CD180 - CD180

CD180
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3B2D
Identifikátory
Aliasy	CD180, LY64, Ly78, RP105, CD180 molekula
Externí ID	OMIM: 602226 MGI: 1194924 HomoloGene: 4077 Genové karty: CD180
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	67,196,799 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární; • extracelulární matrix;
Biologický proces	• pozitivní regulace lipopolysacharidem zprostředkované signální dráhy; • vrozený imunitní systém; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • Proliferace B buněk zapojená do imunitní odpovědi; • proces imunitního systému; • signální dráha podobná mýtnému receptoru; • zánětlivá reakce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4064
	17079
	ENSG00000134061
	ENSMUSG00000021624
	Q99467
	Q62192
	NM_005582
	NM_008533; NM_001360519
	NP_005573
	NP_032559; NP_001347448
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Antigen CD180 je protein že v lidé je kódován CD180 gen.^[4]^[5]^[6]^[7]

CD180 je povrch buňky molekula skládající se z extracelulárních repetic bohatých na leucin (LRR) a krátkého cytoplazmatického ocasu. Je také známý archaickými termíny Bgp-95 a RP105 pro základní označení po objevu u lidí (1988) a myší (1994). CD180 je exprimován na buňkách prezentujících antigen, včetně B buněk a dendritických buněk. Extracelulární LRR je spojena s molekulou zvanou MD-1 a tvoří komplex receptoru buněčného povrchu, CD180 / MD-1. Patří do rodiny patogenních receptorů, Toll-like receptory (TLR). CD180 / MD-1 spolupracuje s TLR4 a řídí rozpoznávání B buněk a signalizaci lipopolysacharidu (LPS), membránové složky gramnegativních bakterií.^[6]

Nedávno bylo prokázáno, že CD180 je zapojen do přežití a prognózy Chronická lymfocytární leukémie B-buněk.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134061 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Miura Y, Shimazu R, Miyake K, Akashi S, Ogata H, Yamashita Y, Narisawa Y, Kimoto M (listopad 1998). „RP105 je spojen s MD-1 a přenáší aktivační signál v lidských B buňkách“. Krev. 92 (8): 2815–22. doi:10,1182 / krev. V92.8.2815. PMID 9763566.
^ Miura Y, Miyake K, Yamashita Y, Shimazu R, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Inazawa J, Abe T, Kimoto M (březen 1997). "Molekulární klonování humánního homologu RP105 a chromozomální lokalizace myších a lidských genů RP105 (Ly64 a LY64)". Genomika. 38 (3): 299–304. doi:10.1006 / geno.1996.0632. PMID 8975706.
^ ^A ^b "Entrezův gen: molekula CD180 CD180".
^ ^[trvalý mrtvý odkaz ] [4]
^ Porakishvili, Nino; Memon, Azka; Vispute, Ketki; Kulíková, Nina; Clark, Edward A .; Rai, Kanti R .; Nathwani, Amit; Damle, Rajendra N .; Chiorazzi, Nicholas; Lydyard, Peter M. (květen 2011). "CD180 funguje při aktivaci, přežití a cyklování buněk B chronické lymfocytární leukémie". British Journal of Hematology. 153 (4): 486–498. doi:10.1111 / j.1365-2141.2011.08605.x. ISSN 0007-1048. PMID 21443749. S2CID 13360804.
^ Gordiienko, Inna; Shlapatska, Larysa; Kholodniuk, Valeriia; Sklyarenko, Lilia; Gluzman, Daniel F .; Clark, Edward A .; Sidorenko, Svetlana P. (10.10.2017). „Souhra drah receptorů CD150 a CD180 přispívá k patobiologii B lymfocytů chronické lymfocytární leukémie selektivní inhibicí signalizace Akt a MAPK“. PLOS ONE. 12 (10): e0185940. doi:10.1371 / journal.pone.0185940. ISSN 1932-6203. PMC 5628907. PMID 28982149.

Další čtení

Honda Y, Yamagiwa S, Matsuda Y a kol. (2007). "Změněná exprese TLR homologu RP105 na monocytech přecitlivělých na LPS u pacientů s primární biliární cirhózou". J. Hepatol. 47 (3): 404–11. doi:10.1016 / j.jhep.2007.03.012. PMID 17448566.
Divanovic S, Trompette A, Atabani SF a kol. (2005). „Negativní regulace signalizace TLR4 pomocí RP105“. Nat. Immunol. 6 (6): 571–8. doi:10.1038 / ni1198. PMC 2144914. PMID 15852007.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Zhang Z, Henzel WJ (2005). „Predikce signálního peptidu na základě analýzy experimentálně ověřených štěpných míst“. Protein Sci. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110 / ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
Izmailova E, Bertley FM, Huang Q a kol. (2003). „HIV-1 Tat přeprogramuje nezralé dendritické buňky tak, aby exprimovaly chemoatraktanty pro aktivované T buňky a makrofágy“. Nat. Med. 9 (2): 191–7. doi:10,1038 / nm822. PMID 12539042. S2CID 26145639.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Miyake K, Shimazu R, Kondo J a kol. (1998). „Myš MD-1, molekula, která je fyzicky spojena s RP105 a pozitivně reguluje její expresi“. J. Immunol. 161 (3): 1348–53. PMID 9686597.

[1]

externí odkazy

Člověk CD180 umístění genomu a CD180 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q99467 (Lidský antigen CD180) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q62192 (Myší CD180 antigen) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134061 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9763566-4] Miura Y, Shimazu R, Miyake K, Akashi S, Ogata H, Yamashita Y, Narisawa Y, Kimoto M (listopad 1998). „RP105 je spojen s MD-1 a přenáší aktivační signál v lidských B buňkách“. Krev. 92 (8): 2815–22. doi:10,1182 / krev. V92.8.2815. PMID 9763566.

[pmid8975706-5] Miura Y, Miyake K, Yamashita Y, Shimazu R, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Inazawa J, Abe T, Kimoto M (březen 1997). "Molekulární klonování humánního homologu RP105 a chromozomální lokalizace myších a lidských genů RP105 (Ly64 a LY64)". Genomika. 38 (3): 299–304. doi:10.1006 / geno.1996.0632. PMID 8975706.

[entrez-6] A ^b "Entrezův gen: molekula CD180 CD180".

[7] [trvalý mrtvý odkaz ] [4]

[8] Porakishvili, Nino; Memon, Azka; Vispute, Ketki; Kulíková, Nina; Clark, Edward A .; Rai, Kanti R .; Nathwani, Amit; Damle, Rajendra N .; Chiorazzi, Nicholas; Lydyard, Peter M. (květen 2011). "CD180 funguje při aktivaci, přežití a cyklování buněk B chronické lymfocytární leukémie". British Journal of Hematology. 153 (4): 486–498. doi:10.1111 / j.1365-2141.2011.08605.x. ISSN 0007-1048. PMID 21443749. S2CID 13360804.

[9] Gordiienko, Inna; Shlapatska, Larysa; Kholodniuk, Valeriia; Sklyarenko, Lilia; Gluzman, Daniel F .; Clark, Edward A .; Sidorenko, Svetlana P. (10.10.2017). „Souhra drah receptorů CD150 a CD180 přispívá k patobiologii B lymfocytů chronické lymfocytární leukémie selektivní inhibicí signalizace Akt a MAPK“. PLOS ONE. 12 (10): e0185940. doi:10.1371 / journal.pone.0185940. ISSN 1932-6203. PMC 5628907. PMID 28982149.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]