CDH17 - CDH17 - Wikipedia

CDH17
Identifikátory
Aliasy	CDH17, CDH16, HPT-1, HPT1, kadherin 17
Externí ID	OMIM: 603017 MGI: 1095414 HomoloGene: 56859 Genové karty: CDH17
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	94,217,303 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	11,817,895 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita transportéru; • vazba kovových iontů; • integrinová vazba; • proton-dependentní oligopeptid sekundární aktivní aktivita transmembránového transportéru; • vazba cytoskeletálního proteinu; • aktivita homodimerizace proteinu; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • povrch buňky; • buněčná membrána; • bazolaterální plazmatická membrána; • buněčné jádro; • buněčné spojení; • komplex katenin;
Biologický proces	• vývoj sleziny; • diferenciace B buněk okrajové zóny; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • pozitivní regulace aktivace integrinu transdukcí signálu spojeného s receptorem buněčného povrchu; • diferenciace B buněk zárodečného centra; • Diferenciace B buněk; • dodržuje organizaci spojení; • transport oligopeptidů; • adheze buněk na buňkách závislých na vápníku prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • oligopeptidový transmembránový transport; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • buněčná adheze; • sestava spojení buňka-buňka; • buněčná adheze zprostředkovaná kadherinem; • buněčná adheze; • buněčná morfogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1015
	12557
	ENSG00000079112
	ENSMUSG00000028217
	Q12864
	Q9R100
	NM_001144663; NM_004063
	NM_019753
	NP_001138135; NP_004054
	NP_062727
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Kadherin-17 je protein že u lidí je kódován CDH17 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je členem kadherin nadčeleď, geny kódující glykoproteiny závislé na vápníku a spojené s membránou. Kódovaný protein je podobný kadherinu, sestává z extracelulární oblasti obsahující 7 kadherinových domén a transmembránové oblasti, ale chybí konzervovaná cytoplazmatická doména. Protein je součástí gastrointestinálního traktu a pankreatických kanálků a působí jako intestinální proton-dependentní peptidový transportér v prvním kroku při perorální absorpci mnoha lékařsky důležitých léčiv na bázi peptidů. Protein může také hrát roli v morfologické organizaci jater a střev.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000079112 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028217 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kremmidiotis G, Baker E, Crawford J, Eyre HJ, Nahmias J, Callen DF (srpen 1998). „Lokalizace lidských genů kadherinu do oblastí chromozomů vykazujících ztrátu heterozygotnosti související s rakovinou“. Genomika. 49 (3): 467–71. doi:10.1006 / geno.1998.5281. PMID 9615235.
^ Chalmers IJ, Hofler H, Atkinson MJ (červen 1999). "Mapování kadherinového genového klastru na oblast chromozomu 5, která je často postižena alelickým karcinomem". Genomika. 57 (1): 160–3. doi:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDH17 kadherin 17, LI kadherin (játra-střevo)".

Další čtení

Gessner R, Tauber R (2001). "Molekuly adheze střevních buněk. Kadherin jater-střevo". Ann. N. Y. Acad. Sci. 915: 136–43. doi:10.1111 / j.1749-6632.2000.tb05236.x. PMID 11193569. S2CID 27317315.
Gilston A (1978). "Snížení rizika odpojených trubek". Anestézie. 32 (9): 922. doi:10.1111 / j.1365-2044.1977.tb10133.x. PMID 603017. S2CID 31703359.
Dantzig AH, Hoskins JA, Tabas LB a kol. (1994). "Sdružení transportu peptidů ve střevě s proteinem souvisejícím s nadrodinou kadherinů". Věda. 264 (5157): 430–3. doi:10.1126 / science.8153632. PMID 8153632.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J a kol. (2001). „Identifikace a charakterizace potenciálních promotorových oblastí 1031 druhů lidských genů“. Genome Res. 11 (5): 677–84. doi:10,1101 / gr. Gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467.
Grötzinger C, Kneifel J, Patschan D a kol. (2001). "LI-kadherin: marker žaludeční metaplazie a neoplazie". Střevo. 49 (1): 73–81. doi:10,1136 / střeva. 49.1.73. PMC 1728355. PMID 11413113.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Takamura M, Sakamoto M, Ino Y a kol. (2003). „Exprese kadherinu v játrech a střevě a jeho možná interakce s galektinem-3 v duktálním adenokarcinomu slinivky břišní“. Cancer Sci. 94 (5): 425–30. doi:10.1111 / j.1349-7006.2003.tb01459.x. PMID 12824888. S2CID 25229564.
Wendeler MW, Praus M, Jung R a kol. (2004). „Ksp-kadherin je funkční molekula adheze buněk k buňkám související s LI-kadherinem“. Exp. Cell Res. 294 (2): 345–55. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.022. PMID 15023525.
Ko S, Chu KM, Luk JM a kol. (2004). „Nadměrná exprese LI-kadherinu u rakoviny žaludku je spojena s metastázami do lymfatických uzlin“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319 (2): 562–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.04.197. PMID 15178443.
Takamura M, Ichida T, Matsuda Y a kol. (2004). „Snížená exprese kadherinu v játrech a střevě je spojena s progresí a metastázami lymfatických uzlin u lidského kolorektálního karcinomu.“ Cancer Lett. 212 (2): 253–9. doi:10.1016 / j.canlet.2004.03.016. PMID 15279905.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Wang XQ, Luk JM, Leung PP a kol. (2005). „Alternativní mRNA sestřih jaterního střeva-kadherinu v hepatocelulárním karcinomu“. Clin. Cancer Res. 11 (2 Pt 1): 483–9. PMID 15701831.
Wang XQ, Luk JM, Garcia-Barcelo M a kol. (2007). „Haplotyp jaterního střeva a kadherinu (CDH17) je spojen se zvýšeným rizikem hepatocelulárního karcinomu“. Clin. Cancer Res. 12 (17): 5248–52. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0558. PMID 16951245.

externí odkazy

CDH17 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CDH17 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CDH16 umístění genomu a CDH16 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000079112 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028217 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9615235-5] Kremmidiotis G, Baker E, Crawford J, Eyre HJ, Nahmias J, Callen DF (srpen 1998). „Lokalizace lidských genů kadherinu do oblastí chromozomů vykazujících ztrátu heterozygotnosti související s rakovinou“. Genomika. 49 (3): 467–71. doi:10.1006 / geno.1998.5281. PMID 9615235.

[pmid10191097-6] Chalmers IJ, Hofler H, Atkinson MJ (červen 1999). "Mapování kadherinového genového klastru na oblast chromozomu 5, která je často postižena alelickým karcinomem". Genomika. 57 (1): 160–3. doi:10.1006 / geno.1998.5717. PMID 10191097.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: CDH17 kadherin 17, LI kadherin (játra-střevo)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]