Fosfatidylethanolamin vázající protein 1 - Phosphatidylethanolamine binding protein 1 - Wikipedia

PEBP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1BD9, 1BEH, 2L7W, 2QYQ
Identifikátory
Aliasy	PEBP1, HCNP, HCNPpp, HEL-210, HEL-S-34, PBP, PEBP, PEBP-1, RKIP, HEL-S-96, protein vázající fosfatidylethanolamin 1
Externí ID	OMIM: 604591 MGI: 1344408 HomoloGene: 37637 Genové karty: PEBP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	118,145,584 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	117,287,625 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba lipidů; • vazba nukleotidů; • vazba protein kinázy; • vazba fosfatidylethanolamin; • aktivita inhibitoru endopeptidázy serinového typu; • ATP vazba; • vazba enzymu; • aktivita inhibitoru peptidázy; • Vazba RNA; • vazba na receptory; • mitogenem aktivovaná vazba proteinkinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • extracelulární exosom; • extracelulární; • mitochondrie; • mitochondriální vnější membrána; • Golgiho aparát; • synaptický váček; • povrch buňky; • tělo neuronových buněk; • myelin; • axonový konec; • apikální část buňky;
Biologický proces	• Kaskáda MAPK; • negativní regulace aktivity peptidázy; • negativní regulace aktivity endopeptidázy; • regulace hladin neurotransmiterů; • regulace síly kontrakce srdce; • reakce na oxidační stres; • stárnutí; • reakce na teplo; • reakce na zranění; • reakce na toxickou látku; • reakce na organonitrogenovou sloučeninu; • reakce na aktivitu; • vývoj hipokampu; • negativní regulace MAPK kaskády; • pozitivní regulace signalizace zprostředkované cAMP; • reakce na ethanol; • pozitivní regulace mitotického jaderného dělení; • kapacitace spermií; • reakce na kortikosteron; • reakce na cAMP; • reakce na iont vápníku; • pozitivní regulace metabolického procesu acetylcholinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5037
	23980
	ENSG00000089220
	ENSMUSG00000032959
	P30086
	P70296
	NM_002567
	NM_018858
	NP_002558
	NP_061346
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající fosfatidylethanolamin 1 je protein že u lidí je kódován PEBP1 gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein 1 vázající fosfatidylethanolamin 1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089220 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032959 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Park S, Yeung ML, Beach S, Shields JM, Yeung KC (květen 2005). „RKIP downregulates B-Raf kinase activity in melanoma rakoviny cells“. Onkogen. 24 (21): 3535–40. doi:10.1038 / sj.onc.1208435. PMID 15782137.
^ "Entrez Gene: PEBP1 fosfatidylethanolamin vázající protein 1".
^ ^A ^b ^C Yeung K, Janosch P, McFerran B, Rose DW, Mischak H, Sedivy JM, Kolch W (květen 2000). "Mechanismus potlačení dráhy Raf / MEK / extracelulárního signálu regulované kinázy proteinem inhibitoru raf kinázy". Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3079–85. doi:10,1128 / mcb. 20.9.3079-3085.2000. PMC 85596. PMID 10757792.

Další čtení

Schoentgen F, Jollès P (1995). "Od struktury k funkci: možné biologické role nové rozšířené rodiny proteinových vazebných hydrofobních ligandů a zobrazení vazebného místa pro nukleotidy". FEBS Lett. 369 (1): 22–6. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00376-K. PMID 7641877. S2CID 25555428.
Ojika K, Mitake S, Tohdoh N, Appel SH, Otsuka Y, Katada E, Matsukawa N (2000). "Hipokampální cholinergní neurostimulační peptidy (HCNP)". Prog. Neurobiol. 60 (1): 37–83. doi:10.1016 / S0301-0082 (99) 00021-0. PMID 10622376. S2CID 13466181.
Odabaei G, Chatterjee D, Jazirehi AR, Goodglick L, Yeung K, Bonavida B (2004). Protein inhibitoru kinázy Raf-1: struktura, funkce, regulace buněčné signalizace a klíčová role v apoptóze. Adv. Cancer Res. Pokroky ve výzkumu rakoviny. 91. 169–200. doi:10.1016 / S0065-230X (04) 91005-6. ISBN 9780120066919. PMID 15327891.
Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (1992). "Mapa lidských jaterních proteinů: referenční databáze vytvořená mikrosekvenováním a gelovým porovnáním". Elektroforéza. 13 (12): 992–1001. doi:10,1002 / elps.11501301201. PMID 1286669. S2CID 23518983.
Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Tohdoh N, Tojo S, Agui H, Ojika K (1995). "Sekvenční homologie krysích a lidských prekurzorových proteinů HCNP, hovězího proteinu vázajícího fosfatidylethanolamin a krysího 23-kDa proteinu spojeného s proteinem vázajícím opioidy". Brain Res. Mol. Brain Res. 30 (2): 381–4. doi:10.1016 / 0169-328X (95) 00029-R. PMID 7637590.
Seddiqi N, Bollengier F, Alliel PM, Périn JP, Bonnet F, Bucquoy S, Jollès P, Schoentgen F (1994). „Aminokyselinová sekvence proteinu 21-23-kDa v mozku Homo sapiens (neuropolypeptid h3), srovnání s jeho protějšky z druhů Rattus norvegicus a Bos taurus a exprese jeho mRNA v různých tkáních.“ J. Mol. Evol. 39 (6): 655–60. doi:10.1007 / BF00160411. PMID 7807553. S2CID 21554565.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Hori N, Chae KS, Murakawa K, Matoba R, Fukushima A, Okubo K, Matsubara K (1994). "Lidský cDNA sekvenční homolog bovinního fosfatidylethanolamin vázajícího proteinu". Gen. 140 (2): 293–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90562-2. PMID 8144042.
Moore C, Perry AC, Love S, Hall L (1996). "Sekvenční analýza a imunolokalizace fosfatidylethanolamin vázajícího proteinu (PBP) v lidské mozkové tkáni". Brain Res. Mol. Brain Res. 37 (1–2): 74–8. doi:10.1016 / 0169-328X (95) 00285-Z. PMID 8738137.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Banfield MJ, Barker JJ, Perry AC, Brady RL (1998). "Funkce ze struktury? Krystalová struktura lidského proteinu vázajícího fosfatidylethanolamin naznačuje roli v membránové signální transdukci". Struktura. 6 (10): 1245–54. doi:10.1016 / S0969-2126 (98) 00125-7. PMID 9782050.
Yeung K, Seitz T, Li S, Janosch P, McFerran B, Kaiser C, Fee F, Katsanakis KD, Rose DW, Mischak H, Sedivy JM, Kolch W (1999). "Potlačení aktivity kinázy Raf-1 a signalizace kinázy MAP pomocí RKIP" (PDF). Příroda. 401 (6749): 173–7. doi:10.1038/43686. PMID 10490027. S2CID 4379551.
Yeung K, Janosch P, McFerran B, Rose DW, Mischak H, Sedivy JM, Kolch W (2000). "Mechanismus potlačení dráhy Raf / MEK / extracelulárního signálu regulované kinázy proteinem inhibitoru raf kinázy". Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3079–85. doi:10.1128 / MCB.20.9.3079-3085.2000. PMC 85596. PMID 10757792.
Hengst U, Albrecht H, Hess D, Monard D (2001). „Fosfatidylethanolamin vázající protein je prototypem nové rodiny inhibitorů serinové proteázy“. J. Biol. Chem. 276 (1): 535–40. doi:10,1074 / jbc.M002524200. PMID 11034991.
Yeung KC, Rose DW, Dhillon AS, Yaros D, Gustafsson M, Chatterjee D, McFerran B, Wyche J, Kolch W, Sedivy JM (2001). „Protein inhibitoru kinázy Raf interaguje s kinázou indukující NF-kappaB a TAK1 a inhibuje aktivaci NF-kappaB“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7207–17. doi:10.1128 / MCB.21.21.7207-7217.2001. PMC 99896. PMID 11585904.
Maki M, Matsukawa N, Yuasa H, Otsuka Y, Yamamoto T, Akatsu H, Okamoto T, Ueda R, Ojika K (2002). „Snížená exprese mRNA prekurzorového proteinu cholinergního neurostimulačního peptidu hipokampu v hipokampu u Alzheimerovy choroby“. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 61 (2): 176–85. doi:10.1093 / jnen / 61.2.176. PMID 11853019.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089220 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032959 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15782137-5] Park S, Yeung ML, Beach S, Shields JM, Yeung KC (květen 2005). „RKIP downregulates B-Raf kinase activity in melanoma rakoviny cells“. Onkogen. 24 (21): 3535–40. doi:10.1038 / sj.onc.1208435. PMID 15782137.

[entrez-6] "Entrez Gene: PEBP1 fosfatidylethanolamin vázající protein 1".

[pmid10757792-7] A ^b ^C Yeung K, Janosch P, McFerran B, Rose DW, Mischak H, Sedivy JM, Kolch W (květen 2000). "Mechanismus potlačení dráhy Raf / MEK / extracelulárního signálu regulované kinázy proteinem inhibitoru raf kinázy". Mol. Buňka. Biol. 20 (9): 3079–85. doi:10,1128 / mcb. 20.9.3079-3085.2000. PMC 85596. PMID 10757792.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]