ABL (gen) - ABL (gene)

ABL1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyABL1, ABL protoonkogen 1, nereceptorová tyrosinkináza, ABL, JTK7, bcr / abl, c-ABL, c-p150, v-abl, CHDSKM, BCR-ABL, geny, abl
Externí IDOMIM: 189980 MGI: 87859 HomoloGene: 3783 Genové karty: ABL1
EC číslo2.7.10.2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 9 (lidský)
Chr.Chromozom 9 (lidský)[1]
Chromozom 9 (lidský)
Genomické umístění pro ABL1
Genomické umístění pro ABL1
Kapela9q34.12Start130,713,016 bp[1]
Konec130,887,675 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ABL1 202123 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

25

11350

Ensembl

ENSG00000097007

ENSMUSG00000026842

UniProt

P00519

P00520

RefSeq (mRNA)

NM_007313
NM_005157

NM_001112703
NM_009594
NM_001283045
NM_001283046
NM_001283047

RefSeq (protein)

NP_005148
NP_009297

NP_001106174
NP_001269974
NP_001269975
NP_001269976
NP_033724

Místo (UCSC)Chr 9: 130,71 - 130,89 MbChr 2: 31,69 - 31,8 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Tyrosin-protein kináza ABL1 také známý jako ABL1 je protein který je u lidí kódován ABL1 gen (předchozí symbol ABL) umístěný na chromozom 9.[5] c-Abl se někdy používá k označení verze genu nalezeného v savčím genomu, zatímco v-Abl se týká virového genu, který byl původně izolován z Abelson virus myší leukémie.[6]

Funkce

The ABL1 protoonkogen kóduje cytoplazmatický a jaderný protein tyrosinkináza který se podílí na procesech buněčné diferenciace, buněčné dělení, buněčná adheze a stresová reakce.[7] Aktivita proteinu ABL1 je negativně regulována jeho SH3 doména a odstranění domény SH3 změní ABL1 na onkogen. The t (9; 22) translokace vede k head-to-tail fúze z BCR a ABL1 geny, vedoucí k a fúzní gen přítomné v mnoha případech chronické myelogenní leukémie. Aktivita vazby na DNA všudypřítomně exprimované ABL1 tyrosinkinázy je regulována CDC2 -zprostředkovaný fosforylace, což naznačuje funkci buněčného cyklu pro ABL1. The ABL1 Gen je exprimován buď jako 6- nebo 7-kb mRNA transkript, s alternativně sestřiženými prvními exony spojenými s běžnými exony 2-11.[8]

Klinický význam

ABL1 kinázová doména (modrá) v komplexu s druhou generací Bcr-Abl inhibitor tyrosinkinázy nilotinib (Červené)

Mutace v ABL1 gen je spojen s chronická myelogenní leukémie (CML). V CML je gen aktivován tím, že je přemístěn v rámci BCR (oblast klastru zarážky) gen na chromozomu 22. Tento nový fúzní gen, BCR-ABL, kóduje neregulovanou tyrosinkinázu zaměřenou na cytoplazmu, která umožňuje buňkám proliferovat bez regulace cytokiny. To zase umožňuje, aby se buňka stala rakovinný.

Tento gen je partnerem fúzního genu s BCR gen v Philadelphia chromozom, charakteristická abnormalita u chronických myelogenní leukémie (CML) a v některých jiných zřídka leukémie formuláře. Přepis BCR-ABL kóduje a tyrosinkináza, který aktivuje mediátory buněčný cyklus regulační systém, vedoucí k klonálnímu myeloproliferativní porucha. Protein BCR-ABL může být inhibován různými malými molekulami. Jedním z takových inhibitorů je imatinib mesylát, který zabírá doménu tyrosinkinázy a inhibuje vliv BCR-ABL na buněčný cyklus. Druhá generace Inhibitory tyrosinkinázy BCR-ABL jsou také ve vývoji k inhibici BCR-ABL mutantů rezistentních na imatinib.

Interakce

ABL gen byl prokázán komunikovat s:

Nařízení

Existují určité důkazy, že exprese Abl je regulována mikroRNA miR-203.[57]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000097007 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026842 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Szczylik C, Skorski T, Nicolaides NC, Manzella L, Malaguarnera L, Venturelli D, Gewirtz AM, Calabretta B (srpen 1991). „Selektivní inhibice proliferace leukemických buněk pomocí BCR-ABL antisense oligodeoxynukleotidů“. Věda. 253 (5019): 562–5. doi:10.1126 / science.1857987. PMID  1857987.
  6. ^ Abelson HT, Rabstein LS (srpen 1970). "Lymfosarkom: viry vyvolané onemocnění nezávislé na brzlíku u myší". Výzkum rakoviny. 30 (8): 2213–22. PMID  4318922.
  7. ^ „UniProtKB - P00519 (ABL1_HUMAN)“. Uniprot. Citováno 18. května 2020.
  8. ^ "Entrez Gene: ABL1 v-abl Abelson myší leukémie virový homolog onkogenu 1".
  9. ^ Tani K, Sato S, Sukezane T, Kojima H, Hirose H, Hanafusa H, Shishido T (červen 2003). „Abl interakce 1 podporuje fosforylaci tyrosinu 296 u savců aktivovanou (Mena) c-Abl kinázou“. J. Biol. Chem. 278 (24): 21685–92. doi:10,1074 / jbc.M301447200. PMID  12672821.
  10. ^ Biesova Z, Piccoli C, Wong WT (leden 1997). „Izolace a charakterizace e3B1, proteinu vázajícího se na eps8, který reguluje růst buněk“. Onkogen. 14 (2): 233–41. doi:10.1038 / sj.onc.1200822. PMID  9010225.
  11. ^ Yamamoto A, Suzuki T, Sakaki Y (červen 2001). „Izolace hNap1BP, který interaguje s lidským Nap1 (NCKAP1), jehož exprese je u Alzheimerovy choroby snížena“. Gen. 271 (2): 159–69. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00521-2. PMID  11418237.
  12. ^ A b Cao C, Leng Y, Li C, Kufe D (duben 2003). „Funkční interakce mezi c-Abl a Arg protein-tyrosin kinázami v reakci na oxidační stres“. J. Biol. Chem. 278 (15): 12961–7. doi:10,1074 / jbc.M300058200. PMID  12569093.
  13. ^ Dai Z, Pendergast AM (listopad 1995). „Abi-2, nový protein obsahující SH3 interaguje s c-Abl tyrosin kinázou a moduluje aktivitu transformace c-Abl“. Genes Dev. 9 (21): 2569–82. doi:10,1101 / gad. 9.21.2569. PMID  7590236.
  14. ^ A b Chen G, Yuan SS, Liu W, Xu Y, Trujillo K, Song B, Cong F, Goff SP, Wu Y, Arlinghaus R, Baltimore D, Gasser PJ, Park MS, Sung P, Lee EY (duben 1999). „Radiačně indukovaná sestava rekombinačního komplexu Rad51 a Rad52 vyžaduje ATM a c-Abl“. J. Biol. Chem. 274 (18): 12748–52. doi:10.1074 / jbc.274.18.12748. PMID  10212258.
  15. ^ Shafman T, Khanna KK, Kedar P, Spring K, Kozlov S, Yen T, Hobson K, Gatei M, Zhang N, Watters D, Egerton M, Shiloh Y, Kharbanda S, Kufe D, Lavin MF (květen 1997). "Interakce mezi ATM proteinem a c-Abl v reakci na poškození DNA". Příroda. 387 (6632): 520–3. doi:10.1038 / 387520a0. PMID  9168117. S2CID  4334242.
  16. ^ A b Kishi S, Zhou XZ, Ziv Y, Khoo C, Hill DE, Shiloh Y, Lu KP (srpen 2001). „Telomerní protein Pin2 / TRF1 jako důležitý cíl ATM v reakci na přerušení dvouvláknové DNA“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29282–91. doi:10,1074 / jbc.M011534200. PMID  11375976.
  17. ^ Salgia R, Pisick E, Sattler M, Li JL, Uemura N, Wong WK, Burky SA, Hirai H, Chen LB, Griffin JD (říjen 1996). „p130CAS tvoří signální komplex s adaptorovým proteinem CRKL v hematopoetických buňkách transformovaných onkogenem BCR / ABL“. J. Biol. Chem. 271 (41): 25198–203. doi:10.1074 / jbc.271.41.25198. PMID  8810278.
  18. ^ Mayer BJ, Hirai H, Sakai R (březen 1995). „Důkaz, že domény SH2 podporují procesní fosforylaci protein-tyrosin kinázami“. Curr. Biol. 5 (3): 296–305. doi:10.1016 / S0960-9822 (95) 00060-1. PMID  7780740. S2CID  16957239.
  19. ^ A b Puil L, Liu J, Gish G, Mbamalu G, Bowtell D, Pelicci PG, Arlinghaus R, Pawson T (únor 1994). „Onkoproteiny Bcr-Abl se vážou přímo na aktivátory signální dráhy Ras“. EMBO J.. 13 (4): 764–73. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06319.x. PMC  394874. PMID  8112292.
  20. ^ Ling X, Ma G, Sun T, Liu J, Arlinghaus RB (leden 2003). "Interakce Bcr a Abl: onkogenní aktivace c-Abl sekvestrací Bcr". Cancer Res. 63 (2): 298–303. PMID  12543778.
  21. ^ Pendergast AM, Muller AJ, Havlik MH, Maru Y, Witte ON (červenec 1991). „BCR sekvence nezbytné pro transformaci onkogenem BCR-ABL se váží na regulační doménu ABL SH2 způsobem nezávislým na fosfotyrosinu“. Buňka. 66 (1): 161–71. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90148-R. PMID  1712671. S2CID  9933891.
  22. ^ Foray N, Marot D, Randrianarison V, Venezia ND, Picard D, Perricaudet M, Favaudon V, Jeggo P (červen 2002). „Konstitutivní sdružení BRCA1 a c-Abl a jeho narušení závislé na ATM po ozáření“. Mol. Buňka. Biol. 22 (12): 4020–32. doi:10.1128 / MCB.22.12.4020-4032.2002. PMC  133860. PMID  12024016.
  23. ^ Cao C, Leng Y, Kufe D (srpen 2003). „Katalázová aktivita je regulována c-Abl a Arg v reakci na oxidační stres“. J. Biol. Chem. 278 (32): 29667–75. doi:10,1074 / jbc.M301292200. PMID  12777400.
  24. ^ A b Miyoshi-Akiyama T, Aleman LM, Smith JM, Adler CE, Mayer BJ (červenec 2001). "Regulace fosforylace Cbl pomocí Abl tyrosinkinázy a adaptéru Nck SH2 / SH3". Onkogen. 20 (30): 4058–69. doi:10.1038 / sj.onc.1204528. PMID  11494134.
  25. ^ A b Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (únor 2003). „Komplex Cbl-ArgBP2 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci c-Abl“. Biochem. J. 370 (Pt 1): 29–34. doi:10.1042 / BJ20021539. PMC  1223168. PMID  12475393.
  26. ^ A b C Ren R, Ye ZS, Baltimore D (duben 1994). „Abl protein-tyrosin kináza vybírá adaptér Crk jako substrát pomocí vazebných míst SH3“. Genes Dev. 8 (7): 783–95. doi:10,1101 / gad. 8.7,783. PMID  7926767.
  27. ^ Heaney C, Kolibaba K, Bhat A, Oda T, Ohno S, Fanning S, Druker BJ (leden 1997). „Přímá vazba CRKL na BCR-ABL není pro transformaci BCR-ABL vyžadována.“. Krev. 89 (1): 297–306. doi:10.1182 / krev.V89.1.297. PMID  8978305.
