PRKD2 - PRKD2

PRKD2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2COA, 3BGM, 4NNX, 4NNY
Identifikátory
Aliasy	PRKD2, PKD2, nPKC-D2, HSPC187, protein kináza D2
Externí ID	OMIM: 607074 MGI: 2141917 HomoloGene: 9516 Genové karty: PRKD2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	46,717,127 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	16,870,464 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita proteinkinázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy C.; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • vazba protein kinázy C.;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Golgiho aparát; • membrána; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • buněčná membrána; • intracelulární;
Biologický proces	• pozitivní regulace signální dráhy receptoru vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • adaptivní imunitní odpověď; • fosforylace; • proces imunitního systému; • morfogeneze endotelové trubice; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru fibroblastového růstového faktoru; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru T buněk; • pozitivní regulace chemotaxe endotelových buněk; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • buněčná smrt; • signalizace protein kinázy D.; • GO: 0010740 pozitivní regulace transdukce intracelulárního signálu; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • pozitivní regulace angiogeneze; • pozitivní regulace migrace endotelových buněk; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace aktivity histon-deacetylázy; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru CREB; • signální dráha receptoru pro vaskulární endoteliální růstový faktor; • buněčná adheze; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • pozitivní regulace produkce interleukinu-2; • angiogeneze; • pozitivní regulace produkce interleukinu-8; • pozitivní regulace migrace endotelových buněk krevních cév; • pozitivní regulace procesu biosyntézy DNA; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • pozitivní regulace chemotaxe endoteliálních buněk signální cestou receptoru pro vaskulární endoteliální růstový faktor aktivovaný VEGF; • autofosforylace; • buněčná odpověď na stimul vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • Signální dráha receptoru T buněk; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace buněčné adheze; • sfingolipidový biosyntetický proces; • peptidyl-serinová fosforylace; • peptidyl-threoninová fosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	25865
	101540
	ENSG00000105287
	ENSMUSG00000041187
	Q9BZL6
	Q8BZ03
	NM_001079880; NM_001079881; NM_001079882; NM_016457
	NM_001252458; NM_178900
	NP_001073349; NP_001073350; NP_001073351; NP_057541
	NP_001239387; NP_849231
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Serin / threonin-protein kináza D2 nebo PKD2 je enzym že u lidí je kódován PRKD2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem patří do protein kináza D (PKD) rodina serin /threonin proteinové kinázy, podrodina protein kináza c. Tuto kinázu lze aktivovat pomocí estery forbolů stejně jako gastrin přes receptor cholecystokininu B. (CCKBR) v buňkách rakoviny žaludku. Může se vázat diacylglycerol (DAG) v trans-Golgiho síť (TGN) a může regulovat bazolaterální membrána výstup bílkovin z TGN. Alternativní sestřih má za následek více variant přepisu kódujících různé izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105287 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041187 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (listopad 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ Sturany S, Van Lint J, Muller F, Wilda M, Hameister H, Hocker M, Brey A, Gern U, Vandenheede J, Gress T, Adler G, Seufferlein T (květen 2001). "Molekulární klonování a charakterizace lidské proteinové kinázy D2. Nový člen rodiny proteinových kináz D serinových threoninových kináz". J Biol Chem. 276 (5): 3310–8. doi:10,1074 / jbc.M008719200. PMID 11062248.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PRKD2 protein kinase D2“.

Další čtení

Sturany S, Van Lint J, Gilchrist A a kol. (2002). "Mechanismus aktivace proteinkinázy D2 (PKD2) receptorem CCK (B) / gastrin". J. Biol. Chem. 277 (33): 29431–6. doi:10,1074 / jbc.M200934200. PMID 12058027.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Rey O, Yuan J, Rozengurt E (2003). „Intracelulární redistribuce proteinkinázy D2 v reakci na agonisty receptoru spřaženého s G-proteinem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 302 (4): 817–24. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00269-9. PMID 12646243.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Yeaman C, Ayala MI, Wright JR a kol. (2004). „Protein kináza D reguluje výstup bazolaterální membránové bílkoviny ze sítě trans-Golgi“. Nat. Cell Biol. 6 (2): 106–12. doi:10.1038 / ncb1090. PMC 3372901. PMID 14743217.
Mihailovic T, Marx M, Auer A a kol. (2005). „Proteinkináza D2 zprostředkovává aktivaci nukleárního faktoru kappaB pomocí Bcr-Abl v buňkách Bcr-Abl + lidské myeloidní leukémie“. Cancer Res. 64 (24): 8939–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-0981. PMID 15604256.
Parra M, Kasler H, McKinsey TA a kol. (2005). „Protein kináza D1 fosforyluje HDAC7 a indukuje jeho jaderný export po aktivaci receptoru T-buněk“. J. Biol. Chem. 280 (14): 13762–70. doi:10,1074 / jbc.M413396200. PMID 15623513.
Auer A, von Blume J, Sturany S a kol. (2006). „Role regulační domény proteinkinázy D2 ve vazbě forbolesteru, katalytické aktivitě a nukleocytoplazmatickém pendlování“. Mol. Biol. Buňka. 16 (9): 4375–85. doi:10,1091 / mbc.E05-03-0251. PMC 1196345. PMID 15975900.
Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globální fosfoproteom buněk HT-29 humánního adenokarcinomu tlustého střeva". J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. doi:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Jackson LN, Li J, Chen LA a kol. (2006). „Nadměrná exprese divokého typu PKD2 vede ke zvýšené proliferaci a invazi endokrinních buněk BON“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 348 (3): 945–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.07.142. PMC 2430871. PMID 16899224.
Chiu TT, Leung WY, Moyer MP a kol. (2007). „Proteinkináza D2 zprostředkovává produkci interleukinu 8 indukovanou kyselinou lysofosfatidovou v netransformovaných lidských epitelových buňkách tlustého střeva prostřednictvím NF-kappaB“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 292 (2): C767–77. doi:10.1152 / ajpcell.00308.2006. PMID 16928771.
Irie A, Harada K, Tsukamoto H a kol. (2007). „Protein kináza D2 přispívá buď k regulaci promotoru IL-2, nebo k indukci buněčné smrti po stimulaci TCR v závislosti na jeho aktivitě v buňkách Jurkat.“. Int. Immunol. 18 (12): 1737–47. doi:10.1093 / intimm / dxl108. PMID 17077180.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Kollers S, Musilova P, Rubes J, Rocha D (2007). "Srovnávací mapování odhaluje mnohonásobné přeskupení mezi prasatovým chromozomem 6 a lidským 19q13". Anim. Genet. 37 (6): 595–6. doi:10.1111 / j.1365-2052.2006.01516.x. PMID 17121608.
Wissing J, Jänsch L, Nimtz M a kol. (2007). „Proteomická analýza proteinových kináz metodou selektivní prefrakce cílové třídy a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Mol. Buňka. Proteomika. 6 (3): 537–47. doi:10,1074 / mcp. T600062-MCP200. PMID 17192257.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105287 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041187 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11042152-5] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (listopad 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

[pmid11062248-6] Sturany S, Van Lint J, Muller F, Wilda M, Hameister H, Hocker M, Brey A, Gern U, Vandenheede J, Gress T, Adler G, Seufferlein T (květen 2001). "Molekulární klonování a charakterizace lidské proteinové kinázy D2. Nový člen rodiny proteinových kináz D serinových threoninových kináz". J Biol Chem. 276 (5): 3310–8. doi:10,1074 / jbc.M008719200. PMID 11062248.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PRKD2 protein kinase D2“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )