ADAM9 - ADAM9

ADAM9
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1M1V
Identifikátory
Aliasy	ADAM9, CORD9, MCMP, MDC9, Mltng, doména metalopeptidázy ADAM 9
Externí ID	OMIM: 602713 MGI: 105376 HomoloGene: 20824 Genové karty: ADAM9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	39,105,261 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	25,016,927 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kolagenu; • Vazba domény SH3; • vazba kovových iontů; • integrinová vazba; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita metaloendopeptidázy; • lamininová vazba; • aktivita hydrolázy; • aktivita metalopeptidázy; • vazba protein kinázy C.;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • ohnisková adheze; • vnitřní složka vnější strany plazmatické membrány; • buněčná membrána; • extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • povrch buňky; • bazolaterální plazmatická membrána; • extracelulární;
Biologický proces	• aktivace aktivity MAPKK; • pozitivní regulace proteolýzy ektodomény membránového proteinu; • reakce na glukokortikoidy; • pozitivní regulace fúze makrofágů; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem; • diferenciace keratinocytů; • proteolýza; • aktivace monocytů; • reakce na iont vápníku; • reakce na faktor nekrózy nádoru; • pozitivní regulace migrace keratinocytů; • buněčná adheze; • reakce na manganový iont; • proteolýza ektodomény membránového proteinu; • pozitivní regulace sekrece bílkovin; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace buněčné adheze zprostředkované integrinem; • buněčná matice adheze; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • reakce na peroxid vodíku; • migrace buněk; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem; • reakce na smykové napětí laminárního fluida; • reakce na cytostatikum;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8754
	11502
	ENSG00000168615; ENSG00000282230
	ENSMUSG00000031555
	Q13443
	Q61072
	NM_001005845; NM_003816
	NM_001270996; NM_007404
	NP_003807
	NP_001257925; NP_031430
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující desintegrin a metaloproteinázovou doménu 9 je enzym že u lidí je kódován ADAM9 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena ADAM (dezintegrátor a metaloproteáza rodina). Členy této rodiny jsou membránou ukotvené proteiny strukturně příbuzné hadímu jedu rozpadá se, a byly zapojeny do různých biologických procesů zahrnujících interakce buňka-buňka a buňka-matice, včetně oplodnění, vývoje svalů a neurogeneze. Protein kódovaný tímto genem interaguje s SH3 doména - obsahující proteiny, váže mitotickou zástavu deficitní 2 beta protein a je také zapojen do indukované TPA ektodoména vylučování membránou ukotveného růstového faktoru podobného EGF vázajícího se na heparin. Byly identifikovány dvě alternativní varianty sestřihu kódující odlišné izoformy.^[6]

Interakce

ADAM9 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282230 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168615, ENSG00000282230 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031555 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Weskamp G, Kratzschmar J, Reid MS, Blobel CP (červenec 1996). „MDC9, široce exprimovaný buněčný desintegrin obsahující cytoplazmatické domény ligandu SH3“. J Cell Biol. 132 (4): 717–26. doi:10.1083 / jcb.132.4.717. PMC 2199860. PMID 8647900.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ADAM9 ADAM metalopeptidázová doména 9 (meltrin gama)“.
^ Nelson KK, Schlöndorff J, Blobel CP (listopad 1999). „Důkazy o interakci metaloprotein-desintegrinového tumor nekrotizujícího faktoru alfa konvertázy (TACE) s mitotickou zástavou deficitní 2 (MAD2) a metaloprotein-desintegrinu MDC9 s novým proteinem souvisejícím s MAD2, MAD2beta“. Biochem. J. 343 (Pt 3): 673–80. doi:10.1042/0264-6021:3430673. PMC 1220601. PMID 10527948.
^ ^A ^b Howard L, Nelson KK, Maciewicz RA, Blobel CP (říjen 1999). „Interakce metaloproteázy dezintegruje MDC9 a MDC15 se dvěma proteiny obsahujícími doménu SH3, endofilinem I a SH3PX1“. J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. doi:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID 10531379.

Další čtení

Mazzocca A, Coppari R, De Franco R, Cho JY, Libermann TA, Pinzani M, Toker A (červen 2005). „Vylučovaná forma ADAM9 podporuje invazi karcinomu prostřednictvím interakcí tumor-stromal“. Cancer Res. 65 (11): 4728–38. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-4449. PMID 15930291.
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T a kol. (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. I. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0001-KIAA0040) odvozené analýzou náhodně vzorkovaných cDNA klonů z lidské nezralé myeloidní buněčné linie KG-1“. DNA Res. 1 (1): 27–35. doi:10.1093 / dnares / 1.1.27. PMID 7584026.
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T a kol. (1995). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. I. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0001-KIAA0040) odvozené analýzou náhodně vzorkovaných cDNA klonů z lidské nezralé myeloidní buněčné linie KG-1 (doplněk)". DNA Res. 1 (1): 47–56. doi:10.1093 / dnares / 1.1.47. PMID 7584028.
McKie N, Dallas DJ, Edwards T a kol. (1996). "Klonování nové membránově vázané metaloproteinázy z buněk lidského myelomu". Biochem. J. 318 (2): 459–62. doi:10.1042 / bj3180459. PMC 1217643. PMID 8809033.
McKie N, Edwards T, Dallas DJ a kol. (1997). "Exprese členů nové membránově vázané metaloproteinázové rodiny (ADAM) v lidských kloubních chondrocytech". Biochem. Biophys. Res. Commun. 230 (2): 335–9. doi:10.1006 / bbrc.1996.5957. PMID 9016778.
Izumi Y, Hirata M, Hasuwa H a kol. (1999). „Metaloproteáza-desintegrin, MDC9 / meltrin-gama / ADAM9 a PKCdelta se podílejí na vylučování ektodomény indukované TPA membránově ukotveného růstového faktoru podobného EGF podobnému EGF. EMBO J.. 17 (24): 7260–72. doi:10.1093 / emboj / 17.24.7260. PMC 1171072. PMID 9857183.
Roghani M, Becherer JD, Moss ML a kol. (1999). "Metaloproteáza-desintegrin MDC9: intracelulární zrání a katalytická aktivita". J. Biol. Chem. 274 (6): 3531–40. doi:10.1074 / jbc.274.6.3531. PMID 9920899.
Nelson KK, Schlöndorff J, Blobel CP (2000). „Důkazy o interakci metaloprotein-desintegrinového nekrotizujícího faktoru alfa konvertázy (TACE) s mitotickou zástavou deficitní 2 (MAD2) a metaloprotein-dezintegin MDC9 s novým proteinem souvisejícím s MAD2, MAD2beta“. Biochem. J. 343 (3): 673–80. doi:10.1042/0264-6021:3430673. PMC 1220601. PMID 10527948.
Howard L, Nelson KK, Maciewicz RA, Blobel CP (1999). „Interakce metaloproteázy dezintegruje MDC9 a MDC15 se dvěma proteiny obsahujícími doménu SH3, endofilinem I a SH3PX1“. J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. doi:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID 10531379.
Zhou M, Graham R, Russell G, Croucher PI (2001). „MDC-9 (ADAM-9 / Meltrin gama) funguje jako adhezní molekula navázáním alfa (v) beta (5) integrinu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (2): 574–80. doi:10,1006 / bbrc.2000.4155. PMID 11162558.
Namba K, Nishio M, Mori K a kol. (2002). "Zapojení ADAM9 do mnohojaderné tvorby obrovských buněk krevních monocytů". Buňka. Immunol. 213 (2): 104–13. doi:10.1006 / cimm.2001.1873. PMID 11831872.
Eto K, Huet C, Tarui T a kol. (2002). „Funkční klasifikace ADAM na základě konzervovaného motivu pro vazbu na integrin alfa 9beta 1: důsledky pro vazbu spermie a vajíčka a další buněčné interakce“. J. Biol. Chem. 277 (20): 17804–10. doi:10,1074 / jbc.M200086200. PMID 11882657.
Lim JM, Lee JH, Wee WR, Joo CK (2002). "Downregulovaná exprese ADAM9 v přední polární kataraktu". Journal of Cataract and Refractive Surgery. 28 (4): 697–702. doi:10.1016 / S0886-3350 (01) 01236-6. PMID 11955914. S2CID 21982654.
Hotoda N, Koike H, Sasagawa N, Ishiura S (2002). "Sekretovaná forma lidského ADAM9 má aktivitu alfa-sekretázy pro APP". Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (2): 800–5. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00302-9. PMID 12054541.
Amour A, Knight CG, English WR, et al. (2002). "Enzymatická aktivita ADAM8 a ADAM9 není regulována TIMP". FEBS Lett. 524 (1–3): 154–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03047-8. PMID 12135759. S2CID 37423323.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mohan S, Thompson GR, Amaar YG a kol. (2003). „ADAM-9 je proteináza proteinu-5 vázající růstový faktor podobný inzulínu produkovaná a vylučovaná lidskými osteoblasty“. Biochemie. 41 (51): 15394–403. doi:10.1021 / bi026458q. PMID 12484779.
Asai M, Hattori C, Szabó B a kol. (2003). "Předpokládaná funkce ADAM9, ADAM10 a ADAM17 jako APP alfa-sekretáza". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (1): 231–5. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02999-6. PMID 12535668.
O'Shea C, McKie N, Buggy Y a kol. (2003). "Exprese mRNA a proteinu ADAM-9 v lidské rakovině prsu". Int. J. Cancer. 105 (6): 754–61. doi:10.1002 / ijc.11161. PMID 12767059. S2CID 19284959.
Grützmann R, Lüttges J, Sipos B a kol. (2004). „Exprese ADAM9 u rakoviny pankreatu je spojena s typem nádoru a je prognostickým faktorem u duktálního adenokarcinomu“. Br. J. Cancer. 90 (5): 1053–8. doi:10.1038 / sj.bjc.6601645. PMC 2409625. PMID 14997207.

externí odkazy

ADAM9 na Atlas genetiky a onkologie
Člověk ADAM9 umístění genomu a ADAM9 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282230 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168615, ENSG00000282230 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031555 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8647900-5] Weskamp G, Kratzschmar J, Reid MS, Blobel CP (červenec 1996). „MDC9, široce exprimovaný buněčný desintegrin obsahující cytoplazmatické domény ligandu SH3“. J Cell Biol. 132 (4): 717–26. doi:10.1083 / jcb.132.4.717. PMC 2199860. PMID 8647900.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ADAM9 ADAM metalopeptidázová doména 9 (meltrin gama)“.

[pmid10527948-7] Nelson KK, Schlöndorff J, Blobel CP (listopad 1999). „Důkazy o interakci metaloprotein-desintegrinového tumor nekrotizujícího faktoru alfa konvertázy (TACE) s mitotickou zástavou deficitní 2 (MAD2) a metaloprotein-desintegrinu MDC9 s novým proteinem souvisejícím s MAD2, MAD2beta“. Biochem. J. 343 (Pt 3): 673–80. doi:10.1042/0264-6021:3430673. PMC 1220601. PMID 10527948.

[pmid10531379-8] A ^b Howard L, Nelson KK, Maciewicz RA, Blobel CP (říjen 1999). „Interakce metaloproteázy dezintegruje MDC9 a MDC15 se dvěma proteiny obsahujícími doménu SH3, endofilinem I a SH3PX1“. J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. doi:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID 10531379.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteázy: metaloendopeptidázy (ES 3.4.24 )
Bílkoviny ADAM	Alfa sekretázy ADAM9 10. ADAM 17. ADAM ADAM19 ADAM2 7. ADAM ADAM8 11. ADAM ADAM12 15. ADAM ADAM18 ADAM22 23. ADAM ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 8. ADAMTS ADAMTS9 10. ADAMTS 12. ADAMTS 13. ADAMTS
Matricové metaloproteinázy	Kolagenázy MMP1 MMP8 Želatinázy MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28
jiný	Neprilysin Prokolagenová peptidáza Termolyzin Těhotenský plazmatický protein A Kostní morfogenetický protein 1 Lysostafin Enzym degradující inzulin ZMPSTE24