Související s receptorem polioviru 1 - Poliovirus receptor-related 1 - Wikipedia

NECTIN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3 ALP, 3 SKU, 3U83, 4FMF, 4MYW
Identifikátory
Aliasy	NECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nektin-1, PVRL1, nektinová buněčná adhezní molekula 1
Externí ID	OMIM: 600644 MGI: 1926483 HomoloGene: 2138 Genové karty: NECTIN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	119,729,200 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	43,832,658 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita coreceptoru; • aktivita virového receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba virionu; • vazba na receptory; • vázání sacharidů; • vazba molekul buněčné adheze; • identická vazba na protein; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • buněčná membrána; • membrána růstového kužele; • synapse; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární oblast; • axon; • buněčné spojení; • neuronová projekce; • komplex katenin; • presynaptická membrána; • apikální spojovací komplex; • kontaktní zóna buňka-buňka; • mezibuněčné spojení; • adherens křižovatka; • dendrit; • hipokampální mechové vlákno na CA3 synapse; • integrální součást presynaptické membrány aktivní zóny;
Biologický proces	• heterofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze buněk plazmatické membrány; • rozpoznávání buněk; • desmosome organizace; • regulace sestavy synapsí; • axonové vedení; • buněčná adheze; • transport železných iontů; • morfogeneze čočky v oku kamery; • vývoj sítnice v oku kamerového typu; • imunitní odpověď; • virový vstup; • mineralizace skloviny; • GO: virový proces 0022415; • dodržuje organizaci spojení; • kamerová morfogeneze oka; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • signální transdukce; • lokalizace proteinu do buněčného spojení; • buněčná adheze; • připojení virionu k hostitelské buňce;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5818
	58235
	ENSG00000110400
	ENSMUSG00000032012
	Q15223
	Q9JKF6
	NM_203286; NM_002855; NM_032767; NM_203285
	NM_021424
	NP_002846; NP_976030; NP_976031
	NP_067399
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Související s receptorem polioviru 1 (PVRL1), také známý jako nektin-1 a CD111 (dříve mediátor vstupu herpesviru C., HVEC) je lidský protein z nadrodina imunoglobulinů (IgSF), rovněž považován za člena nektiny.^[5] Jedná se o membránový protein se třemi extracelulárními imunoglobulinovými doménami, jedinou transmembránovou spirálou a cytoplazmatickým ocasem. Protein může zprostředkovat Ca.²⁺ -nezávislý buněčná adheze dále charakterizovat jako IgSF buněčnou adhezní molekulu (IgSF CAM).

Funkce

PVRL1 je adhezní molekula nacházející se v široké škále tkání, kde se lokalizuje v různých spojích, jako je adherens křižovatka z epitelové tkáně nebo chemická synapse z neurony. Cytoplazmatický konec PVRL1 může vázat protein afadin což je protein lešení, který se váže aktin.

V chemické synapse PVRL1 interaguje s PVRL3 (nektin-3) a oba proteiny lze nalézt v neuronální tkáni již v raných fázích vývoje mozku, stejně jako ve stárnoucích mozcích. Bylo zjištěno, že tyto dva proteiny se asymetricky lokalizují podél chemické synapsy, přičemž PVRL1 je primárně na axonální straně a PVRL3 na dendritický boční.

Protein byl odhalen jako jeden z klíčových hráčů při zprostředkování buněčného vstupu Virus herpes simplex interakcí s virovým glykoproteinem D (gD).^[6]

Viz také

Shluk diferenciace

Interakce

PVRL1 bylo prokázáno komunikovat s MLLT4.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110400 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032012 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: PVRL1 poliovirus receptor related 1 (herpesvirus entry mediator C; nectin)".
^ Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). „V doména receptoru podobného Ig na herpesvirus (HIgR) obsahuje hlavní funkční oblast ve vstupu viru herpes simplex-1 do buněk a fyzicky interaguje s virovým glykoproteinem D“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (26): 15700–5. doi:10.1073 / pnas.95.26.15700. PMC 28107. PMID 9861033.
^ Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (květen 1999). „Nektin / PRR: Imunoglobulinová molekula buněčné adheze získaná na adherenových spojích na bázi kadherinu prostřednictvím interakce s afadinem, proteinem obsahujícím doménu PDZ“. J. Cell Biol. 145 (3): 539–49. doi:10.1083 / jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955.

