TAS2R1 - TAS2R1

TAS2R1
Identifikátory
AliasyTAS2R1, T2R1, TRB7, chuť 2 člen receptoru 1
Externí IDOMIM: 604796 MGI: 2681253 HomoloGene: 10480 Genové karty: TAS2R1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomická poloha pro TAS2R1
Genomická poloha pro TAS2R1
Kapela5p15,31Start9,628,997 bp[1]
Konec9,712,378 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE TAS2R1 221324 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

50834

57254

Ensembl

ENSG00000169777

ENSMUSG00000045267

UniProt

Q9NYW7

Q9JKT2

RefSeq (mRNA)

NM_019599

NM_020503

RefSeq (protein)

NP_062545

NP_065249

Místo (UCSC)Chr 5: 9,63 - 9,71 MbChr 15: 32,18 - 32,18 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Chuťový receptor typu 2, člen 1 (TAS2R1 / T2R1) je protein že u lidí je kódován TAS2R1 gen.[5][6][7] Patří k Receptor spojený s G proteinem (GPCR) rodina a souvisí s třída A -jako GPCR, obsahují 7 transmembránových šroubovicových svazků a krátkou smyčku N-konce.[8] TAS2R1 je dále členem 25 známých lidských receptorů hořké chuti, které umožňují vnímání hořké chuti v ústní dutině. Stále více důkazů naznačuje funkční roli TAS2R v extraorálních tkáních.[9]

Výraz a funkce

Mimoorální role TAS2R

Receptory hořké chuti jsou vyjádřeny v buňky chuťových receptorů, který organizoval do chuťové pohárky na papilech jazyk a patro epitelu.

Kromě toho bylo zjištěno, že TAS2R jsou exprimovány v extraorálních tkáních, např. mozek, plíce, zažívací trakt atd.[9] Doposud je však o jejich funkci známo méně, například se ukázalo, že:

  • TAS2Rs zprostředkovávají relaxaci hladkých svalů dýchacích cest.[10]
  • TAS2R43 se účastní sekrece žaludeční kyseliny v žaludku.[11]

Mimoorální role TAS2R1

  • Bylo zjištěno, že TAS2R1, TAS2R4, TAS2R10, TAS2R38 a TAS2R49 jsou v rakovina prsu buňky[12].
  • TAS2R1, způsobuje vazokonstrikční reakce v plicní okruh a relaxace v dýchacích cestách[13].

Struktura receptoru TAS2R1

Na základě nedávného homologický model z BitterDB[14][15] několik konzervovaných motivy, což jsou protipóly GPCR třídy A.[8] byly nalezeny:

  • Transmembránová šroubovice 1: N1.50xxI1.53
  • Transmembránová šroubovice 2: L2.46xxxR2.50
  • Transmembránová šroubovice 3: F3.49Y3.50xxK3.53
  • Transmembránová šroubovice 5: P5.50
  • Transmembránová šroubovice 6: F6.44xxxY6.46
  • Transmembránová šroubovice 7: H7.49S7.50xxL7.53

Číslování je podle Balleros-Weinstein[16] Systém.

Na rozdíl od GPCR třídy A, v transmembránové šroubovici 4 není DRY[17] motiv byl nalezen a pozice 6.50 není zachována.

TAS2R1 gen

Tento gen kóduje člena rodiny kandidátů chuťové receptory kteří jsou členy Receptor spojený s G proteinem nadčeleď a které jsou specificky exprimovány buňkami chuťových receptorů jazyka a patra epitelu. Tento intronless chuťový receptorový gen kóduje protein 7-transmembránového receptoru, fungující jako hořký chuťový receptor.

SNP

V T2R1 dva SNP jsou známy v R111H a R206W (dbSNP ).

Faktory přepisu

Doposud byly jako vrchol nalezeny AML1a, AP-1, AREB6, FOXL1, IRF-7A, Lmo2, NF-E2, NF-E2 p45 transkripční faktor vazebné stránky společností QIAGEN v TAS2R1 promotor genů.

Mutageneze data

Několik mutace Bylo prokázáno, že ovlivňují vazbu ligandu na TAS2R1 (na základě BitterDB ):

Receptorová oblastBW čísloZbytekOdkaz
TM11.5N24doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM11.53I27doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM22.5R55doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM22.56F61doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM22.61N66doi: 10,3389 / fmolb.2017 00063 doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
ECL1E74doi: 10,3389 / fmolb.2017.00063
TM33.32L85doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.33L86doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.36N89doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983 doi: doi: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM33.37E90doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.41W94doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM33.46L99doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM55.46E182doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM55.61L197doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM55.64S200doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM55.65L201doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM77.39I263doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM77.49H273doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM77.53L277doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983
TM77.54I278doi: 10,1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10,1074 / jbc.M111.246983

Ligandy

Dosud bylo identifikováno 39 ligandů pro T2R1 BitterDB, mezi nimi L-aminokyseliny, peptidy, humulony, malé molekuly atd.[18]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169777 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045267 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Adler E, Hoon MA, Mueller KL, Chandrashekar J, Ryba NJ, Zuker CS (duben 2000). "Nová rodina savčích chuťových receptorů". Buňka. 100 (6): 693–702. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80705-9. PMID  10761934. S2CID  14604586.
  6. ^ Matsunami H, Montmayeur JP, Buck LB (duben 2000). "Rodina kandidátních chuťových receptorů u lidí a myší". Příroda. 404 (6778): 601–4. Bibcode:2000Natur.404..601M. doi:10.1038/35007072. PMID  10766242. S2CID  4336913.
  7. ^ „Entrez Gene: TAS2R1 chuťový receptor, typ 2, člen 1“.
  8. ^ A b Di Pizio, Antonella; Levit, Anat; Slutzki, Michal; Behrens, Maik; Karaman, Rafik; Niv, Masha Y. (2016), „Srovnání GPCR třídy A s receptory hořké chuti“, Metody v buněčné biologii, Elsevier, 132: 401–427, doi:10.1016 / bs.mcb.2015.10.005, ISBN  9780128035955, PMID  26928553
  9. ^ A b Lu, Ping; Zhang, Cheng-Hai; Lifshitz, Lawrence M .; ZhuGe, Ronghua (01.01.2017). „Extraorální receptory hořké chuti ve zdraví a nemoci“. The Journal of General Physiology. 149 (2): 181–197. doi:10.1085 / jgp.201611637. ISSN  0022-1295. PMC  5299619. PMID  28053191.
  10. ^ Deshpande, Deepak A; Wang, Wayne CH; McIlmoyle, Elizabeth L; Robinett, Kathryn S; Schillinger, Rachel M; An, Steven S; Předstíraný, James KS; Liggett, Stephen B (2010-10-24). „Receptory hořké chuti na bronchodilatu hladkého svalstva dýchacích cest lokalizovanou signalizací vápníku a reverzní obstrukcí“. Přírodní medicína. 16 (11): 1299–1304. doi:10,1038 / nm.2237. ISSN  1078-8956. PMC  3066567. PMID  20972434.
  11. ^ Liszt, Kathrin Ingrid; Ley, Jakob Peter; Lieder, Barbara; Behrens, Maik; Stöger, Verena; Reiner, Angelika; Hochkogler, Christina Maria; Köck, Elke; Marchiori, Alessandro (10.7.2017). „Kofein indukuje sekreci žaludeční kyseliny prostřednictvím signalizace hořké chuti v parietálních buňkách žaludku“. Sborník Národní akademie věd. 114 (30): E6260 – E6269. doi:10.1073 / pnas.1703728114. ISSN  0027-8424. PMC  5544304. PMID  28696284.
  12. ^ Singh, Nisha; Chakraborty, Raja; Bhullar, Rajinder Pal; Chelikani, Prashen (duben 2014). „Diferenciální exprese receptorů hořké chuti v nerakovinných buňkách epitelu prsu a buňkách rakoviny prsu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 446 (2): 499–503. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.02.140. ISSN  0006-291X. PMID  24613843.
  13. ^ Upadhyaya, Jasbir D .; Singh, Nisha; Sikarwar, Anurag S .; Chakraborty, Raja; Pydi, Sai P .; Bhullar, Rajinder P .; Dakshinamurti, Shyamala; Chelikani, Prashen (2014-10-23). „Aktivace receptoru hořké chuti zprostředkovaná dextromethorfanem v plicním okruhu způsobuje vazokonstrikci“. PLOS ONE. 9 (10): e110373. Bibcode:2014PLoSO ... 9k0373U. doi:10.1371 / journal.pone.0110373. ISSN  1932-6203. PMC  4207743. PMID  25340739.
  14. ^ Wiener, Ayana; Shudler, Marina; Levit, Anat; Niv, Masha Y. (2011-09-22). „BitterDB: databáze hořkých sloučenin“. Výzkum nukleových kyselin. 40 (D1): D413 – D419. doi:10.1093 / nar / gkr755. ISSN  1362-4962. PMC  3245057. PMID  21940398.
  15. ^ Dagan-Wiener, Ayana; Di Pizio, Antonella; Nissim, Ido; Bahia, Malkeet S; Dubovski, Nitzan; Margulis, Eitan; Niv, Masha Y (2018-10-24). „BitterDB: databáze chuťových ligandů a receptorů v roce 2019“. Výzkum nukleových kyselin. 47 (D1): D1179 – D1185. doi:10.1093 / nar / gky974. ISSN  0305-1048. PMC  6323989. PMID  30357384.
  16. ^ Ballesteros, Juan A .; Weinstein, Harel (1995), „[19] Integrované metody pro konstrukci trojrozměrných modelů a výpočetní sondování vztahů mezi strukturou a funkcí v receptorech spřažených s G proteinem“, Metody v neurovědách, Elsevier, s. 366–428, doi:10.1016 / s1043-9471 (05) 80049-7, ISBN  9780121852955
  17. ^ Rovati, G. E .; Capra, V .; Neubig, R. R. (01.01.2007). „Vysoce konzervovaný DRY ​​motiv motivů receptorů spojených s proteiny třídy G: za základním stavem“. Molekulární farmakologie. 71 (4): 959–964. doi:10,1124 / mol 106,029470. ISSN  0026-895X. PMID  17192495. S2CID  15536186.
  18. ^ „hTAS2R1“. BitterDB. Hebrejská univerzita v Jeruzalémě.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.