PRKAG1 - PRKAG1

PRKAG1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2UV4, 2UV5, 2UV6, 2UV7, 4CFE, 4CFF, 4RER, 4REW, 5EZV, 4ZHX
Identifikátory
Aliasy	PRKAG1, AMPKG, protein kináza AMP aktivovaná nekatalytická podjednotka gama 1
Externí ID	OMIM: 602742 MGI: 108411 HomoloGene: 99712 Genové karty: PRKAG1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	49,018,807 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	98,831,521 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • aktivita proteinkinázy závislá na cAMP; • Vazba ADP; • Aktivita proteinkinázy aktivovaná AMP; • Vazba AMP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita regulátoru proteinkinázy závislá na cAMP; • vazba protein kinázy; • ATP vazba; • vazba adenyl ribonukleotidů;
Buněčná složka	• cytosol; • membrána; • komplex proteinkináz aktivovaný nukleotidy; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• metabolismus lipidů; • metabolický proces mastných kyselin; • regulace glykolytického procesu; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace genové exprese; • proces biosyntézy mastných kyselin; • zástava buněčného cyklu; • spermatogeneze; • makroautofagie; • signální transdukce; • pozitivní regulace aktivity proteinkinázy; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • regulace makroautofagie; • jaderný dovoz; • regulace aktivity proteinové serin / threonin kinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5571
	19082
	ENSG00000181929
	ENSMUSG00000067713
	P54619
	O54950
	NM_001206709; NM_001206710; NM_002733; NM_212461
	NM_016781
	NP_001193638; NP_001193639; NP_002724
	NP_058061
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

5'-AMP aktivovaná podjednotka proteinkinázy gama-1 je enzym že u lidí je kódován PRKAG1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je regulační podjednotkou AMP-aktivovaná protein kináza (AMPK). AMPK je heterotrimer skládající se z alfa katalytické podjednotky a nekatalytických beta a gama podjednotek. AMPK je důležitý enzym snímající energii, který sleduje stav buněčné energie. V reakci na buněčné metabolické stresy se aktivuje AMPK, a tedy fosforyláty a deaktivuje acetyl-CoA karboxyláza (ACC) a beta-hydroxy beta-methylglutaryl-CoA reduktáza (HMGCR), klíčové enzymy podílející se na regulaci de novo biosyntézy mastné kyseliny a cholesterol. Tato podjednotka je jednou z gama regulačních podjednotek AMPK. Alternativně sestříhané varianty přepisu kódující odlišné izoformy byly pozorovány.^[7]

Interakce

PRKAG1 bylo prokázáno komunikovat s PRKAB2^[8] a PRKAB1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181929 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067713 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Stapleton D, Mitchelhill KI, Gao G, Widmer J, Michell BJ, Teh T, House CM, Fernandez CS, Cox T, Witters LA, Kemp BE (leden 1996). „Savčí podrodina proteinkinázy aktivované AMP“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (2): 611–4. doi:10.1074 / jbc.271.2.611. PMID 8557660.
^ Gao G, Fernandez CS, Stapleton D, Auster AS, Widmer J, Dyck JR, Kemp BE, Witters LA (duben 1996). „Nekatalytické izoformy beta- a gama podjednotky 5'-AMP-aktivované proteinové kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (15): 8675–81. doi:10.1074 / jbc.271.15.8675. PMID 8621499.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PRKAG1 protein kináza, AMP-aktivovaná, gama 1 nekatalytická podjednotka".
^ ^A ^b Cheung PC, Salt IP, Davies SP, Hardie DG, Carling D (březen 2000). „Charakterizace izoforem gama podjednotky aktivované proteinovou kinázou AMP a jejich role ve vazbě na AMP“. The Biochemical Journal. 346 Pt 3 (3): 659–69. doi:10.1042/0264-6021:3460659. PMC 1220898. PMID 10698692.

Další čtení

Hofmann B, Nishanian P, Baldwin RL, Insixiengmay P, Nel A, Fahey JL (prosinec 1990). „HIV inhibuje časné kroky aktivace lymfocytů, včetně zahájení metabolismu inositol fosfolipidů“. Journal of Immunology. 145 (11): 3699–705. PMID 1978848.
Beebe SJ, Oyen O, Sandberg M, Frøysa A, Hansson V, Jahnsen T (březen 1990). „Molekulární klonování tkáňově specifické proteinové kinázy (C gamma) z lidského varlete - představující třetí izoformu pro katalytickou podjednotku cAMP-dependentní proteinové kinázy“. Molekulární endokrinologie. 4 (3): 465–75. doi:10.1210 / oprava-4-3-465. PMID 2342480.
Hofmann B, Nishanian P, Nguyen T, Insixiengmay P, Fahey JL (červenec 1993). „Proteiny viru lidské imunodeficience indukují inhibiční dráhu cAMP / protein kinázu A v normálních lymfocytech“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (14): 6676–80. Bibcode:1993PNAS ... 90.6676H. doi:10.1073 / pnas.90.14.6676. PMC 46995. PMID 7688126.
Hofmann B, Nishanian P, Fan J, Nguyen T, Fahey JL (červenec 1994). „Protein HIV Gag p17 zhoršuje proliferaci normálních lymfocytů in vitro“. AIDS. 8 (7): 1016–7. doi:10.1097/00002030-199407000-00025. PMID 7946090.
Woods A, Cheung PC, Smith FC, Davison MD, Scott J, Beri RK, Carling D (duben 1996). "Charakterizace AMP aktivovaných proteinových kináz beta a gama podjednotek. Sestavení heterotrimerního komplexu in vitro". The Journal of Biological Chemistry. 271 (17): 10282–90. doi:10.1074 / jbc.271.48.30517. PMID 8626596.
Dyck JR, Gao G, Widmer J, Stapleton D, Fernandez CS, Kemp BE, Witters LA (červenec 1996). „Regulace aktivity proteinkinázy aktivované 5'-AMP nekatalytickými podjednotkami beta a gama“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (30): 17798–803. doi:10.1074 / jbc.271.30.17798. PMID 8663446.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Swingler S, Gallay P, Camaur D, Song J, Abo A, Trono D (červen 1997). „Nef protein viru lidské imunodeficience typu 1 zvyšuje fosforylaci serinu virové matrice“. Journal of Virology. 71 (6): 4372–7. doi:10.1128 / JVI.71.6.4372-4377.1997. PMC 191654. PMID 9151826.
Stapleton D, Woollatt E, Mitchelhill KI, Nicholl JK, Fernandez CS, Michell BJ, Witters LA, Power DA, Sutherland GR, Kemp BE (červen 1997). "Rodina izoenzymů proteinových kináz aktivovaných AMP: struktura podjednotky a umístění chromozomů". FEBS Dopisy. 409 (3): 452–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00569-3. PMID 9224708. S2CID 39329574.
Chen P, Mayne M, Power C, Nath A (září 1997). „Tat protein HIV-1 indukuje produkci alfa-faktoru nekrotizujícího nádory. Důsledky pro neurologická onemocnění spojená s HIV-1“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (36): 22385–8. doi:10.1074 / jbc.272.36.22385. PMID 9278385.
Reinton N, Haugen TB, Orstavik S, Skålhegg BS, Hansson V, Jahnsen T, Taskén K (duben 1998). „Gen kódující C gamma katalytickou podjednotku cAMP-dependentní protein kinázy je transkribovaný retroposon.“ Genomika. 49 (2): 290–7. doi:10.1006 / geno.1998.5240. PMID 9598317.
Zidovetzki R, Wang JL, Chen P, Jeyaseelan R, Hofman F (červenec 1998). „Tat protein viru lidské imunodeficience indukuje expresi mRNA interleukinu 6 v endoteliálních buňkách lidského mozku prostřednictvím proteinových kinázových C- a cAMP-závislých proteinových kinázových cest“. Výzkum AIDS a lidské retroviry. 14 (10): 825–33. doi:10.1089 / podpora.1998.14.825. PMID 9671211.
Mayne M, Bratanich AC, Chen P, Rana F, Nath A, Power C (1998). "HIV-1 tat molekulární rozmanitost a indukce TNF-alfa: důsledky pro HIV vyvolané neurologické onemocnění". Neuroimunomodulace. 5 (3–4): 184–92. doi:10.1159/000026336. PMID 9730685. S2CID 19529677.
Cheung PC, Salt IP, Davies SP, Hardie DG, Carling D (březen 2000). „Charakterizace izoforem gama podjednotky aktivované proteinovou kinázou AMP a jejich role ve vazbě na AMP“. The Biochemical Journal. 346 Pt 3 (3): 659–69. doi:10.1042/0264-6021:3460659. PMC 1220898. PMID 10698692.
Hamilton SR, Stapleton D, O'Donnell JB, Kung JT, Dalal SR, Kemp BE, Witters LA (červenec 2001). "Aktivující mutace v podjednotce gama 1 AMP-aktivované proteinové kinázy". FEBS Dopisy. 500 (3): 163–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02602-3. PMID 11445078. S2CID 85248755.
Minokoshi Y, Alquier T, Furukawa N, Kim YB, Lee A, Xue B, Mu J, Foufelle F, Ferré P, Birnbaum MJ, Stuck BJ, Kahn BB (duben 2004). „AMP-kináza reguluje příjem potravy reakcí na hormonální a výživové signály v hypotalamu“. Příroda. 428 (6982): 569–74. Bibcode:2004 Natur.428..569M. doi:10.1038 / nature02440. PMID 15058305. S2CID 4302317.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou 5'-AMP aktivovanou proteinovou podjednotku gamma-1 (PRKAG1)

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181929 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067713 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8557660-5] Stapleton D, Mitchelhill KI, Gao G, Widmer J, Michell BJ, Teh T, House CM, Fernandez CS, Cox T, Witters LA, Kemp BE (leden 1996). „Savčí podrodina proteinkinázy aktivované AMP“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (2): 611–4. doi:10.1074 / jbc.271.2.611. PMID 8557660.

[pmid8621499-6] Gao G, Fernandez CS, Stapleton D, Auster AS, Widmer J, Dyck JR, Kemp BE, Witters LA (duben 1996). „Nekatalytické izoformy beta- a gama podjednotky 5'-AMP-aktivované proteinové kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (15): 8675–81. doi:10.1074 / jbc.271.15.8675. PMID 8621499.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: PRKAG1 protein kináza, AMP-aktivovaná, gama 1 nekatalytická podjednotka".

[pmid10698692-8] A ^b Cheung PC, Salt IP, Davies SP, Hardie DG, Carling D (březen 2000). „Charakterizace izoforem gama podjednotky aktivované proteinovou kinázou AMP a jejich role ve vazbě na AMP“. The Biochemical Journal. 346 Pt 3 (3): 659–69. doi:10.1042/0264-6021:3460659. PMC 1220898. PMID 10698692.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )