EIF2AK3 - EIF2AK3

EIF2AK3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4G31, 4G34, 4M7I, 4X7H, 4X7J, 4X7K, 4X7L, 4X7N, 4X7O, 4YZS
Identifikátory
Aliasy	EIF2AK3, PEK, PERK, WRS, eukaryotický iniciační faktor translace 2 alfa kináza 3
Externí ID	OMIM: 604032 MGI: 1341830 HomoloGene: 3557 Genové karty: EIF2AK3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	88,627,464 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	70,905,245 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita proteinkinázy; • Vazba na protein Hsp90; • vazba nukleotidů; • aktivita homodimerizace proteinu; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • vazba enzymu; • vázání proteinové fosfatázy; • ATP vazba; • aktivita iniciačního faktoru 2 eukaryotického translace alfa alfa kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • endoplazmatické retikulum; • perinukleární oblast cytoplazmy; • cytosolický ribozom;
Biologický proces	• vývoj kosterního systému; • mineralizace kostí; • signální dráha receptoru růstového faktoru podobného inzulínu; • negativní regulace překladu; • regulace endoplazmatického retikula stresem indukovaná eIF2 alfa fosforylace; • buněčná odpověď na hladovění glukózy; • negativní regulace překladu v reakci na stres; • zkostnatění; • negativní regulace iniciace translace v reakci na stres; • fosforylace; • buněčná odpověď na hladovění aminokyselin; • vývoj chondrocytů; • regulace endoplazmatického retikula vnitřní apoptotické signální dráhy vyvolané stresem; • sekrece inzulínu; • organizace endoplazmatického retikula; • reakce na stres endoplazmatického retikula; • PERK zprostředkovaná rozložená proteinová odpověď; • Reakce na přetížení ER; • reakce na stres endoplazmatického retikula vyvolaný manganem; • endoplazmatické retikulum rozložilo proteinovou odpověď; • fosforylace bílkovin; • reakce na rozvinutý protein; • pozitivní regulace genové exprese; • buněčná odpověď na chlad; • peptidyl-serinová fosforylace; • angiogeneze; • Fosforylace eiF2alfa v reakci na stres endoplazmatického retikula; • autofosforylace; • pozitivní regulace produkce vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy I.; • homooligomerizace bílkovin; • aktivace aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • negativní regulace myelinizace; • regulace překladu; • vápníkem zprostředkovaná signalizace; • vývoj endokrinního pankreatu; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do jádra; • regulace iniciace translace eIF2 alfa fosforylací;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9451
	13666
	ENSG00000172071
	ENSMUSG00000031668
	Q9NZJ5
	Q9Z2B5
	NM_001313915; NM_004836
	NM_010121; NM_001313918
	NP_001300844; NP_004827
	NP_001300847; NP_034251
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Eukaryotický iniciační faktor translace 2-alfa kináza 3, také známý jako kináza podobná proteinkináze R (PKR) (VYZDOBIT), je enzym že u lidí je kódován EIF2AK3 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem fosforyláty alfa podjednotka eukaryotického translačního iniciačního faktoru 2 (EIF2 ), což vede k jeho inaktivaci, a tím k rychlému snížení iniciace translace a potlačení syntézy globálních proteinů. Je to membránový protein typu I nacházející se v endoplazmatické retikulum (ER), kde je vyvolán stresem ER způsobeným špatně poskládané proteiny.^[6]

Klinický význam

Vyvíjí se pacienti s mutacemi v tomto genu Wolcott-Rallisonův syndrom.^[9]

Interakce

EIF2AK3 bylo prokázáno komunikovat s DNAJC3^[10] a NFE2L2.^[11]

Inhibitory

GSK2606414
3-Fluoro-GSK2606414

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172071 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031668 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shi Y, Vattem KM, Sood R, An J, Liang J, Stramm L, Wek RC (prosinec 1998). „Identifikace a charakterizace pankreatického eukaryotického iniciačního faktoru 2 alfa-podjednotkové kinázy, PEK, podílející se na translační kontrole“. Mol. Buňka. Biol. 18 (12): 7499–509. doi:10.1128 / MCB.18.12.7499. PMC 109330. PMID 9819435.
^ ^A ^b Harding HP, Zhang Y, Ron D (21. ledna 1999). „Translace a skládání proteinů jsou spojeny s kinázou rezidentní v endoplazmatickém retikulu.“ Příroda. 397 (6716): 271–4. doi:10.1038/16729. PMID 9930704. S2CID 4416662.
^ Hayes SE, Conner LJ, Stramm LE, Shi Y (1999). "Přiřazení pankreatické eIF-2alfa kinázy (EIF2AK3) k lidskému chromozomovému pásmu 2p12 radiačním hybridním mapováním a in situ hybridizací". Cytogenet. Cell Genet. 86 (3–4): 327–8. doi:10.1159/000015328. PMID 10575235. S2CID 84483593.
^ „Entrez Gene: EIF2AK3 eukaryotický iniciační faktor translace 2-alfa kináza 3“.
^ Søvik O, Njølstad PR, Jellum E, Molven A (květen 2008). „Wolcott-Rallisonův syndrom s 3-hydroxydikarboxylovou acidurií a smrtícími následky“. J. Zdědit. Metab. Dis. 31 Suppl 2: S293–7. doi:10.1007 / s10545-008-0866-1. PMID 18500571. S2CID 1751676.
^ Yan W, Frank CL, Korth MJ, Sopher BL, Novoa I, Ron D, Katze MG (prosinec 2002). "Kontrola aktivity PERK eIF2alfa kinázy pomocí molekulárního chaperonu P58IPK vyvolaného stresem endoplazmatického retikula". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (25): 15920–5. doi:10.1073 / pnas.252341799. PMC 138540. PMID 12446838.
^ Cullinan SB, Zhang D, Hannink M, Arvisais E, Kaufman RJ, Diehl JA (říjen 2003). „Nrf2 je přímým substrátem PERK a efektorem přežití buněk závislých na PERK“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7198–209. doi:10.1128 / MCB.23.20.7198-7209.2003. PMC 230321. PMID 14517290.

Další čtení

Mellor H, Proud CG (1991). "Syntetický peptidový substrát pro iniciační faktor-2 kinázy". Biochem. Biophys. Res. Commun. 178 (2): 430–7. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 90125-Q. PMID 1677563.
Dever TE, Chen JJ, Barber GN, Cigan AM, Feng L, Donahue TF, London IM, Katze MG, Hinnebusch AG (1993). "Savčí eukaryotický iniciační faktor 2 alfa kinázy funkčně nahrazuje proteinovou kinázu GCN2 v mechanismu kontroly translace GCN4 kvasinek". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (10): 4616–20. doi:10.1073 / pnas.90.10.4616. PMC 46563. PMID 8099443.
Shi Y, Vattem KM, Sood R, An J, Liang J, Stramm L, Wek RC (1998). „Identifikace a charakterizace pankreatického eukaryotického iniciačního faktoru 2 alfa-podjednotkové kinázy, PEK, podílející se na translační kontrole“. Mol. Buňka. Biol. 18 (12): 7499–509. doi:10.1128 / MCB.18.12.7499. PMC 109330. PMID 9819435.
Sood R, Porter AC, Ma K, Quilliam LA, Wek RC (2000). „Pankreatický eukaryotický iniciační faktor-2alfa kináza (PEK) u lidí, Drosophila melanogaster a Caenorhabditis elegans, které zprostředkovávají translační kontrolu v reakci na stres endoplazmatického retikula“. Biochem. J. 346 (2): 281–93. doi:10.1042/0264-6021:3460281. PMC 1220852. PMID 10677345.
Delépine M, Nicolino M, Barrett T, Golamaully M, Lathrop GM, Julier C (2000). „EIF2AK3, kódující faktor iniciace translace 2-alfa kinázy 3, je mutován u pacientů s Wolcott-Rallisonovým syndromem“. Nat. Genet. 25 (4): 406–9. doi:10.1038/78085. PMID 10932183. S2CID 24521894.
Saelens X, Kalai M, Vandenabeele P (2001). "Inhibice translace u apoptózy: aktivace PKR závislá na kaspáze a eIF2-alfa fosforylace". J. Biol. Chem. 276 (45): 41620–8. doi:10,1074 / jbc.M103674200. PMID 11555640.
Ma K, Vattem KM, Wek RC (2002). „Dimerizace a uvolnění inhibice molekulárních chaperonů usnadňuje aktivaci kinázy eukaryotického iniciačního faktoru 2 v reakci na stres endoplazmatického retikula“. J. Biol. Chem. 277 (21): 18728–35. doi:10,1074 / jbc.M200903200. PMID 11907036.
Okada T, Yoshida H, Akazawa R, Negishi M, Mori K (2002). „Zřetelné role aktivačního transkripčního faktoru 6 (ATF6) a dvouřetězcové RNA aktivované proteinkinázy podobné endoplazmatické retikulum kinázy (PERK) v transkripci během reakce rozvinutého proteinu savců“. Biochem. J. 366 (Pt 2): 585–94. doi:10.1042 / BJ20020391. PMC 1222788. PMID 12014989.
Biason-Lauber A, Lang-Muritano M, Vaccaro T, Schoenle EJ (2002). „Ztráta aktivity kinázy u pacienta s Wolcott-Rallisonovým syndromem způsobená novou mutací v genu EIF2AK3“. Cukrovka. 51 (7): 2301–5. doi:10 2337 / diabetes. 51.7.2301. PMID 12086964.
Koumenis C, Naczki C, Koritzinsky M, Rastani S, Diehl A, Sonenberg N, Koromilas A, Wouters BG (2002). „Regulace syntézy proteinů hypoxií prostřednictvím aktivace endoplazmatické retikulární kinázy PERK a fosforylace translačního iniciačního faktoru eIF2alpha“. Mol. Buňka. Biol. 22 (21): 7405–16. doi:10.1128 / MCB.22.21.7405-7416.2002. PMC 135664. PMID 12370288.
Marcu MG, Doyle M, Bertolotti A, Ron D, Hendershot L, Neckers L (2002). „Protein 90 tepelného šoku moduluje rozvinutou proteinovou reakci stabilizací IRE1alpha“. Mol. Buňka. Biol. 22 (24): 8506–13. doi:10.1128 / MCB.22.24.8506-8513.2002. PMC 139892. PMID 12446770.
Yan W, Frank CL, Korth MJ, Sopher BL, Novoa I, Ron D, Katze MG (2002). „Kontrola aktivity PERK eIF2alfa kinázy pomocí molekulárního chaperonu P58IPK vyvolaného stresem endoplazmatického retikula“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (25): 15920–5. doi:10.1073 / pnas.252341799. PMC 138540. PMID 12446838.
Pavio N, Romano PR, Graczyk TM, Feinstone SM, Taylor DR (2003). „Syntéza proteinů a stres endoplazmatického retikula mohou být modulovány obalovým proteinem viru hepatitidy C E2 prostřednictvím eukaryotického iniciačního faktoru 2alfa kinázy PERK“. J. Virol. 77 (6): 3578–85. doi:10.1128 / JVI.77.6.3578-3585.2003. PMC 149509. PMID 12610133.
Cullinan SB, Zhang D, Hannink M, Arvisais E, Kaufman RJ, Diehl JA (2003). „Nrf2 je přímým substrátem PERK a efektorem přežití buněk závislých na PERK“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7198–209. doi:10.1128 / MCB.23.20.7198-7209.2003. PMC 230321. PMID 14517290.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Senée V, Vattem KM, Delépine M, Rainbow LA, Haton C, Lecoq A, Shaw NJ, Robert JJ, Rooman R, Diatloff-Zito C, Michaud JL, Bin-Abbas B, Taha D, Zabel B, Franceschini P, Topaloglu AK, Lathrop GM, Barrett TG, Nicolino M, Wek RC, Julier C (2004). „Wolcott-Rallisonův syndrom: klinické, genetické a funkční studie mutací EIF2AK3 a náznak genetické heterogenity“. Cukrovka. 53 (7): 1876–83. doi:10.2337 / diabetes.53.7.1876. PMID 15220213.
Allotey RA, Mohan V, McDermott MF, Deepa R, Premalatha G, Hassan Z, Cassell PG, North BV, Vaxillaire M, Mein CA, Swan DC, O'Grady E, Ramachandran A, Snehalatha C, Sinnot PJ, Hemmatpour SK, Froguel P, Hitman GA (2004). „Oblast genu EIF2AK3 a diabetes typu I u subjektů z jižní Indie“. Genes Immun. 5 (8): 648–52. doi:10.1038 / sj.gene.6364139. PMID 15483661.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172071 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031668 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9819435-5] Shi Y, Vattem KM, Sood R, An J, Liang J, Stramm L, Wek RC (prosinec 1998). „Identifikace a charakterizace pankreatického eukaryotického iniciačního faktoru 2 alfa-podjednotkové kinázy, PEK, podílející se na translační kontrole“. Mol. Buňka. Biol. 18 (12): 7499–509. doi:10.1128 / MCB.18.12.7499. PMC 109330. PMID 9819435.

[pmid9930704-6] A ^b Harding HP, Zhang Y, Ron D (21. ledna 1999). „Translace a skládání proteinů jsou spojeny s kinázou rezidentní v endoplazmatickém retikulu.“ Příroda. 397 (6716): 271–4. doi:10.1038/16729. PMID 9930704. S2CID 4416662.

[pmid10575235-7] Hayes SE, Conner LJ, Stramm LE, Shi Y (1999). "Přiřazení pankreatické eIF-2alfa kinázy (EIF2AK3) k lidskému chromozomovému pásmu 2p12 radiačním hybridním mapováním a in situ hybridizací". Cytogenet. Cell Genet. 86 (3–4): 327–8. doi:10.1159/000015328. PMID 10575235. S2CID 84483593.

[entrez-8] „Entrez Gene: EIF2AK3 eukaryotický iniciační faktor translace 2-alfa kináza 3“.

[pmid18500571-9] Søvik O, Njølstad PR, Jellum E, Molven A (květen 2008). „Wolcott-Rallisonův syndrom s 3-hydroxydikarboxylovou acidurií a smrtícími následky“. J. Zdědit. Metab. Dis. 31 Suppl 2: S293–7. doi:10.1007 / s10545-008-0866-1. PMID 18500571. S2CID 1751676.

[pmid12446838-10] Yan W, Frank CL, Korth MJ, Sopher BL, Novoa I, Ron D, Katze MG (prosinec 2002). "Kontrola aktivity PERK eIF2alfa kinázy pomocí molekulárního chaperonu P58IPK vyvolaného stresem endoplazmatického retikula". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (25): 15920–5. doi:10.1073 / pnas.252341799. PMC 138540. PMID 12446838.

[pmid14517290-11] Cullinan SB, Zhang D, Hannink M, Arvisais E, Kaufman RJ, Diehl JA (říjen 2003). „Nrf2 je přímým substrátem PERK a efektorem přežití buněk závislých na PERK“. Mol. Buňka. Biol. 23 (20): 7198–209. doi:10.1128 / MCB.23.20.7198-7209.2003. PMC 230321. PMID 14517290.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )