CDH3 (gen) - CDH3 (gene)

CDH3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4OY9
Identifikátory
Aliasy	CDH3, CDHP, HJMD, PCAD, kadherin 3
Externí ID	OMIM: 114021 MGI: 88356 HomoloGene: 20425 Genové karty: CDH3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	68,722,616 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	106,557,297 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • vazba kovových iontů; • molekulární funkce; • vazba cytoskeletálního proteinu; • aktivita homodimerizace proteinu; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • povrch buňky; • komplex katenin;
Biologický proces	• proces vlasového cyklu; • pozitivní regulace množení keratinocytů; • negativní regulace načasování katagenu; • reakce na podnět; • keratinizace; • hojení ran; • regulace vlasového cyklu kanonickou signální cestou Wnt; • negativní regulace produkce transformujícího růstového faktoru beta2; • pozitivní regulace aktivity monofenolmonooxygenázy; • homeostáza sítnice; • pozitivní regulace genové exprese; • buněčná adheze; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru růstového faktoru podobného inzulínu; • kanonická signální cesta Wnt; • pozitivní regulace procesu biosyntézy melaninu; • pozitivní regulace transportu melanosomu; • dodržuje organizaci spojení; • reakce na drogu; • Vizuální vnímání; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • buněčná adheze; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • sestava spojení buňka-buňka; • adheze buněk na buňkách závislých na vápníku prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • buněčná adheze zprostředkovaná kadherinem; • buněčná morfogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1001
	12560
	ENSG00000062038
	ENSMUSG00000061048
	P22223
	P10287
	NM_001793; NM_001317195; NM_001317196
	NM_001037809; NM_007665
	NP_001304124; NP_001304125; NP_001784
	NP_001032898; NP_031691
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kadherin-3, také známý jako P-kadherin, je protein že u lidí je kódován CDH3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je klasický kadherin z nadrodiny kadherinů. Kódovaný protein je na vápníku závislý glykoprotein adheze mezi buňkami složený z pěti extracelulárních opakování kadherinu, transmembránové oblasti a vysoce konzervované cytoplazmatický ocas. Tento gen je umístěn v klastru šesti kadherinů v oblasti na dlouhém rameni chromozomu 16, která se podílí na ztrátě heterozygotních příhod u rakoviny prsu a prostaty. Aberantní exprese tohoto proteinu je navíc pozorována u cervikálních adenokarcinomů.

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly spojeny s vrozenými hypotrichóza s juvenilní makulární dystrofií.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že CDH3 (gen) komunikovat s:

Viz také

EEM syndrom

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000062038 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061048 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kaupmann K, Becker-Follmann J, Scherer G, Jockusch H, Starzinski-Powitz A (říjen 1992). „Gen pro molekulu M-kadherinu buněčné adheze se mapuje na myší chromozom 8 a lidský chromozom 16q24.1-qter a je u obou druhů v blízkosti lokusu E-kadherinu (uvomorulinu)“. Genomika. 14 (2): 488–90. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2. PMID 1427864.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CDH3 kadherin 3, typ 1, P-kadherin (placentární)“.
^ ^A ^b ^C ^d Klingelhöfer J, Troyanovsky RB, Laur OY, Troyanovsky S (srpen 2000). „Aminoterminální doména klasických kadherinů určuje specifičnost adhezivních interakcí“. Journal of Cell Science. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.
^ ^A ^b Schmeiser K, Grand RJ (duben 1999). „Osud E- a P-kadherinu v raných fázích apoptózy“. Buněčná smrt a diferenciace. 6 (4): 377–86. doi:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.
^ Lehtonen S, Lehtonen E, Kudlicka K, Holthöfer H, Farquhar MG (září 2004). „Nephrin tvoří komplex s adherenskými spojovacími proteiny a CASK v podocytech a v psích ledvinových buňkách Madin-Darby exprimujících nefrin“. American Journal of Pathology. 165 (3): 923–36. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8. PMC 1618613. PMID 15331416.

Další čtení

Herrenknecht K, Ozawa M, Eckerskorn C, Lottspeich F, Lenter M, Kemler R (říjen 1991). „Uvomorulin-kotvící protein alfa katenin je vinculinový homolog“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 88 (20): 9156–60. doi:10.1073 / pnas.88.20.9156. PMC 52671. PMID 1924379.
Shimoyama Y, Hirohashi S, Hirano S, Noguchi M, Shimosato Y, Takeichi M, Abe O (duben 1989). "Kadherinové buněčné adhezní molekuly v lidských epiteliálních tkáních a karcinomech". Výzkum rakoviny. 49 (8): 2128–33. PMID 2702654.
Shimoyama Y, Yoshida T, Terada M, Shimosato Y, Abe O, Hirohashi S (říjen 1989). "Molekulární klonování lidské Ca2 + -dependentní molekuly adheze buněk k buňkám homologní s myším placentárním kadherinem: jeho nízká exprese v lidských placentárních tkáních". The Journal of Cell Biology. 109 (4 Pt 1): 1787–94. doi:10.1083 / jcb.109.4.1787. PMC 2115800. PMID 2793940.
Palacios J, Benito N, Pizarro A, Suárez A, Espada J, Cano A, Gamallo C (březen 1995). "Anomální exprese P-kadherinu v karcinomu prsu. Korelace s expresí E-kadherinu a patologickými rysy". American Journal of Pathology. 146 (3): 605–12. PMC 1869170. PMID 7534041.
van der Linden PJ, de Goeij AF, Dunselman GA, Erkens HW, Evers JL (červen 1995). "Exprese kadherinů a integrinů v lidském endometriu během menstruačního cyklu". Plodnost a sterilita. 63 (6): 1210–6. doi:10.1016 / s0015-0282 (16) 57599-2. PMID 7538474.
Tang A, Eller MS, Hara M, Yaar M, Hirohashi S, Gilchrest BA (duben 1994). „E-kadherin je hlavním mediátorem adheze lidských melanocytů k keratinocytům in vitro“. Journal of Cell Science. 107 (4): 983–92. PMID 8056851.
Tassin MT, Beziau A, Gubler MC, Boyer B (březen 1994). "Spatiotemporální exprese molekul asociovaných s junkčními komplexy během in vivo zrání renálních podocytů". International Journal of Developmental Biology. 38 (1): 45–54. PMID 8074995.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Navarro P, Lozano E, Cano A (srpen 1993). „Exprese E- nebo P-kadherinu nestačí k úpravě morfologie a tumorigenního chování buněk myšího vřetenového karcinomu. Možné zapojení plakoglobinu.“ Journal of Cell Science. 105 (4): 923–34. PMID 8227214.
Reynolds AB, Daniel JM, Mo YY, Wu J, Zhang Z (červen 1996). „Nový katenin p120cas váže klasické kadheriny a indukuje neobvyklý morfologický fenotyp ve fibroblastech NIH3T3.“ Experimentální výzkum buněk. 225 (2): 328–37. doi:10.1006 / excr.1996.0183. PMID 8660921.
Soler AP, Harner GD, Knudsen KA, McBrearty FX, Grujic E, Salazar H, Han AC, Keshgegian AA (srpen 1997). "Exprese P-kadherinu identifikuje buňky prostaty specifického antigenu negativní v epiteliálních tkáních mužských pohlavních pomocných orgánů a v karcinomech prostaty. Důsledky pro biologii rakoviny prostaty". American Journal of Pathology. 151 (2): 471–8. PMC 1858007. PMID 9250159.
Wakita H, Furukawa F, Baba S, Takigawa M (listopad 1997). „Buňky lidské buněčné linie spinocelulárních buněk (DJM-1) syntetizují molekuly P-kadherinu zvýšením extracelulárního vápníku: vápník reguluje expresi genu P-kadherinu na translační úrovni prostřednictvím fosforylace proteinu tyrosinu“. International Journal of Cancer. 73 (3): 432–9. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19971104) 73: 3 <432 :: AID-IJC19> 3.0.CO; 2-E. PMID 9359492.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kremmidiotis G, Baker E, Crawford J, Eyre HJ, Nahmias J, Callen DF (květen 1998). „Lokalizace lidských genů kadherinu do oblastí chromozomů vykazujících ztrátu heterozygotnosti související s rakovinou“. Genomika. 49 (3): 467–71. doi:10.1006 / geno.1998.5281. PMID 9615235.
Jarrard DF, Paul R, van Bokhoven A, Nguyen SH, Bova GS, Wheelock MJ, Johnson KR, Schalken J, Bussemakers M, Isaacs WB (listopad 1997). „P-kadherin je bazální buněčný specifický epiteliální marker, který není exprimován v rakovině prostaty“. Klinický výzkum rakoviny. 3 (11): 2121–8. PMID 9815605.
Schmeiser K, Grand RJ (duben 1999). „Osud E- a P-kadherinu v raných fázích apoptózy“. Buněčná smrt a diferenciace. 6 (4): 377–86. doi:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.
Rufas O, Fisch B, Ziv S, Shalgi R (únor 2000). „Exprese molekul adheze kadherinu na lidské gamety“. Molekulární lidská reprodukce. 6 (2): 163–9. doi:10.1093 / mol / 6.2.163. PMID 10655458.
Klingelhöfer J, Troyanovsky RB, Laur OY, Troyanovsky S (srpen 2000). „Aminoterminální doména klasických kadherinů určuje specifičnost adhezivních interakcí“. Journal of Cell Science. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.
Han AC, Edelson MI, Peralta Soler A, Knudsen KA, Lifschitz-Mercer B, Czernobilsky B, Rosenblum NG, Salazar H (listopad 2000). "Exprese kadherinu v žlázových nádorech děložního čípku". Rakovina. 89 (10): 2053–8. doi:10.1002 / 1097-0142 (20001115) 89:10 <2053 :: AID-CNCR4> 3.0.CO; 2-C. PMID 11066045.
Bauer K, Gosau M, Reinders J, Oefner P, Reichert TE, Bauer R (listopad 2013). „Presenilin 1 / γ-sekretáza moduluje zpracování P-kadherinu a ovlivňuje adhezi buněk v buněčných liniích karcinomu dlaždicových buněk orálního původu“. Karcinogeneze. 34 (11): 2622–8. doi:10.1093 / carcin / bgt211. PMID 23740836.

externí odkazy

CDH3 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CDH3 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000062038 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061048 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1427864-5] Kaupmann K, Becker-Follmann J, Scherer G, Jockusch H, Starzinski-Powitz A (říjen 1992). „Gen pro molekulu M-kadherinu buněčné adheze se mapuje na myší chromozom 8 a lidský chromozom 16q24.1-qter a je u obou druhů v blízkosti lokusu E-kadherinu (uvomorulinu)“. Genomika. 14 (2): 488–90. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2. PMID 1427864.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CDH3 kadherin 3, typ 1, P-kadherin (placentární)“.

[pmid10910767-7] A ^b ^C ^d Klingelhöfer J, Troyanovsky RB, Laur OY, Troyanovsky S (srpen 2000). „Aminoterminální doména klasických kadherinů určuje specifičnost adhezivních interakcí“. Journal of Cell Science. 113 (16): 2829–36. PMID 10910767.

[pmid10381631-8] A ^b Schmeiser K, Grand RJ (duben 1999). „Osud E- a P-kadherinu v raných fázích apoptózy“. Buněčná smrt a diferenciace. 6 (4): 377–86. doi:10.1038 / sj.cdd.4400504. PMID 10381631.

[pmid15331416-9] Lehtonen S, Lehtonen E, Kudlicka K, Holthöfer H, Farquhar MG (září 2004). „Nephrin tvoří komplex s adherenskými spojovacími proteiny a CASK v podocytech a v psích ledvinových buňkách Madin-Darby exprimujících nefrin“. American Journal of Pathology. 165 (3): 923–36. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8. PMC 1618613. PMID 15331416.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]