Integrin beta 1 - Integrin beta 1

ITGB1
Protein ITGB1 PDB 1K11.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyITGB1, CD29, FNRB, GPIIA, MDF2, MSK12, VLA-BETA, VLAB, integrinová podjednotka beta 1
Externí IDOMIM: 135630 MGI: 96610 HomoloGene: 22999 Genové karty: ITGB1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomic location for ITGB1
Genomic location for ITGB1
Kapela10p11.22Start32,900,319 bp[1]
Konec33,005,792 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ITGB1 211945 s at.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

3688

16412

Ensembl

ENSG00000150093

ENSMUSG00000025809

UniProt

P05556

P09055

RefSeq (mRNA)

NM_010578

RefSeq (protein)

NP_002202
NP_391988
NP_596867

NP_034708

Místo (UCSC)Chr 10: 32,9 - 33,01 MbChr 8: 128,69 - 128,73 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Integrin beta-1 (ITGB1), také známý jako CD29, je buněčný povrchový receptor že u lidí je kódován ITGB1 gen.[5] Tento integrin spolupracovníci s integrin alfa 1 a integrin alfa 2 za vzniku komplexů integrinu, které fungují jako receptory kolagenu. Vytváří také dimery s integrin alfa 3 za vzniku integrinových receptorů pro netrin 1 a navinout. Tyto a další komplexy integrinu beta 1 byly historicky známé jako antigeny velmi pozdní aktivace (VLA).

Integrin beta 1 je vyjádřen jako nejméně čtyři různé izoformy. v srdeční sval a kosterní sval je specificky exprimována a lokalizována izoforma integrinu beta-1D náklady, kde pomáhá při bočním přenosu síly z Z-disky do extracelulární matrix. Byly nalezeny abnormální hladiny integrinu beta-1D svalová dystrofie končetinového pletence a polyneuropatie.

Struktura

Integrin beta-1 může existovat různě izoformy přes alternativní sestřih. Šest alternativně sestříhané pro tento gen byly nalezeny varianty, které kódují pět alternativních proteinů C-konce.[6] Integrinové receptory existují jako heterodimery a bylo popsáno více než 20 různých integrinových heterodimerních receptorů. Všechny integriny, alfa a beta formy, mají velké extracelulární a krátké intracelulární domény.[7] Cytoplazmatická doména integrinu beta-1 se váže na aktin cytoskelet.[8] Integrin beta-1 je nejhojnější exprimovaný beta-integrin a asociuje se s nejméně 10 různými podjednotkami integrinu-alfa.[7]

Funkce

Členy rodiny integrinu jsou membránové receptory zapojené do buněčné adheze a rozpoznávání v různých procesech včetně embryogeneze, hemostáza, oprava tkáně, imunitní odpověď a metastatická difúze nádorových buněk.[7] Integriny propojují aktin cytoskelet s extracelulární matrix a přenášejí signály obousměrně mezi extracelulární matrix a cytoplazmatický domén.[9][10]Beta-integriny jsou primárně zodpovědné za zacílení integrinových dimerů do příslušných subcelulárních míst, což je hlavně v adhezivních buňkách fokální adheze.[8][11] Mutanti integrinu beta-1 ztrácejí schopnost cílit na weby fokální adheze.[12][13]

Byly identifikovány tři nové izoformy integrinu beta-1, označované jako beta-1B, beta-1C a beta-1D. Integrin beta-1B je transkribován, když je proximální 26 aminokyseliny z cytoplazmatický doména v exonu 6 jsou zachována a poté následována 12 aminokyselina protáhnout se od sousedního intronický kraj.[14] Integrin beta-1B izoforma se jeví jako dominantní negativní v tom, že inhibuje buněčnou adhezi.[15] Druhý integrin beta-1 izoforma bylo popsáno, že má dalších 48 aminokyseliny připojeno k 26 aminokyseliny v cytoplazmatický doména;[16] funkce této izoformy byla inhibiční Syntéza DNA v Fáze G1 z buněčný cyklus.[17] Třetí izoforma, označovaný jako beta-1D, je a pruhovaný sval - specifická izoforma, která nahrazuje kanonickou beta-1A izoforma v srdeční a kosterní sval buňky. Tento izoforma se vyrábí spojením do nového dalšího exonu mezi exony 6 a 7. The cytoplazmatický doména integrinu beta-1D nahrazuje distální 21 aminokyseliny (přítomný v integrinu beta-1A) s alternativním úsekem 24 aminokyseliny (13 jedinečných).[18][19]

Zdá se, že integrin beta-1D je během myofibrilogeneze vývojově regulován,[19] objevující se bezprostředně po fúzi myoblasty v C2C12 buňka s rostoucími úrovněmi myofibrilární diferenciace.[20] Integrin beta-1D je specificky lokalizován náklady a vložené disky z srdeční sval a náklady, myotendinous křižovatky a neuromuskulární spojení z kosterní sval, a zdá se, že funguje obecně jako jiné integriny, jako shlukování integrinů beta-1D na povrchu CHO buňky vyústilo v tyrosin fosforylace z pp125FAK a indukované mitogenem aktivovaná protein kináza aktivace.[20]

Klinický význam

U pacientů s svalová dystrofie končetinového pletence Bylo prokázáno, že integrin typu 2C, beta-1D je výrazně snížen kosterní sval biopsie, koordinovat se snížením alfa 7B-integrin a filamin 2.[21]

U pacientů s citlivým motorem polyneuropatie, úrovně integrin alfa-7B, integrin beta-1D a úšklebek byly významně sníženy téměř na nezjistitelné úrovně; a to odpovídalo nižšímu mRNA úrovně.[22]

Interakce

Bylo prokázáno, že CD29 komunikovat s

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150093 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025809 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Goodfellow PJ, Nevanlinna HA, Gorman P, Sheer D, Lam G, Goodfellow PN (leden 1989). "Přiřazení genu kódujícího beta podjednotku receptoru lidského fibronektinu (beta-FNR) k chromozomu 10p11.2". Annals of Human Genetics. 53 (Pt 1): 15–22. doi:10.1111 / j.1469-1809.1989.tb01118.x. PMID  2524991. S2CID  36485270.
  6. ^ „Entrez Gene: ITGB1 integrin, beta 1 (receptor fibronektinu, beta polypeptid, antigen CD29 zahrnuje MDF2, MSK12)“.
  7. ^ A b C Hynes RO (duben 1992). "Integriny: univerzálnost, modulace a signalizace v buněčné adhezi". Buňka. 69 (1): 11–25. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90115-s. PMID  1555235. S2CID  32774108.
  8. ^ A b Sastry SK, Horwitz AF (říjen 1993). „Integrinové cytoplazmatické domény: mediátory cytoskeletálních vazeb a extra- a intracelulárně iniciovaná transmembránová signalizace“. Aktuální názor na buněčnou biologii. 5 (5): 819–31. doi:10.1016 / 0955-0674 (93) 90031-k. PMID  8240826.
  9. ^ Burridge K, Chrzanowska-Wodnicka M (1996). „Ohniskové adheze, kontraktilita a signalizace“. Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 12: 463–518. doi:10.1146 / annurev.cellbio.12.1.463. PMID  8970735.
  10. ^ Schwartz MA, Schaller MD, Ginsberg MH (1995). "Integriny: vznikající paradigmata přenosu signálu". Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 11: 549–99. doi:10.1146 / annurev.cb.11.110195.003001. PMID  8689569.
  11. ^ LaFlamme SE, Akiyama SK, Yamada KM (duben 1992). „Regulace distribuce fibronektinových receptorů“. The Journal of Cell Biology. 117 (2): 437–47. doi:10.1083 / jcb.117.2.437. PMC  2289425. PMID  1373145.
  12. ^ Akiyama SK, Yamada SS, Yamada KM, LaFlamme SE (červen 1994). "Transmembránová signální transdukce integrinovými cytoplazmatickými doménami exprimovaná v chimérách s jednou podjednotkou". The Journal of Biological Chemistry. 269 (23): 15961–4. PMID  7515874.
  13. ^ Reszka AA, Hayashi Y, Horwitz AF (červen 1992). "Identifikace aminokyselinových sekvencí v integrinové beta 1 cytoplazmatické doméně zapojené do cytoskeletální asociace". The Journal of Cell Biology. 117 (6): 1321–30. doi:10.1083 / jcb.117.6.1321. PMC  2289496. PMID  1376731.
  14. ^ Altruda F, Cervella P, Tarone G, Botta C, Balzac F, Stefanuto G, Silengo L (listopad 1990). "Podjednotka lidského integrinu beta 1 s jedinečnou cytoplazmatickou doménou generovanou alternativním zpracováním mRNA". Gen. 95 (2): 261–6. doi:10.1016/0378-1119(90)90369-3. PMID  2249781.
  15. ^ Balzac F, Retta SF, Albini A, Melchiorri A, Koteliansky VE, Geuna M, Silengo L, Tarone G (říjen 1994). „Exprese izoformy beta 1B integrinu v buňkách CHO má dominantní negativní účinek na adhezi a motilitu buněk“. The Journal of Cell Biology. 127 (2): 557–65. doi:10.1083 / jcb.127.2.557. hdl:2318/39410. PMC  2120206. PMID  7523423.
  16. ^ Languino LR, Ruoslahti E (duben 1992). "Alternativní forma podjednotky integrinu beta 1 s variantní cytoplazmatickou doménou". The Journal of Biological Chemistry. 267 (10): 7116–20. PMID  1551917.
  17. ^ Meredith J, Takada Y, Fornaro M, Languino LR, Schwartz MA (září 1995). "Inhibice progrese buněčného cyklu alternativně sestřiženým integrinem beta 1C". Věda. 269 (5230): 1570–2. doi:10.1126 / science.7545312. PMID  7545312.
  18. ^ Zhidkova NI, Belkin AM, Mayne R (září 1995). "Nová izoforma integrinu beta 1 exprimovaná v kosterním a srdečním svalu". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 214 (1): 279–85. doi:10.1006 / bbrc.1995.2285. PMID  7545396.
  19. ^ A b van der Flier A, Kuikman I, Baudoin C, van der Neut R, Sonnenberg A (srpen 1995). "Nová izoforma beta 1 integrinu produkovaná alternativním sestřihem: jedinečná exprese v srdečním a kosterním svalu". FEBS Dopisy. 369 (2–3): 340–4. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00814-p. PMID  7544298. S2CID  86638879.
  20. ^ A b Belkin AM, Zhidkova NI, Balzac F, Altruda F, Tomatis D, Maier A, Tarone G, Koteliansky VE, Burridge K (leden 1996). „Integrin beta 1D vytěsňuje izoformu beta 1A ve pruhovaných svalech: lokalizace na spojovacích strukturách a signální potenciál v nesvalových buňkách“. The Journal of Cell Biology. 132 (1–2): 211–26. doi:10.1083 / jcb.132.1.211. PMC  2120711. PMID  8567725.
  21. ^ Anastasi G, Cutroneo G, Trimarchi F, Santoro G, Bruschetta D, Bramanti P, Pisani A, Favaloro A (prosinec 2004). „Hodnocení sarkoglykanů, systému vinculin-talin-integrin a filamin2 v alfa- a gama-sarkoglykanopatie: imunohistochemická studie“. International Journal of Molecular Medicine. 14 (6): 989–99. doi:10,3892 / ijmm.14.6.989. PMID  15547664.
  22. ^ Anastasi G, Cutroneo G, Santoro G, Arco A, Rizzo G, Bramanti P, Rinaldi C, Sidoti A, Amato A, Favaloro A (září 2008). "Costameric proteiny v lidském kosterním svalu během svalové nečinnosti". Anatomy Journal. 213 (3): 284–95. doi:10.1111 / j.1469-7580.2008.00921.x. PMC  2732038. PMID  18537849.
  23. ^ Otey CA, Pavalko FM, Burridge K (srpen 1990). „Interakce mezi alfa-aktininem a beta 1 integrinovou podjednotkou in vitro“. The Journal of Cell Biology. 111 (2): 721–9. doi:10.1083 / jcb.111.2.721. PMC  2116186. PMID  2116421.
