GPR113 - GPR113
| ADGRF3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | ADGRF3, PGR23, hGPCR37, GPR113, adhezní G protein spojený s receptorem F3 | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | MGI: 2685887 HomoloGene: 17826 Genové karty: ADGRF3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr 2: 26,31 - 26,35 Mb | Chr 5: 30,19 - 30,21 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
GPR113 je gen který kóduje Pravděpodobný receptor spojený s G-proteinem 113 protein.[5][6]
Gen
The Homo sapiens Gen GPR113 je lokalizován na chromozomu 2 (2p23.3). Tento gen překlenuje délku 38,65 kb oblasti od báze 26531041 do 26569685 na negativním řetězci.[7] Gen GPR113 má dva negativy na obou stranách negativního řetězce: OTOF otoferlin předchozí a HADHA hydroxyacyl-CoA Následující. Přímo naproti GPR113 na kladném řetězci je EPT1 Gen GPR113 je také znám pod přezdívkami PGR23 a HGPCR37.[8]
Homologie a evoluce
GPR113 má 5 lidských paralogů GPR110, GPR115, GPR128, GPR111, a GPR116.[8] GPR113 je dobře konzervován u savců od primátů po polo-vodní druhy, stejně jako u některých obojživelníků. Patří mezi ně šimpanz obecný, slon africký Bush, ptakopysk a žába západní.[9] Homologní domény, které jsou dobře zachovány v celém centru ortologů v 7 transmembránový receptor (rodina sekretinů) oblast na obrázku zvýrazněna fialově.[10]
Protein
Proteinový produkt genu GPR113 je receptor spojený s G-proteinem. Protein má u lidí tři varianty transkriptu.[11] Z těchto tří má GPR113 varianta 1 nejdelší aminokyselinovou sekvenci a má nejvyšší identitu s ortology. To vede k závěru, že GPR113 Varianta 1 je potomkem homo sapiens rodového genu GPR113. GPR113 Var 1 obsahuje 1079 aminokyselin a je nedílnou součástí plazmatické membrány.[12] Receptor se 7 průchody obsahuje 4 domény zvýrazněné na obrázku vpravo: Signální peptid (červený), Doména hormonálního receptoru (Modrý), Doména GPS typu Latrophilin / CL-1 (Oranžová) a 7-transmembránový receptor (fialová). Mezi doménou hormonálních receptorů a GPS je a Doména neznámé funkce to není zvýrazněno.
Funkce
GPR113 je Receptor spojený s G proteinem který je zapojen do neuropeptidové signální dráhy.[12]
Výraz a nemoc
Bylo zjištěno, že GPR113 je exprimován odlišně za nemocných podmínek. Pod podmínkou Diabetes typu 2, percentilové pořadí vzhledem k ostatním přepisům klesá vzhledem k normální funkci buňky.[13] Vymazání TP63, který zprostředkovává širokou škálu důležitých tělesných procesů, také produkuje sníženou expresi GPR113.[14] V mozcích myší mozek a čichová cibulka vykazují transkripci genu GPR113.[15] Studie z Národního institutu hluchoty a dalších poruch komunikace navíc zjistila, že exprese GPR113 je vysoce omezena na podskupinu buněk chuťových receptorů.[16] Závěry tohoto článku spolu s úrovněmi exprese čichové žárovky by mohly poskytnout cestu pro budoucí výzkum a potenciálně osvětlit více o funkci GPR113.
Interagující proteiny
Ukázalo se, že GPR113 se asociuje s receptorem spojeným s osiřelým G proteinem GPR123.[17]
Faktory přepisu
| Top 10 transkripčních faktorů s nejvyšší pravděpodobností[18] |
|---|
| Závazné místo pro homeodomény typu S8 |
| Závazné místo pro homeodomény typu S8 |
| DLX-1, -2 a -5 vazebná místa |
| TCF / LEF-1 (preference sekundární vazby DNA) |
| Homeobox obsahující transkripční faktor specifický pro zárodečné buňky NOBOX |
| Spaltový transkripční faktor 1 |
| Transkripční represor CDP |
| Alternativní sestřihová varianta FOXP1, aktivovaná v ESC |
| Závazné místo pro homeodomény typu S8 |
| Homeobox obsahující transkripční faktor specifický pro zárodečné buňky NOBOX |
Klinický význam
Klinický význam tohoto proteinu nebyl stanoven. Profily exprese však poskytují vzrušující směry pro budoucí výzkum genu GPR113, zejména v oblastech studujících chuť a vůni.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173567 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000067642 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Fredriksson R, Lagerstrom MC, Hoglund PJ, Schioth HB (listopad 2002). "Nové receptory spojené s lidským G proteinem s dlouhými N-terminály obsahujícími GPS domény a oblasti bohaté na Ser / Thr". FEBS Lett. 531 (3): 407–14. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03574-3. PMID 12435584. S2CID 7449692.
- ^ „Entrez Gene: GPR113 G protein-coupled receptor 113“.
- ^ „Homo sapiens chromosome 2, GRCh37.p13 Primary Assembly“. 2013-08-13. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ A b https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=GPR113
- ^ „BLAST: Základní vyhledávací nástroj pro místní zarovnání“.
- ^ „SDSC Biology Workbench“.
- ^ "Homo sapiens adheze G protein spojený s receptorem F3 (ADGRF3), transkriptová varianta 2, mRNA". 2018-06-24. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ A b „ADGRF3 - prekurzor receptoru F3 spojený s adhezí G-proteinem - Homo sapiens (člověk) - gen a protein ADGRF3“.
- ^ „71224040 - Profily GEO - NCBI“.
- ^ „34655140 - Profily GEO - NCBI“.
- ^ "Gene Detail :: Allen Brain Atlas: Mouse Brain".
- ^ Lopezjimenez, N. D .; Sainz, E; Cavenagh, M. M .; Cruz-Ithier, M. A .; Blackwood, C. A .; Battey, J. F .; Sullivan, S.L. (2005). „Dva nové geny, Gpr113, který kóduje receptor spojený s rodinou 2 G-proteinem, a Trcg1, jsou selektivně exprimovány v buňkách chuťových receptorů“. Genomika. 85 (4): 472–82. doi:10.1016 / j.ygeno.2004.12.005. PMID 15780750.
- ^ „STRING: Asociační sítě funkčních proteinů“.
- ^ „ElDorado Introduction“.
Další čtení
- Takeda S, Kadowaki S, Haga T a kol. (2002). "Identifikace genů receptoru spřažených s G proteinem ze sekvence lidského genomu". FEBS Lett. 520 (1–3): 97–101. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02775-8. PMID 12044878. S2CID 7116392.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Vassilatis DK, Hohmann JG, Zeng H a kol. (2003). "Repertoáry receptoru spřaženého s G proteinem člověka a myši". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (8): 4903–8. Bibcode:2003PNAS..100,4903V. doi:10.1073 / pnas.0230374100. PMC 153653. PMID 12679517.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Bjarnadóttir TK, Fredriksson R, Höglund PJ a kol. (2005). „Lidský a myší repertoár adhezní rodiny receptorů spřažených s G-proteinem“. Genomika. 84 (1): 23–33. doi:10.1016 / j.ygeno.2003.12.004. PMID 15203201.