MMP27 - MMP27

MMP27
Identifikátory
AliasyMMP27, MMP-27, matrix metalopeptidáza 27
Externí IDOMIM: 618101 MGI: 3039232 HomoloGene: 23345 Genové karty: MMP27
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro MMP27
Genomické umístění pro MMP27
Kapela11q22.2Start102,691,487 bp[1]
Konec102,705,769 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

64066

234911

Ensembl

ENSG00000137675

ENSMUSG00000070323

UniProt

Q9H306

n / a

RefSeq (mRNA)

NM_022122

NM_001030289
NM_001310717

RefSeq (protein)

NP_071405

n / a

Místo (UCSC)Chr 11: 102,69 - 102,71 MbChr 9: 7,57 - 7,58 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Maticová metalopeptidáza 27 také známý jako MMP-27 je enzym který je u lidí kódován MMP27 gen.[5]

Struktura

MMP-27 byl objeven a klonován v roce 1998 Yangem a Kurkinenem.[6] Zpočátku ve srovnání s takzvaným Chicken MMP (CMMP), MMP-27 ve skutečnosti vykazuje velmi malou sekvenční homologii s touto proteázou. Sekvenční homologie předpovídá, že lidský gen MMP-27 kóduje kanonické domény sdílené většinou MMP (anotace založená na vstupu Uniprot Q9H306): (i) a signální peptid (zbytky 1-17), (ii) a propeptid (18-98) obsahující motiv cysteinového přepínače (89-96), (iii) a katalytická doména (99-263) obsahující typický motiv HEXXHXXGXXH metzincinů (rodiny M10 a M12 databáze MEROPS [2]), (iv) pantová oblast bohatá na prolin (264-278) a (v) doména podobná hemopexinu (279-465) složený jako čtyřlistý B-vrtule prostřednictvím tvorby disulfidové vazby mezi dvěma sousedními zbytky Cys (Cys279 a Cys465). MMP-27 lze klasifikovat do skupiny stromelysinů MMP, protože MMP-27 vykazuje 51,6% homologii se stromelysinem-2 (MMP-10) a lokalizuje se v klastru MMP umístěných na chromozomu 11.

Stejně jako šest známých MT-MMP je i lidský MMP-27 prodloužen o další C-koncovou doménu (466-513). Algoritmus Spoctopus pro topologickou predikci[7] naznačuje, že toto rozšíření C-terminálu (CTE) obsahuje potenciál transmembránová doména (490-510). Tato sekvence je však méně hydrofobní než v transmembránových MT-MMP (MMP-14, -15, -16 a -24), protože obsahuje hydrofilní / nabité zbytky, zejména His492, Lys493, His504 a Lys507.

Funkce

Bílkoviny matricová metaloproteináza (MMP) se podílejí na rozdělení extracelulární matrix v normálních fyziologických procesech, jako je embryonální vývoj, reprodukce a remodelace tkání, stejně jako v chorobných procesech, jako je artritida a metastáza. Většina MMP se vylučuje jako neaktivní proproteiny, které se aktivují štěpením extracelulárně proteinázy.[8]

Cominelli A. a kolegové prokázali, že MMP-27 je neobvyklá proteáza, která není vylučována a je účinně zadržována v endoplazmatické retikulum u tří savců buněčné linie.[9] Deleční mutanti a výměna rekombinantním MMP-10 ukazují, že jedinečné C-koncové prodloužení MMP-27 (CTE) je nezbytné a dostatečné pro retenci endoplazmatického retikula, ale neposkytuje stabilní zakotvení membrány. Navzdory sekvenční homologii s MT-MMP není CTE transmembránovou doménou a trvale neinteraguje s membránou. Tato jedinečná vlastnost pro MMP vyvolává důležité otázky týkající se potenciálních funkcí MMP-27, které je ještě třeba prozkoumat.

Klinický význam

Řídké informace o expresi MMP-27 byly nalezeny ve studiích profilování genové exprese (mikropole ) nebo při analýze expresního vzoru členů rodiny MMP během vývojových, fyziologických nebo patologických procesů. Transkript MMP-27 je detekován téměř v každé tkáni, s výjimkou mozku, s nejvyšší expresí nalezenou v játrech během vývoje myši[10] U dospělých je mRNA MMP-27 většinou hojná v anti-IgG / IgM stimulovaných B lymfocytech,[11] kost a ledviny, ale je přítomen v nižších hladinách srdce.[12]

Nedávné vyšetřování transkriptomu z odlišných tkáňových oddílů menstruačního endometrium popsali specifickou nadměrnou expresi MMP-27 v oblastech stromálního rozpadu.[13] V jiné transkriptomické studii bylo zjištěno, že MMP-27 se zvyšuje v lidském endometriu na konci sekreční fáze před menstruací.[14] Kromě toho je exprese MMP-27 v makrofágech down-regulovaná, pokud je kokultivována s buňkami rakoviny vaječníků[15] ale up-regulováno v chrupavkách od pacientů s osteoartritidou[16] nebo v aneuryzmatu břišní aorty.[17] MMP-27 byl také identifikován na úrovni proteinu v MDA-MB-231 buněčná linie rakoviny prsu[18] a v primární lidské rakovině prsu.[19] Nedávno bylo prokázáno, že MMP-27 je exprimován CD163+/ CD206+ makrofágy v lidském endometriu a v povrchových endometriotických lézích.[20]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137675 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000070323 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Nagase H, Woessner JF (červenec 1999). "Matricové metaloproteinázy". J. Biol. Chem. 274 (31): 21491–4. doi:10.1074 / jbc.274.31.21491. PMID  10419448.
  6. ^ Yang M, Kurkinen M (1998). „Klonování a charakterizace nové matricové metaloproteinázy (MMP), CMMP, z fibroblastů kuřecích embryí. CMMP, Xenopus XMMP a lidská MMP19 mají konzervovaný jedinečný cystein v katalytické doméně“. J. Biol. Chem. 273 (28): 17893–900. doi:10.1074 / jbc.273.28.17893. PMID  9651395.
  7. ^ Viklund H, Bernsel A, Skwark M, Elofsson A (2008). „SPOCTOPUS: kombinovaný prediktor signálních peptidů a topologie membránových proteinů“. Bioinformatika. 24 (24): 2928–9. doi:10.1093 / bioinformatika / btn550. PMID  18945683.
  8. ^ „Entrez Gene: MMP27“.
  9. ^ Cominelli A, Halbout M, N'Kuli F, Lemoine P, Courtoy PJ, Marbaix E, Tyteca D, Henriet P (2014). „Jedinečná C-koncová doména umožňuje retenci matrixové metaloproteinázy-27 v endoplazmatickém retikulu.“ Provoz. 15 (4): 401–17. doi:10.1111 / tra.12149. PMID  24548619. S2CID  38579214.
  10. ^ Nuttall RK, Sampieri CL, Pennington CJ, Gill SE, Schultz GA, Edwards DR (2004). "Expresní analýza celé rodiny genů MMP a TIMP během vývoje myší tkáně". FEBS Lett. 563 (1–3): 129–34. doi:10.1016 / S0014-5793 (04) 00281-9. PMID  15063736. S2CID  41113107.
  11. ^ Bar-Or A, Nuttall RK, Duddy M, Alter A, Kim HJ, Ifergan I, Pennington CJ, Bourgoin P, Edwards DR, Yong VW (2003). „Analýzy všech členů matricové metaloproteinázy v leukocytech zdůrazňují monocyty jako hlavní zánětlivé mediátory u roztroušené sklerózy“. Mozek. 126 (Pt 12): 2738–49. doi:10.1093 / mozek / awg285. PMID  14506071.
  12. ^ Bernal F, Hartung HP, Kieseier BC (2005). "Exprese tkáňové mRNA u krys nově popsaných matricových metaloproteináz". Biol. Res. 38 (2–3): 267–71. doi:10.4067 / S0716-97602005000200016. PMID  16238105.
  13. ^ Gaide Chevronnay HP, Galant C, Lemoine P, Courtoy PJ, Marbaix E, Henriet P (2009). "Spatiotemporální vazba fokální degradace extracelulární matrix a rekonstrukce v menstruačním lidském endometriu". Endokrinologie. 150 (11): 5094–105. doi:10.1210 / cs.2009-0750. PMID  19819954.
  14. ^ Talbi S, Hamilton AE, Vo KC, Tulac S, Overgaard MT, Dosiou C, Le Shay N, Nezhat CN, Kempson R, Lessey BA, Nayak NR, Giudice LC (2006). „Molekulární fenotypizace lidského endometria rozlišuje fáze menstruačního cyklu a základní biologické procesy u normoovulačních žen“. Endokrinologie. 147 (3): 1097–121. doi:10.1210 / cs.2005-1076. PMID  16306079.
  15. ^ Hagemann T, Wilson J, Burke F, Kulbe H, Li NF, Plüddemann A, Charles K, Gordon S, Balkwill FR (2006). „Buňky rakoviny vaječníků polarizují makrofágy směrem k fenotypu spojenému s nádorem“. J. Immunol. 176 (8): 5023–32. doi:10,4049 / jimmunol.176.8.5023. PMID  16585599.
  16. ^ Kevorkian L, Young DA, Darrah C, Donell ST, Shepstone L, Porter S, Brockbank SM, Edwards DR, Parker AE, Clark IM (2004). "Profily exprese metaloproteináz a jejich inhibitorů v chrupavce". Artritida Rheum. 50 (1): 131–41. doi:10.1002 / článek 11333. PMID  14730609.
  17. ^ Lamblin N, Ratajczak P, Hot D, Dubois E, Chwastyniak M, Beseme O, Drobecq H, Lemoine Y, Koussa M, Amouyel P, Pinet F (2010). „Profil makrofágů v lidských aneurysmech břišní aorty: studie transkriptomických, proteomických a protilátkových proteinů“. J. Proteome Res. 9 (7): 3720–9. doi:10.1021 / pr100250s. PMID  20513153.
  18. ^ Hegedüs L, Cho H, Xie X, Eliceiri GL (2008). „Další MDA-MB-231 metaloproteinázy buněčné matrice z karcinomu prsu podporují invazivitu“. J. Cell. Physiol. 216 (2): 480–5. doi:10,1002 / jcp.21417. PMID  18286480. S2CID  10734191.
  19. ^ Köhrmann A, Kammerer U, Kapp M, Dietl J, Anacker J (2009). „Exprese matrixových metaloproteináz (MMP) u primárního lidského karcinomu prsu a buněčných linií karcinomu prsu: Nové poznatky a přehled literatury“. Rakovina BMC. 9: 188. doi:10.1186/1471-2407-9-188. PMC  2706257. PMID  19531263.
  20. ^ Cominelli A, Gaide Chevronnay HP, Lemoine P, Courtoy PJ, Marbaix E, Henriet P (2014). „Matricová metaloproteináza-27 je exprimována v makrofázích CD163 + / CD206 + M2 v cyklickém lidském endometriu a v povrchových endometriotických lézích“. Mol. Hučení. Reprod. 20 (8): 767–75. doi:10,1093 / mol / ga034. PMID  24810263.

externí odkazy

  • The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: M10.027

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.