PASK - PASK - Wikipedia

PASK
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1LL8, 3DLS
Identifikátory
Aliasy	PASK, PASKIN, STK37, doména PAS obsahující serin / threonin kinázu
Externí ID	OMIM: 607505 MGI: 2155936 HomoloGene: 9038 Genové karty: PASK
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	241,150,264 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	93,343,482 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• kinázová aktivita; • aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba fosfatidylinositolu; • vazba lipidů; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • cytosol; • cytoplazma;
Biologický proces	• regulace respirační plynné výměny; • autofosforylace; • negativní regulace procesu biosyntézy glykogenu; • pozitivní regulace překladu; • regulace sekrece glukagonu; • fosforylace; • fosforylace bílkovin; • energetická homeostáza; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23178
	269224
	ENSG00000115687
	ENSMUSG00000026274
	Q96RG2
	Q8CEE6
	NM_001252119; NM_001252120; NM_001252122; NM_001252124; NM_015148
	NM_080850
	NP_001239048; NP_001239049; NP_001239051; NP_001239053; NP_055963
	NP_543126
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Serin / threonin-protein kináza obsahující PAS doménu je enzym že u lidí je kódován PASK gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Domény PAS regulují funkci mnoha intracelulární signální dráhy v reakci na vnější i vnitřní podněty. PASK je evolučně konzervovaný protein přítomný v droždí, letí, a savci. [dodává OMIM]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115687 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026274 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hofer T, Spielmann P, Stengel P, Stier B, Katschinski DM, Desbaillets I, Gassmann M, Wenger RH (listopad 2001). „Savčí PASKIN, PAS-serin / threonin kináza související s bakteriálními kyslíkovými senzory“ (PDF). Biochem Biophys Res Commun. 288 (4): 757–64. doi:10.1006 / bbrc.2001.5840. PMID 11688972.
^ Rutter J, Michnoff CH, Harper SM, Gardner KH, McKnight SL (srpen 2001). „PAS kináza: evolučně konzervovaná serin / threonin kináza regulovaná doménou PAS“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (16): 8991–6. doi:10.1073 / pnas.161284798. PMC 55361. PMID 11459942.
^ da Silva Xavier G, Rutter J, Rutter GA (červen 2004). „Podíl Per-Arnt-Sim (PAS) kinázy na stimulaci exprese preproinzulinu a genu homeoboxu 1 v pankreatu duodenum glukózou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (22): 8319–24. doi:10.1073 / pnas.0307737101. PMC 420392. PMID 15148392.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PASK PAS doména obsahující serin / threonin kinázu“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Nagase T, Seki N, Tanaka A a kol. (1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Ceulemans H, Van Eynde A, Pérez-Callejón E a kol. (1999). „Struktura a produkty sestřihu lidského genu kódujícího sds22, domnělý mitotický regulátor proteinové fosfatázy-1“. Eur. J. Biochem. 262 (1): 36–42. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00344.x. PMID 10231361.
Amezcua CA, Harper SM, Rutter J, Gardner KH (2003). "Struktura a interakce PAS kinázy N-terminální PAS domény: model pro regulaci intramolekulární kinázy". Struktura. 10 (10): 1349–61. doi:10.1016 / S0969-2126 (02) 00857-2. PMID 12377121.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Eckhardt K, Troger J, Reissmann J a kol. (2007). "Exprese mužské zárodečné buňky kinázy PAS domény PASKIN a jejího nového cílového eukaryotického translačního elongačního faktoru eEF1A1". Buňka. Physiol. Biochem. 20 (1–4): 227–40. doi:10.1159/000104169. PMID 17595531.
Kikani CK, Antonysamy SA, Bonanno JB, et al. (2010). „Strukturní základy aktivace kinázy regulované doménou PAS (PASK) při absenci fosforylace aktivační smyčky“. J. Biol. Chem. 285 (52): 41034–43. doi:10.1074 / jbc.M110.157594. PMC 3003402. PMID 20943661.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115687 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026274 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11688972-5] Hofer T, Spielmann P, Stengel P, Stier B, Katschinski DM, Desbaillets I, Gassmann M, Wenger RH (listopad 2001). „Savčí PASKIN, PAS-serin / threonin kináza související s bakteriálními kyslíkovými senzory“ (PDF). Biochem Biophys Res Commun. 288 (4): 757–64. doi:10.1006 / bbrc.2001.5840. PMID 11688972.

[pmid11459942-6] Rutter J, Michnoff CH, Harper SM, Gardner KH, McKnight SL (srpen 2001). „PAS kináza: evolučně konzervovaná serin / threonin kináza regulovaná doménou PAS“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (16): 8991–6. doi:10.1073 / pnas.161284798. PMC 55361. PMID 11459942.

[pmid15148392-7] Silva Xavier G, Rutter J, Rutter GA (červen 2004). „Podíl Per-Arnt-Sim (PAS) kinázy na stimulaci exprese preproinzulinu a genu homeoboxu 1 v pankreatu duodenum glukózou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (22): 8319–24. doi:10.1073 / pnas.0307737101. PMC 420392. PMID 15148392.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: PASK PAS doména obsahující serin / threonin kinázu“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )