DAPK1 - DAPK1

DAPK1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1IG1, 1JKK, 1JKL, 1JKS, 1JKT, 1P4F, 1WVX, 1WVY, 1R5, 2W4J, 2W4K, 2X0G, 2XUU, 2XZS, 2Y0A, 2R4P, 2Y4V, 2YAK, 3DFC, 3DGK, 3EH9, 3EHA, 3F5G, 3F5U, 3GU4, 3GU5, 3GU6, 3GU7, 3GU8, 3GUB, 3ZXT, 4B4L, 4PF4, 4TL0, 4TXC, 4UV0, 4YO4, 4YPD, 5AUW, 5 AUU, 5AV1, 5AUY, 5AUT, 5AUX, 5AUV, 5AUZ, 5AV0, 5AV4, 5AV2, 5AV3
Identifikátory
Aliasy	DAPK1, DAPK, proteinová kináza 1 spojená se smrtí, ROCO3
Externí ID	OMIM: 600831 MGI: 1916885 HomoloGene: 3626 Genové karty: DAPK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	87,708,634 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	60,763,191 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • vazba syntaxin-1; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • aktivita proteinkinázy závislé na kalmodulinu; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • kalmodulinová vazba; • ATP vazba; • aktivita proteinkinázy;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • aktinový cytoskelet; • cytoskelet; • cytoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • negativní regulace překladu; • fosforylace; • negativní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • regulace autofagie; • negativní regulace vnější apoptotické signální dráhy prostřednictvím receptorů domény smrti; • apoptotická signální cesta; • autofosforylace; • regulace překladu; • vnější apoptotická signální cesta přes receptory domény smrti; • signální transdukce; • apoptotický proces; • regulace aktivity NMDA receptoru; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace autofagie; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • buněčná odpověď na interferon-gama; • buněčná odpověď na hydroperoxid;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1612
	69635
	ENSG00000196730
	ENSMUSG00000021559
	P53355
	Q80YE7
	NM_001288729; NM_001288730; NM_001288731; NM_004938
	NM_001285917; NM_029653; NM_134062
	NP_001275658; NP_001275659; NP_001275660; NP_004929
	NP_001272846; NP_083929; NP_598823
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteinová kináza spojená se smrtí 1 je enzym že u lidí je kódován DAPK1 gen.^[5]

Funkce

Se smrtí asociovaná protein kináza 1 je pozitivním mediátorem programované buněčné smrti indukované gama interferonem. DAPK1 kóduje strukturně jedinečnou serod-threonin kinázu závislou na kalmodulinu závislou na 160 kD, která nese 8 ankyrinových opakování a 2 domnělá konsenzuální místa P-smyčky. Je kandidátem potlačujícím nádor.^[6]

V melanocytických buňkách může být exprese genu DAPK1 regulována pomocí MITF.^[7]

Jako drogový cíl

Vyčerpání DAPK1 vede k inhibici počtu nádorových buněk a růstu objemu v buněčných a zvířecích modelech trojitého receptoru negativního karcinomu prsu u jedinců s rakovinou mutující p53.^[8] U skutečných pacientů to nebylo prokázáno.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196730 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021559 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Feinstein E, Druck T, Kastury K, Berissi H, Goodart SA, Overhauser J, Kimchi A, Huebner K (září 1995). „Přiřazení DAP1 a DAPK - genů, které pozitivně zprostředkovávají programovanou buněčnou smrt vyvolanou IFN-gama - do chromozomových oblastí 5p12.2, respektive 9q34.1“. Genomika. 29 (1): 305–7. doi:10.1006 / geno.1995.1255. PMID 8530096.
^ „Entrez Gene: DAPK1 death-associated protein kinase 1“.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (prosinec 2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Výzkum pigmentových buněk a melanomu. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ Zhao J, Zhao D, Poage GM, Mazumdar A, Zhang Y, Hill JL, Hartman ZC, Savage MI, Mills GB, Brown PH (červenec 2015). „Proteinová kináza 1 spojená se smrtí podporuje růst rakovin mutujících p53“. The Journal of Clinical Investigation. 125 (7): 2707–20. doi:10.1172 / JCI70805. PMC 4563671. PMID 26075823.

Další čtení

Deiss LP, Feinstein E, Berissi H, Cohen O, Kimchi A (leden 1995). "Identifikace nové serin / threoninkinázy a nového 15-kD proteinu jako potenciálních mediátorů gama interferonu indukované buněčné smrti". Geny a vývoj. 9 (1): 15–30. doi:10,1101 / gad. 9.1.15. PMID 7828849.
Inbal B, Shani G, Cohen O, Kissil JL, Kimchi A (únor 2000). „Se smrtí asociovanou proteinovou kinázou související protein 1, nová serin / threoninkináza zapojená do apoptózy“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (3): 1044–54. doi:10.1128 / MCB.20.3.1044-1054.2000. PMC 85221. PMID 10629061.
Jin Y, Blue EK, Dixon S, Hou L, Wysolmerski RB, Gallagher PJ (říjen 2001). „Identifikace nové formy proteinové kinázy spojené se smrtí, která podporuje přežití buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (43): 39667–78. doi:10,1074 / jbc.M101886200. PMC 2823794. PMID 11485996.
Shohat G, Spivak-Kroizman T, Cohen O, Bialik S, Shani G, Berrisi H, Eisenstein M, Kimchi A (prosinec 2001). „Proapoptotická funkce proteinové kinázy spojené se smrtí je řízena jedinečným mechanismem založeným na inhibiční autofosforylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (50): 47460–7. doi:10,1074 / jbc.M105133200. PMID 11579085.
Soria JC, Rodriguez M, Liu DD, Lee JJ, Hong WK, Mao L (leden 2002). „Aberantní promotor methylace více genů ve vzorcích průdušek od bývalých kuřáků cigaret“. Výzkum rakoviny. 62 (2): 351–5. PMID 11809677.
Larramendy ML, Niini T, Elonen E, Nagy B, Ollila J, Vihinen M, Knuutila S (červen 2002). „Nadměrná exprese fúzních genů asociovaných s translokací FGFRI, MYC, NPMI a DEK, ale absence translokací při akutní myeloidní leukémii. Analýza microarray“. Haematologica. 87 (6): 569–77. PMID 12031912.
Hasegawa M, Nelson HH, Peters E, Ringstrom E, Posner M, Kelsey KT (červen 2002). „Vzory methylace promotoru genu u rakoviny dlaždicových buněk hlavy a krku“. Onkogen. 21 (27): 4231–6. doi:10.1038 / sj.onc.1205528. PMID 12082610.
Jin Y, Blue EK, Dixon S, Shao Z, Gallagher PJ (prosinec 2002). „Protein reagující se smrtí asociovaný s proteinkinázou (DAPK), DIP-1, je E3 ubikvitin ligáza, která podporuje apoptózu indukovanou faktorem nekrotizujícím nádory a reguluje buněčné hladiny DAPK“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (49): 46980–6. doi:10,1074 / jbc.M208585200. PMC 2824503. PMID 12351649.
Wang WJ, Kuo JC, Yao CC, Chen RH (říjen 2002). „DAP-kináza indukuje apoptózu potlačením aktivity integrinu a narušením signálů o přežití matrice“. The Journal of Cell Biology. 159 (1): 169–79. doi:10.1083 / jcb.200204050. PMC 2173490. PMID 12370243.
Nakatsuka S, Takakuwa T, Tomita Y, Hoshida Y, Nishiu M, Yamaguchi M, Nishii K, Yang WI, Aozasa K (leden 2003). „Hypermethylace CpG ostrova proteinu spojené s smrtí (DAP) je častá nejen v B-buňkách, ale také v malignancích T- a natural killer (NK) / T-buněk“. Cancer Science. 94 (1): 87–91. doi:10.1111 / j.1349-7006.2003.tb01357.x. PMID 12708480. S2CID 11818957.
Tian JH, Das S, Sheng ZH (červenec 2003). „Fosforylace syntaxinu-1A závislá na Ca2 + pomocí kinázy proteinu souvisejícího se smrtí (DAP) reguluje jeho interakci s Munc18“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 26265–74. doi:10,1074 / jbc.M300492200. PMID 12730201.
Gonzalez-Gomez P, Bello MJ, Alonso ME, Lomas J, Arjona D, Amiñoso C, De Campos JM, Isla A, Gutierrez M, Rey JA (2004). „Častá hypermethylace promotoru proteinkinázy spojená se smrtí v mozkových metastázách solidních nádorů“. Zprávy o onkologii. 10 (4): 1031–3. doi:10.3892 / nebo 10.4.1031. PMID 12792765.
Matsumoto H, Nagao M, Ogawa S, Kanehiro H, Hisanaga M, Ko S, Ikeda N, Fujii H, Koyama F, Mukogawa T, Nakajima Y (2003). „Prognostický význam exprese proteinkinázy spojené se smrtí v hepatocelulárních karcinomech“. Protinádorový výzkum. 23 (2B): 1333–41. PMID 12820391.
Henshall DC, Araki T, Schindler CK, Shinoda S, Lan JQ, Simon RP (září 2003). „Exprese proteinové kinázy spojené se smrtí a nábor do signální dráhy faktoru nekrotizující tumor po krátkých záchvatech“. Journal of Neurochemistry. 86 (5): 1260–70. doi:10.1046 / j.1471-4159.2003.01934.x. PMID 12911633. S2CID 21971958.
Voso MT, Scardocci A, Guidi F, Zini G, Di Mario A, Pagano L, Hohaus S, Leone G (leden 2004). „Aberantní metylace DAP-kinázy u akutní myeloidní leukémie a myelodysplastických syndromů souvisejících s léčbou“. Krev. 103 (2): 698–700. doi:10.1182 / krev-2003-07-2249. PMID 14504087.
Jin Y, Gallagher PJ (prosinec 2003). „Antisense vyčerpání proteinové kinázy spojené se smrtí podporuje apoptózu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (51): 51587–93. doi:10,1074 / jbc.M309165200. PMC 2823796. PMID 14530257.
Kim WS, Son HJ, Park JO, Song SY, Park C (prosinec 2003). „Methylace promotoru a down-regulace DAPK je spojena s atrofií žaludku“. International Journal of Molecular Medicine. 12 (6): 827–30. doi:10,3892 / ijmm. 12.6.827. PMID 14612952.
Bai T, Tanaka T, Yukawa K, Maeda M, Umesaki N (březen 2004). „Snížená exprese proteinkinázy spojené se smrtí v buňkách lidského karcinomu dělohy a vaječníků“. Zprávy o onkologii. 11 (3): 661–5. doi:10.3892 / nebo 11.3.661. PMID 14767518.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196730 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021559 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8530096-5] Feinstein E, Druck T, Kastury K, Berissi H, Goodart SA, Overhauser J, Kimchi A, Huebner K (září 1995). „Přiřazení DAP1 a DAPK - genů, které pozitivně zprostředkovávají programovanou buněčnou smrt vyvolanou IFN-gama - do chromozomových oblastí 5p12.2, respektive 9q34.1“. Genomika. 29 (1): 305–7. doi:10.1006 / geno.1995.1255. PMID 8530096.

[entrez-6] „Entrez Gene: DAPK1 death-associated protein kinase 1“.

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (prosinec 2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Výzkum pigmentových buněk a melanomu. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[TNBCarticle-8] Zhao J, Zhao D, Poage GM, Mazumdar A, Zhang Y, Hill JL, Hartman ZC, Savage MI, Mills GB, Brown PH (červenec 2015). „Proteinová kináza 1 spojená se smrtí podporuje růst rakovin mutujících p53“. The Journal of Clinical Investigation. 125 (7): 2707–20. doi:10.1172 / JCI70805. PMC 4563671. PMID 26075823.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )