Polycystin 1 - Polycystin 1

PKD1
Protein PKD1 PDB 1b4r.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPKD1, PBP, Pc-1, TRPP1, polycystin 1, přechodný receptorový potenciální kanál interagující, PC1
Externí IDOMIM: 601313 MGI: 97603 HomoloGene: 250 Genové karty: PKD1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 16 (lidský)
Chr.Chromozom 16 (lidský)[1]
Chromozom 16 (lidský)
Genomické umístění pro PKD1
Genomické umístění pro PKD1
Kapela16p13.3Start2,088,708 bp[1]
Konec2,135,898 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PKD1 202328 s na fs.png

PBB GE PKD1 202327 s na fs.png

PBB GE PKD1 216949 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5310

18763

Ensembl

ENSG00000008710

ENSMUSG00000032855

UniProt

P98161

O08852

RefSeq (mRNA)

NM_000296
NM_001009944

NM_013630

RefSeq (protein)

NP_000287
NP_001009944

NP_038658

Místo (UCSC)Chr 16: 2,09 - 2,14 MbChr 17: 24,55 - 24,6 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Polycystin 1 (často zkráceno na PC1) je protein že v lidé je kódován PKD1 gen [5][6]. Mutace PKD1 jsou spojeny s většinou případů autozomálně dominantní polycystické onemocnění ledvin, těžký dědičná porucha z ledviny charakterizovaný vývojem renálních cyst a těžkou dysfunkcí ledvin [7].

Struktura a funkce bílkovin

PC1 interaguje s polycystin 2 cytoplazmatickou doménou cívky.

PC1 je protein vázaný na membránu 4303 aminokyseliny v délce vyjádřené převážně na primární cilium, stejně jako apikální membrány, dodržuje spojení, a desmosomy [8]. Má 11 transmembránové domény, velká extracelulární N-koncová doména a krátká (asi 200 aminokyselin) cytoplazmatický C-koncová doména [8][9]. Tato intracelulární doména obsahuje doménu coiled-coil, se kterou PC1 interaguje polycystin 2 (PC2), na membránu vázaný Ca2+-propustný iontový kanál.

Bylo navrženo, aby PC1 fungoval jako Receptor spojený s G proteinem [8][10]. C-koncová doména může být štěpena mnoha různými způsoby. V jednom případě bylo zjištěno, že se v oku hromadí část ocasu ~ 35 kDa buněčné jádro v reakci na snížený tok tekutin v ledvinách myší [11]. V jiném případě může být získán 15 kDa fragment, který interaguje s transkripčním aktivátorem a koaktivátorem STAT6 a p100, nebo součásti kanonického Wnt signální cesta inhibičním způsobem [12][13].

Struktura lidského komplexu PKD1-PKD2 byla vyřešena kryo-elektronová mikroskopie, který ve struktuře vykázal poměr PKD1 a PKD2 v poměru 1: 3. PKD1 se skládá z a napěťově řízený iontový kanál záhyb, který interaguje s PKD2.[14]

PC1 zprostředkovává mechanosenzace toku tekutiny primárním ciliem v renálním epitelu a mechanické deformace kloubní chrupavky [15].

Gen

Byly zaznamenány varianty sestřihu kódující různé izoformy PKD1. Gen je úzce spojen se šesti pseudogeny ve známé duplikované oblasti na chromozomu 16p.[16]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000008710 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032855 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Hughes J, Ward CJ, Peral B, Aspinwall R, Clark K, San Millán JL, Gamble V, Harris PC (červen 1995). „Gen polycystického onemocnění ledvin 1 (PKD1) kóduje nový protein s více doménami rozpoznávání buněk“. Genetika přírody. 10 (2): 151–60. doi:10.1038 / ng0695-151. PMID  7663510. S2CID  20636101.
  6. ^ „Polycystické onemocnění ledvin: úplná struktura genu PKD1 a jeho proteinu. Mezinárodní konsorcium polycystických onemocnění ledvin“. Buňka. 81 (2): 289–98. Dubna 1995. doi:10.1016/0092-8674(95)90339-9. PMID  7736581. S2CID  11114706.
  7. ^ Torres VE, Harris PC, Pirson Y (duben 2007). "Autosomálně dominantní polycystické onemocnění ledvin". Lanceta. 369 (9569): 1287–301. doi:10.1016 / S0140-6736 (07) 60601-1. PMID  17434405. S2CID  1700992.
  8. ^ A b C Zhou J (2009). "Polycystiny a primární řasy: primery pro progresi buněčného cyklu". Roční přehled fyziologie. 71: 83–113. doi:10.1146 / annurev.physiol.70.113006.100621. PMID  19572811.
  9. ^ Dalagiorgou G, Basdra EK, Papavassiliou AG (říjen 2010). „Polycystin-1: function as a mechanosensor“. International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 42 (10): 1610–3. doi:10.1016 / j.biocel.2010.06.017. PMID  20601082.
  10. ^ Trudel M, Yao Q, Qian F (leden 2016). „Role štěpení polycystinu-1 ve fyziologii ledvin a polycystických onemocněních v místě proteolýzy spojeného s receptorem G“. Buňky. 5 (1): 3. doi:10,3390 / buňky5010003. PMC  4810088. PMID  26805887.
  11. ^ Chauvet V, Tian X, Husson H, Grimm DH, Wang T, Hiesberger T, Hieseberger T, Igarashi P, Bennett AM, Ibraghimov-Beskrovnaya O, Somlo S, Caplan MJ (listopad 2004). „Mechanické podněty indukují štěpení a nukleární translokaci C konce polycystinu-1“. The Journal of Clinical Investigation. 114 (10): 1433–43. doi:10,1172 / JCI21753. PMC  1052027. PMID  15545994.
  12. ^ Low SH, Vasanth S, Larson CH, Mukherjee S, Sharma N, Kinter MT, Kane ME, Obara T, Weimbs T (leden 2006). „Polycystin-1, STAT6 a P100 fungují v dráze, která přenáší ciliární mechanosenzaci a je aktivována při polycystickém onemocnění ledvin“. Vývojová buňka. 10 (1): 57–69. doi:10.1016 / j.devcel.2005.12.005. PMID  16399078.
  13. ^ Lal M, Song X, Pluznick JL, Di Giovanni V, Merrick DM, Rosenblum ND, Chauvet V, Gottardi CJ, Pei Y, Caplan MJ (říjen 2008). „C-koncový konec polycystinu-1 se asociuje s beta-kateninem a inhibuje kanonickou signalizaci Wnt“. Lidská molekulární genetika. 17 (20): 3105–17. doi:10,1093 / hmg / ddn208. PMC  2722884. PMID  18632682.
  14. ^ Shi, Yigong; Mei, Changlin; Zhou, Qiang; Wang, Tingliang; Yu, Shengqiang; Lei, Jianlin; Ge, Xiaofei; Hu, Feizhuo; Su, Qiang (07.09.2018). "Struktura lidského komplexu PKD1-PKD2". Věda. 361 (6406): eaat9819. doi:10.1126 / science.aat9819. ISSN  0036-8075. PMID  30093605.
  15. ^ Nauli SM, Alenghat FJ, Luo Y, Williams E, Vassilev P, Li X, Elia AE, Lu W, Brown EM, Quinn SJ, Ingber DE, Zhou J (únor 2003). „Polycystiny 1 a 2 zprostředkovávají mechanosenzaci v primárním ciliu ledvinových buněk“. Genetika přírody. 33 (2): 129–37. doi:10.1038 / ng1076. PMID  12514735. S2CID  23149223.
  16. ^ „Entrez Gene: PKD1 polycystické onemocnění ledvin 1 (autozomálně dominantní)“.

externí odkazy