TSC22D3 - TSC22D3

TSC22D3
Identifikátory
Aliasy	TSC22D3, DIP, DSIPI, GILZ, TSC-22R, hDIP, TSC22 člen rodiny domény 3
Externí ID	OMIM: 300506 MGI: 1196284 HomoloGene: 104035 Genové karty: TSC22D3
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	107,777,342 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	140,600,659 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba MRF; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytosol; • cytoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• reakce na osmotický stres; • iontový transmembránový transport; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace vývoje tkáně kosterního svalstva; • negativní regulace aktivací indukované buněčné smrti T buněk; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1831
	14605
	ENSG00000157514
	ENSMUSG00000031431
	Q99576
	Q9Z2S7
	NM_001015881; NM_004089; NM_198057; NM_001318468; NM_001318470
	NM_001077364; NM_010286
	NP_001015881; NP_001305397; NP_001305399; NP_004080; NP_932174
	NP_001070832; NP_034416
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein rodiny TSC22 domény 3 je protein že u lidí je kódován TSC22D3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem sdílí významnou sekvenční identitu s myšími TSC-22 a Drosophila shs, což jsou proteiny leucinového zipu, které fungují jako regulátory transkripce. GILZ vykazuje všudypřítomnou expresi napříč tkáněmi, včetně brzlíku, sleziny, plic, tuků, jater, ledvin, srdce a kosterního svalstva.^[7]^[8] Exprese tohoto genu je stimulována glukokortikoidy a interleukinem 10 a zdá se, že hraje klíčovou roli v protizánětlivých a imunosupresivních účincích tohoto steroidu a chemokinu. Pro tento gen byly identifikovány varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[6]

Interakce

TSC22D3 bylo prokázáno komunikovat s C-Raf,^[9] NFKB2^[10] a NFKB1.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157514 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031431 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vogel P, Mägert HJ, Cieslak A, Adermann K, Forssmann WG (prosinec 1996). „hDIP - potenciální regulátor transkripce související s myší TSC-22 a krátkozrakou Drosophila (shs) - je exprimován ve velkém počtu lidských tkání“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1309 (3): 200–4. doi:10.1016 / s0167-4781 (96) 00177-7. PMID 8982256.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TSC22D3 TSC22 doménová rodina, člen 3“.
^ Ayyar, Vivaswath S .; Almon, Richard R .; Jusko, William J .; DuBois, Debra C. (06.06.2015). "Kvantitativní tkáňově specifická dynamika in vivo exprese a regulace mRNA GILZ pomocí endogenních a exogenních glukokortikoidů". Fyziologické zprávy. 3 (6): e12382. doi:10,14814 / phy2.12382. PMC 4510616. PMID 26056061.
^ Cannarile, L .; Zollo, O .; D'Adamio, F .; Ayroldi, E .; Marchetti, C .; Tabilio, A .; Bruscoli, S .; Riccardi, C. (2001-02-01). „Klonování, přiřazení chromozomů a tkáňová distribuce lidského GILZ, genu indukovaného glukokortikoidním hormonem“. Buněčná smrt a diferenciace. 8 (2): 201–203. doi:10.1038 / sj.cdd.4400798. ISSN 1350-9047. PMID 11313722.
^ Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (listopad 2002). „Glukokortikoidy indukovaný leucinový zip inhibuje kinázovou dráhu regulovanou Raf-extracelulárním signálem vazbou na Raf-1“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (22): 7929–41. doi:10.1128 / MCB.22.22.7929-7941.2002. PMC 134721. PMID 12391160.
^ ^A ^b Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (srpen 2001). "Modulace aktivace T-buněk glukokortikoidem indukovaným leucinovým zipovým faktorem prostřednictvím inhibice nukleárního faktoru kappaB". Krev. 98 (3): 743–53. doi:10.1182 / krev. V98.3.743. PMID 11468175.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Cannarile L, Zollo O, D'Adamio F, Ayroldi E, Marchetti C, Tabilio A, Bruscoli S, Riccardi C (únor 2001). „Klonování, přiřazení chromozomů a tkáňová distribuce lidského GILZ, genu indukovaného glukokortikoidním hormonem“. Buněčná smrt a diferenciace. 8 (2): 201–3. doi:10.1038 / sj.cdd.4400798. PMID 11313722.
Mittelstadt PR, Ashwell JD (srpen 2001). „Inhibice AP-1 glukokortikoidy indukovatelným proteinem GILZ“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (31): 29603–10. doi:10,1074 / jbc.M101522200. PMID 11397794.
Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (srpen 2001). „Modulace aktivace T-buněk glukokortikoidy indukovaným faktorem leucinového zipu prostřednictvím inhibice nukleárního faktoru kappaB“. Krev. 98 (3): 743–53. doi:10.1182 / krev. V98.3.743. PMID 11468175.
Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (listopad 2002). „Glukokortikoidy indukovaný leucinový zip inhibuje kinázovou dráhu regulovanou Raf-extracelulárním signálem vazbou na Raf-1“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (22): 7929–41. doi:10.1128 / MCB.22.22.7929-7941.2002. PMC 134721. PMID 12391160.
Berrebi D, Bruscoli S, Cohen N, Foussat A, Migliorati G, Bouchet-Delbos L, Maillot MC, Portier A, Couderc J, Galanaud P, Peuchmaur M, Riccardi C, Emilie D (leden 2003). „Syntéza leucinového zipu (GILZ) indukovaného glukokortikoidy makrofágy: protizánětlivý a imunosupresivní mechanismus sdílený glukokortikoidy a IL-10“. Krev. 101 (2): 729–38. doi:10.1182 / krev-2002-02-0538. PMID 12393603.
Shi X, Shi W, Li Q, Song B, Wan M, Bai S, Cao X (duben 2003). „Protein leucinu a zipu indukovaný glukokortikoidy, GILZ, inhibuje adipogenezi mezenchymálních buněk“. Zprávy EMBO. 4 (4): 374–80. doi:10.1038 / sj.embor.embor805. PMC 1319161. PMID 12671681.
Asselin-Labat ML, David M, Biola-Vidamment A, Lecoeuche D, Zennaro MC, Bertoglio J, Pallardy M (červenec 2004). „GILZ, nový cíl transkripčního faktoru FoxO3, chrání T lymfocyty před apoptózou vyvolanou vysazením interleukinu-2“. Krev. 104 (1): 215–23. doi:10.1182 / krev-2003-12-4295. PMID 15031210.
Asselin-Labat ML, Biola-Vidamment A, Kerbrat S, Lombès M, Bertoglio J, Pallardy M (červenec 2005). „FoxO3 zprostředkovává antagonistické účinky glukokortikoidů a interleukinu-2 na expresi leucinového zipu vyvolanou glukokortikoidy“. Molekulární endokrinologie. 19 (7): 1752–64. doi:10.1210 / me.2004-0206. PMID 15705665.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Soundararajan R, Zhang TT, Wang J, Vandewalle A, Pearce D (prosinec 2005). „Nová role pro leucinový zipový protein indukovaný glukokortikoidy v transportu sodíku zprostředkovaném epitelovým sodíkovým kanálem“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (48): 39970–81. doi:10,1074 / jbc.M508658200. PMID 16216878.
Hamdi H, Godot V, Maillot MC, Prejean MV, Cohen N, Krzysiek R, Lemoine FM, Zou W, Emilie D (červenec 2007). „Indukce antigenově specifických regulačních T lymfocytů lidskými dendritickými buňkami exprimujícími leucinový zip indukovaný glukokortikoidy“. Krev. 110 (1): 211–9. doi:10.1182 / krev-2006-10-052506. PMC 2077304. PMID 17356131.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157514 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031431 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8982256-5] Vogel P, Mägert HJ, Cieslak A, Adermann K, Forssmann WG (prosinec 1996). „hDIP - potenciální regulátor transkripce související s myší TSC-22 a krátkozrakou Drosophila (shs) - je exprimován ve velkém počtu lidských tkání“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1309 (3): 200–4. doi:10.1016 / s0167-4781 (96) 00177-7. PMID 8982256.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TSC22D3 TSC22 doménová rodina, člen 3“.

[7] Ayyar, Vivaswath S .; Almon, Richard R .; Jusko, William J .; DuBois, Debra C. (06.06.2015). "Kvantitativní tkáňově specifická dynamika in vivo exprese a regulace mRNA GILZ pomocí endogenních a exogenních glukokortikoidů". Fyziologické zprávy. 3 (6): e12382. doi:10,14814 / phy2.12382. PMC 4510616. PMID 26056061.

[8] Cannarile, L .; Zollo, O .; D'Adamio, F .; Ayroldi, E .; Marchetti, C .; Tabilio, A .; Bruscoli, S .; Riccardi, C. (2001-02-01). „Klonování, přiřazení chromozomů a tkáňová distribuce lidského GILZ, genu indukovaného glukokortikoidním hormonem“. Buněčná smrt a diferenciace. 8 (2): 201–203. doi:10.1038 / sj.cdd.4400798. ISSN 1350-9047. PMID 11313722.

[pmid12391160-9] Ayroldi E, Zollo O, Macchiarulo A, Di Marco B, Marchetti C, Riccardi C (listopad 2002). „Glukokortikoidy indukovaný leucinový zip inhibuje kinázovou dráhu regulovanou Raf-extracelulárním signálem vazbou na Raf-1“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (22): 7929–41. doi:10.1128 / MCB.22.22.7929-7941.2002. PMC 134721. PMID 12391160.

[pmid11468175-10] A ^b Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (srpen 2001). "Modulace aktivace T-buněk glukokortikoidem indukovaným leucinovým zipovým faktorem prostřednictvím inhibice nukleárního faktoru kappaB". Krev. 98 (3): 743–53. doi:10.1182 / krev. V98.3.743. PMID 11468175.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]