CDH16 - CDH16

CDH16
Identifikátory
Aliasy	CDH16, kadherin 16
Externí ID	OMIM: 603118 MGI: 106671 HomoloGene: 2997 Genové karty: CDH16
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	66,918,917 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	104,624,396 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • bazolaterální plazmatická membrána;
Biologický proces	• adheze buněk na buňkách závislých na vápníku prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • buněčná adheze; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • signalizace buňka-buňka; • vývoj nervového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1014
	12556
	ENSG00000166589
	ENSMUSG00000031881
	O75309
	O88338
	NM_001204744; NM_001204745; NM_001204746; NM_004062
	NM_001252627; NM_001252628; NM_007663
	NP_001191673; NP_001191674; NP_001191675; NP_004053
	NP_001239556; NP_001239557; NP_031689
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kadherin-16 je protein, který je u lidí kódován CDH16 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je členem kadherin nadčeleď, geny kódující na vápníku závislé, spojené s membránou glykoproteiny. Mapováno na dříve identifikovaný shluk genů kadherinu chromozom 16q 22.1, gen se lokalizuje u členů nadčeledi CDH1, CDH3, CDH5, CDH8 a CDH11. Protein se skládá z extracelulární doména obsahující 6 kadherinových domén, a transmembránová oblast a zkrácen cytoplazmatický doména, ale chybí důslednost a tripeptid Sekvence rozpoznávání adheze HAV typická pro většinu klasických kadherinů. Exprese je výlučně v ledvinách, kde protein funguje jako hlavní mediátor homotypického buněčného rozpoznávání a hraje roli v morfogenní směr vývoje tkáně.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166589 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031881 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Thomson RB, Ward DC, Quaggin SE, Igarashi P, Muckler ZE, Aronson PS (říjen 1998). "cDNA klonování a chromozomální lokalizace lidských a myších izoforem Ksp-kadherinu". Genomika. 51 (3): 445–51. doi:10.1006 / geno.1998.5402. PMID 9721215.
^ Thomson RB, Igarashi P, Biemesderfer D, Kim R, Abu-Alfa A, Soleimani M, Aronson PS (srpen 1995). „Izolace a cDNA klonování Ksp-kadherinu, nového člena ledvin specifické pro skupinu multigenů kadherinu“. J Biol Chem. 270 (29): 17594–601. doi:10.1074 / jbc.270.29.17594. PMID 7615566.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CDH16 cadherin 16, KSP-cadherin“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Thomson RB, Aronson PS (1999). "Imunolokalizace Ksp-kadherinu u dospělých a vyvíjející se králičí ledviny". Dopoledne. J. Physiol. 277 (1 Pt 2): F146–56. doi:10.1152 / ajprenal.1999.277.1.F146. PMID 10409308.
Baudry D, Jeanpierre C (2000). "Přiřazení E-kadherinu (CDH1) a KSP-kadherinu (CDH16) k chromozomu 16q22.1 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet. Cell Genet. 88 (3–4): 253–4. doi:10.1159/000015531. PMID 10828602. S2CID 83989085.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Thomson RB, Mentone S, Kim R a kol. (2003). "Histopatologická analýza renálních cystických epitelů v modelu Pkd2WS25 / - myši ADPKD". Dopoledne. J. Physiol. Renal Physiol. 285 (5): F870–80. doi:10.1152 / ajprenal.00153.2003. PMID 12851251.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování sekretovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Wendeler MW, Praus M, Jung R a kol. (2004). „Ksp-kadherin je funkční molekula adheze buněk k buňkám související s LI-kadherinem“. Exp. Cell Res. 294 (2): 345–55. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.022. PMID 15023525.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hishikawa K, Marumo T, Miura S a kol. (2005). „Inhibiční faktor leukémie indukuje víceřádkovou diferenciaci dospělých kmenových buněk v ledvinách prostřednictvím ledvinově specifického kadherinu 16“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328 (1): 288–91. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.12.167. PMID 15670782.
Thedieck C, Kuczyk M, Klingel K a kol. (2005). "Exprese Ksp-kadherinu během vývoje ledvin a v karcinomu ledvinových buněk". Br. J. Cancer. 92 (11): 2010–7. doi:10.1038 / sj.bjc.6602597. PMC 2361784. PMID 15886705.
Kuehn A, Paner GP, Skinnider BF a kol. (2007). „Expresní analýza kadherinu specifického pro ledviny v širokém spektru tradičních a nově rozpoznaných renálních epiteliálních novotvarů: diagnostické a histogenetické důsledky“. Dopoledne. J. Surg. Pathol. 31 (10): 1528–33. doi:10.1097 / PAS.0b013e318058818c. PMID 17895753. S2CID 46401984.

externí odkazy

CDH16 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CDH16 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166589 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031881 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9721215-5] Thomson RB, Ward DC, Quaggin SE, Igarashi P, Muckler ZE, Aronson PS (říjen 1998). "cDNA klonování a chromozomální lokalizace lidských a myších izoforem Ksp-kadherinu". Genomika. 51 (3): 445–51. doi:10.1006 / geno.1998.5402. PMID 9721215.

[pmid7615566-6] Thomson RB, Igarashi P, Biemesderfer D, Kim R, Abu-Alfa A, Soleimani M, Aronson PS (srpen 1995). „Izolace a cDNA klonování Ksp-kadherinu, nového člena ledvin specifické pro skupinu multigenů kadherinu“. J Biol Chem. 270 (29): 17594–601. doi:10.1074 / jbc.270.29.17594. PMID 7615566.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CDH16 cadherin 16, KSP-cadherin“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]