  24. ^ Otey CA, Vasquez GB, Burridge K, Erickson BW (říjen 1993). "Mapování vazebného místa alfa-aktininu v cytoplazmatické doméně beta 1 integrinu". The Journal of Biological Chemistry. 268 (28): 21193–7. PMID  7691808.
  25. ^ Lozahic S, Christiansen D, Manié S, Gerlier D, Billard M, Boucheix C, Rubinstein E (březen 2000). „CD46 (membránový kofaktorový protein) se asociuje s více integriny beta1 a tetraspany“. European Journal of Immunology. 30 (3): 900–7. doi:10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <900 :: AID-IMMU900> 3.0.CO; 2-X. PMID  10741407.
  26. ^ Radford KJ, Thorne RF, Hersey P (květen 1996). „CD63 se asociuje s transmembránovými 4 členy superrodiny, CD9 a CD81 a s beta 1 integriny v lidském melanomu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 222 (1): 13–8. doi:10.1006 / bbrc.1996.0690. PMID  8630057.
  27. ^ A b Mazzocca A, Carloni V, Sciammetta S, Cordella C, Pantaleo P, Caldini A, Gentilini P, Pinzani M (září 2002). „Exprese transmembránových proteinů superrodiny 4 (TM4SF) a jejich role v motilitě jaterních hvězdicových buněk a migraci hojení ran“. Journal of Hepatology. 37 (3): 322–30. doi:10.1016 / S0168-8278 (02) 00175-7. PMID  12175627.
  28. ^ Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (říjen 2000). „LIM-only protein DRAL / FHL2 se váže na cytoplazmatickou doménu několika alfa a beta integrinových řetězců a je přijímán do adhezních komplexů“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (43): 33669–78. doi:10,1074 / jbc.M002519200. PMID  10906324.
  29. ^ A b van der Flier A, Kuikman I, Kramer D, Geerts D, Kreft M, Takafuta T, Shapiro SS, Sonnenberg A (leden 2002). „Různé varianty sestřihu filaminu-B ovlivňují myogenezi, subcelulární distribuci a určují vazbu na podjednotky integrinu p“. The Journal of Cell Biology. 156 (2): 361–76. doi:10.1083 / jcb.200103037. PMC  2199218. PMID  11807098.
  30. ^ Loo DT, Kanner SB, Aruffo A (září 1998). "Filamin se váže na cytoplazmatickou doménu beta1-integrinu. Identifikace aminokyselin odpovědných za tuto interakci". The Journal of Biological Chemistry. 273 (36): 23304–12. doi:10.1074 / jbc.273.36.23304. PMID  9722563.
  31. ^ Serru V, Le Naour F, Billard M, Azorsa DO, Lanza F, Boucheix C, Rubinstein E (květen 1999). „Selektivní komplexy tetraspan-integrin (CD81 / alfa4beta1, CD151 / alfa3beta1, CD151 / alfa6beta1) za podmínek narušujících interakce tetraspanu“. The Biochemical Journal. 340 (Pt 1): 103–11. doi:10.1042/0264-6021:3400103. PMC  1220227. PMID  10229664.
  32. ^ A b Lee HS, Millward-Sadler SJ, Wright MO, Nuki G, Al-Jamal R, Salter DM (listopad 2002). "Aktivace signalizace Integrin-RACK1 / PKCalpha v mechanotransdukci lidských kloubních chondrocytů". Osteoartróza a chrupavka. 10 (11): 890–7. doi:10.1053 / joca.2002.0842. PMID  12435334.
  33. ^ Liliental J, Chang DD (leden 1998). „Rack1, receptor pro aktivovanou proteinkinázu C, interaguje s podjednotkou integrinu beta“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2379–83. doi:10.1074 / jbc.273.4.2379. PMID  9442085.
