Integrin alfa 4 - Integrin alpha 4

ITGA4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4 HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z
Identifikátory
Aliasy	ITGA4„CD49D, IA4, integrinová podjednotka alfa 4
Externí ID	OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 Genové karty: ITGA4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	181,538,940 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	79,333,123 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba proteinového antigenu; • vazba kovových iontů; • vazba antigenu; • vazba na fibronektin; • vazba molekul buněčné adheze; • aktivita coreceptoru; • Vazba chemokinů C-X3-C; • aktivita heterodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • integrální součást membrány; • membrána; • ohnisková adheze; • povrch buňky; • komplex integrin alfa4-beta7; • komplex integrinu; • buněčná membrána; • růstový kužel; • tělo neuronových buněk; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• diferenciace endodermálních buněk; • Diferenciace B buněk; • pozitivní regulace migrace T buněk; • organizace extracelulární matice; • heterotypická adheze mezi buňkami; • šíření buněk závislé na adhezi; • buněčná odpověď na stimul cytokinů; • buněčná matice adheze podílí na migraci ameboidních buněk; • buněčná matice adheze; • uvázání nebo válcování leukocytů; • Extravazace leukocytů; • regulace imunitní odpovědi; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • migrace leukocytů; • pozitivní regulace vázání nebo válcování leukocytů; • pozitivní regulace adheze leukocytů buňka-buňka; • pozitivní regulace migrace leukocytů; • importovat do buňky; • adheze leukocytů buňka-buňka; • negativní regulace aktivity homodimerizace proteinu; • na klatrinu závislá extracelulární exozomová endocytóza; • buněčná adheze; • shlukování receptorů; • buněčná adheze zprostředkovaná integrinem; • axonogeneze podílející se na inervaci; • buněčná adheze v reakci na extracelulární stimul; • buněčná odpověď na amyloid-beta; • pozitivní regulace proliferace vaskulárních endoteliálních buněk; • rozšíření neuronové projekce; • pozitivní regulace apoptotického procesu endotelových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3676
	16401
	ENSG00000115232
	ENSMUSG00000027009
	P13612
	Q00651
	NM_000885; NM_001316312
	NM_010576
	NP_000876; NP_001303241
	NP_034706
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CD49d je integrin alfa podjednotka. Tvoří polovinu α4β1 receptor pro navádění lymfocytů.

Funkce

Produkt tohoto genu patří do rodiny proteinů alfa řetězce integrinu. Integriny jsou heterodimerní integrální membránové proteiny složené z alfa řetězce a beta řetězce. Tento gen kóduje řetězec alfa 4. Na rozdíl od jiných integrinových alfa řetězců alfa 4 neobsahuje I-doménu ani nepodstupuje štěpení spojené disulfidem. Řetězec Alpha 4 se sdružuje s řetězcem beta 1 nebo beta 7.^[5]

Interakce

CD49d bylo prokázáno komunikovat s LGALS8^[6] a Paxillin.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115232 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027009 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ITGA4 integrin, alfa 4 (antigen CD49D, alfa 4 podjednotka receptoru VLA-4)“.
^ Hadari YR, Arbel-Goren R, Levy Y, Amsterdam A, Alon R, Zakut R, Zick Y (2000). „Vazba galectinu-8 na integriny inhibuje adhezi buněk a vyvolává apoptózu“. J. Cell Sci. 113 (Pt 13): 2385–97. PMID 10852818.
^ Han J, Liu S, Rose DM, Schlaepfer DD, McDonald H, Ginsberg MH (listopad 2001). „Fosforylace cytoplazmatické domény integrinu alfa 4 reguluje vazbu paxilinu“. J. Biol. Chem. 276 (44): 40903–9. doi:10,1074 / jbc.M102665200. PMID 11533025.
^ Liu S, Kiosses WB, Rose DM, Slepak M, Salgia R, Griffin JD, Turner CE, Schwartz MA, Ginsberg MH (červen 2002). „Fragment paxillinu váže cytoplazmatickou doménu alfa 4 integrinu (ocas) a selektivně inhibuje migraci buněk zprostředkovanou alfa 4“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20887–94. doi:10,1074 / jbc.M110928200. PMID 11919182.

Další čtení

Humphries MJ, Sheridan J, Mold AP, Newham P (1995). „Mechanismy vazby VCAM-1 a fibronektinu na integrin alfa 4 beta 1: důsledky pro funkci integrinu a racionální design léčiva“. Nalezena Ciba. Symp. Symposia Novartis Foundation. 189: 177–91, diskuse 191–9. doi:10.1002 / 9780470514719.ch13. ISBN 9780470514719. PMID 7587632.
Oostendorp RA, Dörmer P (1997). "VLA-4 zprostředkované interakce mezi normálními lidskými hematopoetickými progenitory a stromálními buňkami". Leuku. Lymfom. 24 (5–6): 423–35. doi:10.3109/10428199709055581. PMID 9086434.
Porter JC, Hogg N (1999). „Integriny berou partnery: vzájemná komunikace mezi integriny a jinými membránovými receptory“. Trends Cell Biol. 8 (10): 390–6. doi:10.1016 / S0962-8924 (98) 01344-0. PMID 9789327.
Rose DM, Han J, Ginsberg MH (2003). "Integriny alfa4 a imunitní odpověď". Immunol. Rev. 186 (1): 118–24. doi:10.1034 / j.1600-065X.2002.18611.x. PMID 12234367. S2CID 37850994.
O'Connor P (2007). „Natalizumab a role antagonismu alfa 4-integrinu v léčbě roztroušené sklerózy“. Znalecký posudek na biologickou terapii. 7 (1): 123–36. doi:10.1517/14712598.7.1.123. PMID 17150024. S2CID 73319319.
Chan BM, Elices MJ, Murphy E, Hemler ME (1992). "Adheze k vaskulární buněčné adhezní molekule 1 a fibronektinu. Srovnání alfa 4 beta 1 (VLA-4) a alfa 4 beta 7 na lidské B buněčné linii JY". J. Biol. Chem. 267 (12): 8366–70. PMID 1373725.
Fernández-Ruiz E, Pardo-Manuel de Villena F, Rubio MA, Corbí AL, Rodriguez de Córdoba S, Sánchez-Madrid F (1992). "Mapování lidského genu VLA-alfa 4 na chromozom 2q31-q32". Eur. J. Immunol. 22 (2): 587–90. doi:10.1002 / eji.1830220243. PMID 1537388.
Rubio M, Nueda A, Vara A, Corbí Lopez AL (1992). "Jedna mRNA kóduje formy alfa 150 a alfa 80/70 alfa podjednotky VLA4." Eur. J. Immunol. 22 (4): 1099–102. doi:10.1002 / eji.1830220434. PMID 1551405.
Sonnenberg A, Linders CJ, Modderman PW, Damsky CH, Aumailley M, Timpl R (1990). „Integrinové rozpoznávání různých fragmentů lamininu vázajících se na buňky (P1, E3, E8) a důkaz, že alfa 6 beta 1, ale ne alfa 6 beta 4, funguje jako hlavní receptor pro fragment E8“. J. Cell Biol. 110 (6): 2145–55. doi:10.1083 / jcb.110.6.2145. PMC 2116116. PMID 1693624.
Teixidó J, Parker CM, Kassner PD, Hemler ME (1992). "Funkční a strukturní analýza štěpení podjednotky VLA-4 integrinu alfa 4". J. Biol. Chem. 267 (3): 1786–91. PMID 1730718.
Rosemblatt M, Vuillet-Gaugler MH, Leroy C, Coulombel L (1991). „Koexprese dvou fibronektinových receptorů, VLA-4 a VLA-5, nezralými lidskými erytroblastickými prekurzorovými buňkami“. J. Clin. Investovat. 87 (1): 6–11. doi:10.1172 / JCI115002. PMC 294977. PMID 1824634.
Rosen GD, Birkenmeier TM, Dean DC (1991). "Charakterizace promotoru genu integrinu alfa 4". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (10): 4094–8. doi:10.1073 / pnas.88.10.4094. PMC 51604. PMID 2034655.
Takada Y, Elices MJ, Crouse C, Hemler ME (1989). „Primární struktura podjednotky alfa 4 VLA-4: homologie s jinými integriny a možná funkce adheze buněk k buňkám“. EMBO J.. 8 (5): 1361–8. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb03516.x. PMC 400962. PMID 2788572.
Takada Y, Strominger JL, Hemler ME (1987). „Velmi pozdní rodina antigenů heterodimerů je součástí nadrodiny molekul zapojených do adheze a embryogeneze“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (10): 3239–43. Bibcode:1987PNAS ... 84.3239T. doi:10.1073 / pnas.84.10.3239. PMC 304844. PMID 3033641.
Hemler ME, Huang C, Schwarz L (1987). "Rodina proteinů VLA. Charakterizace pěti odlišných heterodimerů na buněčném povrchu, každý se společnou beta podjednotkou o molekulové hmotnosti 130 000". J. Biol. Chem. 262 (7): 3300–9. PMID 3546305.
Gailit J, Pierschbacher M, Clark RA (1993). "Exprese funkčního alfa 4 beta 1 integrinu lidskými dermálními fibroblasty". J. Invest. Dermatol. 100 (3): 323–8. doi:10.1111 / 1523-1747.ep12470011. PMID 8440915.
Pujades C, Teixidó J, Bazzoni G, Hemler ME (1996). „Integriny alfa 4 cysteiny 278 a 717 modulují vazbu ligandu VLA-4 a také přispívají k tvorbě alfa 4/180“. Biochem. J. 313. (Pt 3) (3): 899–908. doi:10.1042 / bj3130899. PMC 1216996. PMID 8611173.
Szabo M, McIntyre BW (1996). "Identifikace dvou variant podjednotky lidského integrinu alfa 4". Mol. Immunol. 32 (17–18): 1453–4. doi:10.1016/0161-5890(96)00001-6. PMID 8643114.
Mannion BA, Berditchevski F, Kraeft SK, Chen LB, Hemler ME (1996). „Transmembránové-4 proteiny superrodiny CD81 (TAPA-1), CD82, CD63 a CD53 specificky spojené s integrinem alfa 4 beta 1 (CD49d / CD29)“. J. Immunol. 157 (5): 2039–47. PMID 8757325.

externí odkazy

Antigen CD49d + v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
ITGA4 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk
Člověk ITGA4 umístění genomu a ITGA4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P13612 (Lidský integrin alfa-4) na PDBe-KB.

Tento imunologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115232 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027009 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] „Entrez Gene: ITGA4 integrin, alfa 4 (antigen CD49D, alfa 4 podjednotka receptoru VLA-4)“.

[pmid10852818-6] Hadari YR, Arbel-Goren R, Levy Y, Amsterdam A, Alon R, Zakut R, Zick Y (2000). „Vazba galectinu-8 na integriny inhibuje adhezi buněk a vyvolává apoptózu“. J. Cell Sci. 113 (Pt 13): 2385–97. PMID 10852818.

[pmid11533025-7] Han J, Liu S, Rose DM, Schlaepfer DD, McDonald H, Ginsberg MH (listopad 2001). „Fosforylace cytoplazmatické domény integrinu alfa 4 reguluje vazbu paxilinu“. J. Biol. Chem. 276 (44): 40903–9. doi:10,1074 / jbc.M102665200. PMID 11533025.

[pmid11919182-8] Liu S, Kiosses WB, Rose DM, Slepak M, Salgia R, Griffin JD, Turner CE, Schwartz MA, Ginsberg MH (červen 2002). „Fragment paxillinu váže cytoplazmatickou doménu alfa 4 integrinu (ocas) a selektivně inhibuje migraci buněk zprostředkovanou alfa 4“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20887–94. doi:10,1074 / jbc.M110928200. PMID 11919182.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350