Receptor obsahující doménu diskoidinu 2 - Discoidin domain-containing receptor 2

DDR2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 WUH, 2Z4F
Identifikátory
Aliasy	DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, receptor diskoidinové domény tyrosinkináza 2, WRCN
Externí ID	OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 Genové karty: DDR2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	162,787,405 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	170,110,762 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • aktivita receptoru proteinu tyrosinkinázy na kolagenu; • aktivita protein tyrosinkinázy; • ATP vazba; • vazba kolagenu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • ohnisková adheze; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární exosom; • apikální plazmatická membrána; • buněčná membrána; • aktinový cytoskelet; • receptorový komplex;
Biologický proces	• signální dráha receptoru tyrosinkinázy aktivovaná kolagenem; • zkostnatění; • fosforylace; • organizace kolagenových vláken; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • regulace mineralizace kostí; • pozitivní regulace proliferace fibroblastů; • vývoj biominerální tkáně; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • organizace extracelulární matice; • regulace demontáže extracelulární matrice; • pozitivní regulace demontáže extracelulární matrice; • fosforylace bílkovin; • buněčná adheze; • pozitivní regulace diferenciace osteoblastů; • množení chondrocytů; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • růst endochondrální kosti; • pozitivní regulace migrace fibroblastů; • signální transdukce; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy; • autofosforylace; • regulace adheze buněčné matice; • buněčná matice adheze; • diferenciace buněk; • regulace organizace extracelulární matice;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4921
	18214
	ENSG00000162733
	ENSMUSG00000026674
	Q16832
	Q62371
	NM_001014796; NM_006182; NM_001354982; NM_001354983
	NM_022563
	NP_001014796; NP_006173; NP_001341911; NP_001341912
	NP_072075
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptor obsahující doménu diskoidinu 2, také známý jako CD167b (shluk diferenciace 167b), je protein, který je u lidí kódován DDR2 gen.^[5] Receptor 2 obsahující diskoidinovou doménu je a receptor tyrosinkinázy (RTK).

Funkce

RTK hrají klíčovou roli v komunikaci buněk s jejich mikroprostředím. Tyto molekuly se podílejí na regulaci buněčného růstu, diferenciace a metabolismu. V několika případech biochemický mechanismus, kterým RTK přenášet signály přes membránu bylo prokázáno, že ligandem indukovaná oligomerizace receptoru a následná intracelulární fosforylace. V případě DDR2 je ligand kolagen který se váže na svou extracelulární doménu discoidinu.^[6] Tento autofosforylace vede k fosforylaci cytosolických cílů a také k asociaci s jinými molekulami, kterých se účastní pleiotropní účinky přenosu signálu. DDR2 byla spojována s řadou nemocí včetně fibróza a rakovina.^[7]

Struktura

RTK mají tripartitní strukturu s extracelulárními, transmembránovými a cytoplazmatickými oblastmi. Tento gen kóduje člena nové podtřídy RTK a obsahuje zřetelnou extracelulární oblast zahrnující faktor VIII podobná doména.^[5]

Gen

Alternativní sestřih v 5 'UTR genu DDR2 vede k více variantám transkriptu kódujících stejný protein.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že DDR2 (gen) komunikovat s SHC1^[8] a fosforylát Shp2.^[9] DDR2 také interaguje s Integrin α₁β₁ a α₂β₁ podporou jejich adheze ke kolagenu.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162733 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026674 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C „Entrez Gene: rodina receptorů diskoidinové domény DDR2, člen 2“.
^ Fu HL, Valiathan RR, Arkwright R, Sohail A, Mihai C, Kumarasiri M, Mahasenan KV, Mobashery S, Huang P, Agarwal G, Fridman R (březen 2013). „Receptory diskoidinové domény: jedinečné receptorové tyrosinkinázy v kolagenem zprostředkované signalizaci“. J. Biol. Chem. 288 (11): 7430–7. doi:10.1074 / jbc.R112.444158. PMC 3597784. PMID 23335507.
^ Leitinger B (květen 2011). "Transmembránové receptory kolagenu". Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265–90. doi:10.1146 / annurev-cellbio-092910-154013. PMID 21568710.
^ Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (květen 2002). „Receptor diskoidinové domény 2 interaguje s Src a Shc po jeho aktivaci kolagenem typu I“. J. Biol. Chem. 277 (21): 19206–12. doi:10,1074 / jbc.M201078200. PMID 11884411.
^ Iwai LK, Payne LS, Luczynski MT, Chang F, Xu H, Clinton RW, Paul A, Esposito EA, Gridley S, Leitinger B, Naegle KM, Huang PH (červenec 2013). „Fosfoproteomika sítí kolagenových receptorů odhaluje fosforylaci SHP-2 po proudu od divokého typu DDR2 a jeho mutantů rakoviny plic“. Biochem. J. 454 (3): 501–13. doi:10.1042 / BJ20121750. PMC 3893797. PMID 23822953.
^ Xu H, Bihan D, Chang F, Huang PH, Farndale RW, Leitinger B (prosinec 2012). „Receptory diskoidinové domény podporují adhezi buněk zprostředkovanou α1β1 a α2β1-integrinem ke kolagenu zvýšením aktivace integrinu“. PLOS ONE. 7 (12): e52209. doi:10.1371 / journal.pone.0052209. PMC 3527415. PMID 23284937.

Další čtení

Lapsys NM, Layfield R, Baker E, Callen DF, Sutherland GR, Abedinia M, Nixon PF, Mattick JS (1992). "Chromozomální umístění lidského genu transketolázy". Cytogenet. Cell Genet. 61 (4): 274–5. doi:10.1159/000133421. PMID 1486804.
Abedinia M, Layfield R, Jones SM, Nixon PF, Mattick JS (1992). „Nukleotid a předpokládaná aminokyselinová sekvence cDNA klonu kódujícího část lidské transketolázy“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 183 (3): 1159–66. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 80312-2. PMID 1567394.
Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (1995). "Mapování genu tyrosinkinázy receptoru NEP na lidský chromozom 6p21.3 a myší chromozom 17C". Genomika. 25 (1): 309–11. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80144-B. PMID 7774938.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Karn T, Holtrich U, Bräuninger A, Böhme B, Wolf G, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1993). "Struktura, exprese a chromozomální mapování TKT od člověka a myši: nová podtřída receptorových tyrosin kináz s doménou podobnou faktoru VIII". Onkogen. 8 (12): 3433–40. PMID 8247548.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Vogel W, Gish GD, Alves F, Pawson T (1997). "Tyrosinkinázy receptoru pro doménu diskoidinu jsou aktivovány kolagenem". Mol. Buňka. 1 (1): 13–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80003-9. PMID 9659899.
Mohan RR, Mohan RR, Wilson SE (2001). „Receptor diskoidinové domény (DDR) 1 a 2: receptory tyrosinkinázy aktivované kolagenem v rohovce“. Exp. Eye Res. 72 (1): 87–92. doi:10,1006 / cvičení. 2000.0932. PMID 11133186.
Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (2002). „Receptor diskoidinové domény 2 interaguje s Src a Shc po jeho aktivaci kolagenem typu I“. J. Biol. Chem. 277 (21): 19206–12. doi:10,1074 / jbc.M201078200. PMID 11884411.
Faraci E, Eck M, Gerstmayer B, Bosio A, Vogel WF (2003). „Extracelulární matrix specifická microarray umožnila identifikaci cílových genů po směru od receptorů diskoidinové domény“. Matrix Biol. 22 (4): 373–81. doi:10.1016 / S0945-053X (03) 00053-2. PMID 12935821.
Ferri N, Carragher NO, Raines EW (2004). „Role receptorů diskoidinové domény 1 a 2 v remodelaci kolagenu zprostředkovanou buňkami lidského hladkého svalstva: potenciální důsledky pro aterosklerózu a lymfangioleiomyomatózu“. Dopoledne. J. Pathol. 164 (5): 1575–85. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63716-9. PMC 1615659. PMID 15111304.
Leitinger B, Steplewski A, Fertala A (2004). „Období D2 kolagenu II obsahuje specifické vazebné místo pro receptor lidské domény discoidinu, DDR2.“ J. Mol. Biol. 344 (4): 993–1003. doi:10.1016 / j.jmb.2004.09.089. PMID 15544808.
Wall SJ, Werner E, Werb Z, DeClerck YA (2005). „Receptor diskoidinové domény 2 zprostředkovává zastavení buněčného cyklu nádorových buněk vyvolané fibrilárním kolagenem“. J. Biol. Chem. 280 (48): 40187–94. doi:10,1074 / jbc.M508226200. PMC 2768768. PMID 16186104.
Yang K, Kim JH, Kim HJ, Park IS, Kim IY, Yang BS (2005). „Fosforylace tyrosinu 740 receptoru diskoidinové domény 2 pomocí Src stimuluje intramolekulární autofosforylaci a tvorbu signálního komplexu Shc“. J. Biol. Chem. 280 (47): 39058–66. doi:10,1074 / jbc.M506921200. PMID 16186108.
Leitinger B, Kwan AP (2006). „Receptor diskoidinové domény DDR2 je receptor pro kolagen typu X“. Matrix Biol. 25 (6): 355–64. doi:10.1016 / j.matbio.2006.05.006. PMID 16806867.
Zhang W, Ding T, Zhang J, Su J, Li F, Liu X, Ma W, Yao L (2006). „Exprese extracelulární domény receptoru diskoidinové domény 2 (DDR2) v pichia pastoris a funkční analýza v synoviálních fibroblastech a buňkách NIT3T3“. Mol. Buňka. Biochem. 290 (1–2): 43–53. doi:10.1007 / s11010-006-9136-4. PMID 16967187.
Ford CE, Lau SK, Zhu CQ, Andersson T, Tsao MS, Vogel WF (2007). „Analýza exprese a mutace receptorů diskoidinové domény 1 a 2 u nemalobuněčného karcinomu plic“. Br. J. Cancer. 96 (5): 808–14. doi:10.1038 / sj.bjc.6603614. PMC 2360060. PMID 17299390.
Xu L, Servais J, Polur I, Kim D, Lee PL, Chung K, Li Y (2010). „Útlum progrese osteoartritidy snížením receptoru 2 domény diskoidinu u myší“. Artritida Rheum. 62 (9): 2736–44. doi:10,1002 / článek 27582. PMC 2946478. PMID 20518074.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162733 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026674 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b ^C „Entrez Gene: rodina receptorů diskoidinové domény DDR2, člen 2“.

[pmid23335507-6] Fu HL, Valiathan RR, Arkwright R, Sohail A, Mihai C, Kumarasiri M, Mahasenan KV, Mobashery S, Huang P, Agarwal G, Fridman R (březen 2013). „Receptory diskoidinové domény: jedinečné receptorové tyrosinkinázy v kolagenem zprostředkované signalizaci“. J. Biol. Chem. 288 (11): 7430–7. doi:10.1074 / jbc.R112.444158. PMC 3597784. PMID 23335507.

[pmid21568710-7] Leitinger B (květen 2011). "Transmembránové receptory kolagenu". Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265–90. doi:10.1146 / annurev-cellbio-092910-154013. PMID 21568710.

[pmid11884411-8] Ikeda K, Wang LH, Torres R, Zhao H, Olaso E, Eng FJ, Labrador P, Klein R, Lovett D, Yancopoulos GD, Friedman SL, Lin HC (květen 2002). „Receptor diskoidinové domény 2 interaguje s Src a Shc po jeho aktivaci kolagenem typu I“. J. Biol. Chem. 277 (21): 19206–12. doi:10,1074 / jbc.M201078200. PMID 11884411.

[pmid23822953-9] Iwai LK, Payne LS, Luczynski MT, Chang F, Xu H, Clinton RW, Paul A, Esposito EA, Gridley S, Leitinger B, Naegle KM, Huang PH (červenec 2013). „Fosfoproteomika sítí kolagenových receptorů odhaluje fosforylaci SHP-2 po proudu od divokého typu DDR2 a jeho mutantů rakoviny plic“. Biochem. J. 454 (3): 501–13. doi:10.1042 / BJ20121750. PMC 3893797. PMID 23822953.

[pmid23284937-10] Xu H, Bihan D, Chang F, Huang PH, Farndale RW, Leitinger B (prosinec 2012). „Receptory diskoidinové domény podporují adhezi buněk zprostředkovanou α1β1 a α2β1-integrinem ke kolagenu zvýšením aktivace integrinu“. PLOS ONE. 7 (12): e52209. doi:10.1371 / journal.pone.0052209. PMC 3527415. PMID 23284937.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )