EPH receptor B4 - EPH receptor B4

EPHB4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2BBA, 2E7H, 2QKQ, 2VWU, 2VWV, 2VWW, 2VWX, 2VWY, 2VWZ, 2VX0, 2VX1, 2X9F, 2XVD, 2YN8, 3ZEW, 4AW5, 4BB4, 2HLE
Identifikátory
Aliasy	EPHB4, Ephb4, AI042935, Htk, MDK2, Myk1, Tyro11, EPH receptor B4, HTK, MYK1, TYRO11, HFASD, CMAVM2, LMPHM7
Externí ID	OMIM: 600011 MGI: 104757 HomoloGene: 20939 Genové karty: EPHB4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	100,827,523 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	137,378,669 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • aktivita protein tyrosinkinázy; • ATP vazba; • aktivita receptoru efrinu; • aktivita transmembránového efrinu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • cytosol; • membrána; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • neuronová projekce; • receptorový komplex;
Biologický proces	• fosforylace; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • morfogeneze srdce; • buněčná migrace zapojená do klíčení angiogeneze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • fosforylace bílkovin; • buněčná adheze; • angiogeneze; • autofosforylace; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • signální dráha receptoru efrinu; • axonové vedení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2050
	13846
	ENSG00000196411
	ENSMUSG00000029710
	P54760
	P54761
	NM_004444
	NM_001159571; NM_010144
	NP_004435
	NP_001153043; NP_034274
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Efrinový receptor typu B 4 je protein že u lidí je kódován EPHB4 gen.^[5]^[6]

Efrinové receptory a jejich ligandy, efriny, zprostředkovávají řadu vývojových procesů, zejména v nervovém systému. Na základě jejich struktur a sekvenčních vztahů jsou efriny rozděleny do třídy ephrin-A (EFNA), které jsou ukotveny k membráně glykosylfosfatidylinositolovou vazbou, a třídy ephrin-B (EFNB), což jsou transmembránové proteiny. Rodina receptorů Eph je rozdělena do 2 skupin na základě podobnosti jejich sekvencí extracelulárních domén a jejich afinit pro vazbu ligandů ephrin-A a ephrin-B. Efrinové receptory tvoří největší podskupinu rodiny receptorových tyrosinkináz (RTK). Protein kódovaný tímto genem se váže na ephrin-B2 a hraje zásadní roli ve vaskulárním vývoji.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196411 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029710 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bennett BD, Wang Z, Kuang WJ, Wang A, Groopman JE, Goeddel DV, Scadden DT (červen 1994). „Klonování a charakterizace HTK, nové transmembránové tyrosinkinázy z podrodiny EPH“. J Biol Chem. 269 (19): 14211–8. PMID 8188704.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EPHB4 EPH receptor B4“.
^ Gerety SS, Wang HU, Chen ZF, Anderson DJ (1999). "Symetrické mutantní fenotypy receptoru EphB4 a jeho specifického transmembránového ligandu ephrin-B2 v kardiovaskulárním vývoji". Mol. Buňka. 4 (3): 403–14. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80342-1. PMID 10518221.

Další čtení

Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). "Efriny a receptory Eph v nervovém vývoji". Annu. Rev. Neurosci. 21: 309–45. doi:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499.
Zhou R (1998). "Eph receptory a ligandy rodiny". Pharmacol. Ther. 77 (3): 151–81. doi:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID 9576626.
Holder N, Klein R (1999). "Eph receptory a efriny: efektory morfogeneze". Rozvoj. 126 (10): 2033–44. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). "Eph receptory a efriny: regulátory vedení a montáže". Int. Reverend Cytol. International Review of Cytology. 196: 177–244. doi:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN 9780123646002. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (2001). "Role Eph receptorů a efrinů v segmentovém vzorování". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 355 (1399): 993–1002. doi:10.1098 / rstb.2000.0635. PMC 1692797. PMID 11128993.
Wilkinson DG (2001). "Více rolí EPH receptorů a efrinů v nervovém vývoji". Nat. Rev. Neurosci. 2 (3): 155–64. doi:10.1038/35058515. PMID 11256076. S2CID 205014301.
Andres AC, Reid HH, Zürcher G a kol. (1994). "Exprese dvou nových eph-souvisejících receptorových proteinových tyrosin kináz ve vývoji mléčné žlázy a karcinogenezi". Onkogen. 9 (5): 1461–7. PMID 8152808.
Berclaz G, Andres AC, Albrecht D a kol. (1996). "Exprese receptorové proteinové tyrosinkinázy myk-1 / htk v normálním a maligním prsním epitelu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 226 (3): 869–75. doi:10.1006 / bbrc.1996.1442. PMID 8831703.
Ephnomenclature Committee (1997). "Jednotná nomenklatura pro receptory rodiny Eph a jejich ligandy, efriny. Výbor pro nomenklaturu Eph". Buňka. 90 (3): 403–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID 9267020. S2CID 26773768.
Nikolova Z, Djonov V, Zuercher G a kol. (1998). „Specifická a na estrogenu závislá exprese receptorové tyrosinkinázy EphB4 a jejího ligandu ephrin-B2 během morfogeneze mléčné žlázy“. J. Cell Sci. 111 (18): 2741–51. PMID 9718367.
Tang XX, Brodeur GM, Campling BG, Ikegaki N (1999). „Koexprese transkriptů kódujících proteinové tyrosinkinázy receptoru EPHB a jejich ligandy ephrin-B v malém karcinomu plic u člověka“. Clin. Cancer Res. 5 (2): 455–60. PMID 10037197.
Dalva MB, Takasu MA, Lin MZ a kol. (2001). „EphB receptory interagují s NMDA receptory a regulují tvorbu excitační synapse“. Buňka. 103 (6): 945–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00197-5. PMID 11136979. S2CID 7698822.
Wilson MD, Riemer C, Martindale DW a kol. (2001). „Srovnávací analýza genově husté oblasti ACHE / TFR2 na lidském chromozomu 7q22 s ortologní oblastí na myším chromozomu 5“. Nucleic Acids Res. 29 (6): 1352–65. doi:10.1093 / nar / 29.6.1352. PMC 29746. PMID 11239002.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196411 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029710 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8188704-5] Bennett BD, Wang Z, Kuang WJ, Wang A, Groopman JE, Goeddel DV, Scadden DT (červen 1994). „Klonování a charakterizace HTK, nové transmembránové tyrosinkinázy z podrodiny EPH“. J Biol Chem. 269 (19): 14211–8. PMID 8188704.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: EPHB4 EPH receptor B4“.

[GERETYETAL-7] Gerety SS, Wang HU, Chen ZF, Anderson DJ (1999). "Symetrické mutantní fenotypy receptoru EphB4 a jeho specifického transmembránového ligandu ephrin-B2 v kardiovaskulárním vývoji". Mol. Buňka. 4 (3): 403–14. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80342-1. PMID 10518221.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )