CDH6 - CDH6

CDH6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3LND
Identifikátory
Aliasy	CDH6, CAD6, KCAD, kadherin 6
Externí ID	OMIM: 603007 MGI: 107435 HomoloGene: 21027 Genové karty: CDH6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	31,329,146 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	13,173,675 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • vazba cytoskeletálního proteinu; • aktivita homodimerizace proteinu; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná membrána; • membrána; • povrch buňky; • komplex katenin;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • buněčná adheze; • dodržuje organizaci spojení; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • sestava spojení buňka-buňka; • adheze buněk na buňkách závislých na vápníku prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • buněčná adheze zprostředkovaná kadherinem; • buněčná adheze; • buněčná morfogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1004
	12563
	ENSG00000113361
	ENSMUSG00000039385
	P55285
	P97326
	NM_004932; NM_001362435
	NM_007666
	NP_004923; NP_001349364
	NP_031692
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kadherin-6 je protein že u lidí je kódován CDH6 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje klasiku typu II kadherin z nadrodiny kadherinů. Zakódováno membránový protein je závislá na vápníku adheze buňka-buňka glykoprotein složený z pěti extracelulární kadherin opakuje, a transmembránový regionu a vysoce konzervativní cytoplazmatický ocas. Kadheriny zprostředkovávají vazbu buněk na buňky homofilním způsobem, což přispívá k třídění heterogenních typů buněk a udržování uspořádaných struktur, jako jsou epitel. V buněčných liniích hepatocelulárního a renálního karcinomu byla pozorována silná transkripční exprese tohoto genu, což naznačuje možnou roli v metastáza a invaze.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113361 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039385 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shimoyama Y, Gotoh M, Terasaki T, Kitajima M, Hirohashi S (červen 1995). "Izolace a sekvenční analýza komplementární DNA lidského kadherinu-6 pro úplnou kódující sekvenci a její expresi v buňkách lidského karcinomu". Cancer Res. 55 (10): 2206–11. PMID 7743525.
^ Chalmers IJ, Hofler H, Atkinson MJ (červen 1999). "Mapování kadherinového genového klastru na oblast chromozomu 5, která je často postižena alelickým karcinomem". Genomika. 57 (1): 160–3. doi:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CDH6 kadherin 6, typ 2, K-kadherin (plodová ledvina)“.

Další čtení

MacCalman CD, Getsios S, Chen GT (1998). "Kadheriny typu 2 v lidském endometriu a placentě: jejich domnělé role v implantaci a placentaci člověka". Dopoledne. J. Reprod. Immunol. 39 (2): 96–107. doi:10.1111 / j.1600-0897.1998.tb00341.x. PMID 9506208. S2CID 23871813.
Suzuki S, Sano K, Tanihara H (1991). „Rozmanitost rodiny kadherinů: důkazy o osmi nových kadherinech v nervové tkáni“. Cell Regul. 2 (4): 261–70. doi:10,1091 / mbc. 2.4.461. PMC 361775. PMID 2059658.
Paul R, Ewing CM, Robinson JC a kol. (1997). "Cadherin-6, buněčná adhezní molekula specificky exprimovaná v proximálním renálním tubulu a karcinomu ledvinových buněk". Cancer Res. 57 (13): 2741–8. PMID 9205085.
Getsios S, Chen GT, Stephenson MD a kol. (1998). "Regulovaná exprese kadherinu-6 a kadherinu-11 v žlázových epiteliálních a stromálních buňkách lidského endometria". Dev. Dyn. 211 (3): 238–47. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199803) 211: 3 <238 :: AID-AJA5> 3.0.CO; 2-I. PMID 9520111.
Kremmidiotis G, Baker E, Crawford J a kol. (1998). „Lokalizace lidských genů kadherinu do oblastí chromozomů vykazujících ztrátu heterozygotnosti související s rakovinou“. Genomika. 49 (3): 467–71. doi:10.1006 / geno.1998.5281. PMID 9615235.
Shimoyama Y, Takeda H, Yoshihara S a kol. (1999). „Biochemická charakterizace a funkční analýza dvou klasických kadherinů typu II, kadherinu-6 a -14, a srovnání s E-kadherinem“. J. Biol. Chem. 274 (17): 11987–94. doi:10.1074 / jbc.274.17.11987. PMID 10207020.
Shimoyama Y, Tsujimoto G, Kitajima M, Natori M (2001). „Identifikace tří lidských klasických kadherinů typu II a časté heterofilní interakce mezi různými podtřídami klasických kadherinů typu II“. Biochem. J. 349 (Pt 1): 159–67. doi:10.1042/0264-6021:3490159. PMC 1221133. PMID 10861224.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Liu T, Qian WJ, Gritsenko MA a kol. (2006). „Analýza N-glykoproteomu lidské plazmy odečtením imunoafinity, chemií hydrazidů a hmotnostní spektrometrií“. J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. doi:10.1021 / pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

externí odkazy

CDH6 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CDH6 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113361 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039385 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7743525-5] Shimoyama Y, Gotoh M, Terasaki T, Kitajima M, Hirohashi S (červen 1995). "Izolace a sekvenční analýza komplementární DNA lidského kadherinu-6 pro úplnou kódující sekvenci a její expresi v buňkách lidského karcinomu". Cancer Res. 55 (10): 2206–11. PMID 7743525.

[pmid10191097-6] Chalmers IJ, Hofler H, Atkinson MJ (červen 1999). "Mapování kadherinového genového klastru na oblast chromozomu 5, která je často postižena alelickým karcinomem". Genomika. 57 (1): 160–3. doi:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CDH6 kadherin 6, typ 2, K-kadherin (plodová ledvina)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]