Sirotčí receptor - Orphan receptor

v biochemie, an sirotčí receptor je protein, který má podobnou strukturu jako ostatní identifikované receptory ale jehož endogenní ligand dosud nebyla identifikována. Pokud je později objeven ligand pro osiřelý receptor, bude tento receptor označován jako „adoptovaný sirotek“.[1] Naopak termín osiřelý ligand "Biologický ligand" označuje biologický ligand, jehož příbuzný receptor dosud nebyl identifikován.

Příklady

Příklady osiřelých receptorů lze nalézt v Receptor spojený s G proteinem (GPCR)[2][3][4] a jaderný receptor[5][6][7] rodiny.

Pokud je nalezen endogenní ligand, je osiřelý receptor „adoptován“ nebo „de-orfanizován“.[8] Příkladem je jaderný receptor Farnesoid X receptor (FXR) a GPCR Receptor žlučových kyselin spojený s proteinem TGR5 / GPCR19 / G, které jsou aktivovány pomocí žlučové kyseliny.[9] Přijaté osiřelé receptory v jaderný receptor skupina zahrnuje FXR, jaterní X receptor (LXR) a receptor aktivovaný proliferátorem peroxisomu (PPAR). Dalším příkladem místa pro osiřelé receptory je PCP vazebné místo v NMDA receptor,[10] typ iontový kanál řízený ligandem. Na tomto místě funguje rekreační droga PCP, ale není známo, že by se na toto místo vážil žádný endogenní ligand.

GPCR osiřelé receptory jsou obvykle pojmenovány „GPR“ následované například číslem GPR1. V rodině GPCR zůstává téměř 100 genů podobných receptorům sirotky.[11]

Objev

Historicky byly receptory objeveny pomocí ligandů k „lovu“ jejich receptorů. Podle definice tedy tyto receptory nebyly sirotky. S moderními technikami molekulární biologie, jako je screening cDNA knihovny a sekvenování celého genomu, receptory byly identifikovány na základě podobnosti sekvencí se známými receptory, aniž by věděli, jaké jsou jejich ligandy.

Reference

  1. ^ Nanduri, Ravikanth; Bhutani, Isha; Somavarapu, Arun Kumar; Mahajan, Sahil; Parkesh, Raman; Gupta, Pawan (01.01.2015). „ONRLDB - ručně upravená databáze experimentálně ověřených ligandů pro osiřelé jaderné receptory: pohledy na objev nových léků“. Databáze. 2015: bav112. doi:10.1093 / databáze / bav112. PMC  4669993. PMID  26637529.
  2. ^ Levoye A, Dam J, Ayoub MA, Guillaume JL, Jockers R (2006). „Mají receptory spojené s osiřelým G-proteinem funkce nezávislé na ligandu? Nové poznatky z heterodimerů receptoru“. EMBO Rep. 7 (11): 1094–8. doi:10.1038 / sj.embor.7400838. PMC  1679777. PMID  17077864.
  3. ^ Civelli O, Saito Y, Wang Z, Nothacker HP, Reinscheid RK (2006). "Sirotčí GPCR a jejich ligandy". Pharmacol Ther. 110 (3): 525–32. doi:10.1016 / j.pharmthera.2005.10.001. PMID  16289308.
  4. ^ Wise A, Jupe SC, Rees S (2004). „Identifikace ligandů na receptorech spřažených s osiřelým G-proteinem“. Annu Rev Pharmacol Toxicol. 44 (Únor): 43–66. doi:10.1146 / annurev.pharmtox.44.101802.121419. PMID  14744238.
  5. ^ Giguère V (říjen 1999). "Sirotčí jaderné receptory: od genu k funkci". Endocr. Rev. 20 (5): 689–725. doi:10.1210 / er.20.5.689. PMID  10529899.
  6. ^ Benoit G, Cooney A, Giguere V, Ingraham H, Lazar M, Muscat G, Perlmann T, Renaud JP, Schwabe J, Sladek F, Tsai MJ, Laudet V (2006). „International Union of Pharmacology. LXVI. Orphan nuclear receptors“. Pharmacol Rev. 58 (4): 798–836. doi:10.1124 / pr.58.4.10. PMID  17132856.
  7. ^ Shi Y (červen 2007). „Sirotčí jaderné receptory při objevování drog“. Drug Discov. Dnes. 12 (11–12): 440–5. doi:10.1016 / j.drudis.2007.04.006. PMC  2748783. PMID  17532527.
  8. ^ SHI, Y (2007). „Sirotčí jaderné receptory při objevování drog“. Objev drog dnes. 12 (11–12): 440–445. doi:10.1016 / j.drudis.2007.04.006. PMC  2748783. PMID  17532527.
  9. ^ Mi LZ, Devarakonda S, Harp JM, Han Q, Pellicciari R, Willson TM, Khorasanizadeh S, Rastinejad F (duben 2003). "Strukturální základ pro vazbu žlučových kyselin a aktivaci jaderného receptoru FXR". Mol. Buňka. 11 (4): 1093–100. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00112-6. PMID  12718893.
  10. ^ Fagg GE (květen 1987). „Fencyklidin a související léky se váží na aktivovaný komplex kanálů N-methyl-D-aspartátového receptoru v mozkových membránách potkanů.“ Neurosci. Lett. 76 (2): 221–7. doi:10.1016/0304-3940(87)90719-1. PMID  2438606.
  11. ^ Laschet, C; Dupuis, N; Hanson, J (2018). „Deorphanizační krajina receptorů spřažených s G proteinem“. Biochemická farmakologie. 153: 62–74. doi:10.1016 / j.bcp.2018.02.016. PMID  29454621.

externí odkazy