SIRPB1 - SIRPB1

SIRPB1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D9C, 2JJU, %% s2JJV
Identifikátory
Aliasy	SIRPB1„CD172b, SIRP-BETA-1, signální regulační protein beta 1
Externí ID	OMIM: 603889 MGI: 3779828 HomoloGene: 82993 Genové karty: SIRPB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	1,620,061 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	15,575,065 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána; • sekreční granulární membrána; • povrch buňky;
Biologický proces	• signální dráha receptoru buněčného povrchu; • vrozený imunitní systém; • signální transdukce; • degranulace neutrofilů; • pozitivní regulace adheze buněk k buňkám; • pozitivní regulace fagocytózy; • pozitivní regulace aktivace T buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10326
	668101
	ENSG00000101307
	ENSMUSG00000095028
	O00241; Q5TFQ8
	n / a
	NM_001083910; NM_001135844; NM_006065; NM_001329157; NM_001330639
	NM_001173460
NP_001077379; NP_001129316; NP_001316086; NP_001317568; NP_006056;
	NP_001129316.1
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Signálně-regulační protein beta-1 je protein že u lidí je kódován SIRPB1 gen.^[5]^[6]^[7] Nedávno byl rovněž určen SIRPB1 CD172B (shluk diferenciace 172B).

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny signálních regulačních proteinů (SIRP) a také patří do nadrodiny imunoglobulinů. Členové rodiny SIRP jsou transmembránové glykoproteiny receptorového typu je známo, že se účastní negativní regulace signálních procesů spojených s receptorem tyrosinkinázy. Bylo zjištěno, že tento protein interaguje s TYROBP / DAP12, nesoucím protein imunoreceptorové tyrosinové aktivační motivy. Uvádí se také, že tento protein se účastnil náboru tyrosinkinázy SYK. Alternativně byly pro tento gen nalezeny sestřižené varianty transkriptu.^[7]

Interakce

SIRPB1 bylo prokázáno komunikovat s TYROBP.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101307 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000095028 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kharitonenkov A; Chen Z; Sures I; Wang H; Schilling J; Ullrich A (duben 1997). "Rodina proteinů, které inhibují signalizaci prostřednictvím receptorů tyrosinkinázy". Příroda. 386 (6621): 181–6. Bibcode:1997 Natur.386..181K. doi:10.1038 / 386181a0. PMID 9062191. S2CID 4259314.
^ van den Berg TK; van Beek EM; Buhring HJ; Colonna M; Hamaguchi M; Howard CJ; Kasuga M; Liu Y; Matozaki T; Neel BG; Parkos CA; Sano S; Viněta A; Vivier E; Wright M; Zawatzky R; Barclay AN (prosinec 2005). „Nomenklatura pro členy rodiny signálních regulačních proteinů“. J. Immunol. 175 (12): 7788–9. doi:10,4049 / jimmunol.175.12.7788. PMID 16339511.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SIRPB1 signálně-regulační protein beta 1".
^ Dietrich, J; Cella M; Seiffert M; Bühring H J; Colonna M (leden 2000). „Špička: signální regulační protein beta 1 je aktivační receptor asociovaný s DAP12 exprimovaný v myeloidních buňkách“. J. Immunol. SPOJENÉ STÁTY. 164 (1): 9–12. doi:10,4049 / jimmunol.164.1.9. ISSN 0022-1767. PMID 10604985.
^ Tomasello, E; Převýšení C; Bühring H J; Vély F; André P; Seiffert M; Ullrich A; Vivier E (srpen 2000). "Sdružení signálních regulačních proteinů beta s KARAP / DAP-12". Eur. J. Immunol. NĚMECKO. 30 (8): 2147–56. doi:10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2147 :: AID-IMMU2147> 3.0.CO; 2-1. ISSN 0014-2980. PMID 10940905.

Další čtení

Dietrich J, Cella M, Seiffert M a kol. (2000). „Špička: signální regulační protein beta 1 je aktivační receptor asociovaný s DAP12 exprimovaný v myeloidních buňkách“. J. Immunol. 164 (1): 9–12. doi:10,4049 / jimmunol.164.1.9. PMID 10604985.
Tomasello E, Cant C, Bühring HJ a kol. (2000). "Sdružení signálních regulačních proteinů beta s KARAP / DAP-12". Eur. J. Immunol. 30 (8): 2147–56. doi:10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2147 :: AID-IMMU2147> 3.0.CO; 2-1. PMID 10940905.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001 Natur.414..865D. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Cannon JP; Haire RN; Litman GW (2002). "Identifikace diverzifikovaných genů, které obsahují variabilní oblasti podobné imunoglobulinu v protochordátu". Nat. Immunol. 3 (12): 1200–7. doi:10.1038 / ni849. PMID 12415263. S2CID 19367972.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Liu Y, Soto I, Tong Q a kol. (2006). „SIRPbeta1 je exprimován jako disulfidový homodimer v leukocytech a pozitivně reguluje neutrofilní transepiteliální migraci“. J. Biol. Chem. 280 (43): 36132–40. doi:10,1074 / jbc.M506419200. PMID 16081415.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA a kol. (2006). „Analýza lidského plazmatu N-glykoproteomu pomocí odečtení imunoafinity, chemie hydrazidů a hmotnostní spektrometrie“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.

externí odkazy

SIRPB1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
SIRPB1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101307 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000095028 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9062191-5] Kharitonenkov A; Chen Z; Sures I; Wang H; Schilling J; Ullrich A (duben 1997). "Rodina proteinů, které inhibují signalizaci prostřednictvím receptorů tyrosinkinázy". Příroda. 386 (6621): 181–6. Bibcode:1997 Natur.386..181K. doi:10.1038 / 386181a0. PMID 9062191. S2CID 4259314.

[pmid16339511-6] van den Berg TK; van Beek EM; Buhring HJ; Colonna M; Hamaguchi M; Howard CJ; Kasuga M; Liu Y; Matozaki T; Neel BG; Parkos CA; Sano S; Viněta A; Vivier E; Wright M; Zawatzky R; Barclay AN (prosinec 2005). „Nomenklatura pro členy rodiny signálních regulačních proteinů“. J. Immunol. 175 (12): 7788–9. doi:10,4049 / jimmunol.175.12.7788. PMID 16339511.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: SIRPB1 signálně-regulační protein beta 1".

[pmid10604985-8] Dietrich, J; Cella M; Seiffert M; Bühring H J; Colonna M (leden 2000). „Špička: signální regulační protein beta 1 je aktivační receptor asociovaný s DAP12 exprimovaný v myeloidních buňkách“. J. Immunol. SPOJENÉ STÁTY. 164 (1): 9–12. doi:10,4049 / jimmunol.164.1.9. ISSN 0022-1767. PMID 10604985.

[pmid10940905-9] Tomasello, E; Převýšení C; Bühring H J; Vély F; André P; Seiffert M; Ullrich A; Vivier E (srpen 2000). "Sdružení signálních regulačních proteinů beta s KARAP / DAP-12". Eur. J. Immunol. NĚMECKO. 30 (8): 2147–56. doi:10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2147 :: AID-IMMU2147> 3.0.CO; 2-1. ISSN 0014-2980. PMID 10940905.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350