Další čtení

Bustos T, Simosa V, Pinto-Cisternas J, Abramovits W, Jolay L, Rodriguez L, Fernandez L, Ramela M (1992). „Autosomálně recesivní ektodermální dysplázie: I. Nepopsaná dysplazie / malformační syndrom“. Dopoledne. J. Med. Genet. 41 (4): 398–404. doi:10,1002 / ajmg.1320410403. PMID 1776626.
Lopez M, Eberlé F, Mattei MG, Gabert J, Birg F, Bardin F, Maroc C, Dubreuil P (1995). "Doplňková charakterizace DNA a chromozomální lokalizace lidského genu souvisejícího s genem kódujícím poliovirový receptor". Gen. 155 (2): 261–5. doi:10.1016 / 0378-1119 (94) 00842-G. PMID 7721102.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Geraghty RJ, Krummenacher C, Cohen GH, Eisenberg RJ, Spear PG (1998). "Vstup alphaherpesvirů zprostředkovaných proteinem 1 souvisejícím s poliovirovým receptorem a poliovirovým receptorem". Věda. 280 (5369): 1618–20. Bibcode:1998Sci ... 280.1618G. doi:10.1126 / science.280.5369.1618. PMID 9616127.
Suzuki K, Bustos T, Spritz RA (1998). „Mapování vazebné nerovnováhy genu pro ektodermální dysplázii na ostrově Margarita (ED4) na 11q23“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 63 (4): 1102–7. doi:10.1086/302072. PMC 1377504. PMID 9758630.
Cocchi F, Menotti L, Mirandola P, Lopez M, Campadelli-Fiume G (1998). „Ektodoména nového člena podrodiny imunoglobulinů související s poliovirovým receptorem má atributy bona fide receptoru pro typy 1 a 2 viru herpes simplex v lidských buňkách“. J. Virol. 72 (12): 9992–10002. doi:10.1128 / JVI.72.12.9992-10002.1998. PMC 110516. PMID 9811737.
Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). „V doména receptoru podobného Ig na herpesvirus (HIgR) obsahuje hlavní funkční oblast ve vstupu viru herpes simplex-1 do buněk a fyzicky interaguje s virovým glykoproteinem D“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (26): 15700–5. doi:10.1073 / pnas.95.26.15700. PMC 28107. PMID 9861033.
Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (1999). „Nektin / PRR: Imunoglobulinová molekula buněčné adheze získaná na adherenových spojích na bázi kadherinu prostřednictvím interakce s afadinem, proteinem obsahujícím doménu PDZ“. J. Cell Biol. 145 (3): 539–49. doi:10.1083 / jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955.
Miyahara M, Nakanishi H, Takahashi K, Satoh-Horikawa K, Tachibana K, Takai Y (2000). „Interakce nektinu s afadinem je nezbytná pro jeho shlukování v kontaktních místech buňka-buňka, ale ne pro jeho dimerizaci cis nebo trans interakci“. J. Biol. Chem. 275 (1): 613–8. doi:10.1074 / jbc.275.1.613. PMID 10617658.
Suzuki K, Hu D, Bustos T, Zlotogora J, Richieri-Costa A, Helms JA, Spritz RA (2000). „Mutace PVRL1 kódující adhezní molekulu buňka / receptor herpesviru v rozštěpu rtu / patra-ektodermální dysplázie“. Nat. Genet. 25 (4): 427–30. doi:10.1038/78119. PMID 10932188. S2CID 6169893.
Lopez M, Cocchi F, Avitabile E, Leclerc A, Adelaide J, Campadelli-Fiume G, Dubreuil P (2001). „Nová, rozpustná izoforma receptoru pro virus herpes simplex (HSV) nektin1 (nebo PRR1-HIgR-HveC) moduluje pozitivní a negativní citlivost na infekci HSV“. J. Virol. 75 (12): 5684–91. doi:10.1128 / JVI.75.12.5684-5691.2001. PMC 114282. PMID 11356977.
Sözen MA, Suzuki K, Tolarova MM, Bustos T, Fernández Iglesias JE, Spritz RA (2001). „Mutace PVRL1 je spojena se sporadickým, nesyndromickým rozštěpem rtu / patra v severní Venezuele“. Nat. Genet. 29 (2): 141–2. doi:10.1038 / ng740. PMID 11559849. S2CID 8641206.
Struyf F, Posavad CM, Keyaerts E, Van Ranst M, Corey L, Spear PG (2002). „Hledání polymorfismů v genech pro mediátor vstupu herpesviru, nektin-1 a nektin-2 u imunitně seronegativních jedinců“. J. Infect. Dis. 185 (1): 36–44. doi:10.1086/338116. PMID 11756979.
Fabre S, Reymond N, Cocchi F, Menotti L, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G, Lopez M (2002). „Prominentní role V-domény podobné Ig v trans-interakcích nektinů. Nektin3 a nektin 4 se váží na předpokládané C-C'-C„ -D beta-řetězce V domény nektinu1 “. J. Biol. Chem. 277 (30): 27006–13. doi:10,1074 / jbc.M203228200. PMID 12011057.
Yoon M, Spear PG (2002). „Narušení spojení adherenů osvobozuje nektin-1, který slouží jako receptor pro vstup viru herpes simplex a viru pseudorabies“. J. Virol. 76 (14): 7203–8. doi:10.1128 / JVI.76.14.7203-7208.2002. PMC 136315. PMID 12072519.
Struyf F, Martinez WM, Spear PG (2002). „Mutace v N-terminálních doménách nektinu-1 a nektinu-2 odhalují rozdíly v požadavcích na vstup různých alphaherpesvirů a na interakce nektin-nektin.“. J. Virol. 76 (24): 12940–50. doi:10.1128 / JVI.76.24.12940-12950.2002. PMC 136698. PMID 12438620.
Takekuni K, Ikeda W, Fujito T, Morimoto K, Takeuchi M, Monden M, Takai Y (2003). „Přímá vazba proteinu PAR-3 na polaritu buněk s nektinem adhezní molekuly buněčná na neuroepiteliální buňky vyvíjející se myši“. J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. doi:10.1074 / jbc.C200707200. PMID 12515806.
Krummenacher C, Baribaud I, Eisenberg RJ, Cohen GH (2003). "Buněčná lokalizace nektinu-1 a glykoproteinu D během infekce virem herpes simplex". J. Virol. 77 (16): 8985–99. doi:10.1128 / JVI.77.16.8985-8999.2003. PMC 167240. PMID 12885915.
Bender FC, Whitbeck JC, Ponce de Leon M, Lou H, Eisenberg RJ, Cohen GH (2003). „Specifická asociace glykoproteinu B s lipidovými rafty během vstupu viru herpes simplex“. J. Virol. 77 (17): 9542–52. doi:10.1128 / JVI.77.17.9542-9552.2003. PMC 187402. PMID 12915568.

externí odkazy

PVRL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110400 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032012 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: PVRL1 poliovirus receptor related 1 (herpesvirus entry mediator C; nectin)".

[pmid9861033-6] Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). „V doména receptoru podobného Ig na herpesvirus (HIgR) obsahuje hlavní funkční oblast ve vstupu viru herpes simplex-1 do buněk a fyzicky interaguje s virovým glykoproteinem D“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (26): 15700–5. doi:10.1073 / pnas.95.26.15700. PMC 28107. PMID 9861033.

[pmid10225955-7] Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (květen 1999). „Nektin / PRR: Imunoglobulinová molekula buněčné adheze získaná na adherenových spojích na bázi kadherinu prostřednictvím interakce s afadinem, proteinem obsahujícím doménu PDZ“. J. Cell Biol. 145 (3): 539–49. doi:10.1083 / jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350