Transmembránová doména - Transmembrane domain
 | tento článek potřebuje další citace pro ověření. (Září 2014) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
Transmembránová doména obvykle označuje transmembránový segment singlu alfa šroubovice a transmembránový protein.[1] Obecněji řečeno, transmembránovou doménou je jakékoli membránové pole proteinová doména.
Identifikace transmembránových šroubovic
Transmembránové šroubovice jsou viditelné ve strukturách membránových proteinů určených Rentgenová difrakce. Lze je také předvídat na základě stupnice hydrofobicity. Protože interiér dvouvrstvá a vnitřky většiny proteinů známé struktury jsou hydrofobní „Předpokládá se, že u aminokyselin, které překlenují membránu, musí být také hydrofobní. Nicméně, membránová čerpadla a iontové kanály také obsahují četné nabité a polární zbytky uvnitř obecně nepolárních transmembránových segmentů.
Použitím hydrofobní analýza předpovídat transmembránové šroubovice umožňuje předpovědi na oplátku "transmembránová topologie" proteinu; tj. předpověď toho, jaké části vyčnívají do buňky, jaké části vyčnívají a kolikrát proteinový řetězec prochází membránou.
Příklady
- Tetraspaniny mají 4 konzervované transmembránové domény.
Reference
- ^ Hayley J. Sharpe; Tim J. Stevens; Sean Munro (9. července 2010). „Komplexní srovnání transmembránových domén odhaluje vlastnosti specifické pro organely“. Buňka. 142 (1): 158–169. doi:10.1016 / j.cell.2010.05.037. PMC 2928124. PMID 20603021.