  34. ^ Chang DD, Wong C, Smith H, Liu J (září 1997). „ICAP-1, nový protein asociovaný s cytoplazmatickou doménou beta1 integrinu, se váže na konzervovaný a funkčně důležitý motiv sekvence NPXY integrinu beta1“. The Journal of Cell Biology. 138 (5): 1149–57. doi:10.1083 / jcb.138.5.1149. PMC  2136751. PMID  9281591.
  35. ^ Chang DD, Hoang BQ, Liu J, Springer TA (březen 2002). "Molekulární základ pro interakci mezi doménou Icap1 alfa PTB a beta 1 integrinem". The Journal of Biological Chemistry. 277 (10): 8140–5. doi:10,1074 / jbc.M109031200. PMID  11741908.
  36. ^ Hadari YR, Arbel-Goren R, Levy Y, Amsterdam A, Alon R, Zakut R, Zick Y (červenec 2000). „Vazba galectinu-8 na integriny inhibuje adhezi buněk a vyvolává apoptózu“. Journal of Cell Science. 113 (13): 2385–97. PMID  10852818.
  37. ^ Poinat P, De Arcangelis A, Sookhareea S, Zhu X, Hedgecock EM, Labouesse M, Georges-Labouesse E (duben 2002). "Konzervovaná interakce mezi beta1 integrinem / PAT-3 a Nck interagující kinázou / MIG-15, která zprostředkovává komisurální axonovou navigaci v C. elegans". Aktuální biologie. 12 (8): 622–31. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00764-9. PMID  11967148. S2CID  9977605.
  38. ^ Fournier HN, Dupé-Manet S, Bouvard D, Lacombe ML, Marie C, Block MR, Albiges-Rizo C (červen 2002). „Protein 1alfa (ICAP-1alfa) asociovaný s integrinovou cytoplazmatickou doménou interaguje přímo s potlačovačem metastáz nm23-H2 a oba proteiny jsou zacíleny na nově vytvořená místa adheze buněk po zapojení integrinu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (23): 20895–902. doi:10,1074 / jbc.M200200200. PMID  11919189.
  39. ^ Parsons M, Keppler MD, Kline A, Messent A, Humphries MJ, Gilchrist R, Hart IR, Quittau-Prevostel C, Hughes WE, Parker PJ, Ng T (srpen 2002). „Lokálně zaměřená porucha periferace interakce proteinkinázy C-integrinu blokuje chemotaxi buněk karcinomu“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (16): 5897–911. doi:10.1128 / MCB.22.16.5897-5911.2002. PMC  133968. PMID  12138200.
  40. ^ Tapley P, Horwitz A, Buck C, Duggan K, Rohrschneider L (březen 1989). „Integriny izolované z fibroblastů kuřecích embryí transformovaných virem Rousova sarkomu“. Onkogen. 4 (3): 325–33. PMID  2468126.
  41. ^ Horwitz A, Duggan K, Buck C, Beckerle MC, Burridge K (1986). „Interakce receptoru fibronektinu plazmatické membrány s talinem - transmembránová vazba“. Příroda. 320 (6062): 531–3. doi:10.1038 / 320531a0. PMID  2938015. S2CID  4356748.
  42. ^ Tachibana I, Bodorova J, Berditchevski F, Zutter MM, Hemler ME (listopad 1997). „NAG-2, nový protein transmembránové 4 superrodiny (TM4SF), který se komplexuje s integriny a dalšími proteiny TM4SF“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (46): 29181–9. doi:10.1074 / jbc.272.46.29181. PMID  9360996.
  43. ^ Han DC, Rodriguez LG, Guan JL (leden 2001). „Identifikace nové interakce mezi integrinem beta1 a 14-3-3beta“. Onkogen. 20 (3): 346–57. doi:10.1038 / sj.onc.1204068. PMID  11313964.

Další čtení

externí odkazy