  28. ^ Kyono WT, de Jong R, Park RK, Liu Y, Heisterkamp N, Groffen J, Durden DL (listopad 1998). „Diferenciální interakce Crkl s Cbl nebo C3G, Hef-1 a gama podjednotkou imunoreceptorový aktivační motiv na bázi tyrosinu při signalizaci myeloidního vysokoafinitního Fc receptoru pro IgG (Fc gama RI)“. J. Immunol. 161 (10): 5555–63. PMID  9820532.
  29. ^ van Dijk TB, van Den Akker E, Amelsvoort MP, Mano H, Löwenberg B, von Lindern M (listopad 2000). „Faktor kmenových buněk indukuje tvorbu komplexu Lyn / Tec / Dok-1 závislou na fosfatidylinositolu 3'-kináze v hematopoetických buňkách“. Krev. 96 (10): 3406–13. doi:10.1182 / krev. V96.10.3406. PMID  11071635.
  30. ^ Yamanashi Y, Baltimore D (leden 1997). „Identifikace proteinu 62 kDa spojeného s Abl a rasGAP jako dokovacího proteinu, Dok“. Buňka. 88 (2): 205–11. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81841-3. PMID  9008161. S2CID  14205526.
  31. ^ Yu HH, Zisch AH, Dodelet VC, Pasquale EB (červenec 2001). "Několik signálních interakcí Abl a Arg kináz s receptorem EphB2". Onkogen. 20 (30): 3995–4006. doi:10.1038 / sj.onc.1204524. PMID  11494128.
  32. ^ Cao C, Leng Y, Huang W, Liu X, Kufe D (říjen 2003). „Glutathionperoxidáza 1 je regulována c-Abl a Arg tyrosinkinázami“. J. Biol. Chem. 278 (41): 39609–14. doi:10,1074 / jbc.M305770200. PMID  12893824.
  33. ^ Bai RY, Jahn T, Schrem S, Munzert G, Weidner KM, Wang JY, Duyster J (srpen 1998). „Adaptérový protein GRB10 obsahující SH2 interaguje s BCR-ABL“. Onkogen. 17 (8): 941–8. doi:10.1038 / sj.onc.1202024. PMID  9747873.
  34. ^ Frantz JD, Giorgetti-Peraldi S, Ottinger EA, Shoelson SE (leden 1997). „Lidská GRB-IRbeta / GRB10. Sestřihové varianty proteinu vázajícího receptor inzulínu a růstového faktoru s doménami PH a SH2“. J. Biol. Chem. 272 (5): 2659–67. doi:10.1074 / jbc.272.5.2659. PMID  9006901.
  35. ^ Kumar V, Sabatini D, Pandey P, Gingras AC, Majumder PK, Kumar M, Yuan ZM, Carmichael G, Weichselbaum R, Sonenberg N, Kufe D, Kharbanda S (duben 2000). „Regulace rapamycinu a cíle FKBP 1 / cíl savce rapamycinu a iniciace translace c-Abl protein-tyrosinkináza závislá na čepici“ “. J. Biol. Chem. 275 (15): 10779–87. doi:10.1074 / jbc.275.15.10779. PMID  10753870.
  36. ^ Warmuth M, Bergmann M, Priess A, Häuslmann K, Emmerich B, Hallek M (prosinec 1997). „Rodina Src kinázy Hck interaguje s Bcr-Abl mechanismem nezávislým na kináze a fosforyluje vazebné místo Grb2 Bcr“. J. Biol. Chem. 272 (52): 33260–70. doi:10.1074 / jbc.272.52.33260. PMID  9407116.
  37. ^ Goldberg Z, Vogt Sionov R, Berger M, Zwang Y, Perets R, Van Etten RA, Oren M, Taya Y, Haupt Y (červenec 2002). „Tyrosinová fosforylace Mdm2 pomocí c-Abl: důsledky pro regulaci p53“. EMBO J.. 21 (14): 3715–27. doi:10.1093 / emboj / cdf384. PMC  125401. PMID  12110584.
  38. ^ Minegishi M, Tachibana K, Sato T, Iwata S, Nojima Y, Morimoto C (říjen 1996). „Struktura a funkce Cas-L, proteinu souvisejícího se substrátem souvisejícím s 105 kD Crk, který se účastní signalizace zprostředkované beta 1 integrinem v lymfocytech.“. J. Exp. Med. 184 (4): 1365–75. doi:10.1084 / jem.184.4.1365. PMC  2192828. PMID  8879209.
  39. ^ Law SF, Estojak J, Wang B, Mysliwiec T, Kruh G, Golemis EA (červenec 1996). „Lidský zesilovač filamentace 1, nový dokovací protein podobný p130cas, se asociuje s fokální adhezní kinázou a indukuje pseudohyfální růst u Saccharomyces cerevisiae“. Mol. Buňka. Biol. 16 (7): 3327–37. doi:10,1128 / mcb.16.7.3327. PMC  231327. PMID  8668148.
  40. ^ Koch A, Mancini A, Stefan M, Niedenthal R, Niemann H, Tamura T (březen 2000). "Přímá interakce receptoru nervového růstového faktoru, TrkA, s nereceptorovou tyrosinkinázou, c-Abl, prostřednictvím aktivační smyčky". FEBS Lett. 469 (1): 72–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01242-4. PMID  10708759.
  41. ^ Yano H, Cong F, Birge RB, Goff SP, Chao MV (únor 2000). "Sdružení Abl tyrosinkinázy s receptorem nervového růstového faktoru Trk". J. Neurosci. Res. 59 (3): 356–64. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (20000201) 59: 3 <356 :: AID-JNR9> 3.0.CO; 2-G. PMID  10679771.
  42. ^ Yuan ZM, Shioya H, Ishiko T, Sun X, Gu J, Huang YY, Lu H, Kharbanda S, Weichselbaum R, Kufe D (červen 1999). „p73 je regulován tyrosinkinázou c-Abl v apoptotické reakci na poškození DNA“. Příroda. 399 (6738): 814–7. doi:10.1038/21704. PMID  10391251. S2CID  4421613.
  43. ^ Agami R, Blandino G, Oren M, Shaul Y (červen 1999). "Interakce c-Abl a p73alpha a jejich spolupráce k vyvolání apoptózy". Příroda. 399 (6738): 809–13. doi:10.1038/21697. PMID  10391250. S2CID  4394015.
  44. ^ Wen ST, Van Etten RA (říjen 1997). „Produkt PAG genu, stresem indukovaný protein s antioxidačními vlastnostmi, je protein vázající Abl SH3 a fyziologický inhibitor aktivity c-Abl tyrosinkinázy.“. Genes Dev. 11 (19): 2456–67. doi:10.1101 / gad.11.19.2456. PMC  316562. PMID  9334312.
  45. ^ Roig J, Tuazon PT, Zipfel PA, Pendergast AM, Traugh JA (prosinec 2000). „Funkční interakce mezi c-Abl a p21-aktivovanou proteinkinázou gama-PAK“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (26): 14346–51. doi:10.1073 / pnas.97.26.14346. PMC  18921. PMID  11121037.
  46. ^ Cong F, Spencer S, Côté JF, Wu Y, Tremblay ML, Lasky LA, Goff SP (prosinec 2000). „Cytoskeletální protein PSTPIP1 směruje proteinovou tyrosin fosfatázu typu PEST na c-Abl kinázu za účelem zprostředkování Abl defosforylace“. Mol. Buňka. 6 (6): 1413–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00138-6. PMID  11163214.
  47. ^ Yoshida K, Komatsu K, Wang HG, Kufe D (květen 2002). „c-Abl tyrosinkináza reguluje lidský protein kontrolního bodu Rad9 v reakci na poškození DNA“. Mol. Buňka. Biol. 22 (10): 3292–300. doi:10.1128 / MCB.22.10.3292-3300.2002. PMC  133797. PMID  11971963.
  48. ^ Miyamura T, Nishimura J, Yufu Y, Nawata H (únor 1997). „Interakce BCR-ABL s proteinem retinoblastomu v buněčných liniích pozitivních na chromozom Philadelphia“. Int. J. Hematol. 65 (2): 115–21. doi:10.1016 / S0925-5710 (96) 00539-7. PMID  9071815.
  49. ^ Welch PJ, Wang JY (listopad 1993). „C-koncová doména vázající protein v proteinu retinoblastomu reguluje nukleární c-Abl tyrosinkinázu v buněčném cyklu“. Buňka. 75 (4): 779–90. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90497-E. PMID  8242749.
  50. ^ Agami R, Shaul Y (duben 1998). „Kinázová aktivita c-Abl, ale ne v-Abl, je potencována přímou interakcí s RFXI, proteinem, který váže zesilovače několika virů a genů regulovaných buněčným cyklem.“. Onkogen. 16 (14): 1779–88. doi:10.1038 / sj.onc.1201708. PMID  9583676.
  51. ^ Zhu J, Shore SK (prosinec 1996). „Aktivita tyrosinkinázy c-ABL je regulována asociací s novým proteinem vázajícím doménu SH3“. Mol. Buňka. Biol. 16 (12): 7054–62. doi:10.1128 / mcb.16.12.7054. PMC  231708. PMID  8943360.
  52. ^ Wisniewski D, Strife A, Swendeman S, Erdjument-Bromage H, Geromanos S, Kavanaugh WM, Tempst P, Clarkson B (duben 1999). „Nová fosfatidylinositol-3,4,5-trisfosfát-5-fosfatáza obsahující SH2 (SHIP2) je konstitutivně tyrosin fosforylovaná a spojená s homologním a kolagenovým genem src (SHC) v progenitorových buňkách chronické myelogenní leukémie.“ Krev. 93 (8): 2707–20. doi:10,1182 / krev. V93.8.2707. PMID  10194451.
  53. ^ Wang B, Golemis EA, Kruh GD (červenec 1997). „ArgBP2, vícečetná doména Src obsahující 3 domény, protein interagující s Arg / Abl, je fosforylován v buňkách transformovaných v-Abl a lokalizován ve stresových vláknech a Z-discích kardiocytů“. J. Biol. Chem. 272 (28): 17542–50. doi:10.1074 / jbc.272.28.17542. PMID  9211900.
  54. ^ A b Ziemnicka-Kotula D, Xu J, Gu H, Potempska A, Kim KS, Jenkins EC, Trenkner E, Kotula L (květen 1998). „Identifikace kandidátského lidského spektrinu proteinu Src 3 vázajícího doménu naznačuje obecný mechanismus asociace tyrosin kináz s membránovým skeletem založeným na spektrinu“. J. Biol. Chem. 273 (22): 13681–92. doi:10.1074 / jbc.273.22.13681. PMID  9593709.
  55. ^ Bassermann F, Jahn T, Miething C, Seipel P, Bai RY, Coutinho S, Tybulewicz VL, Peschel C, Duyster J (duben 2002). „Sdružení Bcr-Abl s protoonkogenem Vav se podílí na aktivaci dráhy Rac-1“. J. Biol. Chem. 277 (14): 12437–45. doi:10,1074 / jbc.M112397200. PMID  11790798.
  56. ^ Rafalska I, Zhang Z, Benderska N, Wolff H, Hartmann AM, Brack-Werner R, Stamm S (srpen 2004). „Intranukleární lokalizace a funkce YT521-B je regulována fosforylací tyrosinu“. Hučení. Mol. Genet. 13 (15): 1535–49. doi:10,1093 / hmg / ddh167. PMID  15175272.
  57. ^ Bueno MJ, Pérez de Castro I, Gómez de Cedrón M, Santos J, Calin GA, Cigudosa JC, Croce CM, Fernández-Piqueras J, Malumbres M (červen 2008). „Genetické a epigenetické umlčení mikroRNA-203 zvyšuje expresi onkogenu ABL1 a BCR-ABL1“. Rakovinová buňka. 13 (6): 496–506. doi:10.1016 / j.ccr.2008.04.018. hdl:10261/7369. PMID  18538733.

Další čtení

externí odkazy