph receptory a efriny: efektory morfogeneze". Rozvoj. 126 (10): 2033–44. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). "Eph receptory a efriny: regulátory vedení a montáže". Int. Reverend Cytol. International Review of Cytology. 196: 177–244. doi:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN 9780123646002. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (2001). "Role Eph receptorů a efrinů v segmentovém vzorování". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 355 (1399): 993–1002. doi:10.1098 / rstb.2000.0635. PMC 1692797. PMID 11128993.
Wilkinson DG (2001). "Více rolí EPH receptorů a efrinů v nervovém vývoji". Nat. Rev. Neurosci. 2 (3): 155–64. doi:10.1038/35058515. PMID 11256076. S2CID 205014301.
Beckmann MP, Cerretti DP, Baum P, Vanden Bos T, James L, Farrah T, Kozlosky C, Hollingsworth T, Shilling H, Maraskovsky E (1994). "Molekulární charakterizace rodiny ligandů pro receptory tyrosinkinázy související s ef". EMBO J.. 13 (16): 3757–62. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06685.x. PMC 395287. PMID 8070404.
Wicks IP, Lapsys NM, Baker E, Campbell LJ, Boyd AW, Sutherland GR (1994). "Lokalizace lidské receptorové tyrosinkinázy (ETK1) do chromozomové oblasti 3p11.2". Genomika. 19 (1): 38–41. doi:10.1006 / geno.1994.1009. PMID 8188238.
Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (1996). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Mol. Immunol. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.
Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (1997). „Ligand pro EPH-příbuznou kinázu (LERK) 7 je upřednostňovaný vysoce afinitní ligand pro HEK receptor“. J. Biol. Chem. 272 (26): 16521–30. doi:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID 9195962.
Kozlosky CJ, VandenBos T, Park L, Cerretti DP, Carpenter MK (1997). „LERK-7: ligand kináz souvisejících s Eph je vývojově regulován v mozku“. Cytokin. 9 (8): 540–9. doi:10.1006 / cyto.1997.0199. PMID 9245480.
Ephnomenclature Committee (1997). "Jednotná nomenklatura pro receptory rodiny Eph a jejich ligandy, efriny. Výbor pro nomenklaturu Eph". Buňka. 90 (3): 403–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID 9267020. S2CID 26773768.
Lackmann M, Oates AC, Dottori M, Smith FM, Do C, Power M, Kravets L, Boyd AW (1998). „Výrazné subdomény receptoru EphA3 zprostředkovávají vazbu ligandu a dimerizaci receptoru“. J. Biol. Chem. 273 (32): 20228–37. doi:10.1074 / jbc.273.32.20228. PMID 9685371.
Ciossek T, Monschau B, Kremoser C, Löschinger J, Lang S, Müller BK, Bonhoeffer F, Drescher U (1998). „Interakce Eph receptor-ligand jsou nezbytné pro vedení axonů gangliových buněk sítnice in vitro“. Eur. J. Neurosci. 10 (5): 1574–80. doi:10.1046 / j.1460-9568.1998.00180.x. PMID 9751130. S2CID 20470923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000044524 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000052504 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1737782-5] Boyd AW, Ward LD, Wicks IP, Simpson RJ, Salvaris E, Wilks A, Welch K, Loudovaris M, Rockman S, Busmanis I (březen 1992). „Izolace a charakterizace nové proteinové tyrosinkinázy receptorového typu (hek) z lidské buněčné linie pre-B“. J Biol Chem. 267 (5): 3262–7. PMID 1737782.

[pmid1311845-6] Wicks IP, Wilkinson D, Salvaris E, Boyd AW (duben 1992). "Molekulární klonování HEK, genu kódujícího receptorovou tyrosinkinázu exprimovanou lidskými lymfoidními buněčnými liniemi". Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (5): 1611–5. doi:10.1073 / pnas.89.5.1611. PMC 48502. PMID 1311845.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: EPHA3 EPH receptor A3“.

[pmid8559144-8] Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (listopad 1995). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Mol. Immunol. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.

[pmid9195962-9] A ^b Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (červen 1997). „Ligand pro EPH-příbuznou kinázu (LERK) 7 je upřednostňovaný vysoce afinitní ligand pro HEK receptor“. J. Biol. Chem. 272 (26): 16521–30. doi:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID 9195962.

[pmid9245480-10] Kozlosky CJ, VandenBos T, Park L, Cerretti DP, Carpenter MK (srpen 1997). „LERK-7: ligand kináz souvisejících s Eph je vývojově regulován v mozku“. Cytokin. 9 (8): 540–9. doi:10.1006 / cyto.1997.0199. PMID 9245480.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )