Protein kináza D1 - Protein kinase D1

PRKD1
Identifikátory
Aliasy	PRKD1, PKC-MU, PKCM, PKD, PRKCM, protein kináza D1, CHDED
Externí ID	OMIM: 605435 MGI: 99879 HomoloGene: 55680 Genové karty: PRKD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	30,191,898 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	50,649,098 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • aktivita proteinkinázy C.; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • ATP vazba; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy;
Buněčná složka	• Golgiho aparát; • membrána; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • autofagosomová membrána; • cytoplazma; • trans-Golgiho síť; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace endocytózy; • diferenciace buněk; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • regulace stability proteinu; • Golgiho organizace; • fosforylace; • proces imunitního systému; • pozitivní regulace chemotaxe endotelových buněk; • signalizace protein kinázy D.; • sfingolipidový biosyntetický proces; • negativní regulace buněčné smrti; • vývoj nervového systému; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • pozitivní regulace angiogeneze; • pozitivní regulace migrace endotelových buněk; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace aktivity histon-deacetylázy; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru CREB; • signální dráha receptoru pro vaskulární endoteliální růstový faktor; • regulace integrinem zprostředkované signální dráhy; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • angiogeneze; • pozitivní regulace migrace endotelových buněk krevních cév; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • pozitivní regulace chemotaxe endoteliálních buněk signální cestou receptoru pro vaskulární endoteliální růstový faktor aktivovaný VEGF; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • autofosforylace; • buněčná odpověď na oxidační stres; • buněčná odpověď na stimul vaskulárního endoteliálního růstového faktoru; • Transdukce signálu proteinu Ras; • buněčná proliferace; • zánětlivá reakce; • vrozený imunitní systém; • signální transdukce; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • apoptotický proces; • pozitivní regulace autofagie; • buněčná odpověď na hladovění aminokyselin; • pozitivní regulace aktivity 3-kinázy fosfatidylinositolu; • buněčná odpověď na hydroperoxid; • regulace množení keratinocytů; • pozitivní regulace diferenciace osteoblastů; • Transport vezikul Golgi; • peptidyl-serinová fosforylace; • peptidyl-threoninová fosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5587
	18760
	ENSG00000184304
	ENSMUSG00000002688
	Q15139
	Q62101
	NM_002742; NM_001330069; NM_001348390
	NM_008858
	NP_001316998; NP_002733; NP_001335319
	NP_032884; NP_001369743; NP_001369744; NP_001369745
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Serin / threonin-protein kináza D1 je enzym že u lidí je kódován PRKD1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Členové protein kináza D (PKD) rodina funguje v mnoha extracelulárních receptorem zprostředkovaných signálních transdukčních drahách. Gen PRKCM kóduje cytosolickou serin-threonin kinázu, která se váže na trans-Golgiho síť a reguluje štěpení transportních nosičů specificky určených na buněčný povrch. [Dodává OMIM]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že proteinová kináza D1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184304 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002688 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Johannes FJ, Prestle J, Eis S, Oberhagemann P, Pfizenmaier K (duben 1994). „PKCu je nový, atypický člen rodiny proteinových kináz C“. J Biol Chem. 269 (8): 6140–8. PMID 8119958.
^ Owczarek CM, Portbury KJ, Kola I, Hertzog PJ (září 2000). "Přiřazení protein kinázy Cmu (PRKCM) k lidskému chromozomovému pásmu 14q11 s hybridy somatických buněk a hybridy záření". Cytogenet Cell Genet. 89 (3–4): 240–1. doi:10.1159/000015624. PMID 10965134.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PRKD1 protein kináza D1".
^ Johannes FJ, Hausser A, Storz P, Truckenmüller L, Link G, Kawakami T, Pfizenmaier K (listopad 1999). „Brutonova tyrosinkináza (Btk) se asociuje s proteinkinázou Cmu“. FEBS Lett. 461 (1–2): 68–72. doi:10.1016 / s0014-5793 (99) 01424-6. PMID 10561498.
^ ^A ^b Storz P, Hausser A, Link G, Dedio J, Ghebrehiwet B, Pfizenmaier K, Johannes FJ (srpen 2000). „Protein kináza C [mikro] je regulována multifunkčním chaperonovým proteinem p32“. J. Biol. Chem. 275 (32): 24601–7. doi:10,1074 / jbc.M002964200. PMID 10831594.
^ Zemlickova E, Dubois T, Kerai P, Clokie S, Cronshaw AD, Wakefield RI, Johannes FJ, Aitken A (srpen 2003). „Centaurin-alfa (1) se asociuje s a je fosforylován izoformami proteinkinázy C“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307 (3): 459–65. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01187-2. PMID 12893243.
^ Rao PS, Jaggi M, Smith DJ, Hemstreet GP, Balaji KC (říjen 2003). „Metallothionein 2A interaguje s kinázovou doménou PKCmu u rakoviny prostaty“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 310 (3): 1032–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.09.118. PMID 14550308.
^ Hausser A, Storz P, Link G, Stoll H, Liu YC, Altman A, Pfizenmaier K, Johannes FJ (duben 1999). „Protein kináza Cmu je negativně regulována 14-3-3 signálními transdukčními proteiny“. J. Biol. Chem. 274 (14): 9258–64. doi:10.1074 / jbc.274.14.9258. PMID 10092600.

Další čtení

Van Lint J, Rykx A, Maeda Y, Vantus T, Sturany S, Malhotra V, Vandenheede JR, Seufferlein T (2002). "Protein kináza D: regulátor intracelulárního přenosu v pohybu". Trends Cell Biol. 12 (4): 193–200. doi:10.1016 / S0962-8924 (02) 02262-6. PMID 11978539.
Busch H, Eisenhart-Rothe BV (1976). „[Staré a nové nebezpečí transfuze krve (překlad autora)]“ “. MMW, Münchener medizinische Wochenschrift. 118 (22): 713–8. PMID 5668.
Jakobovits A, Rosenthal A, Capon DJ (1990). „Transaktivace genové exprese zaměřené na HIV-1 LTR pomocí tat vyžaduje protein kinázu C“. EMBO J.. 9 (4): 1165–70. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08223.x. PMC 551792. PMID 2182321.
Davis RJ, český poslanec (1985). „Nádory podporující forbol diestery způsobují fosforylaci receptorů epidermálního růstového faktoru v normálních lidských fibroblastech na threoninu-654“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82 (7): 1974–8. doi:10.1073 / pnas.82.7.1974. PMC 397463. PMID 2984676.
Davis RJ, český poslanec (1985). „Růstový faktor odvozený z krevních destiček napodobuje působení forbol diesteru na fosforylaci receptoru epidermálního růstového faktoru na threoninu-654“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82 (12): 4080–4. doi:10.1073 / pnas.82.12.4080. PMC 397938. PMID 2987962.
Conant K, Ma M, Nath A, Major EO (1996). „Extracelulární lidský virus imunodeficience typu 1 Tat protein je spojen se zvýšením jak vazby NF-kappa B, tak aktivity proteinkinázy C v primárních lidských astrocytech“. J. Virol. 70 (3): 1384–9. PMC 189957. PMID 8627654.
Sidorenko SP, Law CL, Klaus SJ, Chandran KA, Takata M, Kurosaki T, Clark EA (1996). „Protein kináza C mu (PKC mu) se asociuje s komplexem receptoru antigenu B buněk a reguluje signalizaci lymfocytů“. Imunita. 5 (4): 353–63. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80261-7. PMID 8885868.
Holmes AM (1996). „In vitro fosforylace proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 proteinovou kinázou C: důkaz fosforylace aminokyselinového zbytku serinu-46“. Oblouk. Biochem. Biophys. 335 (1): 8–12. doi:10.1006 / abbi.1996.0476. PMID 8914829.
Borgatti P, Zauli G, Cantley LC, Capitani S (1998). „Extracelulární HIV-1 Tat protein indukuje rychlou a selektivní aktivaci protein kinázy C (PKC) -alfa a -epsilon a -zeta izoformy v buňkách PC12“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 242 (2): 332–7. doi:10.1006 / bbrc.1997.7877. PMID 9446795.
Zidovetzki R, Wang JL, Chen P, Jeyaseelan R, Hofman F (1998). „Tat protein viru lidské imunodeficience indukuje expresi mRNA interleukinu 6 v endoteliálních buňkách lidského mozku prostřednictvím proteinových kinázových C- a cAMP-závislých proteinových kinázových cest“. AIDS Res. Hučení. Retroviry. 14 (10): 825–33. doi:10.1089 / podpora.1998.14.825. PMID 9671211.
Waldron RT, Iglesias T, Rozengurt E (1999). „Pleckstrinová homologická doména proteinové kinázy D interaguje přednostně s eta izoformou proteinové kinázy C“. J. Biol. Chem. 274 (14): 9224–30. doi:10.1074 / jbc.274.14.9224. PMID 10092595.
Hausser A, Storz P, Link G, Stoll H, Liu YC, Altman A, Pfizenmaier K, Johannes FJ (1999). „Protein kináza Cmu je negativně regulována 14-3-3 signálními transdukčními proteiny“. J. Biol. Chem. 274 (14): 9258–64. doi:10.1074 / jbc.274.14.9258. PMID 10092600.
Jamora C, Yamanouye N, Van Lint J, Laudenslager J, Vandenheede JR, Faulkner DJ, Malhotra V (1999). „Regulace Golgiho organizace zprostředkovaná Gbetagammou je prostřednictvím přímé aktivace proteinkinázy D“. Buňka. 98 (1): 59–68. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80606-6. PMID 10412981.
Bagowski CP, Stein-Gerlach M, Choidas A, Ullrich A (1999). „Specifická fosforylace buněčného typu threoninů T654 a T669 pomocí PKD definuje kapacitu signálu receptoru EGF“. EMBO J.. 18 (20): 5567–76. doi:10.1093 / emboj / 18.20.5567. PMC 1171625. PMID 10523301.
Johannes FJ, Hausser A, Storz P, Truckenmüller L, Link G, Kawakami T, Pfizenmaier K (1999). „Brutonova tyrosinkináza (Btk) se asociuje s proteinkinázou Cmu“. FEBS Lett. 461 (1–2): 68–72. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01424-6. PMID 10561498.
Storz P, Hausser A, Link G, Dedio J, Ghebrehiwet B, Pfizenmaier K, Johannes FJ (2000). „Protein kináza C [mikro] je regulována multifunkčním chaperonovým proteinem p32“. J. Biol. Chem. 275 (32): 24601–7. doi:10,1074 / jbc.M002964200. PMID 10831594.
Mayne M, Holden CP, Nath A, Geiger JD (2000). „Uvolňování vápníku z zásob regulovaných inositol 1,4,5-trisfosfátovými receptory pomocí HIV-1 Tat reguluje produkci TNF-alfa v lidských makrofágech“. J. Immunol. 164 (12): 6538–42. doi:10,4049 / jimmunol.164.12.6538. PMID 10843712.
Matthews SA, Iglesias T, Rozengurt E, Cantrell D (2000). "Prostorová a časová regulace protein kinázy D (PKD)". EMBO J.. 19 (12): 2935–45. doi:10.1093 / emboj / 19.12.2935. PMC 203351. PMID 10856238.
Vertommen D, Rider M, Ni Y, Waelkens E, Merlevede W, Vandenheede JR, Van Lint J (2000). „Regulace proteinkinázy D multisite fosforylací. Identifikace fosforylačních míst hmotnostní spektrometrií a charakterizace místně cílenou mutagenezí“. J. Biol. Chem. 275 (26): 19567–76. doi:10,1074 / jbc.M001357200. PMID 10867018.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184304 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002688 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8119958-5] Johannes FJ, Prestle J, Eis S, Oberhagemann P, Pfizenmaier K (duben 1994). „PKCu je nový, atypický člen rodiny proteinových kináz C“. J Biol Chem. 269 (8): 6140–8. PMID 8119958.

[pmid10965134-6] Owczarek CM, Portbury KJ, Kola I, Hertzog PJ (září 2000). "Přiřazení protein kinázy Cmu (PRKCM) k lidskému chromozomovému pásmu 14q11 s hybridy somatických buněk a hybridy záření". Cytogenet Cell Genet. 89 (3–4): 240–1. doi:10.1159/000015624. PMID 10965134.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: PRKD1 protein kináza D1".

[pmid10561498-8] Johannes FJ, Hausser A, Storz P, Truckenmüller L, Link G, Kawakami T, Pfizenmaier K (listopad 1999). „Brutonova tyrosinkináza (Btk) se asociuje s proteinkinázou Cmu“. FEBS Lett. 461 (1–2): 68–72. doi:10.1016 / s0014-5793 (99) 01424-6. PMID 10561498.

[pmid10831594-9] A ^b Storz P, Hausser A, Link G, Dedio J, Ghebrehiwet B, Pfizenmaier K, Johannes FJ (srpen 2000). „Protein kináza C [mikro] je regulována multifunkčním chaperonovým proteinem p32“. J. Biol. Chem. 275 (32): 24601–7. doi:10,1074 / jbc.M002964200. PMID 10831594.

[pmid12893243-10] Zemlickova E, Dubois T, Kerai P, Clokie S, Cronshaw AD, Wakefield RI, Johannes FJ, Aitken A (srpen 2003). „Centaurin-alfa (1) se asociuje s a je fosforylován izoformami proteinkinázy C“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307 (3): 459–65. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01187-2. PMID 12893243.

[pmid14550308-11] Rao PS, Jaggi M, Smith DJ, Hemstreet GP, Balaji KC (říjen 2003). „Metallothionein 2A interaguje s kinázovou doménou PKCmu u rakoviny prostaty“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 310 (3): 1032–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.09.118. PMID 14550308.

[pmid10092600-12] Hausser A, Storz P, Link G, Stoll H, Liu YC, Altman A, Pfizenmaier K, Johannes FJ (duben 1999). „Protein kináza Cmu je negativně regulována 14-3-3 signálními transdukčními proteiny“. J. Biol. Chem. 274 (14): 9258–64. doi:10.1074 / jbc.274.14.9258. PMID 10092600.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )