PTK7 - PTK7

PTK7
Identifikátory
Aliasy	PTK7, CCK-4, CCK4, protein tyrosin kináza 7 (neaktivní)
Externí ID	OMIM: 601890 MGI: 1918711 HomoloGene: 43672 Genové karty: PTK7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	43,161,719 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	46,629,504 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • aktivita coreceptoru zapojená do signální dráhy Wnt, dráha polarity rovinných buněk;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • mezibuněčné spojení; • ohnisková adheze; • buněčná membrána; • buněčné spojení; • integrální součást plazmatické membrány;
Biologický proces	• reorganizace aktinového cytoskeletu; • buněčná odpověď na kyselinu retinovou; • vývoj komorového septa; • konvergentní rozšíření; • stanovení rovinné polarity; • hojení ran; • Wnt signální cesta; • vývoj koronární vaskulatury; • dráha polarity rovinných buněk zapojená do uzavření neurální trubice; • fosforylace bílkovin; • vývoj srdce; • vytvoření apikální / bazální polarity epiteliálních buněk; • buněčná adheze; • uzavření neurální trubice; • prodloužení osy; • morfogeneze kochley; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • kanonická signální cesta Wnt; • vývoj mezenchymu spojený s plicemi; • migrace buněk; • signální transdukce; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5754
	71461
	ENSG00000112655
	ENSMUSG00000023972
	Q13308
	Q8BKG3
NM_001270398; NM_002821; NM_152880; NM_152881; NM_152882;
	NM_152883
	NM_175168
	NP_001257327; NP_002812; NP_690619; NP_690620; NP_690621
	NP_780377
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Tyrosin-protein kináza podobná 7 také známý jako kináza karcinomu tlustého střeva 4 (CCK4) je receptor tyrosinkinázy že u lidí je kódován PTK7 gen.^[5]^[6]

Funkce

Receptorové proteinové tyrosinkinázy přenášejí extracelulární signály přes buněčnou membránu. Podskupině těchto kináz chybí detekovatelná aktivita katalytické tyrosinkinázy, ale zachovávají si roli v signální transdukci. Protein kódovaný tímto genem intracelulární doménou s tyrosinkinázovou homologií a může fungovat jako a buněčná adheze molekula. Předpokládá se, že tento gen je exprimován v karcinomech tlustého střeva, ale ne v normálním tlustém střevě, a proto může být markerem nebo se může podílet na progresi nádoru. Pro tento gen byly nalezeny čtyři varianty transkriptu kódující čtyři různé izoformy.^[6]

PTK7 slouží jako kontextově závislý signalizační spínač pro Wnt cesty (zejména v polarita rovinných buněk související funkce, jako je konvergentní rozšíření a migrace buněk neurální lišty ) a zdá se, že má podobné funkce pro plexin a Flt-1 cesty.^[7] Bylo zjištěno, že PTK7 je vysoce exprimován v rakovině tlustého střeva Saha et al. pomocí sériové analýzy genové exprese (LongSAGE ).^[8] Pfizer se zaměřuje na PTK7 pro rakovinu generováním konjugát protilátka-lék proti receptoru PTK7.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112655 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023972 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mossie K, Jallal B, Alves F, Sures I, Plowman GD, Ullrich A (listopad 1995). „Karcinom tlustého střeva kináza-4 definuje novou podtřídu rodiny receptorových tyrosinkináz“. Onkogen. 11 (10): 2179–84. PMID 7478540.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PTK7 PTK7 protein tyrosinkináza 7".
^ Peradziryi H, Tolwinski NS, Borchers A (srpen 2012). "Mnoho rolí PTK7: univerzální regulátor komunikace mezi buňkami". Archivy biochemie a biofyziky. 524 (1): 71–6. doi:10.1016 / j.abb.2011.12.019. PMID 22230326.
^ Saha, S. a kol. (2002). „Použití transkriptomu k anotaci genomu.“ Nat Biotechnol 20 (5): 508-512.

Další čtení

Lee ST, Strunk KM, Spritz RA (prosinec 1993). „Průzkum mRNA protein tyrosin kinázy exprimovaných v normálních lidských melanocytech“. Onkogen. 8 (12): 3403–10. PMID 8247543.
Park SK, Lee HS, Lee ST (únor 1996). "Charakterizace lidské plné délky cDNA PTK7 kódující molekulu podobnou receptorovému proteinu tyrosinkináze úzce související s kuřecí KLG". Journal of Biochemistry. 119 (2): 235–9. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021228. PMID 8882711.
Banga SS, Ozer HL, Park SK, Lee ST (1997). "Přiřazení PTK7 kódujícího molekulu podobnou receptorové proteinové tyrosinkináze k lidskému chromozomu 6p21.1 -> p12.2 fluorescenční in situ hybridizací". Cytogenetika a genetika buněk. 76 (1–2): 43–4. doi:10.1159/000134511. PMID 9154124.
Jung JW, Ji AR, Lee J, Kim UJ, Lee ST (prosinec 2002). „Organizace lidského genu PTK7 kódujícího molekulu podobnou receptorové proteinové tyrosinkináze a alternativní sestřih jeho mRNA“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1579 (2–3): 153–63. doi:10.1016 / s0167-4781 (02) 00536-5. PMID 12427550.
Zhang H, Li XJ, Martin DB, Aebersold R (červen 2003). „Identifikace a kvantifikace N-vázaných glykoproteinů pomocí hydrazidové chemie, stabilního značení izotopů a hmotnostní spektrometrie“. Přírodní biotechnologie. 21 (6): 660–6. doi:10.1038 / nbt827. PMID 12754519. S2CID 581283.
Kobus FJ, Fleming KG (únor 2005). „Transmembránová doména CCK4 onkogenu obsahující GxxxG nekóduje preferenční vlastní interakce“. Biochemie. 44 (5): 1464–70. doi:10.1021 / bi048076l. PMID 15683231.
Katoh M, Katoh M (září 2007). „Srovnávací integromatika na nekanonických signálních molekulách WNT nebo planární buněčné polarity: transkripční mechanismus PTK7 u kolorektálního karcinomu a mechanismus SEMA6A v nediferencovaných ES buňkách“. International Journal of Molecular Medicine. 20 (3): 405–9. doi:10,3892 / ijmm.20.3.405. PMID 17671748.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112655 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023972 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7478540-5] Mossie K, Jallal B, Alves F, Sures I, Plowman GD, Ullrich A (listopad 1995). „Karcinom tlustého střeva kináza-4 definuje novou podtřídu rodiny receptorových tyrosinkináz“. Onkogen. 11 (10): 2179–84. PMID 7478540.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: PTK7 PTK7 protein tyrosinkináza 7".

[7] Peradziryi H, Tolwinski NS, Borchers A (srpen 2012). "Mnoho rolí PTK7: univerzální regulátor komunikace mezi buňkami". Archivy biochemie a biofyziky. 524 (1): 71–6. doi:10.1016 / j.abb.2011.12.019. PMID 22230326.

[8] Saha, S. a kol. (2002). „Použití transkriptomu k anotaci genomu.“ Nat Biotechnol 20 (5): 508-512.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )