TRIO (gen) - TRIO (gene)

TRIO
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1NTY, 2NZ8
Identifikátory
Aliasy	TRIO, ARHGEF23, tgat, trio Rho guaninový nukleotidový výměnný faktor, MEBAS, MRD44, MRD63
Externí ID	OMIM: 601893 MGI: 1927230 HomoloGene: 20847 Genové karty: TRIO
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	14,532,128 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	28,025,848 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • Aktivita výměnného faktoru Rho guanyl-nukleotid;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• fosforylace; • fosforylace bílkovin; • transmembránový receptorový protein tyrosin fosfatáza signalizační dráha; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • regulace přenosu signálu proteinu Rho; • regulace přenosu signálu zprostředkovaného malou GTPázou; • negativní regulace diferenciace tukových buněk; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • axonové vedení; • vývoj centrálního nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7204
	223435
	ENSG00000038382
	ENSMUSG00000022263
	O75962
	Q0KL02
	NM_007118
	NM_001081302
	NP_009049
	NP_001074771
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trojitý funkční doménový protein je protein že u lidí je kódován TRIO gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že TRIO (gen) komunikovat s Filamin^[7] a RHOA.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000038382 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022263 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Debant A, Serra-Pagès C, Seipel K, O'Brien S, Tang M, Park SH, Streuli M (květen 1996). „Vícedoménový protein Trio váže transmembránovou tyrosin fosfatázu LAR, obsahuje doménu proteinkinázy a má oddělené domény faktoru výměny guaninového nukleotidového výměnného faktoru specifické pro rac“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (11): 5466–71. doi:10.1073 / pnas.93.11.5466. PMC 39269. PMID 8643598.
^ "Entrez Gene: TRIO trojitá funkční doména (PTPRF interagující)".
^ Bellanger JM, Astier C, Sardet C, Ohta Y, Stossel TP, Debant A (prosinec 2000). „Rac1- a RhoG-specifická doména GEF tria cílí na filamin k remodelaci cytoskeletálního aktinu“. Přírodní buněčná biologie. 2 (12): 888–92. doi:10.1038/35046533. PMID 11146652. S2CID 10182923.
^ Medley QG, Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (listopad 2000). „Trio guaninový nukleotidový výměnný faktor je cíl RhoA. Vazba RhoA na doménu podobnou trio imunoglobulinu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (46): 36116–23. doi:10,1074 / jbc.M003775200. PMID 10948190.

Další čtení

Taviaux S, Diriong S, Bellanger JM, Streuli M, Debant A (1997). "Přiřazení TRIO, genu Trio (PTPRF interagující) k lidským chromozomovým pásmům 5p 15,1 -> p14 hybridizací in situ". Cytogenetika a genetika buněk. 76 (1–2): 107–8. doi:10.1159/000134524. PMID 9154137.
Liu X, Wang H, Eberstadt M, Schnuchel A, Olejniczak ET, Meadows RP, Schkeryantz JM, Janowick DA, Harlan JE, Harris EA, Staunton DE, Fesik SW (říjen 1998). "NMR struktura a mutageneze N-koncové domény homologie Dbl nukleotidového výměnného faktoru Trio". Buňka. 95 (2): 269–77. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81757-2. PMID 9790533. S2CID 18146575.
Seipel K, Medley QG, Kedersha NL, Zhang XA, O'Brien SP, Serra-Pages C, Hemler ME, Streuli M (červen 1999). „Trio aminoterminální exprese domény guaninového nukleotidového výměnného faktoru podporuje reorganizaci aktinového cytoskeletu, migraci buněk a růst buněk nezávislý na ukotvení“. Journal of Cell Science. 112 (Pt 12) (12): 1825–1834. PMID 10341202.
Medley QG, Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (listopad 2000). „Trio guaninový nukleotidový výměnný faktor je cíl RhoA. Vazba RhoA na doménu podobnou trio imunoglobulinu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (46): 36116–23. doi:10,1074 / jbc.M003775200. PMID 10948190.
Bellanger JM, Astier C, Sardet C, Ohta Y, Stossel TP, Debant A (prosinec 2000). „Rac1- a RhoG-specifická doména GEF tria cílí na filamin k remodelaci cytoskeletálního aktinu“. Přírodní buněčná biologie. 2 (12): 888–92. doi:10.1038/35046533. PMID 11146652. S2CID 10182923.
Gao Y, Xing J, Streuli M, Leto TL, Zheng Y (prosinec 2001). „Trp (56) rac1 specifikuje interakci s podmnožinou guaninových nukleotidových výměnných faktorů“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (50): 47530–41. doi:10,1074 / jbc.M108865200. PMID 11595749.
Skowronek KR, Guo F, Zheng Y, Nassar N (září 2004). „C-koncový základní konec RhoG pomáhá trojici faktoru výměny guaninového nukleotidu při vazbě na fosfolipidy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (36): 37895–907. doi:10,1074 / jbc.M312677200. PMID 15199069.
Zheng M, Simon R, Mirlacher M, Maurer R, Gasser T, Forster T, Diener PA, Mihatsch MJ, Sauter G, Schraml P (červenec 2004). „Amplifikace TRIO a hojná exprese mRNA je spojena s invazivním růstem nádorů a rychlou proliferací nádorových buněk u rakoviny močového měchýře“. American Journal of Pathology. 165 (1): 63–9. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63275-0. PMC 1618551. PMID 15215162.
Yoshizuka N, Moriuchi R, Mori T, Yamada K, Hasegawa S, Maeda T, Shimada T, Yamada Y, Kamihira S, Tomonaga M, Katamine S (říjen 2004). „Alternativní transkript odvozený z trio lokusu kóduje faktor výměny guanosinového nukleotidu s potenciálem transformovat myší buňky“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (42): 43998–4004. doi:10,1074 / jbc.M406082200. PMID 15308664.
Portales-Casamar E, Briançon-Marjollet A, Fromont S, Triboulet R, Debant A (březen 2006). "Identifikace nových neuronálních izoforem Rho-GEF Trio". Biologie buňky. 98 (3): 183–93. doi:10.1042 / BC20050009. PMID 16033331. S2CID 24166861.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Watts JD, Hood L, Aebersold R (srpen 2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Přírodní metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Adamowicz M, Radlwimmer B, Rieker RJ, Mertens D, Schwarzbach M, Schraml P, Benner A, Lichter P, Mechtersheimer G, Joos S (září 2006). "Časté amplifikace a hojná exprese TRIO, NKD2 a IRX2 v sarkomech měkkých tkání". Geny, chromozomy a rakovina. 45 (9): 829–38. doi:10,1002 / gcc.20343. PMID 16752383. S2CID 24491021.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Chhatriwala MK, Betts L, Worthylake DK, Sondek J (květen 2007). „Domény DH a PH v Trio koordinovaně zapojují Rho GTPasy pro jejich účinnou aktivaci“. Journal of Molecular Biology. 368 (5): 1307–20. doi:10.1016 / j.jmb.2007.02.060. PMC 1890047. PMID 17391702.
Rojas RJ, Yohe ME, Gershburg S, Kawano T, Kozasa T, Sondek J (říjen 2007). "Galphaq přímo aktivuje p63RhoGEF a Trio prostřednictvím konzervovaného prodloužení homologie domény plebstrinové homologie spojené s Dbl" ". The Journal of Biological Chemistry. 282 (40): 29201–10. doi:10,1074 / jbc.M703458200. PMC 2655113. PMID 17606614.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O75962 (Protein s trojí funkční doménou) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000038382 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022263 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8643598-5] Debant A, Serra-Pagès C, Seipel K, O'Brien S, Tang M, Park SH, Streuli M (květen 1996). „Vícedoménový protein Trio váže transmembránovou tyrosin fosfatázu LAR, obsahuje doménu proteinkinázy a má oddělené domény faktoru výměny guaninového nukleotidového výměnného faktoru specifické pro rac“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (11): 5466–71. doi:10.1073 / pnas.93.11.5466. PMC 39269. PMID 8643598.

[entrez-6] "Entrez Gene: TRIO trojitá funkční doména (PTPRF interagující)".

[pmid11146652-7] Bellanger JM, Astier C, Sardet C, Ohta Y, Stossel TP, Debant A (prosinec 2000). „Rac1- a RhoG-specifická doména GEF tria cílí na filamin k remodelaci cytoskeletálního aktinu“. Přírodní buněčná biologie. 2 (12): 888–92. doi:10.1038/35046533. PMID 11146652. S2CID 10182923.

[pmid10948190-8] Medley QG, Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (listopad 2000). „Trio guaninový nukleotidový výměnný faktor je cíl RhoA. Vazba RhoA na doménu podobnou trio imunoglobulinu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (46): 36116–23. doi:10,1074 / jbc.M003775200. PMID 10948190.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )