Souvisí s receptorovou tyrosinkinázou - Related to receptor tyrosine kinase

RYK
Identifikátory
Aliasy	RYK, D3S3195, JTK5, JTK5A, RYK1, tyrosinkináza podobná receptoru, tyrosinkináza podobná receptoru
Externí ID	OMIM: 600524 MGI: 101766 HomoloGene: 68287 Genové karty: RYK
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	134,250,744 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	102,908,305 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita protein tyrosinkinázy; • aktivita transferázy; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • kinázová aktivita; • Aktivita receptoru aktivovaného Wnt; • ATP vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0005110 zkadeřená vazba; • Vazba na Wnt-protein; • aktivita coreceptoru zapojená do signální dráhy Wnt, dráha polarity rovinných buněk; • receptor tyrosinkinázy; • aktivita transmembránového proteinu tyrosinkinázy; • aktivita proteinkinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána; • buněčná membrána; • buněčné jádro; • receptorový komplex;
Biologický proces	• pozitivní regulace kaskády MAPK; • vývoj corpus callosum; • signální transdukce; • kanonická signální cesta Wnt; • nekanonická signální cesta Wnt; • neurogeneze; • komisurální neuronové vedení axonu; • vývoj neuronové projekce; • fosforylace bílkovin; • sestava synapse; • chemorepulze dopaminergního neuronu axonu; • neuronová diferenciace; • proliferace buněk ve středním mozku; • fosforylace; • axonogeneze; • axonové vedení; • Signální dráha Wnt zapojená do diferenciace dopaminergních neuronů středního mozku; • diferenciace dopaminergních neuronů středního mozku; • dráha polarity rovinných buněk zapojená do vedení axonů; • Wnt signální cesta; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • morfogeneze kosterního systému; • negativní regulace prodloužení axonu podílející se na vedení axonu; • negativní chemotaxe; • negativní regulace přenosu signálu; • diferenciace buněk; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • transmembránový receptorový protein tyrosinkinázová signální dráha; • vývoj nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6259
	20187
	ENSG00000163785
	ENSMUSG00000032547
	P34925
	Q01887
	NM_001005861; NM_002958
	NM_001042607; NM_013649; NM_001284258
	NP_001005861; NP_002949
	NP_001036072; NP_001271187; NP_038677
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The související s receptorovou tyrosinkinázou (RYK) gen kóduje protein Ryk.

Protein kódovaný tímto genem je atypickým členem rodiny proteinových tyrosin kináz receptoru růstového faktoru, který se liší od ostatních členů řadou konzervovaných zbytků v aktivačních a nukleotidových vazebných doménách. Tento genový produkt patří do podčeledi, jejíž členové nejeví regulaci fosforylací v aktivačním segmentu. Bylo navrženo, že zprostředkování biologické aktivity prostřednictvím náboru signálně kompetentního pomocného proteinu může nastat prostřednictvím dosud necharakterizovaného mechanismu. Byly identifikovány dvě alternativní varianty sestřihu kódující odlišné izoformy.^[5]

Dějiny

Gen kódování myší RYK byl poprvé identifikován v roce 1992.^[6]Následně cDNA kódování protein RYK byl izolován z následujících druhů.^[7]

Struktura

Stejně jako ostatní receptor tyrosinkinázy členové rodiny, RYK se skládá ze tří domén, an N-terminál, extracelulární ligand -vázací doména, a transmembránový překlenující doménu a C-terminál intracelulární doména. Na rozdíl od jiných receptorové tyrosinkinázy C-koncová doména RYK je nezjistitelná kináza aktivita.^[7]

Funkce

RYK se podílí na regulaci axon růst během vývoje nervový systém.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163785 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032547 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „RYK receptor jako tyrosinkináza [ Homo sapiens (člověk)] ". Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna. 13. března 2020. Citováno 2. dubna 2020.
^ Hovens CM, Stacker SA (1992). „RYK, molekula související s receptorem tyrosinkinázy s neobvyklými motivy domén kinázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (24): 11818–11822. doi:10.1073 / pnas.89.24.11818. PMC 50648. PMID 1334548.
^ ^A ^b Halford MM, Stacker SA (2001). "Odhalení receptoru RYK". BioEssays. 23 (1): 34–45. doi:10.1002 / 1521-1878 (200101) 23: 1 <34 :: AID-BIES1005> 3.0.CO; 2-D. PMID 11135307.
^ Hollis ER, Ishiko N, Yu T, Lu CC, Haimovich A, Tolentino K, Richman A, Tury A, Wang SH, Pessian M, Jo E, Kolodkin A, Zou Y (2016). "Ryk řídí přemapování motorické kůry během funkčního zotavení po poranění míchy". Přírodní neurovědy. 19 (5): 697–705. doi:10.1038 / č. 4282. PMC 4847956. PMID 27065364.

Další čtení

Partanen J, Mäkelä TP, Alitalo R a kol. (1991). „Předpokládané tyrosinkinázy exprimované v buňkách lidské leukémie K-562“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (22): 8913–8917. doi:10.1073 / pnas.87.22.8913. PMC 55070. PMID 2247464.
Gough NM, Rakar S, Hovens CM, Wilks A (1995). „Lokalizace dvou myších genů kódujících protein RYK související s receptorem proteinové tyrosinkinázy“. Mamm. Genom. 6 (4): 255–6. doi:10.1007 / BF00352411. PMID 7613029. S2CID 2577241.
Lee ST, Strunk KM, Spritz RA (1993). „Průzkum mRNA protein tyrosin kinázy exprimovaných v normálních lidských melanocytech“. Onkogen. 8 (12): 3403–3410. PMID 8247543.
Stacker SA, Hovens CM, Vitali A a kol. (1993). "Molekulární klonování a chromozomální lokalizace lidského homologu receptoru souvisejícího s tyrosin kinázami (RYK)". Onkogen. 8 (5): 1347–1356. PMID 8386829.
Tamagnone L, Partanen J, Armstrong E a kol. (1993). "Sekvence lidského ryk cDNA předpovídá protein obsahující dva domnělé transmembránové segmenty a tyrosinkinázovou katalytickou doménu". Onkogen. 8 (7): 2009–2014. PMID 8390040.
Wang XC, Katso R, Butler R a kol. (1996). „H-RYK, neobvyklá receptorová kináza: izolace a analýza exprese u rakoviny vaječníků“. Mol. Med. 2 (2): 189–203. doi:10.1007 / BF03401616. PMC 2230112. PMID 8726462.
Katso RM, Russell RB, Ganesan TS (1999). „Funkční analýza H-Ryk, atypického člena rodiny receptorových tyrosinkináz“. Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 6427–6440. doi:10,1128 / mcb.19.9.6427. PMC 84612. PMID 10454588.
Trivier E, Ganesan TS (2002). „RYK, katalyticky neaktivní receptorová tyrosinkináza, se asociuje s EphB2 a EphB3, ale neinteraguje s AF-6“. J. Biol. Chem. 277 (25): 23037–43. doi:10,1074 / jbc.M202486200. PMID 11956217.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Lu W, Yamamoto V, Ortega B, Baltimore D (2004). „Savčí Ryk je Wnt coreceptor potřebný pro stimulaci růstu neuritů“. Buňka. 119 (1): 97–108. doi:10.1016 / j.cell.2004.09.019. PMID 15454084. S2CID 18567677.
Watanabe A, Akita S, Tin NT a kol. (2006). „Mutace v RYK je genetickým faktorem pro nesyndromický rozštěp rtu a patra“. Rozštěp paláce Craniofac. J. 43 (3): 310–6. doi:10.1597/04-145.1. PMID 16681403. S2CID 23152169.
Szafranski K, Schindler S, Taudien S a kol. (2007). „Porušení pravidel spojování: TG dinukleotidy fungují jako alternativní 3 'spojovací místa v intronech závislých na U2“. Genome Biology. 8 (8): R154. doi:10.1186 / gb-2007-8-8-r154. PMC 2374985. PMID 17672918.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163785 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032547 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „RYK receptor jako tyrosinkináza [ Homo sapiens (člověk)] ". Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna. 13. března 2020. Citováno 2. dubna 2020.

[hovens-6] Hovens CM, Stacker SA (1992). „RYK, molekula související s receptorem tyrosinkinázy s neobvyklými motivy domén kinázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (24): 11818–11822. doi:10.1073 / pnas.89.24.11818. PMC 50648. PMID 1334548.

[halford-7] A ^b Halford MM, Stacker SA (2001). "Odhalení receptoru RYK". BioEssays. 23 (1): 34–45. doi:10.1002 / 1521-1878 (200101) 23: 1 <34 :: AID-BIES1005> 3.0.CO; 2-D. PMID 11135307.

[8] Hollis ER, Ishiko N, Yu T, Lu CC, Haimovich A, Tolentino K, Richman A, Tury A, Wang SH, Pessian M, Jo E, Kolodkin A, Zou Y (2016). "Ryk řídí přemapování motorické kůry během funkčního zotavení po poranění míchy". Přírodní neurovědy. 19 (5): 697–705. doi:10.1038 / č. 4282. PMC 4847956. PMID 27065364.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )