ZNAČKA4 - MARK4

ZNAČKA4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5ES1
Identifikátory
Aliasy	ZNAČKA4, MARK4L, MARK4S, MARKL1, MARKL1L, PAR-1D, kináza 4 regulující afinitu mikrotubulů
Externí ID	OMIM: 606495 MGI: 1920955 HomoloGene: 57146 Genové karty: ZNAČKA4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	45,305,284 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	19,458,821 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • vazba mikrotubulů; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita tau-protein kinázy; • vazba ubikvitinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba gama-tubulinu; • ATP vazba; • vazba tau proteinu;
Buněčná složka	• ciliární bazální tělo; • cytosol; • centrosome; • mikrotubulární cytoskelet; • neuronová projekce; • cytoskelet; • buněčná projekce; • cytoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • komplex gama-tubulin; • dendrit; • střední část těla;
Biologický proces	• fosforylace; • pozitivní regulace programované buněčné smrti; • vývoj nervového systému; • fosforylace bílkovin; • tvorba svazku mikrotubulů; • buněčný cyklus; • buněčné dělení; • stanovení polarity buněk; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • organizace projekce buněk; • ciliární bazální tělo dokování; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • organizace cilium; • pozitivní regulace sestavy cilium; • regulace cyklu centrosomu; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do centrosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57787
	232944
	ENSG00000007047
	ENSMUSG00000030397
	Q96L34
	Q8CIP4
	NM_001199867; NM_031417
	NM_172279; NM_001368427
	NP_001186796; NP_113605
	NP_758483; NP_001355356
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kináza regulující afinitu MAP / mikrotubulů 4 je enzym že u lidí je kódován ZNAČKA4 gen.^[5]^[6]^[7] MARK4 patří do rodiny serin / threonin kinázy ten fosforylát proteiny spojené s mikrotubuly (MAP) způsobující jejich oddělení od mikrotubuly.^[8] Oddělení tím zvyšuje dynamiku mikrotubulů a usnadňuje řadu buněčných aktivit včetně buněčné dělení, buněčný cyklus řízení, polarita buněk stanovení a změny tvaru buněk.^[9]

Existují čtyři členové rodiny proteinů MARK, MARK1-4, které jsou vysoce konzervované. Ukázalo se, že kináza MARK4 je zapojena do organizace mikrotubulů v neuronálních buňkách. Úrovně MARK4 jsou zvýšené v Alzheimerova choroba a může přispívat k patologické fosforylaci tau protein v této nemoci.

Interakce

MARK4 bylo prokázáno komunikovat s USP9X^[10] a Ubikvitin C..^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000007047 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030397 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kato T, Satoh S, Okabe H, Kitahara O, Ono K, Kihara C, Tanaka T, Tsunoda T, Yamaoka Y, Nakamura Y, Furukawa Y (duben 2001). „Izolace nového lidského genu, MARKL1, homologního s MARK3 a jeho zapojení do hepatocelulární karcinogeneze“. Neoplazie. 3 (1): 4–9. doi:10.1038 / sj.neo.7900132. PMC 1505019. PMID 11326310.
^ Drewes G, Ebneth A, Preuss U, Mandelkow EM, Mandelkow E (duben 1997). „MARK, nová rodina proteinových kináz, které fosforylují proteiny spojené s mikrotubuly a vyvolávají narušení mikrotubulů“. Buňka. 89 (2): 297–308. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80208-1. PMID 9108484.
^ „Entrez Gene: MARK4 MAP / microtubule afinita regulující kináza 4“.
^ Drewes G, Ebneth A, Preuss U, Mandelkow EM, Mandelkow E (duben 1997). „MARK, nová rodina proteinových kináz, které fosforylují proteiny spojené s mikrotubuly a vyvolávají narušení mikrotubulů“. Buňka. 89 (2): 297–308. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80208-1. PMID 9108484.
^ Naz F, Anjum F, Islam A, Ahmad F, Hassan MI (listopad 2013). "Microtubule afinita regulující kináza 4: struktura, funkce a regulace". Buněčná biochemie a biofyzika. 67 (2): 485–99. doi:10.1007 / s12013-013-9550-7. PMID 23471664. S2CID 13507976.
^ ^A ^b Al-Hakim AK, Zagorska A, Chapman L, Deak M, Peggie M, Alessi DR (duben 2008). "Kontrola kináz souvisejících s AMPK pomocí USP9X a atypických řetězců polyubiquitinu vázaných na Lys (29) / Lys (33)" (PDF). The Biochemical Journal. 411 (2): 249–60. doi:10.1042 / BJ20080067. PMID 18254724.

Další čtení

Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (duben 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 8 (2): 85–95. doi:10.1093 / dnares / 8.2.85. PMID 11347906.
Beghini A, Magnani I, Roversi G, Piepoli T, Di Terlizzi S, Moroni RF, Pollo B, Fuhrman Conti AM, Cowell JK, Finocchiaro G, Larizza L (květen 2003). „Nervová progenitorem omezená izoforma genu MARK4 v 19q13.2 je v lidských gliomech nadměrně regulována a nadměrně exprimována v podskupině buněčných linií glioblastomu“. Onkogen. 22 (17): 2581–91. doi:10.1038 / sj.onc.1206336. PMID 12735302.
Trinczek B, Brajenovic M, Ebneth A, Drewes G (únor 2004). „MARK4 je nová kináza asociovaná s proteiny asociovaná s mikrotubuly, která se váže na buněčnou síť mikrotubulů a na centrosomy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (7): 5915–23. doi:10,1074 / jbc.M304528200. PMID 14594945.
Brajenovic M, Joberty G, Küster B, Bouwmeester T, Drewes G (březen 2004). „Komplexní proteomická analýza lidských proteinových komplexů Par odhaluje propojenou proteinovou síť“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (13): 12804–11. doi:10,1074 / jbc.M312171200. PMID 14676191.
Schneider A, Laage R, von Ahsen O, Fischer A, Rossner M, Scheek S, Grünewald S, Kuner R, Weber D, Krüger C, Klaussner B, Götz B, Hiemisch H, Newrzella D, Martin-Villalba A, Bach A , Schwaninger M (březen 2004). "Identifikace regulovaných genů během permanentní fokální cerebrální ischemie: charakterizace proteinové kinázy 9b5 / MARKL1 / MARK4". Journal of Neurochemistry. 88 (5): 1114–26. doi:10.1046 / j.1471-4159.2003.02228.x. PMID 15009667. S2CID 44856849.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Wissing J, Jänsch L, Nimtz M, Dieterich G, Hornberger R, Kéri G, Wehland J, Daub H (březen 2007). „Proteomická analýza proteinových kináz metodou selektivní prefrakce cílové třídy a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Molekulární a buněčná proteomika. 6 (3): 537–47. doi:10,1074 / mcp. T600062-MCP200. PMID 17192257.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000007047 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030397 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11326310-5] Kato T, Satoh S, Okabe H, Kitahara O, Ono K, Kihara C, Tanaka T, Tsunoda T, Yamaoka Y, Nakamura Y, Furukawa Y (duben 2001). „Izolace nového lidského genu, MARKL1, homologního s MARK3 a jeho zapojení do hepatocelulární karcinogeneze“. Neoplazie. 3 (1): 4–9. doi:10.1038 / sj.neo.7900132. PMC 1505019. PMID 11326310.

[pmid9108484-6] Drewes G, Ebneth A, Preuss U, Mandelkow EM, Mandelkow E (duben 1997). „MARK, nová rodina proteinových kináz, které fosforylují proteiny spojené s mikrotubuly a vyvolávají narušení mikrotubulů“. Buňka. 89 (2): 297–308. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80208-1. PMID 9108484.

[entrez-7] „Entrez Gene: MARK4 MAP / microtubule afinita regulující kináza 4“.

[8] Drewes G, Ebneth A, Preuss U, Mandelkow EM, Mandelkow E (duben 1997). „MARK, nová rodina proteinových kináz, které fosforylují proteiny spojené s mikrotubuly a vyvolávají narušení mikrotubulů“. Buňka. 89 (2): 297–308. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80208-1. PMID 9108484.

[9] Naz F, Anjum F, Islam A, Ahmad F, Hassan MI (listopad 2013). "Microtubule afinita regulující kináza 4: struktura, funkce a regulace". Buněčná biochemie a biofyzika. 67 (2): 485–99. doi:10.1007 / s12013-013-9550-7. PMID 23471664. S2CID 13507976.

[pmid18254724-10] A ^b Al-Hakim AK, Zagorska A, Chapman L, Deak M, Peggie M, Alessi DR (duben 2008). "Kontrola kináz souvisejících s AMPK pomocí USP9X a atypických řetězců polyubiquitinu vázaných na Lys (29) / Lys (33)" (PDF). The Biochemical Journal. 411 (2): 249–60. doi:10.1042 / BJ20080067. PMID 18254724.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )