ADAM8 - ADAM8

ADAM8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4DD8
Identifikátory
Aliasy	ADAM8, CD156, CD156a, MS2, doména metalopeptidázy ADAM 8
Externí ID	OMIM: 602267 MGI: 107825 HomoloGene: 74384 Genové karty: ADAM8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	133,276,868 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	139,992,562 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • proteinová asociace; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita metaloendopeptidázy; • aktivita hydrolázy; • vazba molekul buněčné adheze; • vazba iontů vápníku; • aktivita endopeptidázy serinového typu; • aktivita metalopeptidázy; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • komplex alfa9-beta1 integrin-vaskulární buněčná adhezní molekula-1; • membrána; • terciární granule; • integrální součást plazmatické membrány; • povrch buňky; • konkrétní granule; • hustá granulární membrána jádra; • podosomy; • fagolysozom; • komplex alfa9-beta1 integrin-ADAM8; • buněčná membrána; • specifická granulovaná membrána; • membrána terciární granule; • granulovaná membrána bohatá na ficolin-1;
Biologický proces	• pozitivní regulace zánětlivé reakce; • demontáž extracelulární matice; • proteolýza; • pozitivní regulace buněčné extravazace; • pozitivní regulace extravazace neutrofilů; • pozitivní regulace zpracování bílkovin; • regulace buněčné adheze; • pozitivní regulace sekrece bílkovin; • zánětlivá reakce; • buněčná odpověď na hypoxii; • pozitivní regulace migrace T buněk; • pozitivní regulace produkce nadrodiny člena 11 nadrodiny faktoru nekrózy nádorů (ligandu); • pozitivní regulace akutní zánětlivé odpovědi; • buněčná morfogeneze; • pozitivní regulace apoptotického procesu thymocytů; • pozitivní regulace kostní resorpce; • negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • pozitivní regulace migrace thymocytů závislé na fibronektinu; • pozitivní regulace migrace eosinofilů; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • migrace leukocytů podílející se na zánětlivé reakci; • pozitivní regulace proteolýzy membránového proteinu ektodomény; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • pozitivní regulace diferenciace T buněk v brzlíku; • chemotaxe lymfocytů; • pozitivní regulace buněčné adheze; • angiogeneze; • degranulace neutrofilů; • buněčná adheze; • pozitivní regulace aktivity MAP kinázy; • pozitivní regulace vrozené imunitní odpovědi;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	101
	11501
	ENSG00000151651
	ENSMUSG00000025473
	P78325
	Q05910
	NM_001109; NM_001164489; NM_001164490
	NM_001291066; NM_007403
	NP_001100; NP_001157961; NP_001157962
	NP_001277995; NP_031429
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující dezintegrin a metaloproteinázovou doménu je enzym že u lidí je kódován ADAM8 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena ADAM (desintegrin a metaloproteináza rodina). Členy této rodiny jsou membránou ukotvené proteiny strukturně příbuzné hadímu jedu rozpadá se, a byly zapojeny do řady biologických procesů zahrnujících buňka-buňka a buňka-matice interakce, včetně oplodnění, vývoje svalů a neurogeneze. Může se podílet na proteinu kódovaném tímto genem buněčná adheze v době neurodegenerace.^[6]

Viz také

Shluk diferenciace

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151651 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025473 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yoshiyama K, Higuchi Y, Kataoka M, Matsuura K, Yamamoto S (duben 1997). "CD156 (lidský ADAM8): exprese, primární aminokyselinová sekvence a umístění genu". Genomika. 41 (1): 56–62. doi:10.1006 / geno.1997.4607. PMID 9126482.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ADAM8 ADAM metalopeptidázová doména 8“.

Další čtení

Yamamoto S, Higuchi Y, Yoshiyama K, Shimizu E, Kataoka M, Hijiya N, Matsuura K (červen 1999). "Proteiny rodiny ADAM v imunitním systému". Imunologie dnes. 20 (6): 278–84. doi:10.1016 / S0167-5699 (99) 01464-4. PMID 10354553.
Schlomann U, Rathke-Hartlieb S, Yamamoto S, Jockusch H, Bartsch JW (listopad 2000). „Tumor nekrotizující faktor alfa indukuje metaloproteázu-desintegrin, ADAM8 (CD 156): důsledky pro interakce neuron-glia během neurodegenerace“. The Journal of Neuroscience. 20 (21): 7964–71. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-21-07964.2000. PMC 6772711. PMID 11050116.
Amour A, Knight CG, English WR, Webster A, Slocombe PM, Knäuper V, Docherty AJ, Becherer JD, Blobel CP, Murphy G (červenec 2002). "Enzymatická aktivita ADAM8 a ADAM9 není regulována TIMP". FEBS Dopisy. 524 (1–3): 154–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03047-8. PMID 12135759. S2CID 37423323.
Ishikawa N, Daigo Y, Yasui W, Inai K, Nishimura H, Tsuchiya E, Kohno N, Nakamura Y (prosinec 2004). „ADAM8 jako nový sérologický a histochemický marker pro rakovinu plic“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (24): 8363–70. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-1436. PMID 15623614.
Foley SC, Mogas AK, Olivenstein R, Fiset PO, Chakir J, Bourbeau J, Ernst P, Lemière C, Martin JG, Hamid Q (duben 2007). "Zvýšená exprese ADAM33 a ADAM8 s progresí onemocnění u astmatu". The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 119 (4): 863–71. doi:10.1016 / j.jaci.2006.12.665. PMID 17339047.
Gómez-Gaviro M, Domínguez-Luis M, Canchado J, Calafat J, Janssen H, Lara-Pezzi E, Fourie A, Tugores A, Valenzuela-Fernández A, Mollinedo F, Sánchez-Madrid F, Díaz-González F (červen 2007 ). „Exprese a regulace metaloproteinázy ADAM-8 během patofyziologické aktivace lidských neutrofilů a její katalytická aktivita při vylučování L-selektinu“. Journal of Immunology. 178 (12): 8053–63. doi:10,4049 / jimmunol.178.12.8053. PMID 17548643.
Valkovskaya N, Kayed H, Felix K, Hartmann D, Giese NA, Osinsky SP, Friess H, Kleeff J (2008). „Exprese ADAM8 je spojena se zvýšenou invazivitou a sníženým přežitím pacientů s rakovinou pankreatu“. Journal of Cellular and Molecular Medicine. 11 (5): 1162–74. doi:10.1111 / j.1582-4934.2007.00082.x. PMC 4401277. PMID 17979891.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: M12.208
ADAM8 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
ADAM8 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro protein 8 obsahující lidskou desintegrin a metaloproteinázovou doménu (ADAM8)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151651 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025473 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9126482-5] Yoshiyama K, Higuchi Y, Kataoka M, Matsuura K, Yamamoto S (duben 1997). "CD156 (lidský ADAM8): exprese, primární aminokyselinová sekvence a umístění genu". Genomika. 41 (1): 56–62. doi:10.1006 / geno.1997.4607. PMID 9126482.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ADAM8 ADAM metalopeptidázová doména 8“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Proteázy: metaloendopeptidázy (ES 3.4.24 )
Bílkoviny ADAM	Alfa sekretázy ADAM9 10. ADAM 17. ADAM ADAM19 ADAM2 7. ADAM ADAM8 11. ADAM ADAM12 15. ADAM ADAM18 ADAM22 23. ADAM ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 8. ADAMTS ADAMTS9 10. ADAMTS 12. ADAMTS 13. ADAMTS
Matricové metaloproteinázy	Kolagenázy MMP1 MMP8 Želatinázy MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28
jiný	Neprilysin Prokolagenová peptidáza Termolyzin Těhotenský plazmatický protein A Kostní morfogenetický protein 1 Lysostafin Enzym degradující inzulin ZMPSTE24

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )