ARL6 - ARL6
Protein podobný ADP-ribosylačnímu faktoru 6 je protein že u lidí je kódován ARL6 gen.[5][6][7]
Protein kódovaný tímto genem patří do Rodina ARF proteinů vázajících GTP. ARF proteiny jsou důležitými regulátory buněčného přenosu a jsou zakládajícími členy rozšiřující se rodiny homologních proteinů a genomových sekvencí. Odcházejí od ostatních malých proteinů vázajících GTP jedinečným strukturním zařízením, které implementuje komunikaci zepředu dozadu od N-konce k místu vázajícímu nukleotidy. Studie myšího ortologu tohoto proteinu naznačují účast na transportu bílkovin, přenosu membrány nebo buněčné signalizaci během zrání krvetvorby. Na tomto místě dochází k alternativnímu sestřihu a byly popsány dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113966 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022722 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Chiang AP, Nishimura D, Searby C, Elbedour K, Carmi R, Ferguson AL, Secrist J, Braun T, Casavant T, Stone EM, Sheffield VC (červenec 2004). „Srovnávací genomová analýza identifikuje gen podobný ADP-ribosylačnímu faktoru jako příčinu Bardet-Biedlova syndromu (BBS3)“. Jsem J Hum Genet. 75 (3): 475–84. doi:10.1086/423903. PMC 1182025. PMID 15258860.
- ^ Fan Y, Esmail MA, Ansley SJ, Blacque OE, Boroevich K, Ross AJ, Moore SJ, Badano JL, May-Simera H, Compton DS, Green JS, Lewis RA, van Haelst MM, Parfrey PS, Baillie DL, Beales PL , Katsanis N, Davidson WS, Leroux MR (září 2004). „Mutace u člena nadrodiny Ras malých proteinů vázajících GTP způsobují Bardet-Biedlův syndrom“. Nat Genet. 36 (9): 989–93. doi:10.1038 / ng1414. PMID 15314642.
- ^ A b „Entrez Gene: ARL6 ADP-ribosylační faktor podobný 6“.
externí odkazy
- GeneReviews / NIH / NCBI / UW záznam o Bardet-Biedlově syndromu
- Člověk ARL6 umístění genomu a ARL6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9H0F7 (Protein podobný lidskému ADP-ribosylačnímu faktoru 6 (ARL6)) na PDBe-KB.
Další čtení
- Sheffield VC, Carmi R, Kwitek-Black A a kol. (1995). „Identifikace lokusu Bardet-Biedlova syndromu na chromozomu 3 a vyhodnocení efektivního přístupu k mapování homozygotů“. Hučení. Mol. Genet. 3 (8): 1331–5. doi:10,1093 / hmg / 3,8,1331. PMID 7987310.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Jacobs S, Schilf C, Fliegert F a kol. (1999). „ADP-ribosylační faktor (ARF) podobný 4, 6 a 7 představuje podskupinu charakterizace rodiny ARF rychlou výměnou nukleotidů a signálem nukleární lokalizace“. FEBS Lett. 456 (3): 384–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00759-0. PMID 10462049. S2CID 84422541.
- Ingley E, Williams JH, Walker CE a kol. (1999). „Nový faktor podobný ADP-ribosylaci (ARL-6) interaguje s podjednotkou kanálu SEC61beta, který vede protein“. FEBS Lett. 459 (1): 69–74. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01188-6. PMID 10508919. S2CID 30948975.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Pasqualato S, Renault L, Cherfils J (2003). „Proteiny Arf, Arl, Arp a Sar: rodina proteinů vázajících GTP se strukturním zařízením pro„ přední-zadní “komunikaci“. EMBO Rep. 3 (11): 1035–41. doi:10.1093 / embo-reports / kvf221. PMC 1307594. PMID 12429613.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |