CD1D - CD1D

CD1D
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4 mil, 4MQ7, 4WW2
Identifikátory
Aliasy	CD1D, Molekula CD1A, R3, R3G1, CD1d
Externí ID	OMIM: 188410 MGI: 107674 HomoloGene: 1337 Genové karty: CD1D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	158,186,427 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	86,999,441 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba beta-2-mikroglobulinu; • vazba lipopeptidů; • histonová vazba; • vazba endogenního lipidového antigenu; • vazba lipidového antigenu; • vazba exogenního lipidového antigenu; • vazba molekul buněčné adheze; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • endozom; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • povrch buňky; • lysozomální membrána; • bazolaterální plazmatická membrána; • lysozom; • endosomová membrána; • buněčná membrána; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární; • vnější strana plazmatické membrány;
Biologický proces	• proces imunitního systému; • Výběr T buněk; • heterotypická adheze mezi buňkami; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • detekce bakterie; • pozitivní regulace vrozené imunitní odpovědi; • zpracování a prezentace antigenu, exogenní lipidový antigen prostřednictvím MHC třídy Ib; • vrozený imunitní systém; • GO: virový proces 0022415; • zpracování a prezentace antigenu, endogenní lipidový antigen prostřednictvím MHC třídy Ib; • regulace imunitní odpovědi; • pozitivní regulace cytotoxicity zprostředkované T buňkami; • imunitní odpověď;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	912
	12479
	ENSG00000158473
	ENSMUSG00000028076
	P15813
	P11609
	NM_001766; NM_001319145; NM_001371761; NM_001371762; NM_001371763
	NM_007639; NM_001379501; NM_001379502; NM_001379503
	NP_001306074; NP_001757; NP_001358690; NP_001358691; NP_001358692
	NP_031665; NP_001366430; NP_001366431; NP_001366432
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CD1D je člověk gen který kóduje protein CD1d,^[5] člen CD1 (shluk diferenciace 1) rodina glykoproteiny vyjádřený na povrchu různých lidí buňky prezentující antigen. Jsou neklasické MHC proteiny související s třída I MHC proteiny a podílejí se na prezentaci lipidů antigeny na T buňky. CD1d je jediným členem molekul CD1 skupiny 2.

Biologický význam

Lipidové antigeny prezentované CD1d aktivují speciální třídu T buněk, známou jako buňky přirozeného zabijáka T (NKT) prostřednictvím interakce s Receptor T-buněk přítomný na membránách NKT.^[5] Po aktivaci se buňky NKT rychle produkují Th1 a Th2 cytokiny, obvykle reprezentován interferon-gama a interleukin 4 Výroba.

Nomenklatura

CD1d je také známý jako R3G1

Ligandy

Některé ze známých ligandů pro CD1d jsou:

α -galaktosylceramid (α-GalCer), sloučenina původně odvozená z mořské houby Agelas Mauritán^[6] bez fyziologické role, ale s velkým výzkumným využitím.
α-glukuronyl- a α-galakturonyl- ceramidy, skupina sloučenin mikrobiálního původu, které lze nalézt například na buněčná stěna z Sfingomonas, všudypřítomný Gramnegativní bakterie.^[7] Související β-D-glukopyranosylceramid se hromadí v buňky prezentující antigen po infekci, kde slouží k aktivaci invariantní NKT (iNKTs), speciální druh NKT.
iGb3, vlastní antigen, který byl zahrnut do selekce iNKT.^[8]
HS44, syntetická amino skupina cyklitolický analog ceramidu, který má menší kontakt s TCR, aktivuje iNKT omezenějším způsobem než α-GalCer (zvláště ve vztahu k produkci cytokinů Th2), a je tedy zajímavější pro terapeutické použití.^[9]

CD1d tetramery

CD1d tetramery jsou proteinové konstrukty složené ze čtyř molekul CD1d spojených dohromady a obvykle fluorescenčně značené, používané k identifikaci NKT buněk nebo jiných buněk reagujících s CD1d. Zejména jsou nimi obarveny NKT buňky typu I a některé NKT buňky typu II. Diferenciaci těchto dvou typů lze získat u člověka použitím protilátky proti řetězci TCR Va24, který je specifický pro NKT buňky typu I.^[10]

Ačkoli jsou nejčastěji používanými CD1d oligomery, někdy se místo nich používají dimery CD1d (dvě jednotky) nebo pentamery (pět jednotek).^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158473 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028076 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „P15813 (CD1D_HUMAN)“. Uniprot. Citováno 1. března 2013.
^ Franck, Richard W. (1. ledna 2012). "C-galaktosylceramid: syntéza a imunologie". Comptes Rendus Chimie. 15 (1): 46–56. doi:10.1016 / j.crci.2011.05.006. PMC 3293403. PMID 22408579.
^ Bendelac, A; Savage PB; Teyton I (2007). "Biologie NKT buněk". Výroční přehled imunologie. 25 (1): 297–336. doi:10.1146 / annurev.immunol.25.022106.141711. PMID 17150027.
^ Zhou, D (srpen 2006). "Imunologická funkce iGb3". Současná věda o proteinech a peptidech. 7 (4): 325–333. doi:10.2174/138920306778018007. PMID 16918447.
^ J. Kerzerho; E. Yu; C. M. Barra; E. Alari-Pahissa; E. Girardi; Y. Harrak; P. Lauzurica; A. Llebaria; D. Zajonc; O. Akbari; A. R. Castaño (2012). „Strukturální a funkční charakterizace nového neglykosidického agonisty iNKT s imunomodulačními vlastnostmi“. Journal of Immunology. 188 (5): 2254–2265. doi:10,4049 / jimmunol. 1103049. PMC 3288653. PMID 22301545.
^ ^A ^b Terabe, Masaki; Berzofsky, Jay A. (2008). „Role NKT buněk v imunitě nádorů“. Adv Cancer Res. 101: 277–348. doi:10.1016 / S0065-230X (08) 00408-9. PMC 2693255. PMID 19055947.

Další čtení

Melián A, Beckman EM, Porcelli SA, Brenner MB (1996). "Prezentace antigenu CD1 a MHC kódovanými molekulami typu I". Curr. Opin. Immunol. 8 (1): 82–88. doi:10.1016 / S0952-7915 (96) 80109-9. PMID 8729450.
Joyce S (2001). „CD1d a přirozené T buňky: jak jejich vlastnosti nastartují imunitní systém“. Buňka. Mol. Life Sci. 58 (3): 442–469. doi:10.1007 / PL00000869. PMID 11315191.
Sköld M, Behar SM (2003). "Úloha NKT buněk omezených na CD1d v mikrobiální imunitě". Infikovat. Immun. 71 (10): 5447–5455. doi:10.1128 / IAI.71.10.5447-5455.2003. PMC 201095. PMID 14500461.
Brigl M, Brenner MB (2004). "CD1: prezentace antigenu a funkce T buněk". Annu. Rev. Immunol. 22 (1): 817–890. doi:10.1146 / annurev.immunol.22.012703.104608. PMID 15032598.
Sporák V, Verhasselt B (2006). "Modelování brzlíkových účinků HIV-1 Nef". Curr. HIV Res. 4 (1): 57–64. doi:10.2174/157016206775197583. PMID 16454711.
Brutkiewicz RR (2006). „CD1d ligandy: dobré, špatné a ošklivé“. J. Immunol. 177 (2): 769–775. doi:10,4049 / jimmunol.177.2.769. PMID 16818729.
Blumberg RS, Terhorst C, Bleicher P a kol. (1991). „Exprese nepolymorfní molekuly podobné MHC třídy I, CD1D, lidskými intestinálními epiteliálními buňkami“. J. Immunol. 147 (8): 2518–2524. PMID 1717564.
Balk SP, Bleicher PA, Terhorst C (1989). "Izolace a charakterizace cDNA a gen kódující čtvrtou molekulu CD1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (1): 252–256. Bibcode:1989PNAS ... 86..252B. doi:10.1073 / pnas.86.1.252. PMC 286442. PMID 2463622.
Calabi F, Jarvis JM, Martin L, Milstein C (1989). "Dvě třídy genů CD1". Eur. J. Immunol. 19 (2): 285–292. doi:10.1002 / eji.1830190211. PMID 2467814.
Yu CY, Milstein C (1990). „Fyzická mapa spojující pět genů antigenu pro diferenciaci lidského thymocytů CD1“. EMBO J.. 8 (12): 3727–3732. doi:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08548.x. PMC 402056. PMID 2583117.
Martin LH, Calabi F, Milstein C (1987). „Izolace genů CD1: rodina hlavních diferenciačních antigenů souvisejících s histokompatibilním komplexem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83 (23): 9154–9158. doi:10.1073 / pnas.83.23.9154. PMC 387093. PMID 3097645.
Balk SP, Burke S, Polischuk JE a kol. (1994). „Beta 2-mikroglobulin nezávislá molekula MHC třídy Ib exprimovaná lidským intestinálním epitelem“. Věda. 265 (5169): 259–262. doi:10.1126 / science.7517575. PMID 7517575.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kawano T, Cui J, Koezuka Y a kol. (1997). "CD1d-omezená a TCR-zprostředkovaná aktivace valpha14 NKT buněk glykosylceramidy". Věda. 278 (5343): 1626–1629. Bibcode:1997Sci ... 278.1626K. doi:10.1126 / science.278.5343.1626. PMID 9374463.
Katabami S, Matsuura A, Chen HZ a kol. (1998). „Strukturální organizace krysího CD1 typizuje evolučně konzervované geny třídy CD1D“. Imunogenetika. 48 (1): 22–31. doi:10,1007 / s002510050396. PMID 9601940.
Somnay-Wadgaonkar K, Nusrat A, Kim HS a kol. (1999). "Imunolokalizace CD1d v lidských intestinálních epiteliálních buňkách a identifikace formy spojené s beta2-mikroglobulinem". Int. Immunol. 11 (3): 383–392. doi:10.1093 / intimm / 11.3.383. PMID 10221650.
Campbell NA, Kim HS, Blumberg RS, Mayer L. (1999). „Neklasická molekula třídy I CD1d se asociuje s novým ligandem CD8 gp180 na buňkách střevního epitelu“. J. Biol. Chem. 274 (37): 26259–26265. doi:10.1074 / jbc.274.37.26259. PMID 10473580.
Han M, Hannick LI, DiBrino M, Robinson MA (2000). „Polymorfismus lidských genů CD1“. Tkáňové antigeny. 54 (2): 122–127. doi:10.1034 / j.1399-0039.1999.540202.x. PMID 10488738.

externí odkazy

Antigen CD1d + v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CD1A umístění genomu a CD1A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CD1D umístění genomu a CD1D stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158473 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028076 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[P15813_CD1D_HUMAN-5] A ^b „P15813 (CD1D_HUMAN)“. Uniprot. Citováno 1. března 2013.

[6] Franck, Richard W. (1. ledna 2012). "C-galaktosylceramid: syntéza a imunologie". Comptes Rendus Chimie. 15 (1): 46–56. doi:10.1016 / j.crci.2011.05.006. PMC 3293403. PMID 22408579.

[7] Bendelac, A; Savage PB; Teyton I (2007). "Biologie NKT buněk". Výroční přehled imunologie. 25 (1): 297–336. doi:10.1146 / annurev.immunol.25.022106.141711. PMID 17150027.

[8] Zhou, D (srpen 2006). "Imunologická funkce iGb3". Současná věda o proteinech a peptidech. 7 (4): 325–333. doi:10.2174/138920306778018007. PMID 16918447.

[9] J. Kerzerho; E. Yu; C. M. Barra; E. Alari-Pahissa; E. Girardi; Y. Harrak; P. Lauzurica; A. Llebaria; D. Zajonc; O. Akbari; A. R. Castaño (2012). „Strukturální a funkční charakterizace nového neglykosidického agonisty iNKT s imunomodulačními vlastnostmi“. Journal of Immunology. 188 (5): 2254–2265. doi:10,4049 / jimmunol. 1103049. PMC 3288653. PMID 22301545.

[Terabe2008-10] A ^b Terabe, Masaki; Berzofsky, Jay A. (2008). „Role NKT buněk v imunitě nádorů“. Adv Cancer Res. 101: 277–348. doi:10.1016 / S0065-230X (08) 00408-9. PMC 2693255. PMID 19055947.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Proteiny: shluky diferenciace (viz také seznam lidských klastrů diferenciace )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 y δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 A CD9 CD10 CD11 A b C d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 A b C d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 A b C d E F CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 A b C d E F CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 A b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 A d E h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 A b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 A b CD121 A b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 A b C CD157 CD158 (A d E i k ) CD159 A C CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 A b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 A b G CD174 CD177 CD178 CD179 A b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 A b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (A b ) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 A b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350