VPREB1 - VPREB1

VPREB1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2H32, 2H3N, 3BJ9
Identifikátory
Aliasy	VPREB1, IGI, IGVPB, VPREB, CD179a, pre-B lymfocyt 1, V-set pre-B buněčný náhradní lehký řetězec 1
Externí ID	OMIM: 605141 MGI: 98936 HomoloGene: 84741 Genové karty: VPREB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	22,245,515 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	16,870,843 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
	7441
	22362
	ENSG00000169575
	ENSMUSG00000059305
	P12018
	P13372
	NM_007128; NM_001303509
	NM_016982
	NP_001290438; NP_009059
	NP_058678
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Řetězec iota imunoglobulinu je protein že u lidí je kódován VPREB1 gen.^[5]^[6] VPREB1 byl také nedávno jmenován CD179A (shluk diferenciace 179A).

Funkce

CD179a (VpreB) je polypeptid dlouhý 126 126 se zjevnou molekulovou hmotností 16-18 kDa. Vyjadřuje se selektivně v raných fázích vývoje B buněk, konkrétně v proB a časných preB buňkách. CD179a má strukturu podobnou Ig V doméně, ale postrádá poslední beta řetězec (beta7) typické V domény. Místo toho má karboxylový terminální konec, který nevykazuje žádné sekvenční homologie s jinými proteiny. CD179a se nekovalentně asociuje s CD179b (lambda5 nebo lambda-podobná) nesoucí strukturu podobnou doméně Ig C za vzniku struktury podobné lehkému řetězci Ig, který se nazývá náhradní lehký řetězec nebo pseudo lehký řetězec. V tomto komplexu se zdá, že neúplná V doména CD179a je doplněna extra beta7 vláknem CD179b. Na povrchu časných preB buněk je náhradní lehký řetězec CD179a / CD179b disulfidově vázán na membránově vázaný těžký řetězec Ig mu ve spojení se signálním měničem CD79a / CD79b heterodimerem za vzniku struktury podobné B buněčnému receptoru, tzv. PreB buněčný receptor (preBCR). Ačkoli dosud nebylo hlášeno žádné lidské onemocnění nebo patologie související s CD179a, ukázalo se, že nedostatek dalších složek receptoru preB buněk, jako je CD179b, těžký řetězec Ig mu a CD79a, vede k vážnému poškození vývoje B buněk a agamaglobulinemie u člověka. PreBCR přenáší signály pro: 1) buněčnou proliferaci, diferenciaci z proB buňky do preB buněčného stádia, 2) alelickou exkluzi v místě genu Ig těžkého řetězce a 3) podporu přeskupení genu Ig lehkého řetězce. PreBCR tedy funguje jako kontrolní bod v časném vývoji B buněk, aby sledoval produkci těžkého řetězce Ig mu prostřednictvím funkčního přeskupení genu Ig těžkého řetězce a také schopnosti Ig těžkého řetězce asociovat s lehkým řetězcem Ig.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169575 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (listopad 1988). „Lidský gen Vpre B je umístěn na chromozomu 22 poblíž shluku genových segmentů V lambda.“ Imunogenetika. 28 (5): 328–33. doi:10.1007 / BF00364231. PMID 3139558.
^ ^A ^b "Entrez gen: VPREB1 pre-B lymfocytární gen 1".

Další čtení

Tsubata T, Reth M (září 1990). „Produkty genů specifických pro pre-B buňky (lambda 5 a VpreB) a řetězec imunoglobulinu mu tvoří komplex, který je transportován na povrch buňky“. The Journal of Experimental Medicine. 172 (3): 973–6. doi:10.1084 / jem.172.3.973. PMC 2188549. PMID 2117639.
Bauer SR, Kudo A, Melchers F (leden 1988). "Struktura a pre-B lymfocyt omezená exprese VpreB u lidí a zachování její struktury u jiných druhů savců". Časopis EMBO. 7 (1): 111–6. PMC 454222. PMID 3258819.
Guelpa-Fonlupt V, Bossy D, Alzari P, Fumoux F, Fougereau M, Schiff C (říjen 1994). "Lidský pre-B buněčný receptor: strukturální omezení pro předběžný model řetězce pseudo-light (psi L)". Molekulární imunologie. 31 (14): 1099–108. doi:10.1016/0161-5890(94)90105-8. PMID 7935499.
Ohnishi K, Takemori T (listopad 1994). "Molekulární komponenty a sestavení komplexů lehkého řetězce mu.surrogátu v pre-B buněčných liniích". The Journal of Biological Chemistry. 269 (45): 28347–53. PMID 7961773.
Guelpa-Fonlupt V, Tonnelle C, Blaise D, Fougereau M, Fumoux F (leden 1994). "Diskrétní časná stádia pro-B a pre-B v normální lidské kostní dřeni, jak je definována expresí povrchového pseudo-lehkého řetězce". European Journal of Immunology. 24 (1): 257–64. doi:10.1002 / eji.1830240140. PMID 8020565.
Bornemann KD, Brewer JW, Perez E, Doerre S, Sita R, Corley RB (březen 1997). "Sekrece rozpustných receptorů pre-B buněk pre-B buňkami". Journal of Immunology. 158 (6): 2551–7. PMID 9058786.
Kawasaki K, Minoshima S, Nakato E, Shibuya K, Shintani A, Schmeits JL, Wang J, Shimizu N (březen 1997). „Jedna megabázová sekvenční analýza lokusu lidského imunoglobulinového lambda genu“. Výzkum genomu. 7 (3): 250–61. doi:10,1101 / gr. 7.3.250. PMID 9074928.
Fang T, Smith BP, Roman CA (říjen 2001). "Konvenční a náhradní lehké řetězce diferenčně regulují zrání a těžkou řetězec Ig mu a Dmu těžkého řetězce a povrchovou expresi". Journal of Immunology. 167 (7): 3846–57. doi:10,4049 / jimmunol.167.7.3846. PMID 11564802.
Gisler R, Sigvardsson M (květen 2002). „Lidský promotor V-preB je cílem koordinované aktivace časným faktorem B buněk a E47“. Journal of Immunology. 168 (10): 5130–8. doi:10,4049 / jimmunol.168.10.5130. PMID 11994467.
Gauthier L, Rossi B, Roux F, Termine E, Schiff C (říjen 2002). „Galectin-1 je ligand stromálních buněk receptoru pre-B buněk (BCR) zapojený do tvorby synapsí mezi pre-B a stromálními buňkami a do spouštění pre-BCR“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (20): 13014–9. doi:10.1073 / pnas.202323999. PMC 130578. PMID 12271131.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Rossi B, Espeli M, Schiff C, Gauthier L (červenec 2006). „Shlukování integrinů pre-B buněk indukuje přemístění a aktivaci receptorů pre-B buněk závislých na galektinu-1“. Journal of Immunology. 177 (2): 796–803. doi:10,4049 / jimmunol.177.2.796. PMID 16818733.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P12018 (Iota lidského imunoglobulinu) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169575 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid3139558-5] Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (listopad 1988). „Lidský gen Vpre B je umístěn na chromozomu 22 poblíž shluku genových segmentů V lambda.“ Imunogenetika. 28 (5): 328–33. doi:10.1007 / BF00364231. PMID 3139558.

[entrez-6] A ^b "Entrez gen: VPREB1 pre-B lymfocytární gen 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350